FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5462, 309 aa 1>>>pF1KE5462 309 - 309 aa - 309 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8915+/-0.00121; mu= 12.1995+/- 0.071 mean_var=132.9408+/-42.733, 0's: 0 Z-trim(102.3): 384 B-trim: 399 in 1/46 Lambda= 0.111236 statistics sampled from 6456 (6907) to 6456 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16 Scan time: 2.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 2034 338.6 3.5e-93 CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1387 234.9 6.8e-62 CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1358 230.2 1.6e-60 CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1309 222.3 3.7e-58 CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1296 220.2 1.7e-57 CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1288 218.9 3.9e-57 CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1262 214.8 7e-56 CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1243 211.7 5.8e-55 CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1236 210.6 1.3e-54 CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1217 207.5 1e-53 CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1211 206.6 2e-53 CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1207 206.0 3.6e-53 CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1174 200.6 1.2e-51 CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1145 196.0 3.1e-50 CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1131 193.8 1.5e-49 CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1118 191.7 6.4e-49 CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1108 190.0 1.9e-48 CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1098 188.4 5.9e-48 CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1091 187.3 1.3e-47 CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1077 185.1 6.1e-47 CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1073 184.4 9.5e-47 CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1067 183.5 1.9e-46 CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1061 182.5 3.6e-46 CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1041 179.3 3.5e-45 CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1021 176.1 3.3e-44 CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1015 175.1 6e-44 CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1013 174.8 7.5e-44 CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1008 174.0 1.3e-43 CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1008 174.0 1.3e-43 CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1007 173.8 1.5e-43 CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1002 173.0 2.5e-43 CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1002 173.0 2.6e-43 CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 998 172.4 3.9e-43 CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 997 172.2 4.4e-43 CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 994 171.8 6.2e-43 CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 987 170.6 1.3e-42 CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 980 169.5 2.9e-42 CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 974 168.5 5.6e-42 CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 968 167.6 1.1e-41 CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 960 166.3 2.7e-41 CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 959 166.1 3e-41 CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 958 166.0 3.5e-41 CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 940 163.1 2.5e-40 CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 938 162.8 3.2e-40 CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 938 162.8 3.2e-40 CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 938 162.8 3.2e-40 CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 935 162.3 4.4e-40 CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 899 156.5 2.4e-38 CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 898 156.4 2.7e-38 CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 894 155.7 4.2e-38 >>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 (309 aa) initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034 Z-score: 1786.3 bits: 338.6 E(32554): 3.5e-93 Smith-Waterman score: 2034; 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CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS 310 320 330 340 >>CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 (315 aa) initn: 717 init1: 717 opt: 1358 Z-score: 1199.9 bits: 230.2 E(32554): 1.6e-60 Smith-Waterman score: 1358; 66.8% identity (85.9% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF :. .:.:.::::::.:.: ::.::::::: :..:.:::::::: . .: .:::::::: CCDS73 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC :: ::::: ::..:::.:: ::: ...::::.::.::::.:.:::.:::::.::: : CCDS73 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY :::::::::::.:: . :: :::::. .:::.::.::. ..:.::::::::: :: :::. 