Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6057
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6057, 320 aa
  1>>>pF1KE6057 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6881+/-0.00122; mu= 13.4924+/- 0.072
 mean_var=183.0770+/-67.079, 0's: 0 Z-trim(102.9): 480  B-trim: 428 in 1/46
 Lambda= 0.094789
 statistics sampled from 6598 (7180) to 6598 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.221), width:  16
 Scan time:  2.050

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11      ( 320) 2081 297.9   7e-81
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1        ( 325)  839 128.1 9.5e-30
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11      ( 303)  818 125.2 6.7e-29
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1        ( 317)  802 123.0 3.1e-28
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1        ( 312)  799 122.6 4.1e-28
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11       ( 317)  799 122.6 4.1e-28
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6        ( 315)  792 121.6   8e-28
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7       ( 310)  789 121.2 1.1e-27
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1         ( 317)  783 120.4 1.9e-27
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1         ( 314)  781 120.1 2.3e-27
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19        ( 320)  778 119.7   3e-27
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9        ( 311)  777 119.6 3.3e-27
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9       ( 320)  777 119.6 3.4e-27
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19       ( 312)  774 119.2 4.4e-27
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2        ( 312)  773 119.0 4.8e-27
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1        ( 308)  771 118.7 5.8e-27
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9        ( 311)  771 118.7 5.8e-27
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7        ( 310)  770 118.6 6.4e-27
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7       ( 310)  770 118.6 6.4e-27
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2        ( 331)  769 118.5 7.3e-27
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16         ( 312)  765 117.9   1e-26
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11          ( 327)  764 117.8 1.2e-26
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9         ( 313)  763 117.7 1.2e-26
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9       ( 319)  762 117.5 1.4e-26
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9         ( 311)  759 117.1 1.8e-26
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11       ( 315)  758 117.0   2e-26
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9        ( 330)  758 117.0 2.1e-26
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1       ( 335)  758 117.0 2.1e-26
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1        ( 347)  757 116.9 2.3e-26
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19        ( 319)  755 116.6 2.7e-26
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7       ( 310)  753 116.3 3.2e-26
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7        ( 311)  751 116.0 3.9e-26
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321)  751 116.0 3.9e-26
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9       ( 346)  751 116.1 4.1e-26
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1        ( 312)  748 115.6 5.2e-26
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11      ( 314)  748 115.6 5.2e-26
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1       ( 317)  747 115.5 5.7e-26
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9        ( 322)  747 115.5 5.8e-26
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11      ( 314)  746 115.3 6.3e-26
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7        ( 311)  745 115.2 6.9e-26
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19       ( 313)  745 115.2 6.9e-26
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19        ( 319)  743 114.9 8.4e-26
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9       ( 318)  742 114.8 9.2e-26
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14      ( 324)  742 114.8 9.3e-26
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11      ( 310)  739 114.4 1.2e-25
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9         ( 313)  739 114.4 1.2e-25
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9        ( 316)  739 114.4 1.2e-25
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11       ( 309)  738 114.2 1.3e-25
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19      ( 309)  738 114.2 1.3e-25
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17         ( 314)  738 114.2 1.3e-25


>>CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11           (320 aa)
 initn: 2081 init1: 2081 opt: 2081  Z-score: 1565.6  bits: 297.9 E(32554): 7e-81
Smith-Waterman score: 2081; 100.0% identity (100.0% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYIY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 HCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGRA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRNR
              250       260       270       280       290       300

              310       320
pF1KE6 DVKAAITKIMSQDPGCDRSI
       ::::::::::::::::::::
CCDS31 DVKAAITKIMSQDPGCDRSI
              310       320

>>CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1             (325 aa)
 initn: 869 init1: 798 opt: 839  Z-score: 647.6  bits: 128.1 E(32554): 9.5e-30
Smith-Waterman score: 839; 43.7% identity (72.9% similar) in 295 aa overlap (16-310:17-310)

