Result of FASTA (omim) for pFN21AE5955
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5955, 312 aa
  1>>>pF1KE5955 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5704+/-0.000622; mu= 20.9071+/- 0.039
 mean_var=132.1970+/-35.037, 0's: 0 Z-trim(105.8): 343  B-trim: 907 in 1/49
 Lambda= 0.111548
 statistics sampled from 13536 (13990) to 13536 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.473), E-opt: 0.2 (0.164), width:  16
 Scan time:  5.830

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  871 152.6 9.7e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  861 151.0   3e-36
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  852 149.5   8e-36
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  848 148.9 1.3e-35
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  839 147.4 3.4e-35
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  839 147.4 3.4e-35
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  839 147.5 3.5e-35
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  822 144.7 2.3e-34
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  822 144.7 2.3e-34
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  822 144.7 2.3e-34
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  818 144.1 3.6e-34
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  807 142.3 1.2e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  806 142.1 1.4e-33
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  804 141.8 1.7e-33
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  792 139.9 6.5e-33
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  783 138.4 1.8e-32
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  772 136.6 5.9e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  768 136.0 9.4e-32
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  758 134.4 2.8e-31
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  740 131.5 2.1e-30
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  521 96.3 8.8e-20
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  466 87.4 4.1e-17
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370)  232 49.9 9.5e-06
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370)  232 49.9 9.5e-06
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 370)  232 49.9 9.5e-06
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370)  232 49.9 9.5e-06
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  232 49.9 9.7e-06
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  232 49.9 9.7e-06
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  232 49.9 9.7e-06
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399)  232 49.9 9.9e-06
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318)  223 48.3 2.4e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor  ( 428)  222 48.4 3.1e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332)  218 47.5 4.3e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348)  215 47.1 6.1e-05
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389)  213 46.9 8.1e-05
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392)  213 46.9 8.2e-05
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397)  213 46.9 8.2e-05
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400)  213 46.9 8.2e-05
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403)  213 46.9 8.3e-05
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406)  213 46.9 8.3e-05
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  213 46.9 8.4e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  213 46.9 8.4e-05
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412)  213 46.9 8.4e-05
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  213 46.9 8.4e-05
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  213 46.9 8.4e-05
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414)  213 46.9 8.4e-05
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418)  213 46.9 8.4e-05
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420)  213 46.9 8.4e-05
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446)  213 47.0 8.7e-05
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493)  213 47.0 9.2e-05


>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 929 init1: 869 opt: 871  Z-score: 780.6  bits: 152.6 E(85289): 9.7e-37
Smith-Waterman score: 871; 41.4% identity (78.0% similar) in 309 aa overlap (2-310:4-312)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLLAALSY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 DRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE5 ISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE5 CSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
              250       260       270       280       290       300

      300       310  
pF1KE5 FKAVFRKIFSASDK
       .  :. .  ..:  
NP_003 LANVISRKRTSSFL
              310    

>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo  (317 aa)
 initn: 855 init1: 829 opt: 861  Z-score: 771.9  bits: 151.0 E(85289): 3e-36
Smith-Waterman score: 861; 41.7% identity (77.2% similar) in 307 aa overlap (3-308:5-311)

                 10         20        30        40        50       
pF1KE5   MKNHTRQIEFILLGLTD-NSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPM
           : :.  ::::.....  ...: ..:: .:   .... ::  :: . : : .:..::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE5 YFFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLLAALS
       ::::::.:::::.:. . .:..: :..... :::  :: .:..:..:.::.: ::::...
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 YDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFIC
       ::::::::.::.:  ::....  .:. .::  :: .  .     ... ::..: ..::.:
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE5 TCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQ
       :::::..:::. : :  . :. :..:.    .: ...  : :.:.:::.::.:::..::.
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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       300       310    
pF1KE5 AFKAVFRKIFSASDK  
       :.. .:.:...      
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
              310       

>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo   (308 aa)
 initn: 863 init1: 741 opt: 852  Z-score: 764.2  bits: 149.5 E(85289): 8e-36
Smith-Waterman score: 852; 42.0% identity (76.4% similar) in 305 aa overlap (3-307:5-307)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY
           :.:.  ::.::::.:. . . ..:. ::   .....::. .:.:. .::::.::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLLAALSY
       ::: :.:. .. :.:  .:. :. ...:.:.:. . : ..:.:....: :.  :::..::
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICD
       :::::::.:::: .::. ::: ::. .::..:.:.  .   . : : . .:: : ::.:.
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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      180       190       200       210       220       230        
pF1KE5 ISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFST
          .: :. .:::  :.  ::..:. :.. .::...::. :: :..:. :.  . :::::
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 CSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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      300       310  
pF1KE5 FKAVFRKIFSASDK
       .. :  . :     
NP_003 LRKVATRNFP    
      300            

>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo   (327 aa)
 initn: 879 init1: 654 opt: 848  Z-score: 760.4  bits: 148.9 E(85289): 1.3e-35
Smith-Waterman score: 848; 44.9% identity (72.3% similar) in 303 aa overlap (2-299:4-306)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE5   MKNHTRQI-EFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPM
          .::. .. ::.:::.   . ::...: .:::  :: .  :  ::  :   : :. ::
NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80            90       100       110   
pF1KE5 YFFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKT----ISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLL
       :::: :.::::: ..:. ::..:  .:  ..     :: .::..::.:.. :: ::  ::
NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE5 AALSYDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIID
       :...::::.::: ::.:  :.:...: :.. .::. :: : .. ..:  .:..:. :::.
NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE5 HFICDISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKK
       ::.::.::.:.:::.:    ::  :.::.. :.  : ..  ::  :  .....:::  . 
NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
              190       200       210       220       230       240

