FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5925, 311 aa 1>>>pF1KE5925 311 - 311 aa - 311 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2712+/-0.000665; mu= 16.3557+/- 0.041 mean_var=111.8623+/-31.022, 0's: 0 Z-trim(105.0): 297 B-trim: 890 in 1/47 Lambda= 0.121264 statistics sampled from 12830 (13250) to 12830 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.475), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16 Scan time: 5.850 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1130 209.6 6.6e-54 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 997 186.4 6.6e-47 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 967 181.1 2.5e-45 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 937 175.9 9.7e-44 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 936 175.7 1.1e-43 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 936 175.7 1.1e-43 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 936 175.7 1.1e-43 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 911 171.3 2.3e-42 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 911 171.3 2.3e-42 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 911 171.3 2.3e-42 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 910 171.1 2.5e-42 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 887 167.1 4.2e-41 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 866 163.4 5.3e-40 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 857 161.8 1.5e-39 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 854 161.3 2.2e-39 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 846 159.9 5.9e-39 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 828 156.8 5.3e-38 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 827 156.6 5.9e-38 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 813 154.1 3.2e-37 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 790 150.1 5.2e-36 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 561 110.1 6.1e-24 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 540 106.4 7.9e-23 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 230 52.3 1.9e-06 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 230 52.3 1.9e-06 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 226 51.5 2.7e-06 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 222 50.8 4.6e-06 NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 212 49.1 1.6e-05 XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 212 49.1 1.6e-05 NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 212 49.1 1.7e-05 XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05 XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05 XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05 XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05 XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05 NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 200 46.9 6.4e-05 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 200 47.0 6.7e-05 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 199 46.8 7.1e-05 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 193 45.7 0.00014 NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 193 45.7 0.00015 NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 193 45.7 0.00015 NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 192 45.7 0.0002 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 188 44.9 0.00028 NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 189 45.1 0.00028 NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 184 44.2 0.00051 XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 184 44.2 0.00051 NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 183 44.0 0.00055 XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 183 44.0 0.00055 NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 183 44.1 0.00056 XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 183 44.1 0.00056 XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 175 42.0 0.00069 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 1151 init1: 786 opt: 1130 Z-score: 1088.8 bits: 209.6 E(85289): 6.6e-54 Smith-Waterman score: 1130; 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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 STCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVK ::::::: .:::. ::..: : .: :: . :.. :::::: ::.:::::::::::.:: NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 NALIRVMQRRQDSR .: .:.. . :: NP_006 DAAEKVLRSKVDSS 310 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 973 init1: 697 opt: 967 Z-score: 934.7 bits: 181.1 E(85289): 2.5e-45 Smith-Waterman score: 967; 48.2% identity (75.2% similar) in 307 aa overlap (2-307:3-309) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM : : :.. ::: :.:: .. .:: .::.::. .. :...:..::.: .::::: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMA ::::..:::::. : . .:: :.::: . :.:.::. :.:.: .: .: :...:: NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFC ::::.:::.:: : ::: :: .: : :. .. :. .. . .:::: :::.::::: NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DTSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALS : .: ::: ::. ...: ::. ..: ..: :: : .:.::.:..:..::.. NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN :::::: .:..:: . ::.::. .. : . :. ::::::.::::::::::::::::.:. NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR :: :...:. NP_001 ALKRLQKRKCC 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 956 init1: 707 opt: 937 Z-score: 906.3 bits: 175.9 E(85289): 9.7e-44 Smith-Waterman score: 937; 48.4% identity (75.8% similar) in 306 aa overlap (5-306:5-308) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSD-SEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM : :.. .::: ..:. :.: ::. :: :::.:. :: .::. : .::.:: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMA :::: .:::...... ::.:: :..::... :::.:: .::.:: :.:.::::::..:: NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 YDRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFC :::::::::::.:::::..: :... . .: . :...:. . :: .: : :::: NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DTSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTL--MVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKA :. :.: : : :: .:: . ..:. : :. . : ::. : ..:::: :..::.:: NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEI--YAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LSTCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEV .:::.:::: :..:: . .::. :... : .. :. ::.: :::::.::::::.:: NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KNALIRVMQRRQDSR :::: :.... NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP 300 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 951 init1: 668 opt: 936 Z-score: 905.4 bits: 175.7 E(85289): 1.1e-43 Smith-Waterman score: 936; 46.1% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY :. :...: .:.: ::: . . : ::..:: .:: :.:::. .:: . .: :::::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLAN-LLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY :::..:::.:. .: . .:: ::: .: .. ::: ::..::.: .. . :::. ::: XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD :..::.: ::.: . :...:: ::.: .:.. .: ..... :. : :: .:.. ::::: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVS-LITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALS ..:.: ::: ::. :..: . :. .:.. .. : :::. : :.::. ::.:. ::.: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN ::.::: : .::.:.: .:..: .:.: .: .:.:.::.: :::::.::::::. .:. XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR :: .:. : XP_011 ALKKVVGRVVFSV 300 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 951 init1: 668 opt: 936 Z-score: 905.4 bits: 175.7 E(85289): 1.1e-43 Smith-Waterman score: 936; 46.1% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY :. :...: .:.: ::: . . : ::..:: .:: :.:::. .:: . .: :::::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLAN-LLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY :::..:::.:. .: . .:: ::: .: .. ::: ::..::.: .. . :::. ::: NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD :..::.: ::.: . :...:: ::.: .:.. .: ..... :. : :: .:.. ::::: NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVS-LITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALS ..:.: ::: ::. :..: . :. .:.. .. : :::. : :.::. ::.:. ::.: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN ::.::: : .::.:.: .:..: .:.: .: .:.:.::.: :::::.::::::. .:. 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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 891 init1: 583 opt: 911 Z-score: 881.7 bits: 171.3 E(85289): 2.3e-42 Smith-Waterman score: 911; 46.3% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY :: :.: : .::: :::.. .....::.:::..:..:.::: ..:.:::: .:::::: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY ::::.::..:.::.: ..:. ::..:. . : :..: ::.:: . ::. : ::. ::: NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD :::::.:. ::: .:: :: :. .: .::.: :... .: .: .. . :. :. 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