Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6011
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6011, 314 aa
1>>>pF1KE6011 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5951+/-0.00156; mu= 14.3254+/- 0.091
mean_var=132.0822+/-41.477, 0's: 0 Z-trim(99.6): 406 B-trim: 684 in 2/46
Lambda= 0.111597
statistics sampled from 5282 (5779) to 5282 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.498), E-opt: 0.2 (0.178), width: 16
Scan time: 2.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1337 227.7 9.2e-60
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 1300 221.7 5.7e-58
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1298 221.4 7.4e-58
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1082 186.6 2.1e-47
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1021 176.8 1.9e-44
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 992 172.1 4.9e-43
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 990 171.8 6.1e-43
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 983 170.7 1.3e-42
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 976 169.6 2.9e-42
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 959 166.8 1.9e-41
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 959 166.8 1.9e-41
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 955 166.2 3e-41
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 951 165.5 4.7e-41
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 950 165.4 5.2e-41
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 950 165.4 5.2e-41
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 949 165.2 5.9e-41
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 946 164.7 8.2e-41
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 943 164.3 1.2e-40
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 941 163.9 1.4e-40
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 936 163.1 2.6e-40
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 930 162.2 5e-40
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 930 162.2 5.2e-40
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 928 161.8 6.1e-40
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 928 161.8 6.1e-40
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 927 161.7 6.8e-40
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 923 161.0 1.1e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 923 161.0 1.1e-39
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 920 160.5 1.5e-39
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 918 160.2 1.9e-39
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 916 159.9 2.4e-39
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 914 159.6 2.9e-39
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 907 158.5 7e-39
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 905 158.1 7.9e-39
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 905 158.1 8e-39
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 903 157.8 9.9e-39
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 902 157.7 1.2e-38
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 901 157.6 1.4e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 899 157.2 1.6e-38
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 896 156.7 2.2e-38
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 894 156.4 2.7e-38
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 892 156.0 3.4e-38
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 892 156.0 3.4e-38
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 891 155.9 3.7e-38
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 886 155.1 7e-38
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 882 154.5 1.1e-37
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 880 154.1 1.3e-37
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 877 153.6 1.8e-37
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 875 153.3 2.3e-37
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 872 152.8 3.2e-37
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 871 152.7 3.5e-37
>>CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1376 init1: 1314 opt: 1337 Z-score: 1186.4 bits: 227.7 E(32554): 9.2e-60
Smith-Waterman score: 1337; 65.0% identity (85.5% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMASERNQSSTPTFILLGFSEYPEIQVPLFLVFLFVYTVTVVGNLGMIIIIRLNSKLHTI
:. ..:: :.: :: :::::.:::.::::::::: .:.:::.::.:.:.::..: ::::
CCDS31 MLLTDRNTSGT-TFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYFFLSHLSLTDFCFSTVVTPKLLENLVVEYRTISFSGCIMQFCFACIFGVTETFMLAAM
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CCDS31 MYFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AYDRFVAVCKPLLYTTIMSQKLCALLVAGSYTWGIVCSLILTYFLLDLSFCESTFINNFI
:::::::.:.:::::. ::::::.:::.:::.::. ::: :: : : : . ::.:.
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVNMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHSVIVSASYSDPYISQRLCFIIAIFNEVSSLIIILTSYMLIFTTIMKMRSASGRQKTF
:. : ..: : :: ::.: : :..: :::.:.:.:.:::: .: .::.::::.:::.:.:
CCDS31 CEFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNPKTSSLIVTVASVFYTVAIPMLNPLIYSLRNKDIN
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CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 NMFEKLVVTKLIYH
. ... ::.
CCDS31 DTVTEILDTKVFSY
300 310
>>CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1352 init1: 1300 opt: 1300 Z-score: 1154.2 bits: 221.7 E(32554): 5.7e-58
Smith-Waterman score: 1300; 61.5% identity (84.1% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMASERNQSSTPTFILLGFSEYPEIQVPLFLVFLFVYTVTVVGNLGMIIIIRLNSKLHTI
:: :: : ::: ::::..::..:.:::::::..:..::::::::::::..: :.::
CCDS31 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYFFLSHLSLTDFCFSTVVTPKLLENLVVEYRTISFSGCIMQFCFACIFGVTETFMLAAM
:::::::::..:::.:..::::::::::. ..: . .:.::. ..: :::.:.::.:
CCDS31 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AYDRFVAVCKPLLYTTIMSQKLCALLVAGSYTWGIVCSLILTYFLLDLSFCESTFINNFI
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CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHSVIVSASYSDPYISQRLCFIIAIFNEVSSLIIILTSYMLIFTTIMKMRSASGRQKTF
:......:.: :: : . : : .: :::. .:.::::::..::.:..:.::.:::.:.:
CCDS31 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNPKTSSLIVTVASVFYTVAIPMLNPLIYSLRNKDIN
:: :::::.:::::::::::::::: :.: : ::::::::. ::::::::::::::..
