FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5920, 310 aa 1>>>pF1KE5920 310 - 310 aa - 310 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3049+/-0.000578; mu= 15.8674+/- 0.036 mean_var=105.3976+/-26.567, 0's: 0 Z-trim(105.9): 338 B-trim: 1575 in 2/49 Lambda= 0.124928 statistics sampled from 13607 (14055) to 13607 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.48), E-opt: 0.2 (0.165), width: 16 Scan time: 5.230 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1130 215.3 1.3e-55 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 1013 194.2 2.8e-49 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1010 193.7 4.1e-49 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 910 175.7 1.1e-43 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 904 174.6 2.3e-43 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 886 171.3 2.2e-42 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 886 171.3 2.2e-42 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 886 171.3 2.2e-42 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 886 171.3 2.2e-42 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 885 171.1 2.5e-42 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 877 169.7 6.8e-42 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 877 169.7 6.8e-42 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 877 169.7 6.8e-42 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 874 169.2 9.8e-42 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 868 168.1 2.1e-41 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 858 166.3 7.2e-41 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 839 162.9 7.8e-40 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 821 159.6 7.2e-39 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 767 149.9 6.2e-36 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 710 139.6 7.7e-33 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 543 109.5 9.1e-24 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 537 108.4 1.9e-23 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 229 53.0 1e-06 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 225 52.2 1.6e-06 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 202 48.1 2.9e-05 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 200 47.7 3.8e-05 NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 197 47.3 6.9e-05 NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 189 45.7 0.00015 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 188 45.6 0.00019 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 188 45.6 0.00019 NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 186 45.3 0.00024 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 184 44.8 0.00028 NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 181 44.3 0.00042 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 178 43.8 0.0006 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 177 43.6 0.00066 NP_444508 (OMIM: 606927) trace amine-associated re ( 342) 173 42.9 0.0011 XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 172 42.6 0.0012 XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 172 42.7 0.0012 XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 172 42.7 0.0012 NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 172 42.7 0.0013 NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 172 42.7 0.0013 NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 172 42.7 0.0013 NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 171 42.5 0.0015 NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 172 42.8 0.0015 XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 172 42.8 0.0015 NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 172 42.8 0.0015 NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 172 42.8 0.0016 XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 172 42.8 0.0016 XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 172 42.8 0.0016 NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 172 42.8 0.0016 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 665 init1: 614 opt: 1130 Z-score: 1119.6 bits: 215.3 E(85289): 1.3e-55 Smith-Waterman score: 1130; 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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKN :::::: ::..:: : ::.::. .. .: . . ::::::.:::::::::::::::..:. 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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS 310 >>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa) initn: 648 init1: 447 opt: 910 Z-score: 905.1 bits: 175.7 E(85289): 1.1e-43 Smith-Waterman score: 910; 45.0% identity (73.6% similar) in 307 aa overlap (4-305:5-311) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPM :. .:. :.: :: ::: :: ..:. :.... : .: :: : :: :: NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNF----QSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLL ::::.:..:..:.: ... :: :..: :.. . ::: ::..:.:::.:: : :: :: NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 GSMAYNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSSI-N . :::.::.::: :: : :..: .. ... .. :: :...:..::.:..: .: : NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 HFFCDTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQ :::::.. :: :::.: .:...:.:: : ::. : . ..:. : .:...: ::::: NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 KAFSTCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNK :::::::::: .: :::.. :: : .: :.. ...::.:....:.:::.:: :::. NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 DVKNALLRVIHRKLFP .:: :: ..: NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV 310 320 >>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa) initn: 885 init1: 458 opt: 904 Z-score: 899.5 bits: 174.6 E(85289): 2.3e-43 Smith-Waterman score: 904; 47.6% identity (74.9% similar) in 307 aa overlap (5-310:5-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY : :.:: :.: :... :. . ::...: .:: :::::: ::.:...::::::::: NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY ::: ::.. :. .:....:.:::.. : .. :.:. : ... ::. . : .: ::. :.: NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDS-SINHFFCD .::.:::::: : .:. :: :.. .. :. :.... : : . : :: ::::. NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 TTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFST . ::: :. .:: ..::. :... :: ...: :.: :: ......:..: ::::: NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNA :.::::.: .:::: :.::. : :: : . .::::.:: :::::::::::::::: : NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 LLRVIHRKLFP : .: :. :: NP_003 LRKVATRN-FP 300 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 841 init1: 419 opt: 886 Z-score: 881.9 bits: 171.3 E(85289): 2.2e-42 Smith-Waterman score: 886; 43.5% identity (75.5% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY :.:.: . :. :.: :.. .:. : ::..:: .:: :::::: .: . .:: :::::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY ::::::.:.:: .: :..:: :.: . ..::: ::..:::: .: . :::. ::: XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFC-DSSINHFFCD ....:.:.:: :.. :.... : . .:.. . :. . ... :.:: :..:.::::: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 TTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFST .: :: ::: :: .:.. . ....... .: : ..:. : ..:.. :. :: ::::: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNA :.::: .: .::...: .:..: .. : . .:.:.::.: :::::.::::::. .:.: XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 LLRVIHRKLFP : .:. : .: XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 841 init1: 419 opt: 886 Z-score: 881.9 bits: 171.3 E(85289): 2.2e-42 Smith-Waterman score: 886; 43.5% identity (75.5% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY :.:.: . :. :.: :.. .:. : ::..:: .:: :::::: .: . .:: :::::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY ::::::.:.:: .: :..:: :.: . ..::: ::..:::: .: . :::. ::: NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFC-DSSINHFFCD ....:.:.:: :.. :.... : . .:.. . :. . ... :.:: :..:.::::: NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 TTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFST .: :: ::: :: .:.. . ....... .: : ..:. : ..:.. :. :: ::::: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNA :.::: .: .::...: .:..: .. : . .:.:.::.: :::::.::::::. .:.: NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 LLRVIHRKLFP : .:. : .: NP_036 LKKVVGRVVFSV 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 920 init1: 433 opt: 886 Z-score: 881.9 bits: 171.3 E(85289): 2.2e-42 Smith-Waterman score: 886; 45.5% identity (74.4% similar) in 312 aa overlap (1-308:1-310) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHP-ELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRM-DSQLHTP :: .:.::.. ::: .:.. : :.: ::: :: ::: :. :: .:: :. . : .::.: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGN-SLIILVTLADPMLHSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 MYFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSM ::::: ::.:..: .. ...:: : .. .. .:::.:: .::::: . :::::..: NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 AYNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLI-SVWVISSLAFCDSS-INHF ::.::.:::.:: : :.:.:.. :.. . :: . . ..:..: . :: .. .::: NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFS-FPFCGTNKVNHF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FCDTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKA :::. .: : :.:: :. ..: . .... :.: .: : .:::.: :: :..:: NP_835 FCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FSTCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDV ::::.:::..:..:: : .::. : ...: . .. :. ::.: :::::.::::::..: NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KNALLRVIHRKLFP :::: :..:. : NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP 300 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 841 init1: 419 opt: 886 Z-score: 881.8 bits: 171.3 E(85289): 2.2e-42 Smith-Waterman score: 886; 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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 MDSQLHTPMYFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCC .:: ::::::::::::.:.:: .: :..:: :.: . ..::: ::..:::: .: XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE5 ECFLLGSMAYNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFC- . :::. :::....:.:.:: :.. :.... : . .:.. . :. . ... :.:: XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 DSSINHFFCDTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQS :..:.:::::.: :: ::: :: .:.. . ....... .: : ..:. : ..:.. : XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 AAGRQKAFSTCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIY . :: ::::::.::: .: .::...: .:..: .. : . .:.:.::.: :::::.:: XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 pF1KE5 SLRNKDVKNALLRVIHRKLFP ::::. .:.:: .:. : .: XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 310 320 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 881 init1: 488 opt: 885 Z-score: 881.0 bits: 171.1 E(85289): 2.5e-42 Smith-Waterman score: 885; 44.9% identity (75.2% similar) in 294 aa overlap (12-304:15-308) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHT ::: ::.: :.:.: .:.. :..::.:..::: .: : .::.::: NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 PMYFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGS :::::::::.:.:. :... :. :::. . ...::..::..:.:: ..: :: :: NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 MAYNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDS-SINHF :.:.:: :.: :: :.:.: . . :.: .: :::.: . . .: ...:: NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FCDTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKA ::.. ::: :::::: .:.. .. ... .: :..: ..: :. ::::.::..: ::. NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FSTCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDV :.::..:::::..:. . :::: . .: :.. ..:::.: : ::::::.:::: : NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 KNALLRVIHRKLFP ..:. :.. NP_001 RGAVKRLMGWE 310 310 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 07:56:52 2016 done: Tue Nov 8 07:56:53 2016 Total Scan time: 5.230 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]