FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5955, 312 aa 1>>>pF1KE5955 312 - 312 aa - 312 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5704+/-0.000622; mu= 20.9071+/- 0.039 mean_var=132.1970+/-35.037, 0's: 0 Z-trim(105.8): 343 B-trim: 907 in 1/49 Lambda= 0.111548 statistics sampled from 13536 (13990) to 13536 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.473), E-opt: 0.2 (0.164), width: 16 Scan time: 5.830 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 871 152.6 9.7e-37 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 861 151.0 3e-36 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 852 149.5 8e-36 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 848 148.9 1.3e-35 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 839 147.4 3.4e-35 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 839 147.4 3.4e-35 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 839 147.5 3.5e-35 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 822 144.7 2.3e-34 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 822 144.7 2.3e-34 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 822 144.7 2.3e-34 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 818 144.1 3.6e-34 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 807 142.3 1.2e-33 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 806 142.1 1.4e-33 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 804 141.8 1.7e-33 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 792 139.9 6.5e-33 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 783 138.4 1.8e-32 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 772 136.6 5.9e-32 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 768 136.0 9.4e-32 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 758 134.4 2.8e-31 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 740 131.5 2.1e-30 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 521 96.3 8.8e-20 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 466 87.4 4.1e-17 NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 232 49.9 9.5e-06 NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 232 49.9 9.5e-06 XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 232 49.9 9.5e-06 NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 232 49.9 9.5e-06 XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 232 49.9 9.7e-06 XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 232 49.9 9.7e-06 XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 232 49.9 9.7e-06 NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 232 49.9 9.9e-06 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 223 48.3 2.4e-05 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 222 48.4 3.1e-05 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 218 47.5 4.3e-05 NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 215 47.1 6.1e-05 NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 213 46.9 8.1e-05 NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 213 46.9 8.2e-05 NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 213 46.9 8.2e-05 NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 213 46.9 8.2e-05 NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 213 46.9 8.3e-05 NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 213 46.9 8.3e-05 NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 213 46.9 8.4e-05 NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 213 46.9 8.4e-05 NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 213 46.9 8.4e-05 NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 213 46.9 8.4e-05 NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 213 46.9 8.4e-05 NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 213 46.9 8.4e-05 NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 213 46.9 8.4e-05 NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 213 46.9 8.4e-05 NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 213 47.0 8.7e-05 NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 213 47.0 9.2e-05 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 929 init1: 869 opt: 871 Z-score: 780.6 bits: 152.6 E(85289): 9.7e-37 Smith-Waterman score: 871; 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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFIC ::::::::.::.: ::.... .:. .:: :: . . ... ::..: ..::.: NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFS : :.:.: :.:: :.:. :.. ....... .:.. ::. : .:::.:::. :.:::: NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQ :::::..:::. : : . :. :..:. .: ... : :.:.:::.::.:::..::. NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 AFKAVFRKIFSASDK :.. .:.:... NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa) initn: 863 init1: 741 opt: 852 Z-score: 764.2 bits: 149.5 E(85289): 8e-36 Smith-Waterman score: 852; 42.0% identity (76.4% similar) in 305 aa overlap (3-307:5-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY :.:. ::.::::.:. . . ..:. :: .....::. .:.:. .::::.:::: NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLLAALSY ::: :.:. .. :.: .:. :. ...:.:.:. . : ..:.:....: :. :::..:: NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICD :::::::.:::: .::. ::: ::. .::..:.:. . . : : . .:: : ::.:. NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFST .: :. .::: :. ::..:. :.. .::...::. :: :..:. :. . ::::: NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQA :.::..:: . ::: .. :. :..... :.:.:. . :.:.:::.::.:::..:: : NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 FKAVFRKIFSASDK .. : . : NP_003 LRKVATRNFP 300 >>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa) initn: 879 init1: 654 opt: 848 Z-score: 760.4 bits: 148.9 E(85289): 1.3e-35 Smith-Waterman score: 848; 44.9% identity (72.3% similar) in 303 aa overlap (2-299:4-306) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNHTRQI-EFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPM .::. .. ::.:::. . ::...: .::: :: . : :: : : :. :: NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKT----ISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLL :::: :.::::: ..:. ::..: .: .. :: .::..::.:.. :: :: :: NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 AALSYDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIID :...::::.::: ::.: :.:...: :.. .::. :: : .. ..: .:..:. :::. NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 HFICDISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKK ::.::.::.:.:::.: :: :.::.. :. : .. :: : .....::: . NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KAFSTCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQ ::::::.::. :: : :.. .::: .:.: .: :.:: . ..:::::.:: :::: NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 QVKQAFKAVFRKIFSASDK .::.:. NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV 310 320 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 851 init1: 830 opt: 839 Z-score: 752.8 bits: 147.4 E(85289): 3.4e-35 Smith-Waterman score: 839; 41.2% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (3-308:5-311) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY :.. ::.::::. . : : ..:.:.: . ...::. :: . .:: :.:::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFF-YIFLGVTEFFLLAALS ::: :.::..: :. . .:..: . . . .::: ::..:..: ..:. . .: :::... XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNF-LLAVMA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFIC ::..::.:.::.: . :....: :: . ::.. : .. .: :.:::.: : ::.: XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFS :..:.:.:::::::: :.: . .....:. .. .. :: .: :.:: ::.. . :::: XP_011 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQ ::.::. :: . :.. . .:..: ... . . .::: : :.:.::::::.:::. .: XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AFKAVF-RKIFSASDK :.: : : .:: XP_011 ALKKVVGRVVFSV 300 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 851 init1: 830 opt: 839 Z-score: 752.8 bits: 147.4 E(85289): 3.4e-35 Smith-Waterman score: 839; 41.2% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (3-308:5-311) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY :.. ::.::::. . : : ..:.:.: . ...::. :: . .:: :.:::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFF-YIFLGVTEFFLLAALS ::: :.::..: :. . .:..: . . . .::: ::..:..: ..:. . .: :::... NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNF-LLAVMA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFIC ::..::.:.::.: . :....: :: . ::.. : .. .: :.:::.: : ::.: NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFS :..:.:.:::::::: :.: . .....:. .. .. :: .: :.:: ::.. . :::: NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQ ::.::. :: . :.. . .:..: ... . . .::: : :.:.::::::.:::. .: NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AFKAVF-RKIFSASDK :.: : : .:: NP_036 ALKKVVGRVVFSV 300 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 851 init1: 830 opt: 839 Z-score: 752.7 bits: 147.5 E(85289): 3.5e-35 Smith-Waterman score: 839; 41.2% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (3-308:15-321) 10 20 30 40 pF1KE5 MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALIL :.. ::.::::. . : : ..:.:.: . ...::. :: . 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