                10        20        30        40        50         
pF1KE6  MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPS
                       : :::.:. : .: :  : :::  ::: :. : ::..:. .. .
CCDS30 MTTIILEVDNHTVTTRFILLGFPTRP-AFQLLFFSIFLATYLLTLLENLLIILAIHSDGQ
               10        20         30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE6 LHKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFI
       ::::::::: .:: :.. ..:.  ::::  ::  :. .::..:. :.:.: .:.:.: ..
CCDS30 LHKPMYFFLSHLSFLEMWYVTVISPKMLVDFLSHDKSISFNGCMTQLYFFVTFVCTEYIL
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE6 LVVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYI
       :..::.:::::::.::.:::.:. :  .:::.. :. .:.  .  .:  .:. : ..  :
CCDS30 LAIMAFDRYVAICNPLRYPVIMTNQLCGTLAGGCWFCGLMTAMIKMVFIAQLHYCGMPQI
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 YHCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGR
        : :::   ....:: :..   .. : .:..:  .:: .:. ::. :::..::: : .::
CCDS30 NHYFCDISPLLNVSCEDASQAEMVDFFLALMVIAIPLCVVVASYAAILATILRIPSAQGR
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE6 AKAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRN
        ::::::.::: ::  .::   ..:.  .     . . . .:.:....:.:::.:: :::
CCDS30 QKAFSTCASHLTVVILFYSMTLFTYARPKLMYAYNSNKVVSVLYTVIVPLLNPIIYCLRN
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320     
pF1KE6 RDVKAAITKIMSQDPGCDRSI     
       ..::::. : .               
CCDS30 HEVKAALRKTIHCRGSGPQGNGAFSS
     300       310       320     

>>CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11           (303 aa)
 initn: 830 init1: 808 opt: 818  Z-score: 632.4  bits: 125.2 E(32554): 6.7e-29
Smith-Waterman score: 818; 43.4% identity (73.1% similar) in 297 aa overlap (19-312:1-294)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
                         ... :::  .   .:. :: .::. :::: ::.....:.: :
CCDS31                   MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPML
                                 10        20        30        40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       :.:::::: ::: :.: :. . :::::. .:  :  .:: .:  :::.:  :  .: :.:
CCDS31 HSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLL
             50        60        70        80        90       100  

              130       140       150       160       170          
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQM---AYNSIA
       ..:::::::::: ::::::.:: .: : :::..:. ..  :. :.:.:. .    . .  
CCDS31 ATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGF--PV-ATVQTTWLFSFPFCGTN
            110       120       130       140          150         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE6 YIYHCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLE
        . : :::   :..  :.::.   ....  ...: ..: ::.: ::.:: :..:.: : .
CCDS31 KVNHFFCDSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAK
     160       170       180       190       200       210         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE6 GRAKAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTL
       :. :::::::::::::. .: :....:   ...   . . . .. :...::.:::.::.:
CCDS31 GKNKAFSTCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSL
     220       230       240       250       260       270         

       300       310       320 
pF1KE6 RNRDVKAAITKIMSQDPGCDRSI 
       :: .:: :... .:.         
CCDS31 RNNEVKNALSRTVSKALALRNCIP
     280       290       300   

>>CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1             (317 aa)
 initn: 781 init1: 755 opt: 802  Z-score: 620.3  bits: 123.0 E(32554): 3.1e-28
Smith-Waterman score: 802; 43.2% identity (72.1% similar) in 294 aa overlap (16-308:12-303)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
                      : :.:.:. :   .: .: .:. .::: :. ::::. ..   :::
CCDS53     MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLL-LFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSL
                   10        20         30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       :.:::::: .:: :.. . ..:.:..:. ::  :  .:. .:. :.:.: ...:.:  .:
CCDS53 HRPMYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLL
          60        70        80        90       100       110     

              130       140        150       160       170         
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNAT-LAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYI
       .:::::::.::: :: :: :: :.. :: :::..: ....  .  ..  ::..: .   :
CCDS53 AVMAYDRYLAICGPLLYPSLM-PSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNII
         120       130        140       150       160       170    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE6 YHCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGR
        : :::   ... .:::     :. : .:.:. .:::: :. ::. :.:..::: . .::
CCDS53 NHFFCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGR
          180       190       200       210       220       230    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE6 AKAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRN
        ::::::..:: ::  ::::  ..:.  ::   .. . . .:.:.:..:..:: :: :::
CCDS53 HKAFSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRN
          240       250       260       270       280       290    

     300       310       320  
pF1KE6 RDVKAAITKIMSQDPGCDRSI  
       ..:: :. :              
CCDS53 KEVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
          300       310       