CCDS31 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 NMFEKLVVTKLIYH
. : ::. :.. .:
CCDS31 DAFWKLIHTQVPFH
310
>>CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 1322 init1: 1291 opt: 1298 Z-score: 1152.2 bits: 221.4 E(32554): 7.4e-58
Smith-Waterman score: 1298; 62.3% identity (83.7% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMASERNQSSTPTFILLGFSEYPEIQVPLFLVFLFVYTVTVVGNLGMIIIIRLNSKLHTI
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CCDS31 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 MYFFLSHLSLTDFCFSTVVTPKLLENLVVEYRTISFSGCIMQFCFACIFGVTETFMLAAM
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CCDS31 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 AYDRFVAVCKPLLYTTIMSQKLCALLVAGSYTWGIVCSLILTYFLLDLSFCESTFINNFI
:::.:::.:.:::::. .::::::.::. :.::..::: :. : ::: . ::.:.
CCDS31 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
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pF1KE6 CDHSVIVSASYSDPYISQRLCFIIAIFNEVSSLIIILTSYMLIFTTIMKMRSASGRQKTF
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CCDS31 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNPKTSSLIVTVASVFYTVAIPMLNPLIYSLRNKDIN
::::::::::::::::::::::::: :.: : ::::::::.::.::::::::::::..
CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 NMFEKLVVTKLIYH
. ..:.. :: ..
CCDS31 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
310 320
>>CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1096 init1: 1075 opt: 1082 Z-score: 964.5 bits: 186.6 E(32554): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 1082; 52.8% identity (81.8% similar) in 307 aa overlap (5-311:3-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMASERNQSSTPTFILLGFSEYPEIQVPLFLVFLFVYTVTVVGNLGMIIIIRLNSKLHTI
..: ... :::::.:. ::..: :::.::..: ::...:::: .:...:.:::
CCDS31 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTP
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYFFLSHLSLTDFCFSTVVTPKLLENLVVEYRTISFSGCIMQFCFACIFGVTETFMLAAM
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CCDS31 VYFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AYDRFVAVCKPLLYTTIMSQKLCALLVAGSYTWGIVCSLILTYFLLDLSFCESTFINNFI
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CCDS31 AYDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFF
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHSVIVSASYSDPYISQRLCFIIAIFNEVSSLIIILTSYMLIFTTIMKMRSASGRQKTF
:: ..: . :: ... : :..: .:: ...::::::.::.:::.:..:: .:.:.:
CCDS31 CDLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNPKTSSLIVTVASVFYTVAIPMLNPLIYSLRNKDIN
:::::::::::. :::::..:: :. .:. . ::.:::::.:::::::::::::::.:
CCDS31 STCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 NMFEKLVVTKLIYH
. ..:.. .:.
CCDS31 KALRKVMGSKIHS
300 310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1099 init1: 1015 opt: 1021 Z-score: 911.4 bits: 176.8 E(32554): 1.9e-44
Smith-Waterman score: 1021; 51.2% identity (79.5% similar) in 303 aa overlap (7-307:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMASERNQSSTPTFILLGFSEYPEIQVPLFLVFLFVYTVTVVGNLGMIIIIRLNSKLHTI
:.. . :::.:... ::.:.:::.::::.: .:.::::::: .: :.: :::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTP
10 20 30 40 50
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pF1KE6 MYFFLSHLSLTDFCFSTVVTPKLLENLVVEYRTISFSGCIMQFCFACIFGVTETFMLAAM
::::::.:::.:: .:..::::.. .... . : ...: :: : : ..:.:.::.:
CCDS31 MYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASM
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 AYDRFVAVCKPLLYTTIMSQKLCALLVAGSYTWGIVCSLILTYFLLDLSFCESTFINNFI
::::..:.:::: ::: :. ..:: :. ::: :.. . : : . ::::.:. ...:.
CCDS31 AYDRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 CDHSVIVSASYSDPYISQRLCFIIAIFNEVSSLIIILTSYMLIFTTIMKMRSASGRQKTF
:: ... : :: :::. . :... ::.. :...:: ::..:: ::::::: ::::.:
CCDS31 CDAPPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNPKTSSLIVT--VASVFYTVAIPMLNPLIYSLRNKD
:::::::::..::.:: .:.: :: .: .. : .:::::...:::::::.::::::.
CCDS31 STCASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPN--SSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 INNMFEKLVVTKLIYH
... :.: :
CCDS31 VKSAFKKTVGKAKASIGFIF
300 310
>>CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 978 init1: 933 opt: 992 Z-score: 886.2 bits: 172.1 E(32554): 4.9e-43
Smith-Waterman score: 992; 48.4% identity (78.8% similar) in 306 aa overlap (6-311:4-309)
10 20 30 40 50 60
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CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
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CCDS31 NALLRVIHRKLFP
300 310
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