FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6059, 320 aa 1>>>pF1KE6059 320 - 320 aa - 320 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0790+/-0.000512; mu= 16.4194+/- 0.032 mean_var=62.1692+/-13.654, 0's: 0 Z-trim(106.6): 184 B-trim: 887 in 1/48 Lambda= 0.162662 statistics sampled from 14439 (14686) to 14439 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.506), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16 Scan time: 6.500 The best scores are: opt bits E(85289) NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 1021 248.9 1e-65 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 964 235.5 1.1e-61 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 575 144.2 3.3e-34 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 544 136.9 5.1e-32 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 540 136.0 9.8e-32 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 540 136.0 9.8e-32 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 540 136.0 9.8e-32 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 540 136.0 1e-31 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 536 135.1 1.9e-31 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 536 135.1 1.9e-31 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 536 135.1 1.9e-31 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 519 131.1 2.9e-30 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 504 127.6 3.4e-29 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 498 126.2 9.2e-29 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 495 125.4 1.5e-28 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 494 125.2 1.7e-28 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 486 123.3 6.4e-28 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 482 122.4 1.2e-27 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 465 118.4 1.9e-26 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 465 118.4 2e-26 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 464 118.2 2.3e-26 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 453 115.6 1.3e-25 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 174 50.1 6.9e-06 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 174 50.1 7.7e-06 NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 157 46.2 0.00013 XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 157 46.2 0.00013 XP_016861176 (OMIM: 604836) PREDICTED: C-C chemoki ( 360) 154 45.5 0.0002 NP_005499 (OMIM: 604836) C-C chemokine receptor ty ( 360) 154 45.5 0.0002 NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 153 45.2 0.00023 XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 153 45.2 0.00023 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 152 45.0 0.00025 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 147 43.8 0.00059 NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 145 43.3 0.00088 NP_001116868 (OMIM: 601267) C-C chemokine receptor ( 360) 145 43.3 0.00088 XP_011532371 (OMIM: 601267) PREDICTED: C-C chemoki ( 360) 145 43.3 0.00088 XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 145 43.3 0.00088 NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 145 43.4 0.00095 XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 145 43.4 0.001 XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 145 43.4 0.001 XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 145 43.4 0.001 XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 145 43.4 0.001 XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 145 43.4 0.001 NP_005675 (OMIM: 604106) probable G-protein couple ( 361) 142 42.6 0.0014 NP_940799 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 366) 142 42.6 0.0015 NP_004113 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 289) 137 41.4 0.0027 NP_001093638 (OMIM: 601373,609532,610379,612522) C ( 352) 137 41.5 0.0032 NP_000570 (OMIM: 601373,609532,610379,612522) C-C ( 352) 137 41.5 0.0032 NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 135 41.0 0.0053 XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 135 41.1 0.0055 NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 133 40.5 0.0057 >>NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [Homo (318 aa) initn: 1006 init1: 777 opt: 1021 Z-score: 1300.7 bits: 248.9 E(85289): 1e-65 Smith-Waterman score: 1021; 45.9% identity (77.9% similar) in 307 aa overlap (5-310:6-309) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHR ::. . . ::: :.::::....:..::::..: ::. ::. ..:.. ...::. 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NP_001 IYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP 290 300 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 520 init1: 466 opt: 540 Z-score: 690.8 bits: 136.0 E(85289): 9.8e-32 Smith-Waterman score: 540; 31.9% identity (64.5% similar) in 304 aa overlap (4-303:1-298) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MSFLNGTSLTPAS-FILNGIPGL-EDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALH ..::. . .: :.: :. .. :: . : : .:: .. ::. .. . : :: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFL-SMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 RPMYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLM ::: ::. :::.:. . .:.:. : .. . :.: .::.::.:: :. :.. .: NP_036 TPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LMALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAK--AGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVI .:: :: ::.: ::.:.. .:... : ::. .. . . :. :.: : .: :.: NP_036 VMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGL--WVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 PHTYCDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADAR : .:: . :.::.....: . : . :. .::: :: : .:... :. .: NP_036 THFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 QKAFSTCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYG :::::: .:. :.:: . .... . . ...:. . . . :: .. : .::..:. NP_036 WKAFSTCGSHL-AVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSA--EKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 VKTRQVRESVIRFFLKGKDNSHNF ...: .. NP_036 LRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 300 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 520 init1: 466 opt: 540 Z-score: 690.8 bits: 136.0 E(85289): 9.8e-32 Smith-Waterman score: 540; 31.9% identity (64.5% similar) in 304 aa overlap (4-303:1-298) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MSFLNGTSLTPAS-FILNGIPGL-EDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALH ..::. . .: :.: :. .. :: . : : .:: .. ::. .. . : :: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFL-SMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 RPMYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLM ::: ::. :::.:. . .:.:. : .. . :.: .::.::.:: :. :.. .: XP_011 TPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LMALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAK--AGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVI .:: :: ::.: ::.:.. .:... : ::. .. . . :. :.: : .: :.: XP_011 VMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGL--WVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 PHTYCDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADAR : .:: . :.::.....: . : . :. .::: :: : .:... :. .: XP_011 THFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 QKAFSTCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYG :::::: .:. :.:: . .... . . ...:. . . . :: .. : .::..:. XP_011 WKAFSTCGSHL-AVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSA--EKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 VKTRQVRESVIRFFLKGKDNSHNF ...: .. XP_011 LRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 300 310 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 497 init1: 473 opt: 540 Z-score: 690.7 bits: 136.0 E(85289): 9.8e-32 Smith-Waterman score: 540; 30.0% identity (63.1% similar) in 320 aa overlap (1-317:1-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP : : . . . ::: :.: .... . . . :.:.: . ::.::: :: : :. : NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM :: ::. :::.:. . .. .:. : . . : :.. .: :..: ::. :: .: : NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVIPHTY : :. :::: :: :..... .. . :..: : : . : .. : :: ::: : . 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NP_006 KTFSTCASHLTSVTI-YQGTLL--FIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 KTRQVRESVIRFFLKGKDNSHNF ....:.... . . . :.: NP_006 RNKDVKDAAEKVLRSKVDSS 300 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 520 init1: 466 opt: 540 Z-score: 690.6 bits: 136.0 E(85289): 1e-31 Smith-Waterman score: 540; 31.9% identity (64.5% similar) in 304 aa overlap (4-303:11-308) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MSFLNGTSLTPAS-FILNGIPGL-EDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLI ..::. . .: :.: :. .. :: . : : .:: .. ::. .. . XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFL-SMYLATVLGNLLIILSV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YCDEALHRPMYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTG : :: ::: ::. :::.:. . .:.:. : .. . :.: .::.::.:: :. 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XP_011 LNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 300 310 320 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 485 init1: 485 opt: 536 Z-score: 685.6 bits: 135.1 E(85289): 1.9e-31 Smith-Waterman score: 536; 29.5% identity (66.6% similar) in 302 aa overlap (14-312:12-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP ::: :. . :... . . .:: ... :: .. :: : :: : XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM :: ::. ::..:: . ::..:. : . . : : :..: ::.:: .. :.: .: .: XP_011 MYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVIPHTY : :. ::.: :::..:. ... :. .. ... : . .: .: ::.:... : : XP_011 AYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHIS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE6 CDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLI--VALLIGGFDILC-ITISYTMILQAVVSLSSADARQ :. ..:....: .. : . .. ..::. : : . .:: .:........: ..:. 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