Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5903
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5903, 309 aa
  1>>>pF1KE5903 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5842+/-0.0012; mu= 14.3460+/- 0.071
 mean_var=142.1021+/-42.765, 0's: 0 Z-trim(101.3): 361  B-trim: 385 in 1/47
 Lambda= 0.107591
 statistics sampled from 6058 (6470) to 6058 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.199), width:  16
 Scan time:  1.950

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11      ( 309) 2025 326.8 1.3e-89
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11      ( 309) 1661 270.3 1.3e-72
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11      ( 309) 1352 222.4 3.6e-58
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11       ( 370) 1337 220.1   2e-57
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11       ( 329) 1266 209.1 3.9e-54
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11      ( 309) 1263 208.6 5.1e-54
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11       ( 344) 1259 208.0 8.4e-54
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11       ( 309) 1249 206.4 2.3e-53
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11        ( 315) 1218 201.6 6.6e-52
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11      ( 310) 1196 198.2   7e-51
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11       ( 305) 1173 194.6 8.2e-50
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11       ( 309) 1173 194.6 8.3e-50
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11       ( 311) 1172 194.4 9.2e-50
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11       ( 309) 1139 189.3 3.2e-48
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11       ( 328) 1138 189.2 3.7e-48
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11       ( 318) 1094 182.3 4.1e-46
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11        ( 312) 1060 177.0 1.6e-44
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14       ( 307) 1057 176.6 2.2e-44
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14       ( 313) 1053 176.0 3.4e-44
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17        ( 310) 1031 172.5 3.6e-43
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15       ( 316) 1030 172.4   4e-43
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14        ( 313) 1025 171.6 6.9e-43
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14      ( 343) 1022 171.2   1e-42
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11       ( 314) 1021 171.0 1.1e-42
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14       ( 308) 1007 168.8 4.7e-42
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11      ( 311) 1003 168.2 7.3e-42
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14       ( 314)  999 167.6 1.1e-41
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14       ( 348)  999 167.6 1.2e-41
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11      ( 311)  998 167.4 1.2e-41
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15        ( 305)  997 167.3 1.4e-41
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19       ( 305)  996 167.1 1.5e-41
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17       ( 307)  988 165.9 3.6e-41
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1         ( 305)  985 165.4   5e-41
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14      ( 310)  982 164.9   7e-41
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11       ( 314)  980 164.6 8.7e-41
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1       ( 312)  970 163.1 2.5e-40
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5         ( 312)  970 163.1 2.5e-40
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1        ( 312)  970 163.1 2.5e-40
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14       ( 313)  970 163.1 2.5e-40
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14        ( 323)  970 163.1 2.6e-40
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8       ( 312)  967 162.6 3.5e-40
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14        ( 311)  966 162.5 3.9e-40
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15       ( 313)  958 161.2 9.3e-40
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14       ( 312)  954 160.6 1.4e-39
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15      ( 312)  953 160.4 1.6e-39
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14      ( 304)  927 156.4 2.6e-38
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15       ( 312)  918 155.0 6.8e-38
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11      ( 311)  910 153.8 1.6e-37
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14       ( 310)  906 153.1 2.5e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321)  889 150.5 1.6e-36


>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 2025 init1: 2025 opt: 2025  Z-score: 1722.4  bits: 326.8 E(32554): 1.3e-89
Smith-Waterman score: 2025; 99.0% identity (99.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS73 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
       ::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
              250       260       270       280       290       300

                
pF1KE5 SRKDISGDK
       :::::::::
CCDS73 SRKDISGDK
                

>>CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 1676 init1: 1655 opt: 1661  Z-score: 1417.1  bits: 270.3 E(32554): 1.3e-72
Smith-Waterman score: 1661; 83.5% identity (90.6% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
       : ::::.:::.:::::::::::::::::: :::: ...: ::::::::::::: ::::. 
CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
       :::::::::::::::::.::: ::: .:.:::::::::::::::: :.: ::::::::::
CCDS31 LAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
       :::::::::: :.:.: ::.::.:: :.::::::::::::: ::::::::::::::::: 
CCDS31 YVAICKPLHYTTVMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDLY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVF
        :.:::::.:: : ::::::::::::::  ::::: :::: ::.::::::::.:::::: 
CCDS31 TLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
       ::::::: :.: ::::::: ::::::::::.:::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS31 HITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
              250       260       270       280       290       300

                
pF1KE5 SRKDISGDK
       ::: ::. :
CCDS31 SRKAISSVK
                

>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 1342 init1: 1342 opt: 1352  Z-score: 1157.9  bits: 222.4 E(32554): 3.6e-58
Smith-Waterman score: 1352; 65.6% identity (88.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
       ::...:.:::.:.:::.:: :.:. ::::.:.:.::. : .:::::::.: .:.::::. 
CCDS31 MEKKKNVTEFILIGLTQNPIMEKVTFVVFLVLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
       :..::.::. ::: ..:.::. :.  :: : :::::.:...::.::..: ::::::: : 
CCDS31 LTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQEKKIISFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
       ::::::::.: :::.. .: ::..:.:.::::::::::::   ::::::::: :::::: 
CCDS31 YVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVAWVGGFLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVF
       :::.:.: ::: : ::.:.:::::::::: .:.::::.:: ::...:::.: ::::::. 
CCDS31 PLLKLVCIDTHTLGLFVAVNSGFICLLNFLILVVSYVIILRSLKNNSLEGRCKALSTCIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
       :: ::.::::: ::::.: ..:::::::::.::::..:::::..::::::..:.::::: 
CCDS31 HIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPIDKAVAVFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKL-
              250       260       270       280       290          

