FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6052, 318 aa 1>>>pF1KE6052 318 - 318 aa - 318 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9228+/-0.00122; mu= 11.7672+/- 0.070 mean_var=152.3695+/-51.422, 0's: 0 Z-trim(102.3): 382 B-trim: 778 in 2/46 Lambda= 0.103902 statistics sampled from 6387 (6908) to 6387 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16 Scan time: 1.760 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 2078 324.3 7.8e-89 CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1277 204.2 1.1e-52 CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1229 197.1 1.6e-50 CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1160 186.7 2.1e-47 CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1140 183.7 1.6e-46 CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1089 176.1 3.3e-44 CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1085 175.5 5e-44 CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1071 173.3 2.1e-43 CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1069 173.1 2.6e-43 CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1067 172.8 3.2e-43 CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1063 172.2 4.9e-43 CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1058 171.4 8.3e-43 CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1057 171.3 9.2e-43 CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1055 170.9 1.1e-42 CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1050 170.3 2e-42 CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1045 169.4 3.2e-42 CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1045 169.5 3.2e-42 CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1030 167.2 1.5e-41 CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1026 166.6 2.4e-41 CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1020 165.7 4.3e-41 CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1020 165.7 4.4e-41 CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1017 165.3 5.8e-41 CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1005 163.5 2.1e-40 CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1001 162.9 3.1e-40 CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1001 162.9 3.1e-40 CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 995 162.0 5.8e-40 CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 993 161.7 7e-40 CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 979 159.6 3e-39 CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 976 159.1 4.1e-39 CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 972 158.5 6.4e-39 CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 960 156.7 2.2e-38 CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 956 156.2 3.5e-38 CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 953 155.7 4.5e-38 CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 952 155.5 5e-38 CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 925 151.5 8.2e-37 CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 910 149.3 4.1e-36 CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 859 141.6 8e-34 CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 848 140.0 2.6e-33 CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 838 138.4 6.9e-33 CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 827 136.8 2.2e-32 CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 822 136.0 3.7e-32 CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 820 135.7 4.5e-32 CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 817 135.4 6.8e-32 CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 813 134.7 9.5e-32 CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 812 134.5 1e-31 CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 754 125.8 4.3e-29 CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 753 125.7 4.8e-29 CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 647 109.8 2.9e-24 CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 642 109.1 4.9e-24 CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 634 107.8 1.1e-23 >>CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 (318 aa) initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 1708.3 bits: 324.3 E(32554): 7.8e-89 Smith-Waterman score: 2078; 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CCDS77 QIRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK 300 310 320 >>CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 (324 aa) initn: 1195 init1: 965 opt: 1229 Z-score: 1020.5 bits: 197.1 E(32554): 1.6e-50 Smith-Waterman score: 1229; 57.9% identity (84.2% similar) in 311 aa overlap (1-309:10-319) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGL-EEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIY ... ::: :.::.:.:.::: .:::::::: .: .:.::::::. CCDS31 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 IVRTEHSLHEPMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSL :.:.:. ::::::.:: ::: ::...:. .:::: ..: .. :.:. :: ::: ::.: CCDS31 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SGMESTVLLAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLP :..::.:::::::::.::::::::::.::: :.:::..:..:: ... ::: ..: : CCDS31 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FCRSNILSHSYCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLG .:... ..::.:::::.:::.: : ::::::::..:.:..:.:::.:.:::.::: .:: CCDS31 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE6 LT-REAQAKAFGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVL :. :.: :::.::.::.:::..::::.::::.:::.. : : :..:: :::.:::. CCDS31 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPT-SLLHVVMANTYLLLPPVV 250 260 270 280 290 290 300 310 pF1KE6 NPIVYGVKTKEIRQRILRLFHVATHASEP ::.:::.::::: .:.: .: CCDS31 NPLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK 300 310 320 >>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa) initn: 1127 init1: 841 opt: 1160 Z-score: 964.7 bits: 186.7 E(32554): 2.1e-47 Smith-Waterman score: 1160; 52.2% identity (83.0% similar) in 312 aa overlap (1-309:1-312) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MMVDPNGNESSATY--FILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSL : . :: ::.. :.: :.::::. ..:...::: .::... :: ::..:..::.:: CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 HEPMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVL :::::.:: ::. ::. .: ..: .:.::: .. :. :::. :.: :: .: .::.:: CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILS :.:::::.:::::::.....:: . .::.... :..::. ::: ..:..:.: : .:: CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 HSYCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TREAQA :::::::.:::::: :...: .::..::.:..:.::::: ::: :::.:::.. .: . 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CCDS31 KQIRESLLQIPRIEMKIR 300 310 >>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa) initn: 1049 init1: 963 opt: 1071 Z-score: 892.6 bits: 173.3 E(32554): 2.1e-43 Smith-Waterman score: 1071; 53.7% identity (82.1% similar) in 296 aa overlap (13-306:12-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHE : :.:.:.:::: :..:...:.::.::::.::: ::..:..:: :::: CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 PMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVLLA ::: :: ::. :. .: ::.: .:.:: ::. :. .::. : : ::..: .::.::: CCDS31 PMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 MAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILSHS :.:::..:: .:::....:: ::..::.. .. :. :.: ...: .:..: :::: CCDS31 MSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE6 YCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TREAQAKA ::::::::::::.: :..:.::.. . . .: .::. :: ::::::::. ... : :: CCDS31 YCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 FGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPL-PVILANIYLLVPPVLNPIVYGVKT ..:::::.:::.:::.:.:.:..::::. :. ::: :..::. :::::. ::::: ::: CCDS31 LNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFA-RHVSPLINVLMANVLLLVPPLTNPIVYCVKT 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 KEIRQRILRLFHVATHASEP :.:: :.. CCDS31 KQIRVRVVAKLCQRKI 300 310 >>CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 (314 aa) initn: 780 init1: 761 opt: 1069 Z-score: 891.0 bits: 173.1 E(32554): 2.6e-43 Smith-Waterman score: 1069; 48.7% identity (79.4% similar) in 310 aa overlap (2-310:1-310) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHE :. ::. . . . : :.::.. . :.:. .: ::.:...:::.:. .: : .::. 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CCDS31 QIREYVLSLFQRKNM 300 310 318 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 09:04:02 2016 done: Tue Nov 8 09:04:02 2016 Total Scan time: 1.760 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]