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CCDS31 RKKVTSDND >>CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 (328 aa) initn: 1296 init1: 1296 opt: 1296 Z-score: 1145.9 bits: 220.2 E(32554): 1.7e-57 Smith-Waterman score: 1296; 64.3% identity (85.7% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF :.: .:::.:::::.::.: .:.:::::::.::.:::::::: ::. : .::: :::: CCDS31 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC :: ::..: :::...::.:. :. . .::...::.:::::::.::.:::::.::::: CCDS31 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY :::: :::::: :: . ::.:::::. .:::.::: :. ..:.::.:::::::: :::: CCDS31 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS :::.:.: ::. ::: ::::::. : ..: .:::: ::::. ::. ::. :.::: :: : CCDS31 PLLELLCLDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW :. ::.. ::::::::.::. .::.:: ..:::..:: :::::::.::.::: .:::.:: CCDS31 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 RRDLISSST CCDS31 CEKLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR 310 320 >>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa) initn: 1288 init1: 1288 opt: 1288 Z-score: 1139.3 bits: 218.9 E(32554): 3.9e-57 Smith-Waterman score: 1288; 61.4% identity (85.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF :: :.:.:.:::::.:.::: ::..::.:...::.:.:: .:::::.:.: .::::::. CCDS73 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC :: ::::: ::: .: ::. ..:...: :..::.:.: ::.:::.: .:: ::::: CCDS73 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY ::::::::::..:: : ::.::. : :.:::::...:. .:. ::::::::::::.::. CCDS73 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS :::.:.::::: . :...::.:. : . : :::.:: ::: ::.. : ..:.:::::: : CCDS73 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW :.:::..:::::::.: ::: :.::::.:..:::.::::::::::::.:..: .:..:: CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 RRDLISSST : :: CCDS73 SRKDISGDK >>CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 (309 aa) initn: 1262 init1: 1262 opt: 1262 Z-score: 1116.7 bits: 214.8 E(32554): 7e-56 Smith-Waterman score: 1262; 60.6% identity (84.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF : :.:::.:.:::.:.::: ::..::.: ..:: .:.::.:::::.:.: .: :::::: CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC :: ::::: ::: .:.::. .. :..: :..::.:.: ::.: : ::.:: ::::: CCDS31 LAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY :::::::::: ..:.: :: ::. :::::::::...:. .: ::::::::::::.::.: CCDS31 YVAICKPLHYTTVMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDLY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS :..:.::.::..::...::.:. : . ::::.: :::.:::. : ..:..::::: : CCDS31 TLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW :.:::.. :.::::.: :: :.::::.:.::::.:: :::::::::::..: .:..:: CCDS31 HITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 RRDLISSST : ::: CCDS31 SRKAISSVK >>CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 (309 aa) initn: 1272 init1: 1243 opt: 1243 Z-score: 1100.3 bits: 211.7 E(32554): 5.8e-55 Smith-Waterman score: 1243; 57.6% identity (84.8% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF :: ..:::.:.:::.:.: . :.. ..::..:. :.. :::::::. .:..: :::::: CCDS31 MENQNNVTEFILLGLTENLELWKIFSAVFLVMYVATVLENLLIVVTIITSQSLRSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC :. ::..:...:: ..:..: . ...::...:..:::.::.::: ..:: ::::: CCDS31 LTFLSLLDVMFSSVVAPKVIVDTLSKSTTISLKGCLTQLFVEHFFGGVGIILLTVMAYDR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY :::::::::: .:: :: :.. .:::::.:...:: ..: .::::::.::::.::.. 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CCDS31 MKWEALAGK >>CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 (329 aa) initn: 1312 init1: 1203 opt: 1236 Z-score: 1093.9 bits: 210.6 E(32554): 1.3e-54 Smith-Waterman score: 1236; 59.0% identity (84.7% similar) in 300 aa overlap (1-300:28-327) 10 20 30 pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFY :. .:.:.: .::..:: . :.::::.:::.: CCDS31 MQLVLLLMFLLVFIGNTAPAFSVTLESMDIPQNITEFFMLGLSQNSEVQRVLFVVFLLIY 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 ILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQ ..:. ::.:::::.: : ::.::.:::::.::::: .::::..:.::. .. . .::.. CCDS31 VVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYE 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 SCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDCYVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLH :::::: :..:: :..:: ::::: ::::::::: .:: . .:..:. :.:.::::: CCDS31 CCMAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLH 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 SVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLL :. :: .. :::::::::.:: ::.::::...::.:..::::::::.:: : . ::.: CCDS31 SLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLA 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 ISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFY :: :::.::.. : :: ::::::..:. ::..::::::: :..: :.::::....:: CCDS31 ASYIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMALFY 250 260 270 280 290 300 280 290 300 pF1KE5 TVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLWRRDLISSST ..::::::::::::: :. .::.::. CCDS31 GILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW 310 320 >>CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 (310 aa) initn: 1217 init1: 1217 opt: 1217 Z-score: 1077.7 bits: 207.5 E(32554): 1e-53 Smith-Waterman score: 1217; 55.9% identity (82.0% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF :. ..: .:.:::.::.: .::..::.::.::. :.:::.::.::. :.::::::::: CCDS31 MQQNNSVPEFILLGLTQDPLRQKIVFVIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHLFGGSEVFLLLVMAYDC : ::: : .:.: .:::: . .. :... ::.:.: :::: :.:.:..:: : CCDS31 LFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSEKKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVLLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY ::::::::.: .:: : ::..:.:..:.:...::. :. . :::::: .:::. ::. 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