FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6080, 324 aa 1>>>pF1KE6080 324 - 324 aa - 324 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2123+/-0.000608; mu= 16.3773+/- 0.038 mean_var=93.0846+/-23.923, 0's: 0 Z-trim(105.5): 298 B-trim: 1655 in 2/46 Lambda= 0.132934 statistics sampled from 13219 (13649) to 13219 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.484), E-opt: 0.2 (0.16), width: 16 Scan time: 5.250 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1049 212.4 1e-54 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 998 202.6 8.8e-52 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 964 196.1 8e-50 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 964 196.1 8e-50 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 964 196.1 8.2e-50 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 934 190.3 4.3e-48 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 904 184.6 2.3e-46 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 885 181.0 2.9e-45 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 867 177.5 3.2e-44 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 867 177.5 3.2e-44 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 867 177.5 3.2e-44 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 866 177.3 3.6e-44 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 866 177.3 3.6e-44 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 851 174.4 2.7e-43 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 846 173.5 5.2e-43 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 840 172.3 1.2e-42 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 829 170.2 5e-42 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 827 169.8 6.5e-42 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 814 167.3 3.7e-41 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 812 166.9 4.7e-41 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 492 105.6 1.4e-22 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 487 104.6 2.8e-22 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 198 49.2 1.3e-05 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 198 49.2 1.5e-05 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 188 47.3 5.2e-05 NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458) 187 47.3 7.5e-05 NP_001243689 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine re ( 458) 187 47.3 7.5e-05 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 180 45.8 0.00016 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 180 45.9 0.0002 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 178 45.5 0.00024 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 171 44.0 0.00051 NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 169 43.7 0.0007 NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 169 43.7 0.0007 NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 170 44.0 0.00071 NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 169 43.7 0.00074 NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 169 43.7 0.00074 NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 169 43.7 0.00074 XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 170 44.0 0.00079 NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 168 43.6 0.00088 NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 166 43.1 0.00097 NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 166 43.1 0.00097 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 166 43.1 0.0011 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 166 43.1 0.0011 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 165 42.9 0.0011 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 163 42.5 0.0014 XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 161 42.1 0.0019 NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 162 42.4 0.002 NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 161 42.2 0.0022 NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 159 41.9 0.0032 NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 157 41.4 0.0034 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 1073 init1: 1045 opt: 1049 Z-score: 1103.5 bits: 212.4 E(85289): 1e-54 Smith-Waterman score: 1049; 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NP_003 LANVISRKRTSSFL 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 975 init1: 920 opt: 964 Z-score: 1015.5 bits: 196.1 E(85289): 8e-50 Smith-Waterman score: 964; 46.3% identity (76.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPMY :. .: :. :.: :.. .:. : : :: .::.:::::: .: ..::. :::::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 YFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMAY .:::.:.:::.:.: . .:::..: ..: .:: : .: ::. . . :. . :::: ::: XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD ..::.: ::::.. :....: ::: .. . : .:.::.. :..:. : :.::.:: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIST :.: :::::::..:..:.. ... ::. .:.::. : ..:.. ::.:. ::.:: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKDA ::::...: .::.:.: .:..: :.:: . : ::.:.:::: :::::.::::::. .: : XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY ::.. . XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 975 init1: 920 opt: 964 Z-score: 1015.5 bits: 196.1 E(85289): 8e-50 Smith-Waterman score: 964; 46.3% identity (76.