                 
pF1KE5 SRKDISGDK 
        :: ...:  
CCDS31 WRKKVTSDND
     300         

>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11            (370 aa)
 initn: 1370 init1: 1152 opt: 1337  Z-score: 1144.4  bits: 220.1 E(32554): 2e-57
Smith-Waterman score: 1337; 63.5% identity (87.1% similar) in 310 aa overlap (1-309:55-364)

                                             10        20        30
pF1KE5                               MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFF
                                     :.:.. .::::::::..::..:.:.::::.
CCDS31 PQIDLKQIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFL
           30        40        50        60        70        80    

               40        50         60        70        80         
pF1KE5 VIYIITVVGYVLIVVTITASPSLG-SPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKA
        .:: :: : .:::::: .::.:  ::::. :..:::.:::.::: ::..:. :::  :.
CCDS31 FVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKT
           90       100       110       120       130       140    

      90       100       110       120       130       140         
pF1KE5 ILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMG
       : :.::: :.:.::::.:.: :.::.::::.:::::::::: .:::. .:..::::.: :
CCDS31 ISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTG
          150       160       170       180       190       200    

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE5 GFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNF
       :.::. ::::: :::::::::::.:::::: :::.:::::::.. :... ::::::..::
CCDS31 GLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINF
          210       220       230       240       250       260    

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE5 ALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAV
       .::::::.::: :::::: :.: ::::::  ::.:::::::: :::: :: ... .:: .
CCDS31 SLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMA
          270       280       290       300       310       320    

     270       280       290       300               
pF1KE5 AIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK      
       :::: ...:.:::::::.:: ..:.:.:.. .:  . .:.      
CCDS31 AIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
          330       340       350       360       370

>>CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11            (329 aa)
 initn: 1263 init1: 1263 opt: 1266  Z-score: 1085.4  bits: 209.1 E(32554): 3.9e-54
Smith-Waterman score: 1266; 61.2% identity (86.6% similar) in 299 aa overlap (1-299:28-326)

                                          10        20        30   
pF1KE5                            MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIY
                                  :.  .:.::: .:::..: ..:...::::..::
CCDS31 MQLVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIY
               10        20        30        40        50        60

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE5 IITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFN
       ..:: : .:::::::.::.:.::.:. :: :::::. :::  .:.::. :::  ..: ..
CCDS31 VVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYE
               70        80        90       100       110       120

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE5 GCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLH
        ::.:.:: ::.::.: :::::::::.:::::::::  :::.. .::.:.::.:.:::::
CCDS31 CCMAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLH
              130       140       150       160       170       180

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE5 ATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLL
       . .:.:... :::::::::.:: ::: :::..:::.:... :...::::.:::::: .: 
CCDS31 SLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLA
              190       200       210       220       230       240

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE5 VSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFY
       .::.::: :::.:: ..: ::::::  :. :: ::::: ::.:..: .:::::: .:.::
CCDS31 ASYIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMALFY
              250       260       270       280       290       300

           280       290       300         
pF1KE5 TMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK
        ..::::::::::::: ..:::.:::          
CCDS31 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW       
              310       320                

>>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11           (309 aa)
 initn: 1263 init1: 1263 opt: 1263  Z-score: 1083.2  bits: 208.6 E(32554): 5.1e-54
Smith-Waterman score: 1263; 60.8% identity (85.3% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
       :: :.:.:.:::::.:.::: ::..::.:...::.:.:: .:::::.:.: .::::::. 
CCDS31 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
       :: :::::  :::  .: ::.  ..:...: :..::.:.: ::.:::.: .:: ::::: 
CCDS31 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
       ::::::::::..:: : ::..:. : :.:::::...:. .:. ::::::::::::.::. 
CCDS31 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVVLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVF
       :::.:.::::: . :...::.:. : . : :::.:: ::: ::.. : ..:.::::::  
CCDS31 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
       :.:::..:::: ::.: ::: :.::::.:..:::.::::::::::::::..: .:..:: 
CCDS31 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
              250       260       270       280       290       300

                
pF1KE5 SRKDISGDK
        :  ::   
CCDS31 RRDLISSST
                

>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11            (344 aa)
 initn: 1250 init1: 1250 opt: 1259  Z-score: 1079.4  bits: 208.0 E(32554): 8.4e-54
Smith-Waterman score: 1259; 60.4% identity (86.8% similar) in 303 aa overlap (1-303:31-333)

