Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5394, 309 aa
1>>>pF1KE5394 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6129+/-0.00132; mu= 13.9970+/- 0.078
mean_var=146.6945+/-47.422, 0's: 0 Z-trim(101.2): 376 B-trim: 761 in 2/47
Lambda= 0.105893
statistics sampled from 5963 (6430) to 5963 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.524), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 1.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 2020 321.3 6.1e-88
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1591 255.7 3.3e-68
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1533 246.9 1.5e-65
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1484 239.4 2.7e-63
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1400 226.5 2e-59
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1118 183.5 1.8e-46
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1077 177.2 1.4e-44
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1070 176.1 3e-44
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1066 175.5 4.5e-44
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1065 175.4 5.1e-44
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1061 174.8 8.2e-44
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1057 174.1 1.2e-43
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1055 173.8 1.5e-43
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1052 173.4 2e-43
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1050 173.1 2.5e-43
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1038 171.3 9.1e-43
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1038 171.3 9.7e-43
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1036 171.0 1.2e-42
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1035 170.8 1.2e-42
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1031 170.2 1.9e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1029 169.9 2.3e-42
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1028 169.7 2.5e-42
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1024 169.1 3.9e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1018 168.2 7.6e-42
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1010 167.0 1.7e-41
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1009 166.8 1.9e-41
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1002 165.7 4e-41
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1001 165.6 4.6e-41
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1000 165.4 5e-41
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 998 165.1 6.1e-41
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 995 164.8 9.1e-41
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 989 163.8 1.6e-40
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 987 163.5 2e-40
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 986 163.3 2.2e-40
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 981 162.5 3.7e-40
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 977 161.9 5.8e-40
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 976 161.8 6.3e-40
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 974 161.5 7.8e-40
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 969 160.7 1.3e-39
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 968 160.5 1.5e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 967 160.4 1.6e-39
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 966 160.3 1.9e-39
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 964 159.9 2.2e-39
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 963 159.8 2.5e-39
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 957 158.9 4.7e-39
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 956 158.7 5.2e-39
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 955 158.6 5.8e-39
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 953 158.3 7.2e-39
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 952 158.1 8.1e-39
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 951 158.0 8.9e-39
>>CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 2020 init1: 2020 opt: 2020 Z-score: 1692.3 bits: 321.3 E(32554): 6.1e-88
Smith-Waterman score: 2020; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCDVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCDVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALSTCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNAFK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KVLRRQKFL
:::::::::
CCDS31 KVLRRQKFL
>>CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1617 init1: 1591 opt: 1591 Z-score: 1338.0 bits: 255.7 E(32554): 3.3e-68
Smith-Waterman score: 1591; 76.9% identity (91.9% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMYFF
::: ::::.:::::::. :::.:::: : :::..:: ::::...::. :::::.:::::
CCDS31 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAYDR
::::::::: ::::::: :::::: ::::::::::.::..:::.:::::::::::::::
CCDS31 LSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCDVP
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CCDS31 YAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALSTCA
:::.:::::.: ::..:... :::::..::::.::: ::::::::::::. .:: :::::
CCDS31 AVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNAFK
::: ::..::::.::.:::::::::::::::: :::.:.::::::.::::::.::..:::
CCDS31 SHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KVLRRQKFL
::... :.
CCDS31 KVVEKAKLSVGWSV
310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1590 init1: 1533 opt: 1533 Z-score: 1290.2 bits: 246.9 E(32554): 1.5e-65
Smith-Waterman score: 1533; 73.3% identity (91.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMYFF
::: ::::.:::.:::. :::::::::.: ::::.:: :::::. :::.:::::::::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAYDR
::::::::::::::::::::.::: ::: : :::::.:.:::::. :.:..:::::::::
CCDS31 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCDVP
:::.:::::::::::..: ::::.:::.:::::::.: :. : ::::.::.:.:::::.:
CCDS31 YAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALSTCA
...:::::.. ::... :. .:: .: .:::.::::::::::.::.: .:.:::.::::
CCDS31 PLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNAFK
::.::::.:::: ::.::.:.::: : ::::::::::..::::::.::::::.::..:::
CCDS31 SHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KVLRRQKFL
:.. . :
CCDS31 KTVGKAKASIGFIF
310
>>CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1517 init1: 1484 opt: 1484 Z-score: 1249.7 bits: 239.4 E(32554): 2.7e-63
Smith-Waterman score: 1484; 71.1% identity (91.9% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMYFF
::: :::..:::::::..::::.::::.::.:::.:: :::::..:::.:: ::::::::
CCDS31 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAYDR
::::::. .::::::::::..:.: ::.:::.:::.:::: ...::::::::.::::::
CCDS31 LSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCDVP
:::::.:::::::::. : ::::.: :: ::::::..:: : :::: ::..:::::: :
CCDS31 YAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCDKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALSTCA
::..:.::.:: ::.:::..::::.::.::: .::::::.::::: :..::.:: ::::.
CCDS31 AVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLSTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNAFK
::. :. .:: :::..:..:::::::::::.:::::.::::::.:.::.:::..:.:::
CCDS31 SHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNAFM
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KVLRRQKFL
::... :.
CCDS31 KVVEKAKYSLDSVF
310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1425 init1: 913 opt: 1400 Z-score: 1180.4 bits: 226.5 E(32554): 2e-59
Smith-Waterman score: 1400; 68.2% identity (90.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMYFF
::: ::::.:::::::. :.:::::.. : ::::.:: :: :::..: :: ::::::::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAYDR
::::::::.::::::.::..:.. :::.:::..::.:.::::..:::: ::::::::::
CCDS31 LSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCDVP
.::::.::::::::::.: : :: :::: ::::::.: .: : :::: :: ..:::::.:
CCDS31 HAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALSTCA
..:::::: . :... ::...::.::.::::.:::.:: ::: .::::.:..:..::::
CCDS31 PLLALSCSDTRISKLV-VFVAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFSTCA
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNAFK
::.::.:.::::.::.::::.::.:.::::.:::::...::::::..:::::.::..:.
CCDS31 SHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSALW
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KVLRRQKFL
:.: .
CCDS31 KILNKLYPQY
300
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1157 init1: 1116 opt: 1118 Z-score: 947.6 bits: 183.5 E(32554): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 1118; 55.1% identity (83.3% similar) in 305 aa overlap (3-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMY
:::..:.:::.:::. ::..:::.:: :::.:. ::::..::: :. :.::::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAY
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
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