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPMY :. .: :. :.: :.. .:. : : :: .::.:::::: .: ..::. :::::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 YFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMAY .:::.:.:::.:.: . .:::..: ..: .:: : .: ::. . . :. . :::: ::: NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD ..::.: ::::.. :....: ::: .. . : .:.::.. :..:. : :.::.:: NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIST :.: :::::::..:..:.. ... ::. .:.::. : ..:.. ::.:. ::.:: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKDA ::::...: .::.:.: .:..: :.:: . : ::.:.:::: :::::.::::::. .: : NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY ::.. . NP_036 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 975 init1: 920 opt: 964 Z-score: 1015.3 bits: 196.1 E(85289): 8.2e-50 Smith-Waterman score: 964; 46.3% identity (76.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:11-317) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIK :. .: :. :.: :.. .:. : : :: .::.:::::: .: .. XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 IDTRLHTPMYYFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMIT ::. ::::::.:::.:.:::.:.: . .:::..: ..: .:: : .: ::. . . :. XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 ECFLLASMAYGRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCG . :::: ::: ..::.: ::::.. :....: ::: .. . : .:.::.. :..:. XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 PNLINHFYCDDLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRS : :.::.:: :.: :::::::..:..:.. ... ::. .:.::. : ..:.. : XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TQGQHKAISTCGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIY :.:. ::.::::::...: .::.:.: .:..: :.:: . : ::.:.:::: :::::.:: XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 SLRNKEVKDASKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY ::::. .: : ::.. . XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 310 320 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 967 init1: 925 opt: 934 Z-score: 984.4 bits: 190.3 E(85289): 4.3e-48 Smith-Waterman score: 934; 45.2% identity (75.7% similar) in 305 aa overlap (5-309:6-310) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPM :: .: ::: :... :.. : .:::::.... ::.::.::..:..::::: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YYFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMA :.:::.:.:.:.:: :. .:::. :.. :..:: : .: : : :. ..: :...:: NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YGRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYC : ::.:::.:: ::..:: .:. .: :. .. ..::. ..: .:: :.: ::.: NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 DDLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIS : .: :::.:: . ... .. : :.:. ... :: .: .:..: :..:. ::.. NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKD ::.::...:..:: . ::.::. .:. : . :..:::::::::::::::::::::::.:: NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 ASKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY : :. . : NP_001 ALKRLQKRKCC 310 >>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa) initn: 870 init1: 707 opt: 904 Z-score: 953.3 bits: 184.6 E(85289): 2.3e-46 Smith-Waterman score: 904; 45.5% identity (75.9% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-301) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPMY : ..: :: :.: :... :. . : :.: .::::::::: ::.:...:..:::::: NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 YFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMAY .:: .:...:::.:. :.:. .:... ....: : ::..: .:: : :.: ::: :.: NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD ::::::.::.: ..:. .::.::.. . ..::.. :.. .:: : : : : ::.:. NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIST .: :. .::: .:. :: .. .. ..:.:: ::.......:: :. ::.:: NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKDA ::::...: .:::. :. :. ::: : . .: .::::..: :::::::::::::.:: : NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY .: NP_003 LRKVATRNFP 300 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 876 init1: 848 opt: 885 Z-score: 933.5 bits: 181.0 E(85289): 2.9e-45 Smith-Waterman score: 885; 45.7% identity (75.2% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-308) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRP-ELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKI-DTRLHTP :: : .. ::: .... : :.:. : .::.:::::. :: .:: :. . : ::.: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGN-SLIILVTLADPMLHSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 MYYFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASM ::.:: .:.:... .. .:.:::. ..... .:: : .::::. .:. : ..::::::.: NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AYGRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFY :: ::::::::::: ..:..:. .:.:. .. .: :: .:. : . .:: : .:::. 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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 DLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIST : . :.: :: .:. :.. . ... .:: ::: ::..::.:.: .:..::. : NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKDA :.::...:.. ::. :: :.::.:. :. .:. ::::... :::::.:::::::::: : NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY .: : : NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 897 init1: 855 opt: 867 Z-score: 914.8 bits: 177.5 E(85289): 3.2e-44 Smith-Waterman score: 867; 43.0% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPMY :. : .:. ::: :... . .. : .:::.:.:::::: .. ::..:.::::::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 YFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMAY .::..:..::. :.....:.....:..:...:::..::.:: . :.. : ::: ::: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD ::::.:. :.::..: .: .:. . .. .:. . .:.:::.: .: ..:.:. :. 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