>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1             (312 aa)
 initn: 815 init1: 768 opt: 799  Z-score: 618.2  bits: 122.6 E(32554): 4.1e-28
Smith-Waterman score: 799; 41.4% identity (70.4% similar) in 297 aa overlap (16-312:12-307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
                      : .::.: : .   . .:...::.::. ..:: ::...:  .  :
CCDS30     MDTGNWSQVAEFIILGFPHL-QGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRL
                   10        20         30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       : ::: :.  ::  .. .:..:.::::. .:   . .:::.::::.:.:.:.  .: ..:
CCDS30 HTPMYHFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLL
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYIY
       ..::::::.:::.:::::.::.:   : .: . :: .:  :.  .   :.. . .   : 
CCDS30 TAMAYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQ
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 HCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGRA
       : :::   :.. .:.::. ..:. : :     .  .::.: :::.:. .:::: :  :. 
CCDS30 HVFCDFPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKR
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRNR
       ::.:::.::. ::  .:.::   ::  . .  ::.     :::..:::.:::.::.:::.
CCDS30 KAISTCASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNK
         240       250       260       270       280       290     

              310       320
pF1KE6 DVKAAITKIMSQDPGCDRSI
       ..: :. . ...        
CCDS30 EIKEAVRRQLKRIGILA   
         300       310     

>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11            (317 aa)
 initn: 799 init1: 777 opt: 799  Z-score: 618.1  bits: 122.6 E(32554): 4.1e-28
Smith-Waterman score: 799; 43.2% identity (72.6% similar) in 296 aa overlap (16-308:12-304)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
                      : :... :::  .   .:. :: .::. : ::.::.....:.: :
CCDS77     MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPML
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       :.:::::: ::: :.: :. . :::::. .:  :  .:: .:  :::.:  :  .: :.:
CCDS77 HSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLL
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170          
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQM---AYNSIA
       ..:::::::::: ::::::.:: .: : :::..:. ..  :. :.:.:. .    . .  
CCDS77 ATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGF--PV-ATVQTTWLFSFPFCGTN
        120       130       140       150          160       170   

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE6 YIYHCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLE
        . : :::   :..  :.::.   ....  ...: ..: ::.: ::..: :..:.: : .
CCDS77 KVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAK
           180       190       200       210       220       230   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE6 GRAKAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTL
       :. :::::::::::::. .: : ...:   ...   . . . .. :...::.:::.::.:
CCDS77 GKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSL
           240       250       260       270       280       290   

       300       310       320 
pF1KE6 RNRDVKAAITKIMSQDPGCDRSI 
       :: .:: :...             
CCDS77 RNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
           300       310       

>>CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6             (315 aa)
 initn: 812 init1: 540 opt: 792  Z-score: 613.0  bits: 121.6 E(32554): 8e-28
Smith-Waterman score: 792; 41.7% identity (73.6% similar) in 295 aa overlap (16-310:14-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
                      : :::. ..::  ::  :..:   :..:..:: ::.::::.   :
CCDS34   MEIVSTGNETITEFVLLGFYDIPELHFL-FFIVFTAVYVFIIIGNMLIIVAVVSSQRL
                 10        20         30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       :::::.:: ::: ::::.:....::::  ::  .  .: ..::::...: :.. .: ..:
CCDS34 HKPMYIFLANLSFLDILYTSAVMPKMLEGFLQ-EATISVAGCLLQFFIFGSLATAECLLL
        60        70        80         90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYIY
       .:::::::.:::.:::::.::.:.    :....::.....   .:. ..:. . .  .: 
CCDS34 AVMAYDRYLAICYPLHYPLLMGPRRYMGLVVTTWLSGFVVDGLVVALVAQLRFCGPNHID
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 HCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGRA
       . .:: .  :  .:::     .  . ...    .:. :.: ::..:...:::. .  .: 
CCDS34 QFYCDFMLFVGLACSDPRVAQVTTLILSVFCLTIPFGLILTSYARIVVAVLRVPAGASRR
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRNR
       .::::::::: :: :.:... : :::  :     .  . ...:...::..::.:::.::.
CCDS34 RAFSTCSSHLAVVTTFYGTLMIFYVAPSAVHSQLLSKVFSLLYTVVTPLFNPVIYTMRNK
        240       250       260       270       280       290      

