Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6046
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6046, 318 aa
1>>>pF1KE6046 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5360+/-0.00118; mu= 14.6006+/- 0.069
mean_var=206.3963+/-75.622, 0's: 0 Z-trim(103.3): 407 B-trim: 406 in 1/47
Lambda= 0.089274
statistics sampled from 6807 (7327) to 6807 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 2.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 2110 285.4 4.1e-77
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1318 183.4 2.1e-46
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1296 180.5 1.5e-45
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1262 176.2 3.1e-44
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1235 172.7 3.4e-43
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1230 172.0 5.3e-43
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1222 171.0 1.1e-42
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1205 168.8 4.9e-42
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1205 168.8 4.9e-42
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1194 167.4 1.3e-41
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1181 165.7 4.2e-41
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1166 163.8 1.6e-40
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1165 163.6 1.8e-40
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1146 161.2 9.6e-40
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1144 161.0 1.1e-39
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1143 160.8 1.3e-39
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1137 160.0 2.1e-39
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1134 159.8 3e-39
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1126 158.6 5.7e-39
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1124 158.4 6.8e-39
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1119 157.8 1.1e-38
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1118 157.6 1.2e-38
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1114 157.1 1.7e-38
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1102 155.5 4.8e-38
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1099 155.1 6.3e-38
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1097 154.9 7.8e-38
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1094 154.6 1e-37
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1093 154.5 1.1e-37
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1081 152.8 3.2e-37
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1052 149.1 4.3e-36
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1051 149.0 4.6e-36
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1047 148.4 6.5e-36
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1045 148.2 7.9e-36
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1043 147.9 9.4e-36
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1035 146.9 1.9e-35
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1034 146.8 2.1e-35
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1029 146.1 3.3e-35
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1028 146.0 3.6e-35
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1024 145.5 5.1e-35
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1015 144.3 1.1e-34
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1015 144.3 1.1e-34
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1015 144.3 1.1e-34
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1012 143.9 1.5e-34
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1012 143.9 1.5e-34
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1007 143.3 2.4e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 997 142.0 5.8e-34
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 993 141.5 8.2e-34
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 989 141.0 1.2e-33
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 988 140.9 1.3e-33
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 984 140.3 1.8e-33
>>CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 2110 init1: 2110 opt: 2110 Z-score: 1498.0 bits: 285.4 E(32554): 4.1e-77
Smith-Waterman score: 2110; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
::::::::::::::::::
CCDS31 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
310
>>CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1318 init1: 1318 opt: 1318 Z-score: 946.7 bits: 183.4 E(32554): 2.1e-46
Smith-Waterman score: 1318; 62.5% identity (85.5% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
:. :...: :..::..: :: :.:: . ::. :..::.::.: :: . :::: ::
CCDS31 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
::: :::.::.:.::::::..:.:::: . ::::.::.::.::::..:: .: :.:::.
CCDS31 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
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CCDS31 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALSTC
:::..::::::::.:::::.::::::. . :. :: :::..:.:::::. ::: ::.:::
CCDS31 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
.:::.:::: ::::::::.::: ..: : :.:: .:...:.::: ::::::.:. .::.:
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
: ::
CCDS31 LKRRLGQSERILIQ
310
>>CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 (310 aa)
initn: 1298 init1: 1273 opt: 1296 Z-score: 931.5 bits: 180.5 E(32554): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 1296; 61.8% identity (85.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
:.: : .::. :::::.::. ::. .: .: :: :.::::::.: :: : .::: ::
CCDS42 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
::: ::...:.:::..:.:.::::.: . :::. ::..:.::::..:: .:.:.::::
CCDS42 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
::::::::::.:. ::: .:. :..:.:::::.:::::.:: . ::::::. :::::::
CCDS42 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALSTC
:::...:::::: .::.::.::.::.... ::.:: :::..:::::::: ..: :: :::
CCDS42 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
..:: ::..::.::::.:: :: : ::::::. ::..:::::: ::::::... ::..
CCDS42 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
:
CCDS42 LGKCLVICRE
310
>>CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1278 init1: 1251 opt: 1262 Z-score: 907.7 bits: 176.2 E(32554): 3.1e-44
Smith-Waterman score: 1262; 59.7% identity (81.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
:. ::..: : .: :.. ::.: .:.:: ::: ::.:: :::: .: . .::: ::
CCDS31 MDQINHTNVKEFFFLELTRSRELEFFLFVVFFAVYVATVLGNALIVVTITCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
::: : : ::. .::::.:..:::::: :::.. :..:.::::: :: ::.:.::::
CCDS31 FLLRNKSVLDIVFSSITVPKFLVDLLSDRKTISYNDCMAQIFFFHFAGGADIFFLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
:::.::..::::. .: . : . :..::::.: .:::.:. : . .:::::. :: :::
CCDS31 DRYLAIAKPLHYVTMMRKEVWVALVVASWVSGGLHSIIQVILMLPFPFCGPNTLDAFYCY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALSTC
: :..::::::::.:::.:.::::::::. ::.::::::..:::::::: :::.::::::
CCDS31 VLQVVKLACTDTFALELFMISNNGLVTLLWFLLLLGSYTVILVMLRSHSGEGRNKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
.::. :::: ::::.:.: ::: :.::: ..:. :..:::::: ::.:::.:. ::..
CCDS31 TSHMLVVTLHFVPCVYIYCRPFMTLPMDTTISINNTVITPMLNPIIYSLRNQEMKSAMQR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
: :: .:: : :
CCDS31 LQRR----LGPSESRKWG
310
>>CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 (307 aa)
initn: 1219 init1: 1219 opt: 1235 Z-score: 889.0 bits: 172.7 E(32554): 3.4e-43
Smith-Waterman score: 1235; 58.7% identity (83.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
:. .: . :. ::.:::::. ::. .: .: ::. ::.::.::.. :::: .::: ::
CCDS32 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
::: ::. ::.:.::.:::.::::::: . :::. ::. :.:::::.:: .:.:.:::.
CCDS32 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
:: ::::.::.:. .:: . . :..:.:::::.:::::.:: . ::::::. :::::::
CCDS32 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALSTC
:::...:::::: .::.: .::.::. .. :..:: :: .::::::: :.: :: :::
CCDS32 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPGEARRKAASTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
..:: ::..:::: ::.:.::: ::::: ::. .:..:::::: ::::::... :...
CCDS32 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
: :..
CCDS32 LGRHRLV
>>CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1088 init1: 1088 opt: 1230 Z-score: 885.5 bits: 172.0 E(32554): 5.3e-43
Smith-Waterman score: 1230; 56.7% identity (82.2% similar) in 314 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHL-HTTM
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CCDS32 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQNKVFST
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CCDS32 CASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTAMK
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300 310
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CCDS31 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
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CCDS31 LKRRLVPSERE
310
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CCDS32 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
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CCDS32 ITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASMKK
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.. .
CCDS32 VFNKHIA
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CCDS53 MEMENCTRVKEFIFLGLTQNREVSLVLFLFLLLVYVTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
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CCDS53 FLLHNLSIADICFSSITVPKVLVDLLSERKTISFNHCFTQMFLFHLIGGVDVFSLSVMAL
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CCDS53 VHRVLKLAHTDIFILELLMISNNGLLTTLWFFLLLVSYIVILSLPKSQAGEGRRKAISTC
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CCDS53 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPMDKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNHEMKSAMRR
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CCDS53 LKRRLVPSDRK
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CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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CCDS32 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
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CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
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CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
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CCDS32 RKVVTKYILCEEK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]