FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6005, 314 aa 1>>>pF1KE6005 314 - 314 aa - 314 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8236+/-0.00123; mu= 12.7667+/- 0.072 mean_var=183.3399+/-66.496, 0's: 0 Z-trim(102.2): 365 B-trim: 413 in 1/45 Lambda= 0.094721 statistics sampled from 6406 (6845) to 6406 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16 Scan time: 2.180 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 2057 294.4 7.4e-80 CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1874 269.4 2.5e-72 CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1140 169.1 3.9e-42 CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1133 168.2 7.5e-42 CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1132 168.0 8.3e-42 CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1124 167.0 1.8e-41 CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1118 166.2 3.2e-41 CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1109 164.9 7.4e-41 CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1091 162.5 4.1e-40 CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1086 161.8 6.6e-40 CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1084 161.5 7.9e-40 CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1079 160.8 1.3e-39 CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1074 160.1 2e-39 CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1074 160.1 2.1e-39 CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1071 159.7 2.7e-39 CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1071 159.7 2.7e-39 CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1070 159.6 2.9e-39 CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1063 158.6 5.8e-39 CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1056 157.7 1.1e-38 CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1056 157.7 1.1e-38 CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1048 156.6 2.5e-38 CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1047 156.4 2.6e-38 CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1041 155.6 4.6e-38 CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1039 155.4 5.7e-38 CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1031 154.3 1.2e-37 CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1028 153.8 1.6e-37 CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1026 153.6 2e-37 CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1014 151.9 5.9e-37 CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1011 151.5 7.9e-37 CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1004 150.6 1.6e-36 CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 996 149.5 3.3e-36 CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 996 149.5 3.3e-36 CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 984 147.8 1e-35 CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 972 146.2 3.2e-35 CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 954 143.7 1.7e-34 CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 936 141.3 9.7e-34 CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 914 138.3 8.2e-33 CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 913 138.1 8.6e-33 CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 896 135.9 4.5e-32 CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 851 129.7 3e-30 CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 846 129.0 4.8e-30 CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 842 128.5 7.7e-30 CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 836 127.6 1.2e-29 CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 812 124.3 1.2e-28 CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 798 122.4 4.6e-28 CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 785 120.6 1.6e-27 CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 760 117.2 1.7e-26 CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 748 115.6 5.3e-26 CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 684 106.8 2.2e-23 CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 651 102.3 5.1e-22 >>CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 (314 aa) initn: 2057 init1: 2057 opt: 2057 Z-score: 1547.2 bits: 294.4 E(32554): 7.4e-80 Smith-Waterman score: 2057; 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CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LHEPMYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAV :::::: ::::: .::: ::....::::.:::: .::.: .::..:::.: :. ::: : CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LLAMAFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVI :.:::::::.::::::.:: .::...:. :. :: :.. ...:: ::: . .: .: CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 AHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEAR : :::::...::::.. . : .:.. . ...::..:.::::. :: ::. : : ::: CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLG-NISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEAR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 YKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGV ::..:: ::::.::::.: . .: . :: ... ..::.:::.:.. :: .::.:::: CCDS31 LKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 KTKQIRESILGVFPRKDM .:::::: .: .: CCDS31 RTKQIRERVLRIFLKTNH 300 310 >>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa) initn: 1177 init1: 791 opt: 1133 Z-score: 864.8 bits: 168.2 E(32554): 7.5e-42 Smith-Waterman score: 1133; 51.0% identity (81.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP : : .. ::..:.:.:::::: .:.::: ::: .: .::::: :.::.:... .:.:: CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM :. :::.:..:::.::....:.::.:::: .:::. ::.::::..:.:. ::. ::::: CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVIAHCY :::::::.: ::::. .::..... :.: : : : : :. .:. . .:.. .::: : CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 CEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKAF ::::....:.::. .:.:::. :. :.: :.:.:. .::..::.::. : :..:. ::. CCDS31 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFV-LNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKAL 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 GTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ .:: .:.:.: .:: :.: . :: ... ..:::.::.::..:: .:::::::.::: CCDS31 STCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQ 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE6 IRESILGVFPRKDM ::: .: :: .: CCDS31 IRERVLYVFTKK 300 310 >>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa) initn: 1146 init1: 1127 opt: 1132 Z-score: 864.0 bits: 168.0 E(32554): 8.3e-42 Smith-Waterman score: 1132; 53.4% identity (82.8% similar) in 309 aa overlap (2-309:9-312) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQA :.:... : ::: ::::::..:::::::.:. : ... ::::.:.::.. CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSAT----FLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 DAALHEPMYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIME . .:::::::::.::: ::: :: .:: .:.::: :::. ::.::.::.: ::..: CCDS31 ERSLHEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SAVLLAMAFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRG :.:::.:::::.::::.::::...::...: .::.....:.:.:. ::::.:. : :: . CCDS31 SSVLLSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 PVIAHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQ ::..: :: :. :..:::.: . :.:::. : . : .: ::...:: .::..:: .::. CCDS31 PVLSHSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 EARYKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPH-VHILLANFYLLFPPMVNPI :.::..:::::: :.: ::: .. ::.:: ...: :: :..... .::::::..::: CCDS31 AERFKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQA-PHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPI 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 IYGVKTKQIRESILGVFPRKDM .:.:::::::. . .: CCDS31 VYSVKTKQIRDRVTHAFCY 300 310 >>CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 (317 aa) initn: 1138 init1: 605 opt: 1124 Z-score: 858.1 bits: 167.0 E(32554): 1.8e-41 Smith-Waterman score: 1124; 51.5% identity (82.6% similar) in 305 aa overlap (11-314:11-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP :..: :.:::::: ::.:.:::: : .:..:: :.: ... . .::.: CCDS31 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM ::.:: ::::::::::.:..::.:.:::: .:.. :::.:::..: :. .::...::: CCDS31 MYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMFLIHCFATVESGIFLAM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRC-FHYCRGPVIAHC :::::::::.::... ::: ... ..:.... :.: . :::...: . . ::.: CCDS31 AFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVISHS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 YCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKA :::::::: :.:::. ::.::.........:: . . ::..:..::. ::. ::: :. 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CCDS53 CEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKAL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 GTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ .:: ::. .:: ::. .. . :. .:. ::::::::.:. :::.:::.::::::: CCDS53 STCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYGVKTKQ 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 IRESILGVFPRKDM :::.. : CCDS53 IREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS 310 320 >>CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 (320 aa) initn: 1055 init1: 1055 opt: 1086 Z-score: 830.0 bits: 161.8 E(32554): 6.6e-40 Smith-Waterman score: 1086; 49.5% identity (83.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-306) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP ::. : .:: : :.:.::::::. :.:...:. :..:..::: ...:.... .:: : CCDS77 MSSCN--FTHAT-FVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSLHAP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM ::::: :::::::.::.:..::.::.::: .:::.: :::.::::.:..: .::..:::: CCDS77 MYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTILLAM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVIAHCY :::::::::.::... ::.... ..::..::.:. .. :::.:.. . .:.. :..: : CCDS77 AFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLSHSY 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 CEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKAF : :. :..:: .:: : .::... .... .:.... :::..:...:: : :. : ::: CCDS77 CVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERAKAF 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 GTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ ::::::::..::::. .. ::.:: . : :.......:::.::..::::::.:::: CCDS77 GTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAKTKQ 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE6 IRESILGVFPRKDM :: .:..: CCDS77 IRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK 300 310 320 314 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:39:57 2016 done: Tue Nov 8 08:39:57 2016 Total Scan time: 2.180 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]