FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4259, 1038 aa 1>>>pF1KE4259 1038 - 1038 aa - 1038 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0883+/-0.000583; mu= 7.7220+/- 0.036 mean_var=152.8841+/-31.268, 0's: 0 Z-trim(111.3): 58 B-trim: 246 in 2/48 Lambda= 0.103727 statistics sampled from 19850 (19889) to 19850 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16 Scan time: 10.530 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006382 (OMIM: 605586) importin-7 [Homo sapiens] (1038) 6944 1052.6 0 NP_006381 (OMIM: 605600) importin-8 isoform 1 [Hom (1037) 4591 700.4 1.3e-200 XP_016874180 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8 (1020) 4479 683.7 1.4e-195 XP_016874181 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8 ( 975) 4361 666.0 2.8e-190 NP_001177924 (OMIM: 605600) importin-8 isoform 2 [ ( 832) 3684 564.7 7.7e-160 XP_016874182 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8 ( 532) 2539 393.2 2e-108 XP_011526901 (OMIM: 601342) PREDICTED: exportin-2 ( 945) 362 67.6 3.8e-10 NP_001307 (OMIM: 601342) exportin-2 isoform 1 [Hom ( 971) 362 67.6 3.9e-10 NP_001243064 (OMIM: 601342) exportin-2 isoform 2 [ ( 915) 250 50.8 4.2e-05 NP_057422 (OMIM: 610889) importin-11 isoform 2 [Ho ( 975) 201 43.5 0.0071 NP_001128251 (OMIM: 610889) importin-11 isoform 1 (1015) 201 43.5 0.0073 >>NP_006382 (OMIM: 605586) importin-7 [Homo sapiens] (1038 aa) initn: 6944 init1: 6944 opt: 6944 Z-score: 5625.7 bits: 1052.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6944; 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