Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5950
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5950, 312 aa
1>>>pF1KE5950 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3587+/-0.00123; mu= 15.0888+/- 0.072
mean_var=133.3019+/-43.525, 0's: 0 Z-trim(102.3): 386 B-trim: 771 in 2/45
Lambda= 0.111085
statistics sampled from 6394 (6892) to 6394 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 2.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 2065 343.2 1.5e-94
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1508 254.0 1.1e-67
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1471 248.1 7e-66
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1445 243.9 1.2e-64
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1311 222.4 3.6e-58
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1227 209.0 4.1e-54
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1225 208.6 5.1e-54
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1217 207.3 1.2e-53
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1182 201.7 6.1e-52
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1172 200.1 1.8e-51
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1119 191.6 6.7e-49
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1109 190.0 2e-48
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1095 187.8 9.5e-48
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1088 186.7 2.1e-47
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1086 186.3 2.6e-47
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1081 185.5 4.5e-47
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1080 185.4 5e-47
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1070 183.8 1.5e-46
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1068 183.5 2e-46
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1062 182.5 3.7e-46
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1046 179.9 2.2e-45
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1016 175.2 6.4e-44
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1015 175.0 6.8e-44
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1007 173.7 1.7e-43
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1000 172.6 3.6e-43
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 995 171.8 6.3e-43
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 986 170.3 1.7e-42
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 979 169.2 3.7e-42
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 972 168.1 8.1e-42
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 964 166.8 2e-41
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 957 165.7 4.6e-41
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 936 162.3 4.5e-40
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 935 162.2 5e-40
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 932 161.7 7e-40
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 896 155.9 3.8e-38
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 887 154.5 1e-37
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 885 154.1 1.3e-37
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 870 151.7 6.7e-37
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 855 149.4 3.8e-36
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 812 142.4 4.3e-34
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 789 138.7 5.5e-33
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 785 138.2 9.3e-33
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 772 136.0 3.6e-32
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 768 135.4 5.7e-32
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 763 134.6 9.8e-32
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 729 129.1 4.4e-30
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 721 127.9 1.1e-29
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 695 123.7 1.9e-28
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 672 120.0 2.4e-27
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 660 118.1 9.1e-27
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 2065 init1: 2065 opt: 2065 Z-score: 1810.9 bits: 343.2 E(32554): 1.5e-94
Smith-Waterman score: 2065; 98.7% identity (99.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILHLPFCGHNIIPHTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFHLPSQDVRLKAFN
::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS31 CEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 REQIVKIFVQKE
::::::::::::
CCDS31 REQIVKIFVQKE
310
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1500 init1: 1475 opt: 1508 Z-score: 1328.4 bits: 254.0 E(32554): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1508; 69.4% identity (90.3% similar) in 310 aa overlap (1-310:5-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHS
: . : :.:.: :::::::::. .::::. :: .:::.:..:: ..::::.::.:
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LHQPMFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVL
::.::.::::::. :::::::.:::::::::::: .:::::::: .:::::.::.::...
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LVVMAYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILHLPFCGHNII
::.::.::..:::.::.::::::.: ::..:...: :.: .:.:.:::.:.:::::: ::
CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PHTYCEHMGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFHLPSQDVRL
:::::::::.: :::: ::.:: .:: :: ...::::: ::: :: ::: ::: ..::
CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFNTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVR
::.::::::. :.: :.:::::::.:::::.:::.::::.::::::::::::::::::::
CCDS31 KALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TKQIREQIVKIFVQKE
::::::....::..
CCDS31 TKQIRERVLRIFLKTNH
310
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 1513 init1: 1471 opt: 1471 Z-score: 1296.3 bits: 248.1 E(32554): 7e-66
Smith-Waterman score: 1471; 68.8% identity (88.3% similar) in 308 aa overlap (5-312:5-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
:::.:.: :::::::::.::::::.:::: ::.::..::.:::.::::. :::::
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
::::::::. :.::::.::::::::::.::. : : .:: :::::: :: ::...::.:
CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILHLPFCGHNIIPHTY
::: .:::::::::. :::::..:... : : :..: : ..:::.:::::...:::::
CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHVIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFHLPSQDVRLKAFN
::::::: :.:: ::::::::: .: .. :. .:: ::: :: :::.::....:::...
CCDS31 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
::::::::.: :::::.:::::::::.:.:.::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS31 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 REQIVKIFVQKE
. . ::..:..
CCDS31 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
310 320
>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1487 init1: 1445 opt: 1445 Z-score: 1273.9 bits: 243.9 E(32554): 1.2e-64
Smith-Waterman score: 1445; 67.0% identity (87.8% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
:: :::.:. :::::::::. .::::.::: :::::..:: .:.:::.::.:::.:
CCDS53 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
:.: ::::. :::.:::.::::::::::::..:::::: : ::::::.:: ::...::.:
CCDS53 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILHLPFCGHNIIPHTY
:.::..:::.:: ::::::.: ::..:...: :.: .: :.:::.:.:::::: ::::::
CCDS53 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFHLPSQDVRLKAFN
:::::.: :::: ::.::..:: :: ...::.:: :.. :: ::: ::: ..::::.:
CCDS53 CEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKALN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
:::::. :.: : :::::::.:: ::..::.::::.::::::::::.:::::::::::.:
CCDS53 TCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKHI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 REQIVKIFVQKE
:: ...:: . .
CCDS53 RETVLRIFFKTDH
310
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1305 init1: 1276 opt: 1311 Z-score: 1157.9 bits: 222.4 E(32554): 3.6e-58
Smith-Waterman score: 1311; 58.0% identity (87.6% similar) in 307 aa overlap (5-311:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
: . :.: :.:.:::::. .:.::: ::: :::.:..:: :::.:::.:..:..:
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
::::::.:: :::.:::...:.:::::::. .::..:.:. :::.:: :::::. .:..:
CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILHLPFCGHNIIPHTY
:.::.::.: ::.:. :::.... .. .: : ..:. :.:.:: .:::: .:: :.:
CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFHLPSQDVRLKAFN
:::::.: :.:. :.:: ::::.:.:.......::. ::: ::::::.:::.:..:::..
CCDS31 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
:::.:: :. :: :. :::.:::::..:: :::::.::::...::.:::.:::::::::
CCDS31 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 REQIVKIFVQKE
::... .:..:
CCDS31 RERVLYVFTKK
310
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1198 init1: 705 opt: 1227 Z-score: 1085.0 bits: 209.0 E(32554): 4.1e-54
Smith-Waterman score: 1227; 55.2% identity (83.5% similar) in 310 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
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CCDS53 YCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKA
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CCDS31 GVKTKQIRDKVILLFSKGTG
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CCDS31 MSDSNLSDNHL-PDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALH
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CCDS31 AMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTH
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CCDS31 TYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHK
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CCDS31 ALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGAR
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CCDS31 TKEIRSRLLKLLHLGKTSI
300 310
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CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
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CCDS44 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAF
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CCDS44 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
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CCDS31 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
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CCDS31 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
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CCDS31 CDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAF
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CCDS31 QIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]