                                             10        20        30
pF1KE5                               MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFF
                                     :.:.::.:::.:::::.::. ::..::.:.
CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
               10        20        30        40        50        60

               40        50        60        70        80        90
pF1KE5 VIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAI
       .::..:..: .::.::: :: :::::::. :: :::::. ::.. .:..:.  :  ::.:
CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
               70        80        90       100       110       120

              100       110       120       130       140       150
pF1KE5 LFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGG
        :.:::.:.: .:.:.::: :::.:::::.:.::::::: .  ::. ::.:.. ..:.::
CCDS31 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
              130       140       150       160       170       180

              160       170       180       190       200       210
pF1KE5 FLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFA
       :::. .:.:::.:::::::::::.:.::: :::.::::.:..  : . ::.: :: ..: 
CCDS31 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
              190       200       210       220       230       240

              220       230       240       250       260       270
pF1KE5 LLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVA
        .:.:: ::: ::.:.:::...::. ::. :.::::::::: ::.: :: .:.::::...
CCDS31 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
              250       260       270       280       290       300

              280       290       300              
pF1KE5 IFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK     
       .  :.::::::::::::.::.::.:.::: :.:           
CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
              310       320       330       340    

>>CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11            (309 aa)
 initn: 1249 init1: 1249 opt: 1249  Z-score: 1071.5  bits: 206.4 E(32554): 2.3e-53
Smith-Waterman score: 1249; 60.9% identity (86.3% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
       :::.::.:::.::::::: .. ::. .::.:.:. ::.  .:::::: .: :: ::::. 
CCDS31 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
       :..::..:. .::: .:..:. .:  . .: ..::.::.: ::::::.  :::::::::.
CCDS31 LTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
       ::::::::::  ::.  :: :..: .:.:::.:: ::.::..:.::::::.::::.::: 
CCDS31 YVAICKPLHYTIIMSPRVCCLMVGGAWVGGFMHAMIQLLFMYQIPFCGPNIIDHFICDLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVF
        ::.:::::::.: :... :::..:.  : .:..::.::::::...: ..::::::::  
CCDS31 QLLTLACTDTHILGLLVTLNSGMMCVAIFLILIASYTVILCSLKSYSSKGRHKALSTCSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
       :.:::.::::: ::.::::..: :::::.:.  ..:::::::::::::::..:.:..:: 
CCDS31 HLTVVVLFFVPCIFLYMRPVVTHPIDKAMAVSDSIITPMLNPLIYTLRNAEVKSAMKKLW
              250       260       270       280       290       300

                
pF1KE5 SRKDISGDK
                
CCDS31 MKWEALAGK
                

>>CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11             (315 aa)
 initn: 1220 init1: 632 opt: 1218  Z-score: 1045.4  bits: 201.6 E(32554): 6.6e-52
Smith-Waterman score: 1218; 60.4% identity (84.8% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
       :.. ::.:::::::....: .:: .::.:.. :..:::: .:::: : ::::::::::. 
CCDS73 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
       :: :::::: ::.. .:.::.  .  ::.: :.::: :.: .::::::: .::.::: :.
CCDS73 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
       ::::::::::.::::. :: ::. :. .:::.:...::. ...::::::::: :: ::..
CCDS73 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIV-VYSLPFCGPNVIVHFSCDMH
              130       140       150        160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVF
       :::.::::::... : ...::: ::.. : :::.:: ::: ::.:.: : : ::::::  
CCDS73 PLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSS
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
         :::.::::: ::.:.::....: :: ...:::.:: ::.::::::::..:.:::.:: 
CCDS73 GSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLL
     240       250       260       270       280       290         

                       
pF1KE5 SRKDISGDK       
       ..:             
CCDS73 GKKLTIFIIGGVSVLM
     300       310     

>>CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11           (310 aa)
 initn: 1213 init1: 1180 opt: 1196  Z-score: 1027.0  bits: 198.2 E(32554): 7e-51
Smith-Waterman score: 1196; 56.6% identity (82.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
       :.. :.. ::.:::::..:  :::.::.:...:. :::: .::.::: .: .::::::. 
CCDS31 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
       : :::: :.:.:. ..: ::. .:  :: : .: ::::::. :.::  : ..: .:: :.
CCDS31 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
       ::::::::.: :::.: :: .:. ..:.:...:.: ::.. ..:::::: .:::. :::.
CCDS31 YVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLAWIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVF
       :::.::: ::.:..:....::: ::  .: .:..::.::: :::.:: ....::::.:. 
CCDS31 PLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICSSSFMILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 HITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
       :: :::::: : ::.: :: .:.:.:: ::.:::. ::.:::::::::::..:::.::: 
CCDS31 HIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMDKMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLW
              250       260       270       280       290       300

                 
pF1KE5 SRKDISGDK 
         : :: .: 
CCDS31 HGKIISENKG
              310




309 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 07:47:14 2016 done: Tue Nov  8 07:47:14 2016
 Total Scan time:  1.950 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com