FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2540, 974 aa 1>>>pF1KE2540 974 - 974 aa - 974 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5018+/-0.000404; mu= 7.7388+/- 0.025 mean_var=215.3014+/-44.573, 0's: 0 Z-trim(117.6): 54 B-trim: 272 in 1/57 Lambda= 0.087408 statistics sampled from 29676 (29730) to 29676 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16 Scan time: 12.930 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001073981 (OMIM: 601331,614295) protein bicauda ( 974) 6352 814.9 0 XP_016872166 (OMIM: 601331,614295) PREDICTED: prot ( 930) 5946 763.6 0 XP_011538487 (OMIM: 601331,614295) PREDICTED: prot ( 998) 5946 763.7 0 XP_016872167 (OMIM: 601331,614295) PREDICTED: prot ( 926) 5937 762.5 0 XP_011538490 (OMIM: 601331,614295) PREDICTED: prot (1003) 5937 762.5 0 XP_005270226 (OMIM: 601331,614295) PREDICTED: prot ( 927) 5832 749.3 2.2e-215 XP_011538491 (OMIM: 601331,614295) PREDICTED: prot ( 922) 5826 748.5 3.6e-215 XP_011538492 (OMIM: 601331,614295) PREDICTED: prot ( 894) 5821 747.9 5.5e-215 XP_011538493 (OMIM: 601331,614295) PREDICTED: prot ( 846) 5510 708.6 3.4e-203 XP_016869936 (OMIM: 615370,615382) PREDICTED: anky ( 469) 257 46.0 0.00056 XP_011516659 (OMIM: 615370,615382) PREDICTED: anky ( 556) 257 46.1 0.00063 NP_775822 (OMIM: 615370,615382) ankyrin repeat and ( 871) 259 46.5 0.00074 XP_016869934 (OMIM: 615370,615382) PREDICTED: anky ( 871) 259 46.5 0.00074 XP_005251851 (OMIM: 615370,615382) PREDICTED: anky ( 885) 259 46.5 0.00075 NP_001230829 (OMIM: 142695) vigilin isoform b [Hom (1235) 261 46.9 0.00081 XP_016859431 (OMIM: 142695) PREDICTED: vigilin iso (1250) 261 46.9 0.00081 NP_001307896 (OMIM: 142695) vigilin isoform c [Hom (1250) 261 46.9 0.00081 XP_016859430 (OMIM: 142695) PREDICTED: vigilin iso (1250) 261 46.9 0.00081 XP_016869935 (OMIM: 615370,615382) PREDICTED: anky ( 792) 257 46.2 0.00082 XP_005247060 (OMIM: 142695) PREDICTED: vigilin iso (1268) 261 46.9 0.00082 XP_005247059 (OMIM: 142695) PREDICTED: vigilin iso (1268) 261 46.9 0.00082 NP_976221 (OMIM: 142695) vigilin isoform a [Homo s (1268) 261 46.9 0.00082 XP_011509362 (OMIM: 142695) PREDICTED: vigilin iso (1268) 261 46.9 0.00082 NP_001307894 (OMIM: 142695) vigilin isoform a [Hom (1268) 261 46.9 0.00082 NP_001307895 (OMIM: 142695) vigilin isoform a [Hom (1268) 261 46.9 0.00082 XP_011509360 (OMIM: 142695) PREDICTED: vigilin iso (1268) 261 46.9 0.00082 NP_005327 (OMIM: 142695) vigilin isoform a [Homo s (1268) 261 46.9 0.00082 XP_016859429 (OMIM: 142695) PREDICTED: vigilin iso (1268) 261 46.9 0.00082 XP_006712538 (OMIM: 142695) PREDICTED: vigilin iso (1268) 261 46.9 0.00082 XP_006717062 (OMIM: 615370,615382) PREDICTED: anky ( 828) 257 46.2 0.00085 XP_006717061 (OMIM: 615370,615382) PREDICTED: anky ( 872) 257 46.2 0.00088 XP_005251850 (OMIM: 615370,615382) PREDICTED: anky ( 886) 257 46.2 0.00089 >>NP_001073981 (OMIM: 601331,614295) protein bicaudal C (974 aa) initn: 6352 init1: 6352 opt: 6352 Z-score: 4342.1 bits: 814.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6352; 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