FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6094, 326 aa 1>>>pF1KE6094 326 - 326 aa - 326 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6286+/-0.0012; mu= 14.1202+/- 0.071 mean_var=140.0861+/-44.369, 0's: 0 Z-trim(102.7): 406 B-trim: 819 in 2/45 Lambda= 0.108362 statistics sampled from 6526 (7065) to 6526 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16 Scan time: 2.380 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 2110 342.3 3.1e-94 CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1367 226.2 3e-59 CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1340 221.9 5.3e-58 CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1316 218.1 7.1e-57 CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1312 217.5 1.1e-56 CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1299 215.5 4.5e-56 CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1292 214.4 9.6e-56 CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1262 209.7 2.5e-54 CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1240 206.3 2.7e-53 CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1169 195.2 5.9e-50 CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1103 184.8 7.5e-47 CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1093 183.3 2.2e-46 CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1088 182.5 3.8e-46 CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1062 178.5 7e-45 CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1053 177.0 1.7e-44 CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1047 176.1 3.2e-44 CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1045 175.8 4.1e-44 CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1045 175.8 4.1e-44 CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1042 175.3 5.6e-44 CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1038 174.7 8.6e-44 CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1033 173.9 1.5e-43 CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1032 173.7 1.6e-43 CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1029 173.3 2.3e-43 CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1022 172.2 4.8e-43 CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1020 171.9 6.1e-43 CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1017 171.4 8.3e-43 CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1017 171.4 8.4e-43 CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1013 170.8 1.3e-42 CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1007 169.8 2.5e-42 CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1006 169.7 2.8e-42 CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1003 169.2 3.8e-42 CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 995 168.0 9.1e-42 CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 994 167.8 1e-41 CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 985 166.4 2.7e-41 CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 982 165.9 3.7e-41 CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 982 166.0 3.9e-41 CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 977 165.1 6.4e-41 CCDS31536.1 OR9G1 gene_id:390174|Hs108|chr11 ( 305) 976 165.0 7e-41 CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 969 163.9 1.6e-40 CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 965 163.3 2.3e-40 CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 965 163.3 2.4e-40 CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 964 163.1 2.6e-40 CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 963 163.0 3e-40 CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 962 162.8 3.3e-40 CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 961 162.6 3.6e-40 CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 961 162.7 3.7e-40 CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 960 162.5 4.1e-40 CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 958 162.2 5e-40 CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 958 162.2 5e-40 CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 957 162.0 5.6e-40 >>CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 (326 aa) initn: 2110 init1: 2110 opt: 2110 Z-score: 1805.2 bits: 342.3 E(32554): 3.1e-94 Smith-Waterman score: 2110; 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CCDS73 FRVQFCKFDLINHYFCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP ::: : .::::::::::::::. :: .:.::.:::::.::.:::. : .:.::::: ..: CCDS73 SILHIRSTEGRSKAFSTCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 pF1KE6 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF ::::::::::::.:.....: :. CCDS73 MLNPLIYSLRNKDVHVSLKKMLQRRTLL 290 300 310 >>CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 (314 aa) initn: 1315 init1: 734 opt: 1316 Z-score: 1134.5 bits: 218.1 E(32554): 7.1e-57 Smith-Waterman score: 1316; 65.0% identity (86.1% similar) in 309 aa overlap (18-325:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL :.. ::::::::.:.:::..:.:::::: :::::: ::.:::: CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF .::..: :: :::::::::::.::..:.::::::::::: .:. . :::.::: ::.: CCDS31 SMISIIRLNRQLHTPMYYFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM : : ::.:::::..:: ::::::: :::: .::: ..: ::::.:...:. ..:. : . 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