FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5944, 312 aa 1>>>pF1KE5944 312 - 312 aa - 312 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6145+/-0.000594; mu= 19.9526+/- 0.037 mean_var=115.9823+/-32.872, 0's: 0 Z-trim(105.0): 379 B-trim: 760 in 1/50 Lambda= 0.119091 statistics sampled from 12735 (13226) to 12735 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.467), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16 Scan time: 5.770 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 998 183.6 4.5e-46 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 981 180.7 3.4e-45 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 903 167.3 3.7e-41 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 903 167.3 3.7e-41 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 903 167.3 3.8e-41 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 874 162.3 1.2e-39 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 872 161.9 1.5e-39 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 839 156.3 7.6e-38 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 839 156.3 7.6e-38 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 830 154.7 2.2e-37 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 830 154.7 2.2e-37 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 830 154.7 2.2e-37 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 817 152.5 1e-36 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 817 152.5 1.1e-36 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 811 151.4 2.1e-36 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 807 150.8 3.4e-36 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 777 145.6 1.2e-34 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 739 139.1 1.1e-32 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 738 138.9 1.3e-32 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 718 135.4 1.3e-31 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 528 102.8 9.3e-22 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 506 99.1 1.3e-20 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 196 45.8 0.00014 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 196 45.9 0.00015 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 196 46.0 0.00016 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 195 45.8 0.00018 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 189 44.6 0.00031 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 189 44.7 0.00034 NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 186 44.2 0.00049 XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 185 43.9 0.00049 NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 185 43.9 0.00049 NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 185 43.9 0.00049 NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 186 44.2 0.0005 NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 186 44.2 0.00051 NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 186 44.2 0.00051 NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 186 44.2 0.00052 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 185 43.9 0.00052 NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 186 44.3 0.00054 XP_016884926 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 185 44.0 0.00056 XP_006724702 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 185 44.0 0.00056 NP_005287 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid rec ( 370) 185 44.0 0.00056 XP_005262183 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 185 44.0 0.00056 XP_016884927 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 185 44.0 0.00056 NP_001264929 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid ( 370) 185 44.0 0.00056 NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 184 43.8 0.0006 NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 184 43.8 0.0006 NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 184 43.8 0.00062 NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 184 43.8 0.00062 XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 184 43.8 0.00062 NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 184 43.9 0.00065 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 1024 init1: 699 opt: 998 Z-score: 948.1 bits: 183.6 E(85289): 4.5e-46 Smith-Waterman score: 998; 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XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 932 init1: 610 opt: 903 Z-score: 859.7 bits: 167.3 E(85289): 3.8e-41 Smith-Waterman score: 903; 45.2% identity (76.2% similar) in 303 aa overlap (1-302:11-313) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTK : : ..:.::.: :.. . : ::..:: .:. .:.::: .:. .. XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LDSRLQTPMYFFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGS .:: :.::::::: .:.:.:. .: :. ::::.: ... . ::. : ::. : ..:. XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 ELFILSAMSYDRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCG . :.:..:.::..::.:.:: ::. :....: .::: .. .. :: :. . ::::. 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NP_003 LRKVATRNFP 300 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 863 init1: 594 opt: 872 Z-score: 831.1 bits: 161.9 E(85289): 1.5e-39 Smith-Waterman score: 872; 44.3% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (5-308:6-310) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPM :.: .. ::: :..:. .. ::..::.::. :. ::..::: ..::.:.::: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMS :::: .:.:.:. : ... :::: :.. ... :.. : : .: .. :: ...::. 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NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 806 init1: 544 opt: 830 Z-score: 792.0 bits: 154.7 E(85289): 2.2e-37 Smith-Waterman score: 830; 43.6% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-306) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY : : : :.:::: :... . .. ::.:::..::..:.:: ...: .:::::.:::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY ::: .:...:..:.:.: :..:..:..... : . ::.:: : :.. : :. .:..:.: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKI-FTLSFCGYNVISHFYC :::::.:. : :..:: .: : :: ::: : : : : .: . :.:. : XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARL-AITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DSLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNS-AGRQKAFS . : .. : : .: :. :.. . . :.. . .:::::. :. .::...: ::.::: XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKY ::..::::: . ::. .: :.::.:: : .:. :.::... :::::.:::::::.:: XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 ALRRT-WNNLCNIFV : .. : XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT 300 310 312 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:10:33 2016 done: Tue Nov 8 08:10:34 2016 Total Scan time: 5.770 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]