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE5 KAFSTCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQ
       ::::::.::. :: : :.. .::: .:.:      .: :.:: . ..:::::.:: ::::
NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
              250       260       270       280       290       300

           300       310          
pF1KE5 QVKQAFKAVFRKIFSASDK        
       .::.:.                     
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
              310       320       

>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 851 init1: 830 opt: 839  Z-score: 752.8  bits: 147.4 E(85289): 3.4e-35
Smith-Waterman score: 839; 41.2% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (3-308:5-311)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY
           :..   ::.::::. . : : ..:.:.:   . ...::. ::  . .:: :.::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100        110       
pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFF-YIFLGVTEFFLLAALS
       ::: :.::..: :. . .:..: . . . .:::  ::..:..: ..:. . .: :::...
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNF-LLAVMA
               70        80        90       100       110          

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE5 YDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFIC
       ::..::.:.::.: . :....:  :: . ::.. : ..   .:   :.:::.: : ::.:
XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE5 DISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFS
       :..:.:.:::::::: :.: .  .....:. .. .. :: .:  :.:: ::.. . ::::
XP_011 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE5 TCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQ
       ::.::. :: . :.. . .:..: ... .  .  .::: : :.:.::::::.:::. .: 
XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
     240       250       260       270       280       290         

       300        310  
pF1KE5 AFKAVF-RKIFSASDK
       :.: :  : .::    
XP_011 ALKKVVGRVVFSV   
     300       310     

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 851 init1: 830 opt: 839  Z-score: 752.8  bits: 147.4 E(85289): 3.4e-35
Smith-Waterman score: 839; 41.2% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (3-308:5-311)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY
           :..   ::.::::. . : : ..:.:.:   . ...::. ::  . .:: :.::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100        110       
pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFF-YIFLGVTEFFLLAALS
       ::: :.::..: :. . .:..: . . . .:::  ::..:..: ..:. . .: :::...
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNF-LLAVMA
               70        80        90       100       110          

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE5 YDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFIC
       ::..::.:.::.: . :....:  :: . ::.. : ..   .:   :.:::.: : ::.:
NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE5 DISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFS
       :..:.:.:::::::: :.: .  .....:. .. .. :: .:  :.:: ::.. . ::::
NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE5 TCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQ
       ::.::. :: . :.. . .:..: ... .  .  .::: : :.:.::::::.:::. .: 
NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
     240       250       260       270       280       290         

       300        310  
pF1KE5 AFKAVF-RKIFSASDK
       :.: :  : .::    
NP_036 ALKKVVGRVVFSV   
     300       310     

>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 851 init1: 830 opt: 839  Z-score: 752.7  bits: 147.5 E(85289): 3.5e-35
Smith-Waterman score: 839; 41.2% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (3-308:15-321)

                           10        20        30        40        
pF1KE5             MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALIL
                     :..   ::.::::. . : : ..:.:.:   . ...::. ::  . 
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE5 LDSQLKTPMYFFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFF-YIFLGV
       .:: :.::::::: :.::..: :. . .:..: . . . .:::  ::..:..: ..:. .
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
               70        80        90       100       110       120

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE5 TEFFLLAALSYDRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFC
        .: :::...::..::.:.::.: . :....:  :: . ::.. : ..   .:   :.::
XP_011 DNF-LLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFC
               130       140       150       160       170         

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE5 ASNIIDHFICDISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFP
       :.: : ::.::..:.:.:::::::: :.: .  .....:. .. .. :: .:  :.:: :
XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
     180       190       200       210       220       230         

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE5 SAQQKKKAFSTCSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFI
       :.. . ::::::.::. :: . :.. . .:..: ... .  .  .::: : :.:.:::::
XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
     240       250       260       270       280       290         

       290       300        310  
pF1KE5 YTLRNQQVKQAFKAVF-RKIFSASDK
       :.:::. .: :.: :  : .::    
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV   
     300       310       320     

>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep  (317 aa)
 initn: 858 init1: 815 opt: 822  Z-score: 737.9  bits: 144.7 E(85289): 2.3e-34
Smith-Waterman score: 822; 40.0% identity (74.8% similar) in 310 aa overlap (3-312:5-314)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY
           :.:   :::::::... . .. .:...:.  :....::  :. :: :::.:.::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLLAALSY
       ::: :.:....:..:. .:..:  .....:.:  ..: .:::: . ::  :: :::...:
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 DRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICD
       :::::.:  ::: .:: . .: .:...:::.::.   .   . ..: .: ...:::. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE5 ISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFST
       .  ...:.: ::   :.  .. ... :.. . ::.:::  ::.::::. : . .:::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE5 CSSHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQA
       :.::. ::.. ::  .: ::.: ..  :   :  .:. . ..:.:::.::.:::..:: :
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
              250       260       270       280       290       300

      300       310     
pF1KE5 FKAVFRKIFSASDK   
       .. .. :. . ..:   
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
              310       

>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo   (317 aa)
 initn: 858 init1: 815 opt: 822  Z-score: 737.9  bits: 144.7 E(85289): 2.3e-34
Smith-Waterman score: 822; 40.0% identity (74.8% similar) in 310 aa overlap (3-312:5-314)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMY
           :.:   :::::::... . .. .:...:.  :....::  :. :: :::.:.::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLLAALSY
       ::: :.:....:..:. .:..:  .....:.:  ..: .:::: . ::  :: :::...:
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 DRYVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICD
       :::::.:  ::: .:: . .: .:...:::.::.   .   . ..: .: ...:::. :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE5 ISPILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFST
       .  ...:.: ::   :.  .. ... :.. . ::.:::  ::.::::. : . .:::: :
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       .. .. :. . ..:   
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              310       

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       ::: :.:....:..:. .:..:  .....:.:  ..: .:::: . ::  :: :::...:
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312 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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