FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0929, 385 aa 1>>>pF1KE0929 385 - 385 aa - 385 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4688+/-0.000788; mu= 7.3918+/- 0.048 mean_var=122.1203+/-24.405, 0's: 0 Z-trim(112.5): 31 B-trim: 94 in 1/49 Lambda= 0.116059 statistics sampled from 13209 (13240) to 13209 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.407), width: 16 Scan time: 2.970 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 ( 385) 2643 453.2 1.9e-127 CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 495) 1322 232.0 8.8e-61 CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 372) 1277 224.4 1.3e-58 CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 398) 1277 224.5 1.4e-58 CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 ( 447) 839 151.1 1.8e-36 CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 545) 824 148.7 1.2e-35 CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 546) 816 147.3 3.1e-35 CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 ( 607) 805 145.5 1.2e-34 CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 ( 712) 789 142.9 8.9e-34 CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 602) 787 142.5 9.7e-34 CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 518) 785 142.1 1.1e-33 CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 723) 784 142.0 1.6e-33 CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 468) 769 139.4 6.3e-33 CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 496) 768 139.3 7.4e-33 CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX ( 520) 754 136.9 3.9e-32 CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 ( 436) 744 135.2 1.1e-31 CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (2856) 648 119.5 3.8e-26 CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (3065) 648 119.5 4e-26 CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17 ( 535) 634 116.8 4.5e-26 CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 ( 682) 628 115.9 1.1e-25 CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 705) 586 108.9 1.5e-23 CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 686) 583 108.4 2.1e-23 CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 743) 516 97.2 5.3e-20 CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 377) 489 92.5 6.8e-19 CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 410) 470 89.3 6.6e-18 CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1 ( 448) 470 89.4 7.1e-18 CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 435) 465 88.5 1.2e-17 >>CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 (385 aa) initn: 2643 init1: 2643 opt: 2643 Z-score: 2401.8 bits: 453.2 E(32554): 1.9e-127 Smith-Waterman score: 2643; 100.0% identity (100.0% similar) in 385 aa overlap (1-385:1-385) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSSTGAQAVAEPTGQGPKNP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSSTGAQAVAEPTGQGPKNP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 RVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 RVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 DDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 DDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 NGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 NGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 IASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKASASTSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 IASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKASASTSK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 TPAWLHHQLLPPPEVLLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 TPAWLHHQLLPPPEVLLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQG 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 GLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ ::::::::::::::::::::::::: CCDS31 GLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ 370 380 >>CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 (495 aa) initn: 1309 init1: 1244 opt: 1322 Z-score: 1204.7 bits: 232.0 E(32554): 8.8e-61 Smith-Waterman score: 1325; 58.0% identity (71.2% similar) in 386 aa overlap (6-364:32-411) 10 20 30 pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTT---SSGWEPRLG : : .: : : : .. : CCDS13 HFSTVTRDMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAP 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 pF1KE0 SPFP---SGPCTSSTGA--QAVAEPTGQG---------P--KNPRVSRVTVQLEMKPLWE .: : . : . ..:: .:.::: : : : :: .:. :.:::::: ::. CCDS13 GPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWD 70 80 90 100 110 120 80 90 100 110 120 130 pF1KE0 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLV :::::::::::::::::::: ::::..::: .::: :::::.:.::::::::::::.::: CCDS13 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLV 130 140 150 160 170 180 140 150 160 170 180 190 pF1KE0 AGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF :::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 AGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 pF1KE0 HVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLD :::.::::::::.::.::::.:.: ::.:::::::::::::::::::::::::::. : . 