FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5394, 309 aa 1>>>pF1KE5394 309 - 309 aa - 309 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0316+/-0.000576; mu= 17.6642+/- 0.036 mean_var=107.7935+/-28.373, 0's: 0 Z-trim(106.9): 275 B-trim: 891 in 1/49 Lambda= 0.123532 statistics sampled from 14622 (15005) to 14622 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.496), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16 Scan time: 5.050 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1070 202.3 1e-51 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1000 189.8 6e-48 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 986 187.3 3.3e-47 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 949 180.7 3.2e-45 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 949 180.7 3.2e-45 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 949 180.7 3.3e-45 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 906 173.1 6.6e-43 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 906 173.1 6.6e-43 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 906 173.1 6.6e-43 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 889 170.0 5.4e-42 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 878 168.1 2.1e-41 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 857 164.3 2.8e-40 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 839 161.1 2.6e-39 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 823 158.3 1.8e-38 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 812 156.3 7.5e-38 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 811 156.1 8.2e-38 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 804 154.9 1.9e-37 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 797 153.6 4.6e-37 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 790 152.4 1.1e-36 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 781 150.8 3.3e-36 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 549 109.5 9.4e-24 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 502 101.1 3.2e-21 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 214 49.8 9.4e-06 NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 207 48.5 2.2e-05 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 204 47.9 3e-05 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 204 48.0 3.2e-05 NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 196 46.6 8.7e-05 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 192 45.9 0.00015 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 192 45.9 0.00015 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 187 44.9 0.00025 NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 177 43.4 0.0011 XP_011530319 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 445) 171 42.3 0.0022 NP_001304021 (OMIM: 602001) neuropeptide Y recepto ( 445) 171 42.3 0.0022 NP_001304020 (OMIM: 602001) neuropeptide Y recepto ( 445) 171 42.3 0.0022 NP_006165 (OMIM: 602001) neuropeptide Y receptor t ( 445) 171 42.3 0.0022 XP_005263095 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 445) 171 42.3 0.0022 XP_016863744 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 171 42.3 0.0022 XP_011530317 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 171 42.3 0.0022 XP_016863745 (OMIM: 602001) PREDICTED: neuropeptid ( 452) 171 42.3 0.0022 XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 168 41.5 0.0026 XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 168 41.6 0.0027 XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 168 41.6 0.0029 XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 168 41.6 0.0029 XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 168 41.7 0.003 NP_444508 (OMIM: 606927) trace amine-associated re ( 342) 167 41.4 0.0031 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 167 41.4 0.0031 NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 168 41.7 0.0031 XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 165 41.1 0.0042 NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 165 41.1 0.0042 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 164 40.9 0.0048 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 1115 init1: 1042 opt: 1070 Z-score: 1049.3 bits: 202.3 E(85289): 1e-51 Smith-Waterman score: 1070; 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NP_003 LANVISRKRTSSFL 310 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 1014 init1: 994 opt: 1000 Z-score: 981.8 bits: 189.8 E(85289): 6e-48 Smith-Waterman score: 1000; 47.7% identity (80.6% similar) in 304 aa overlap (3-306:7-310) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTP : : ::.:::::. . ::::: ::..: .: . : ::.:.:::: .: :.:: NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 MYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASM :::::::::.::. : : ..::....:: .: ::: .::.:..:: ..: .:...::.: NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 AYDRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFF :::::.:.:.:: ::..:. .. : . ::. : ... : . : :..: .:...::: NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CDVPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKAL ::.: .. :::.: .: .: ..: .. ...:.:::.::....::..: .:..:.. NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 STCASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQ ::::::.:.:... ::..::: .:: .: .:::. ::::...::.:::..:::::..:. NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK 250 260 270 280 290 300 300 pF1KE5 NAFKKVLRRQKFL .: .:::: . 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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQN :::::.::::.:: . ::.::. ::. : . :..:::::...::::::..:::::.:... NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD 250 260 270 280 290 300 300 pF1KE5 AFKKVLRRQKFL :.:.. .:. 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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 MDSCLHTPMYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATV .::::::::::::::::.::. .: ...::..:. . ..::. .: .::.: .. . XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 ENYLLASMAYDRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCK .:.::: ::::...:::.:::::. :: .. : :. : .: . ::. .: . :::: XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 SNLVHHFFCDVPAVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHS .: . :::::: .. ::::: : .:::.. ... .. .: :. ::. : :.::. : XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 AKGHQKALSTCASHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVY .::. ::.:::.::...: .::.:.: .:..: :::: . : ::.:.:... ::::: .: XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY 250 260 270 280 290 300 290 300 pF1KE5 SLRNREVQNAFKKVLRRQKFL ::::: ...:.:::. : : XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 310 320 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 915 init1: 890 opt: 906 Z-score: 891.3 bits: 173.1 E(85289): 6.6e-43 Smith-Waterman score: 906; 45.7% identity (78.1% similar) in 302 aa overlap (2-303:4-305) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMY .: : :..::::::.: . .. ::.:: .:..:. :: ..::: .:: :::::: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAY :::.:::::: .:...:.:...: :: :.: ...::.:.:: .::. .: ::: ::: NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCD :::.::: :.:.. : ... : ::. :.: ::... . . :.: .:..... :. :. 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