Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5464
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5464, 309 aa
1>>>pF1KE5464 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7289+/-0.000513; mu= 19.2476+/- 0.032
mean_var=103.8722+/-26.818, 0's: 0 Z-trim(106.8): 283 B-trim: 864 in 1/48
Lambda= 0.125842
statistics sampled from 14512 (14904) to 14512 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.513), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 5.690
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1682 316.8 3.4e-86
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 823 160.9 3e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 823 160.9 3e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 823 160.9 3.1e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 790 154.9 1.9e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 779 152.9 7.7e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 778 152.7 8.6e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 775 152.2 1.3e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 766 150.5 3.9e-36
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 764 150.2 5.1e-36
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 764 150.2 5.1e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 764 150.2 5.1e-36
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 758 149.1 1.1e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 749 147.5 3.3e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 747 147.1 4.3e-35
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 737 145.3 1.5e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 732 144.4 2.8e-34
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 725 143.1 7e-34
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 720 142.2 1.3e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 719 142.0 1.5e-33
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 535 108.6 1.7e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 471 97.0 5.3e-20
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 203 48.4 2.4e-05
XP_011535421 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 671) 205 49.1 2.8e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 202 48.3 3e-05
XP_005268094 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 764) 205 49.2 3.1e-05
NP_000360 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) thyr ( 764) 205 49.2 3.1e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 202 48.3 3.1e-05
XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 202 48.5 3.8e-05
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 189 46.0 0.00017
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 189 46.1 0.00018
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1697 init1: 1676 opt: 1682 Z-score: 1668.5 bits: 316.8 E(85289): 3.4e-86
Smith-Waterman score: 1682; 84.1% identity (91.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF
: ::::.:::.:::::::::::::::::: :::: ...: ::::::::::::: ::::.
NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDH
:::::::::::::::::.::: ::: .:.:::::::::::::::: :.: ::::::::::
NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDLY
:::::::::: :::.: ::.::.:: :.::::::::::::: :::::::::::::::::
NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVS
:.:::::.:: : :::::::::::::: ::::: :::: ::.::::::::.:::::::
NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
::::::: :.::::::::: ::::::::::.:::::: :::::::::.::::::::::::
NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SRKAISSVK
::: ::. :
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 805 init1: 619 opt: 823 Z-score: 825.6 bits: 160.9 E(85289): 3e-39
Smith-Waterman score: 823; 39.7% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (3-306:5-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DHYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYS-LKTHSLEARHEALST
. :..:.:..:: ..: ...... . : .:.: . : . ::. : ..: .:.::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CVSHITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDK--AVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRKLCSRKAISSVK
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 805 init1: 619 opt: 823 Z-score: 825.6 bits: 160.9 E(85289): 3e-39
Smith-Waterman score: 823; 39.7% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (3-306:5-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DHYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYS-LKTHSLEARHEALST
. :..:.:..:: ..: ...... . : .:.: . : . ::. : ..: .:.::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CVSHITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDK--AVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRKLCSRKAISSVK
..:. .: ..:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 805 init1: 619 opt: 823 Z-score: 825.4 bits: 160.9 E(85289): 3.1e-39
Smith-Waterman score: 823; 39.7% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (3-306:15-321)
10 20 30 40
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTIT
:...:.::.::::...:..:...:: : .:. ...::.::.....
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 ASPSLRSPMYFFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGV
. :..::::::. :::.: :.: ...::.... . :..:: : ::.::.. .: .
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 EVILLTVMAYDHYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCG
. .::.::::::.::.:.:::::. : ...:.:::. :: . :.. .. :.. : ::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 PNVIDHFMCDLYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYS-LKTHS
:.: ::.::. :..:.:..:: ..: ...... . : .:.: . : . ::. :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 LEARHEALSTCVSHITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDK--AVAVFYTMITSMLNPLIY
..: .:.::: ::..::.: . : ::. : .. .: ..:.::..: ::::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE5 TLRNAQMKNAIRKLCSRKAISSVK
.::: .:.:..:. .: ..:
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 758 init1: 489 opt: 790 Z-score: 793.2 bits: 154.9 E(85289): 1.9e-37
Smith-Waterman score: 790; 40.8% identity (74.1% similar) in 309 aa overlap (3-307:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMY
: ...:::.::::... ..: :.:. : ::: ...::. ... : . .:..:::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAY
:::: :::.:.: :.. :::...: : :.::: : ::. :.. . .: ::. .:::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DHYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCD
:.:.:::.:: :. ::.. : ... ....:.:. .. . .: :: ::: ::.::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCV-VILYSL-KTHSLEARHEALS
:..:.:..: : :.. . . ... ::...: .:.:. . :: :.::.:.:
NP_003 SPPLFKLSCSDT-ILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCVSHITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPI--DKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKN
::.::.:..:: . ::..:.:: .. . ::...::::.. :::::::.::. ..:.
NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 AIRKLCSRKAISSVK
:. .. ::: ::
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 697 init1: 578 opt: 779 Z-score: 782.4 bits: 152.9 E(85289): 7.7e-37
Smith-Waterman score: 779; 40.5% identity (69.9% similar) in 309 aa overlap (3-307:7-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSP
: . ::::::::. :..: ..:..: ..: .:::. ... : .: :..:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDHYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFM
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDLYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNC-LLLLVSCVVILYS-LKTHSLEARHEA
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDT-TINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSTCVSHITVVILSFIPCIFVYMRPPATL-P-IDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQM
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 KNAIRKLCSRKAISSVK
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NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 751 init1: 550 opt: 778 Z-score: 781.5 bits: 152.7 E(85289): 8.6e-37
Smith-Waterman score: 778; 38.9% identity (73.8% similar) in 301 aa overlap (3-299:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVF
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pF1KE5 LAYLSFIDA-CYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYD
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NP_001 LLTLAVVDIICTTSI-IPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYD
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pF1KE5 HYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDL
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NP_001 RYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEI
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 YTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSC-VVILYSLKTHSLEARHEALSTC
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NP_001 PPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VSHITVVILSFIPCIFVYMRPPA--TLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAI
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NP_001 SSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGI
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 RKLCSRKAISSVK
::.
NP_001 RKVFAFLKH
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 727 init1: 538 opt: 775 Z-score: 778.5 bits: 152.2 E(85289): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 775; 40.5% identity (71.1% similar) in 304 aa overlap (3-303:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDHYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYS-LKTHSLEARHEALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCVSHITVVILSFIPCIFVYMRPPA--TLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 AIRKLCSRKAISSVK
:...: .::
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 721 init1: 551 opt: 766 Z-score: 769.7 bits: 150.5 E(85289): 3.9e-36
Smith-Waterman score: 766; 38.2% identity (73.7% similar) in 293 aa overlap (10-299:15-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 PMYFFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAYDHYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 MCDLYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYS-LKTHSLEARHEA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSTCVSHITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPID--KAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQM
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300
pF1KE5 KNAIRKLCSRKAISSVK
..:...:
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 753 init1: 521 opt: 764 Z-score: 767.6 bits: 150.2 E(85289): 5.1e-36
Smith-Waterman score: 764; 41.4% identity (72.8% similar) in 302 aa overlap (3-299:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMY
:.. :.:::::::. . . .::.: :.:. ...:: :::. : . :..:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DHYVAICKPLHYTTIMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 LYTLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLN--CLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALS
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSS-IVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]