FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4259, 1038 aa 1>>>pF1KE4259 1038 - 1038 aa - 1038 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7329+/-0.00134; mu= 9.5413+/- 0.081 mean_var=125.4365+/-24.869, 0's: 0 Z-trim(103.7): 48 B-trim: 2 in 1/50 Lambda= 0.114515 statistics sampled from 7496 (7519) to 7496 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16 Scan time: 3.910 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31425.1 IPO7 gene_id:10527|Hs108|chr11 (1038) 6944 1159.8 0 CCDS8719.1 IPO8 gene_id:10526|Hs108|chr12 (1037) 4591 771.0 0 CCDS53773.1 IPO8 gene_id:10526|Hs108|chr12 ( 832) 3684 621.1 2.9e-177 CCDS13412.1 CSE1L gene_id:1434|Hs108|chr20 ( 971) 362 72.3 5.5e-12 >>CCDS31425.1 IPO7 gene_id:10527|Hs108|chr11 (1038 aa) initn: 6944 init1: 6944 opt: 6944 Z-score: 6205.0 bits: 1159.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6944; 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CCDS87 TMCLQVAIAALYYNPDLLLHTLERIQLPHNPGPITVQFINQWMNDTDCFLGHHDRKMCII 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE4 GLCALIDMEQIPQVLNQVSGQILPAFILLFNGLKRAYACHAEHENDSDDDDEAE--DDDE :: :..... : ... : :::.:....:: :::.. : ... . .: ..:: : .: CCDS87 GLSILLELQNRPPAVDAVVGQIVPSILFLFLGLKQV--CATRQLVNREDRSKAEKADMEE 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KE4 TEELGSDEDDIDEDGQEYLEILAKQAGEDGDDEDWEEDDAEETALEGYSTIIDDEDNPVD .::..:::.. . .: . .. :. .:.::.:. :::::::.:: .: :: :: CCDS87 NEEISSDEEETNVTAQAMQSNNGRGEDEEEEDDDWDEEVLEETALEGFSTPLD-LDNSVD 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE4 EYQIFKAIFQTIQNRNPVWYQALTHGLNEEQRKQLQDIATLADQRRAAHESKM-IEKHGG :::.: . :.:.:. .::: : :.:.:: ::.. :::..::.. :.: ::..:: CCDS87 EYQFFTQALITVQSRDAAWYQLLMAPLSEDQRTALQEVYTLAEHRRTVAEAKKKIEQQGG 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE4 YKFSAPVVPSSFNFGGPAPGMN . : : :.:::: .:. : CCDS87 FTFENKGVLSAFNFG-TVPSNN 1020 1030 >>CCDS53773.1 IPO8 gene_id:10526|Hs108|chr12 (832 aa) initn: 2183 init1: 1960 opt: 3684 Z-score: 3295.8 bits: 621.1 E(32554): 2.9e-177 Smith-Waterman score: 3684; 64.9% identity (86.6% similar) in 829 aa overlap (213-1038:9-832) 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 DRFIQLLSDQSDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRDVPN :.:::.:.:.:..: :.::..:...: :: CCDS53 MESLTLKGYALPLQLVNNQTMTTWMEIFRTIIDRTVPP 10 20 30 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 ETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVGVQQ :::...::::::: :::::::::::.:::::::::::::.::: ::.: :::..:::.:: CCDS53 ETLHIDEDDRPELVWWKCKKWALHIVARLFERYGSPGNVTKEYFEFSEFFLKTYAVGIQQ 40 50 60 70 80 90 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 VLLKVLYQYKEKQYMAPRVLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMCYTD ::::.: ::..:.:.:::::::..::.:::: :..:::..:::::.: .:::: .::: : CCDS53 VLLKILDQYRQKEYVAPRVLQQAFNYLNQGVVHSITWKQMKPHIQNISEDVIFSVMCYKD 100 110 120 130 140 150 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 ADEELWQEDPYEYIRMKFDVFEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQILTEP ::::::::::::::::::.:::. ::::::::::.:: .:::::: : :.:::::::.: CCDS53 EDEELWQEDPYEYIRMKFDIFEDYASPTTAAQTLLYTAAKKRKEVLPKMMAFCYQILTDP 160 170 180 190 200 210 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 NADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARACWVLHY : ::::::::::.:::::::::::...::::: .::::::::. :.:::.:::.::::: CCDS53 NFDPRKKDGALHVIGSLAEILLKKSLFKDQMELFLQNHVFPLLLSNLGYLRARSCWVLHA 220 230 240 250 260 270 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 FCEVKFKSDQNLQTALELTRRCLIDDREMPVKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFIRPV : .::... ::..:.::... ::.:.:::::::::.::: ::::: .::::. : .::. 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CCDS13 NEYIMKAIMRSFSLLQEAIIPYIPTLITQLTQKL-LAVSKNPSKPHFNHYMFEAI----C 570 580 590 600 610 620 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 IDTLLSVVEDHKEITQQLEGICLQVIGTVLQQHVLEFYEEIFSLAHSL--TCQQVSPQMW .. .. . ... :.. : :. .::. : :: .:.. : : .. :. . CCDS13 LSIRITCKANPAAVVNFEEALFL-VFTEILQNDVQEFIPYVFQVMSLLLETHKNDIPSSY 630 640 650 660 670 680 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 Q-LLPLVFEVFQQDGFDYFTDMMPLLHNYVTVDTDTLLSDTK-YLEMIYSMCKKVLTGVA . :.: ... . . .. ::. .. ..:. : . . . .. .:. .: CCDS13 MALFPHLLQPVLWERTGNIPALVRLLQAFLERGSNTIASAAADKIPGLLGVFQKL---IA 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 GEDAECHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVEAALERLTREVKTSELRTMCLQVAIAAL .. . .. ::. :: . ...:: . ..:: :. .... . . . . CCDS13 SKANDHQGFYLLNSIIEHMPPESVDQYRKQIFILLFQRLQNSKTTKFIKSFLVFINLYCI 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 pF1KE4 YYNPHLLLNTLENLRFPNNVEPVTNHFITQWLNDVDCFLGLHDRKMCVLGLCALIDMEQI :. : . ..... :. : ...: .. :. : ..:.:..:. : . . 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