              310       320
pF1KE6 DVKAAITKIMSQDPGCDRSI
       .:. :. ::.          
CCDS34 EVHQALRKILCIKQTETLD 
        300       310      

>>CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7            (310 aa)
 initn: 799 init1: 776 opt: 789  Z-score: 610.8  bits: 121.2 E(32554): 1.1e-27
Smith-Waterman score: 789; 41.3% identity (72.7% similar) in 293 aa overlap (18-310:13-304)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
                        :::.   : .. : .: .::::: : ::::..::  .  .  :
CCDS43      MESNQTWITEVILLGFQVDP-ALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRL
                    10        20         30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       : ::: :: .:. .:. ....::::::. ...  . .::. :.:: .:. .:. .: .::
CCDS43 HTPMYVFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLIL
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYIY
       :.: :::::::::::.: ..:: .. ..::.. :. ..:: .  ..   .. . .   : 
CCDS43 VMMCYDRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKIN
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 HCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGRA
       : ::. ..: . .:.::  . .. :  .  .   :: :::.::.:::...:::.: ::: 
CCDS43 HFFCQIMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRR
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRNR
       :::::::::: ::: ...:  . :.: ...   . . . .. :....::::::::.::: 
CCDS43 KAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNA
          240       250       260       270       280       290    

              310       320
pF1KE6 DVKAAITKIMSQDPGCDRSI
       .::.:. ...          
CCDS43 EVKGALKRVLWKQRSM    
          300       310    

>>CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1              (317 aa)
 initn: 790 init1: 771 opt: 783  Z-score: 606.3  bits: 120.4 E(32554): 1.9e-27
Smith-Waterman score: 783; 39.7% identity (70.4% similar) in 297 aa overlap (16-312:12-307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
                      : .::. :.  .    .: ..:: ::. . :: ::. ..  . .:
CCDS30     MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGW-LFVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAAL
                   10        20         30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       : ::: :.  :: :.. .:.::.::::: .:   . .::..:::: :.:.:.  :: ..:
CCDS30 HTPMYHFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLL
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYIY
       ..::::::.:::.:::::..:.    : .::. :  ..: ::  :. .::. . .   : 
CCDS30 TAMAYDRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQ
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 HCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGRA
       : :::   ... .:.::. . :. : :   . .. ......::..:...::.:..  :: 
CCDS30 HIFCDFPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRK
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 KAFSTCSSHLLVVGTYYSSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRNR
       ::::::.::: ::  ...:: . ::  . .  : .     .::..:::..::.::.:::.
CCDS30 KAFSTCASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNK
         240       250       260       270       280       290     

              310       320  
pF1KE6 DVKAAITKIMSQDPGCDRSI  
       ..  :: . . :          
CCDS30 EIIKAIKRTIFQKGDKASLAHL
         300       310       

>>CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1              (314 aa)
 initn: 817 init1: 744 opt: 781  Z-score: 604.9  bits: 120.1 E(32554): 2.3e-27
Smith-Waterman score: 781; 40.9% identity (71.6% similar) in 296 aa overlap (16-310:12-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 MDATACNESVDGSPVFYLLGIPSLPETFFLPVFFIFLLFYLLILMGNALILVAVVAEPSL
                      : :::.::  :   : .  .:: .::   .:: ::....  .  :
CCDS41     MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHL-LSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHL
                   10        20         30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 HKPMYFFLINLSTLDILFTTTTVPKMLSLFLLGDRFLSFSSCLLQMYLFQSFTCSEAFIL
       :.:::::: ::. .:: ::.::::.:.  .: : . .::..:: :...: ::.  ....:
CCDS41 HSPMYFFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLL
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VVMAYDRYVAICHPLHYPVLMNPQTNATLAASAWLTALLLPIPAVVRTSQMAYNSIAYIY
        :::::::::::::::: . ::    . :.:. ::.. :  .  .:  .:... .   :.
CCDS41 CVMAYDRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIH
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 HCFCDHLAVVQASCSDTTPQTLMGFCIAMVVSFLPLLLVLLSYVHILASVLRISSLEGRA
       : :::   ..: ::::.. .... : .. .... ::. .:.::  :...::.:.: .:. 
CCDS41 HFFCDLNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQ
         180       190       200       210       220       230     

              250        260       270       280       290         
pF1KE6 KAFSTCSSHLLVVGTYY-SSIAIAYVAYRADLPLDFHIMGNVVYAILTPILNPLIYTLRN
       .: :::: :: ::  .: ..::. .      .: .   .....:....:.:::.::::::
CCDS41 RAVSTCSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMP-ESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRN
         240       250       260        270       280       290    

     300       310       320
pF1KE6 RDVKAAITKIMSQDPGCDRSI
       ::.: .. :..          
CCDS41 RDMKRGLQKMLLKCTVFQQQ 
          300       310     




320 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 09:07:06 2016 done: Tue Nov  8 09:07:07 2016
 Total Scan time:  2.050 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com