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CCDS13 GPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWD 70 80 90 100 110 120 80 90 100 110 120 130 pF1KE0 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLV :::::::::::::::::::: ::::..::: .::: :::::.:.::::::::::::.::: CCDS13 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLV 130 140 150 160 170 180 140 150 160 170 180 190 pF1KE0 AGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF :::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 AGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 pF1KE0 HVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLD :::.::::::::.::.::::.:.: ::.:::::::::::::::::::::::::::. : . CCDS13 HVVYVDPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPE 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 SWPVAPRP----LLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKASASTSKTPAWLHHQLLPP .:: :: :.:. :::.. .. . ..:.. . .. ... :. : : :: CCDS13 DWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEK----GLVTEGSGLQPGLLDVLLKPP 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE0 PEVLLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGLLS CCDS13 SKKSESLRPPHCKDT 360 370 >>CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 (398 aa) initn: 1266 init1: 1244 opt: 1277 Z-score: 1165.4 bits: 224.5 E(32554): 1.4e-58 Smith-Waterman score: 1282; 58.8% identity (73.3% similar) in 359 aa overlap (6-333:32-390) 10 20 30 pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTT---SSGWEPRLG : : .: : : : .. : CCDS13 HFSTVTRDMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAP 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 pF1KE0 SPFP---SGPCTSSTGA--QAVAEPTGQG---------P--KNPRVSRVTVQLEMKPLWE .: : . : . ..:: .:.::: : : : :: .:. :.:::::: ::. CCDS13 GPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWD 70 80 90 100 110 120 80 90 100 110 120 130 pF1KE0 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLV :::::::::::::::::::: ::::..::: .::: :::::.:.::::::::::::.::: CCDS13 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLV 130 140 150 160 170 180 140 150 160 170 180 190 pF1KE0 AGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF :::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 AGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 pF1KE0 HVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLD :::.::::::::.::.::::.:.: ::.:::::::::::::::::::::::::::. : . CCDS13 HVVYVDPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPE 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 pF1KE0 SWPVAPRP----LLSVPARSHSSLSPCVLKGATDRE----KDPNKASASTSKTPAWLHHQ .:: :: :.:. :::.. .. . ..:.. :: . . .. .:: . CCDS13 DWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKGGHVLKDKEVKAETSRNTPEREVEL 310 320 330 340 350 360 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 LLPPPEV----LLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPL : : :: .: . :.: .: CCDS13 LRDAGGCVNLGLPCPAECQPFNTQGLVAGRTAGDRLC 370 380 390 >>CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 (447 aa) initn: 811 init1: 624 opt: 839 Z-score: 768.3 bits: 151.1 E(32554): 1.8e-36 Smith-Waterman score: 847; 41.4% identity (65.2% similar) in 374 aa overlap (15-376:50-402) 10 20 30 40 pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPL-PTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSS : . :: :: . ..:. :.: .:: CCDS43 IAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTSLDAHGEFGGGSGSSPSSSS 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE0 TGAQAVAEPTGQGPKNPRVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKIL .. . : :.. ...... .:: : ::..:..::::::.::.:::::: ..:.. CCDS43 LCTEPLIPTTPIIPSE-EMAKIACSLETKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFS 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE0 GMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMR :.: : : .:::..:.:.::::::.: :.::::::::: :.:.. ::::: : : .. CCDS43 GVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLK 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 pF1KE0 QIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSE----RYAQENFKSFI :.:::.:.::::: ::..:::::::::.:::: :.. .:: .:.:..:: CCDS43 QMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHII---KKKDHTASLLNLKSEEFRTFI 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 FTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPC : :: :::::::::. ::.::: :::::::::.:. . . . . :. . . :: CCDS43 FPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSRLT-DIERESVESLIQKHSYARSPI 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 VLKGATD------REKDPNKASASTSKTPAWLHHQLLPPPEVLLAPATYRPVTYQSLYSG :. . . ::..:: :.. : . :. .: ::: . CCDS43 RTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVSSSSSF---PGFQHP---QSLTAL 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE0 APSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGL-LSPTVVCLGPGQDSQ . : .: . : :.:. ::.:: . ::. :.:... CCDS43 GTSTASI--ATPIPHPI--------QGSLPPYSRLGMPLTPSAIASSMQGSGPTFPSFHM 370 380 390 400 410 CCDS43 PRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV 420 430 440 >>CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 (545 aa) initn: 621 init1: 395 opt: 824 Z-score: 753.4 bits: 148.7 E(32554): 1.2e-35 Smith-Waterman score: 824; 39.9% identity (63.2% similar) in 378 aa overlap (13-374:16-381) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSST---GAQAVAEPTG ::. . ..... :: :..: :: .: ::..:: .. CCDS11 MLQDKGLSESEEAFRAPGPALGEASAANAPEPALAAPGLSGAALGSPPGPGADVVAAAAA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 QGPKNPRVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALL . . . : :. : ::..:.. :::::.::::::::: ..::. ::. . : :: CCDS11 E----QTIENIKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIITKAGRRMFPSYKVKVTGMNPKTKYILL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 MDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLT .:..: ::.::. : .. :.:::::.:: :::.. :::::: ::.::::.:::.::::: CCDS11 IDIVPADDHRYK--FCDNKWMVAGKAEPAMPGRLYVHPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 NNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSERYAQEN--FKSFIFTETQFTAVTAYQ :: :: :::::::::.::::.:.: .: ... ....: : . .: ::.: .::.:: CCDS11 NNHLDPFGHIILNSMHKYQPRLHIVKAD---ENNAFGSKNTAFCTHVFPETSFISVTSYQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 NHRITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPN ::.:::::: .:::::::: :: .. :: :. :.: . ... . : . CCDS11 NHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDSDLRVARLQSKEYPVISKSIMRQRLISPQLSATPDVG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE0 KASASTSKTPAWLH----HQLLPPPEVLLAPATYRPVTYQS-LY------SGAPSHLGIP .. . . : :. : :. : : . :. .: :. . :: .: CCDS11 PLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAEPQDL--PLSTFPTQRDSSLFYHCLKRRDGTRHLDLP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 RTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ : . :. .. : : .:::. CCDS11 CKR-SYLEAPSSVGEDHYFRSPPPYDQQMLSPSYCSEVTPREACMYSGSGPEIAGVSGVD 350 360 370 380 390 400 CCDS11 DLPPPPLSCNMWTSVSPYTSYSVQTMETVPYQPFPTHFTATTMMPRLPTLSAQSSQPPGN 410 420 430 440 450 460 >>CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 (546 aa) initn: 834 init1: 393 opt: 816 Z-score: 746.1 bits: 147.3 E(32554): 3.1e-35 Smith-Waterman score: 825; 40.3% identity (63.7% similar) in 377 aa overlap (13-374:16-382) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSST---GAQAVAEPTG ::. . ..... :: :..: :: .: ::..:: .. CCDS82 MLQDKGLSESEEAFRAPGPALGEASAANAPEPALAAPGLSGAALGSPPGPGADVVAAAAA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 QGPKNPRVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALL . . . : :. : ::..:.. :::::.::::::::: ..::. ::. . : :: CCDS82 E----QTIENIKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIITKAGRRMFPSYKVKVTGMNPKTKYILL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 MDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLT .:..: ::.::. : .. :.:::::.:: :::.. :::::: ::.::::.:::.::::: CCDS82 IDIVPADDHRYK--FCDNKWMVAGKAEPAMPGRLYVHPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 NNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSERYAQEN--FKSFIFTETQFTAVTAYQ :: :: :::::::::.::::.:.: .: ... ....: : . .: ::.: .::.:: CCDS82 NNHLDPFGHIILNSMHKYQPRLHIVKAD---ENNAFGSKNTAFCTHVFPETSFISVTSYQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 NHRITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPN ::.:::::: .:::::::: :: .. :: :. :.: . ... . : . CCDS82 NHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDSDLRVARLQSKEYPVISKSIMRQRLISPQLSATPDVG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE0 KASASTSKTPAWLHH-----QLLPPPEVLLAP-ATYRPVT--YQSLYSGAPS--HLGIPR .. . . :. :: : .. :. : : . :. : : . :: .: CCDS82 PLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAEPQDLPLSTFPTQRDSSLFYHCLKRRADGTRHLDLPC 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 pF1KE0 TRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ : . :. .. : : .:::. CCDS82 KR-SYLEAPSSVGEDHYFRSPPPYDQQMLSPSYCSEVTPREACMYSGSGPEIAGVSGVDD 360 370 380 390 400 410 CCDS82 LPPPPLSCNMWTSVSPYTSYSVQTMETVPYQPFPTHFTATTMMPRLPTLSAQSSQPPGNA 420 430 440 450 460 470 >>CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 (607 aa) initn: 783 init1: 622 opt: 805 Z-score: 735.5 bits: 145.5 E(32554): 1.2e-34 Smith-Waterman score: 820; 45.1% identity (67.6% similar) in 324 aa overlap (33-330:109-425) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 AFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPS-GPCTSSTGAQAVAEPTGQGPKNPR ::. : : ... :...:.: : .:. CCDS34 AGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKGSPARSLARPGTPLP-SPQ 80 90 100 110 120 130 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 VSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLD . : :.:. ::..:...:::::.::::::::: ..::: :.: .: . ::..:.: CCDS34 APR--VDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLDPHQQYYIAMDIVPVD 140 150 160 170 180 190 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 DKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDN .:::::..::: :.:::.:: .: ::..::::::.: ::::..:::::::::: :::. CCDS34 NKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSPASGETWMRQVISFDKLKLTNNELDDQ 