Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5908
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5908, 310 aa
1>>>pF1KE5908 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6923+/-0.0013; mu= 13.6812+/- 0.076
mean_var=139.7921+/-41.930, 0's: 0 Z-trim(102.1): 424 B-trim: 733 in 2/49
Lambda= 0.108476
statistics sampled from 6283 (6793) to 6283 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 2.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1466 241.8 5e-64
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1177 196.6 2.1e-50
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1158 193.6 1.6e-49
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1149 192.3 4.8e-49
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1144 191.4 7.4e-49
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1141 191.0 1.1e-48
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1107 185.6 4.1e-47
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1102 184.9 7e-47
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1093 183.5 1.9e-46
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1076 180.8 1.2e-45
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1066 179.2 3.5e-45
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1058 178.0 8.4e-45
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1056 177.6 1e-44
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1043 175.6 4.2e-44
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1041 175.3 5.5e-44
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1002 169.2 3.6e-42
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 989 167.2 1.5e-41
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 980 165.8 3.9e-41
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 959 162.5 3.9e-40
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 959 162.5 4.1e-40
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 933 158.4 6.5e-39
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 932 158.3 7.2e-39
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 929 157.8 1e-38
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 928 157.6 1.1e-38
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 924 157.0 1.7e-38
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 920 156.4 2.7e-38
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 918 156.1 3.3e-38
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 918 156.1 3.3e-38
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 917 155.9 3.6e-38
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 912 155.1 6.3e-38
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 911 155.0 7.2e-38
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 911 155.0 7.5e-38
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 907 154.3 1.1e-37
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 900 153.2 2.3e-37
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 893 152.1 5e-37
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 886 151.0 1.1e-36
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 871 148.7 5.4e-36
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 870 148.6 6e-36
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 861 147.1 1.6e-35
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 858 146.7 2.2e-35
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 855 146.2 3.1e-35
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 844 144.5 1e-34
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 844 144.5 1e-34
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 844 144.5 1e-34
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 842 144.2 1.3e-34
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 835 143.1 2.7e-34
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 829 142.1 5.1e-34
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 786 135.4 5.6e-32
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 785 135.3 6.1e-32
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 779 134.3 1.2e-31
>>CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1466 init1: 1466 opt: 1466 Z-score: 1262.9 bits: 241.8 E(32554): 5e-64
Smith-Waterman score: 1466; 67.3% identity (89.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF
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CCDS31 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR
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CCDS31 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQ
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CCDS31 YVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS
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CCDS31 PLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLW
::::::::::::::.:: :.::::::.:::::.:: ::::.::::.:.:::.::::::
CCDS31 HIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 SKKLITDDKR
:.:...:
CCDS31 HGKIISENKG
310
>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1171 init1: 1171 opt: 1177 Z-score: 1018.5 bits: 196.6 E(32554): 2.1e-50
Smith-Waterman score: 1177; 55.5% identity (83.1% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF
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CCDS31 MEKKKNVTEFILIGLTQNPIMEKVTFVVFLVLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR
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CCDS31 LTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQEKKIISFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQ
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CCDS31 YVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVAWVGGFLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS
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CCDS31 PLLKLVCIDTHTLGLFVAVNSGFICLLNFLILVVSYVIILRSLKNNSLEGRCKALSTCIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLW
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CCDS31 HIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPIDKAVAVFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 SKKLITDDKR
::. .:.
CCDS31 RKKVTSDND
>>CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1182 init1: 1155 opt: 1158 Z-score: 1002.4 bits: 193.6 E(32554): 1.6e-49
Smith-Waterman score: 1158; 54.4% identity (80.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF
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CCDS31 MEKINNVTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR
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CCDS31 LSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAKDKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDR
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 YVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQ
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CCDS31 YVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVH
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS
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CCDS31 PVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLW
:: .:..::::: ::: :.: :::.:::::. : .:::.::::.:.:::.::.:::
CCDS31 HIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 SKKLITDDKR
..... . :
CCDS31 GRNVFLEAKGK
310
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
initn: 1149 init1: 987 opt: 1149 Z-score: 994.0 bits: 192.3 E(32554): 4.8e-49
Smith-Waterman score: 1149; 51.4% identity (82.0% similar) in 311 aa overlap (1-310:55-365)
10 20 30
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFL
:: .. ::::.::::.:.: ..:.::.::
CCDS31 PQIDLKQIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KE5 RLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALK-NPMFFFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTT
.:..:. ::.::.... .: :: .::.::: .::. :.:.:. :.:.::::.: :
CCDS31 FVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKT
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 ISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDRYVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVG
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CCDS31 ISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTG
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 SCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQPLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSY
. .::..::.....::::::::::: .::: :::. ::..:.. .:..: ::: :: ...
CCDS31 GLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINF
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 VMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVSHIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMI
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CCDS31 SLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMA
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310
pF1KE5 AVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLWSKKLITDDKR
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CCDS31 AIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
330 340 350 360 370
>>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1164 init1: 1140 opt: 1144 Z-score: 990.6 bits: 191.4 E(32554): 7.4e-49
Smith-Waterman score: 1144; 52.0% identity (81.0% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF
:. .:::.:.:::.::.: .:.:::.:: .:. :..:::::...: .:..: .::.::
CCDS31 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR
: ::. : :.::.::.: .. ...:::. :: :.: :.:: :.:.:.. : :
CCDS31 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQ
:: :::::::..:. :::: ::..:.:::. .::. :. . .:::::::::.: :::.
CCDS31 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVVLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS
:::: .:..:....::.:.:.: :.. ...:..:: ..::::.: : . .:::::: :
CCDS31 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLW
:. ::..:: ::::::. : .::.:: ..::::: : .:::.::::.:.:. :::.:::
CCDS31 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 SKKLITDDKR
. ::.
CCDS31 RRDLISSST
>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 1155 init1: 1136 opt: 1141 Z-score: 987.6 bits: 191.0 E(32554): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 1141; 54.3% identity (81.9% similar) in 304 aa overlap (1-304:31-334)
10 20 30
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFL
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CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
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40 50 60 70 80 90
pF1KE5 RLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTI
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CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
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CCDS31 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
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CCDS31 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
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220 230 240 250 260 270
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CCDS31 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
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280 290 300 310
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CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
310 320 330 340
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CCDS31 MASTSNVTELIFTGLFQDPAVQSVCFVVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMYFF
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CCDS31 LSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAKIKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAYDC
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CCDS31 YVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGSWLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCDLQ
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CCDS31 HITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTEDKLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIAIRRLW
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310
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CCDS31 SKKENPGRE
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CCDS73 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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CCDS73 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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CCDS73 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
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CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
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310
pF1KE5 SKKLITDDKR
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CCDS73 SRKDISGDK
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10 20 30
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CCDS31 MQLVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIY
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CCDS31 VVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYE
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CCDS31 CCMAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLH
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CCDS31 SLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLA
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CCDS31 ASYIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMALFY
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CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF
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CCDS31 YVAICKPLHYTTVMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDLY
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pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS
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CCDS31 TLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVS
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CCDS31 SRKAISSVK
310 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]