200 210 220 230 240 250 190 200 210 220 230 pF1KE0 GHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKD----SERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRIT :::::.:::.:::: ::. : : . . :. :.: : :: ::.::::::..:: CCDS34 GHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFPETVFTTVTAYQNQQIT 260 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 pF1KE0 QLKIASNPFAKGFRESDLDS------------WPVAPRPLL-----SVPARSHSSLSPCV .::: ::::::::.: . : . : : ..: ....: : . CCDS34 RLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFEDIPGIPKQGNAS-SSTL 320 330 340 350 360 370 290 300 310 320 330 pF1KE0 LKGATDR--EKDPNKASASTSKTPAWLHHQLLPPPEVL--LAPATYRPVTYQSLYSGAPS :.:. . :. :.:. ..::. .: : : :::: : . ..: CCDS34 LQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAF---HLGPNTSQLCSLAPADYSACARSGLTLNRYS 380 390 400 410 420 430 340 350 360 370 380 pF1KE0 HLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ CCDS34 TSLAETYNRLTNQAGETFAPPRTPSYVGVSSSTSVNMSMGGTDGDTFSCPQTSLSMQISG 440 450 460 470 480 490 >>CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 (712 aa) initn: 571 init1: 365 opt: 789 Z-score: 719.9 bits: 142.9 E(32554): 8.9e-34 Smith-Waterman score: 795; 40.0% identity (59.7% similar) in 385 aa overlap (1-365:26-382) 10 20 30 pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPF :.:::.:. . :. . : : . . .: : .: CCDS11 MREPALAASAMAYHPFHAPRPADFPMSAFLAAAQPSFFPALALP-PGALA--KP-LPDPG 10 20 30 40 50 40 50 60 70 pF1KE0 PSGPCTSSTGAQAVAEP----TGQGPKNPRVSRVT---------------VQLEMKPLWE .: .....: :.:: .. ::. : . . : :: : ::. CCDS11 LAGAAAAAAAAAAAAEAGLHVSALGPHPPAAHLRSLKSLEPEDEVEDDPKVTLEAKELWD 60 70 80 90 100 110 80 90 100 110 120 130 pF1KE0 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLV .:..:::::..::.::::::::.:.. :.:. : : ::::.. :: ::. ::.: :.: CCDS11 QFHKLGTEMVITKSGRRMFPPFKVRVSGLDKKAKYILLMDIVAADDCRYK--FHNSRWMV 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE0 AGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF :::::: : :...:::::: : ::: . :.: :::::::. : .: ::::::.::::: CCDS11 AGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMAKPVAFHKLKLTNNISDKHGFTILNSMHKYQPRF 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE0 HVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLD :.: .. : . .:....: ::.: ::::::: .:::::: .:::::::: : CCDS11 HIVRAN---DILKLPYSTFRTYVFPETDFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFAKGFR--DTG 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE0 SWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKASASTSKTPAWLHHQLLPPPEVL . : :..: :: . . :.: ...::. : . :: CCDS11 NGRREKRKQLTLP-----SLR--LYEEHCKPERDGAESDASSCDPPPARE----PPTSPG 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KE0 LAPATYRPVTYQSLYSG-APSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGLLSPTV ::. : :. . : . . : : : . :: : : : CCDS11 AAPSPLR------LHRARAEEKSCAADSDPEPERLSEERAGAPLGRSPAPDSASPTRLTE 340 350 360 370 380 390 380 pF1KE0 VCLGPGQDSQ CCDS11 PERARERRSPERGKEPAESGGDGPFGLRSLEKERAEARRKDEGRKEAAEGKEQGLAPLVV 400 410 420 430 440 450 >>CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 (602 aa) initn: 789 init1: 624 opt: 787 Z-score: 719.2 bits: 142.5 E(32554): 9.7e-34 Smith-Waterman score: 808; 42.8% identity (65.9% similar) in 320 aa overlap (16-322:65-382) 10 20 30 40 pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSSTG : .: :.: . .. . : :. :: CCDS81 WEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTEDAAAHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTS--CSFSTH 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE0 AQAVAEPTGQGPKN-PRVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILG .. .. .: : . .. :.:. ::..:...:::::.::::::::: ..::: : CCDS81 TDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITG 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE0 MDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQ .: .: . ::..:.:.:::::..::: :.:::.:: .: ::..:::: :.: :::: CCDS81 LDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQ 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE0 IVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKD----SERYAQENFKSFIF .::::::::::: :::.:::::.:::.:::: ::. : .: . . .. :.: : CCDS81 VVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNF 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 pF1KE0 TETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAP----RPLLSVPARSHSSL :: ::.::::::..::.::: ::::::::.: . . . :.:. . CCDS81 PETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFE 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 SPCVLKGATDREKDPNKASAST-SKTPAWLHHQLLP---PPEVLLAPATYRPVTYQSLYS . ... . ...:: . .:. : : : :: ::: :. CCDS81 DFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLC 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 pF1KE0 GAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ CCDS81 NLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPT 400 410 420 430 440 450 385 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 02:23:26 2016 done: Sun Nov 6 02:23:26 2016 Total Scan time: 2.970 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]