Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5952
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5952, 312 aa
1>>>pF1KE5952 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8305+/-0.00129; mu= 12.8622+/- 0.074
mean_var=196.7810+/-70.624, 0's: 0 Z-trim(102.2): 429 B-trim: 401 in 1/46
Lambda= 0.091429
statistics sampled from 6314 (6852) to 6314 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 2083 288.3 5.2e-78
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1943 269.8 1.9e-72
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1909 265.3 4.2e-71
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1905 264.9 6.4e-71
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1544 217.2 1.3e-56
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1234 176.3 2.7e-44
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1225 175.1 6.2e-44
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1209 173.0 2.7e-43
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1179 169.1 4.1e-42
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1158 166.3 2.8e-41
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1158 166.3 2.8e-41
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1144 164.5 1e-40
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1137 163.6 2.1e-40
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1105 159.3 3.6e-39
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1102 159.0 4.9e-39
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1101 158.8 5.1e-39
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1087 156.9 1.8e-38
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1087 156.9 1.8e-38
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 1068 154.4 1.1e-37
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1065 154.1 1.4e-37
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1060 153.4 2.2e-37
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1059 153.2 2.4e-37
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1057 153.0 2.8e-37
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1044 151.3 9.5e-37
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 1030 149.4 3.4e-36
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1026 148.9 4.9e-36
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1025 148.7 5.4e-36
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1023 148.5 6.4e-36
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1014 147.3 1.5e-35
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1009 146.6 2.3e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 946 138.4 7.5e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 926 135.7 4.5e-32
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 924 135.4 5.4e-32
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 924 135.4 5.4e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 923 135.3 6e-32
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 921 135.0 7.2e-32
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 915 134.2 1.2e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 914 134.2 1.5e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 912 133.8 1.6e-31
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 910 133.6 2e-31
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 903 132.6 3.7e-31
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 902 132.5 4.1e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 900 132.2 4.9e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 900 132.3 5e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 898 132.0 5.9e-31
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 896 131.7 7e-31
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 890 130.9 1.2e-30
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 887 130.5 1.6e-30
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 887 130.6 1.6e-30
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 886 130.4 1.8e-30
>>CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2083 init1: 2083 opt: 2083 Z-score: 1514.0 bits: 288.3 E(32554): 5.2e-78
Smith-Waterman score: 2083; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKILGKGKSGD
::::::::::::
CCDS31 LMKILGKGKSGD
310
>>CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1991 init1: 1943 opt: 1943 Z-score: 1414.2 bits: 269.8 E(32554): 1.9e-72
Smith-Waterman score: 1943; 92.6% identity (97.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
:::::: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS31 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
::: ::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
::::::::::::::::.:.:::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
:::::::::::::::::: :.::: .::::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKILGKGKSGD
: :.::::: :.
CCDS31 LRKVLGKGKCGE
310
>>CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1928 init1: 1909 opt: 1909 Z-score: 1390.0 bits: 265.3 E(32554): 4.2e-71
Smith-Waterman score: 1909; 91.7% identity (97.8% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.:
CCDS31 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: ::
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
:::::::::.::::::...:::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
:::::.::::::::.::: :.::: .:: :::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKILGKGKSGD
.::::::::::.
CCDS31 FMKILGKGKSGE
310
>>CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 1905 init1: 1905 opt: 1905 Z-score: 1386.7 bits: 264.9 E(32554): 6.4e-71
Smith-Waterman score: 1905; 92.3% identity (96.8% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
::::::::::::.::::::::: :::::::::.:: :::::::.::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
::: :::::::::::: :::::::..:::::::::::::::::::::.::::::::: :.
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: :::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::::::::::::.::: :.::: ::: :::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKILGKGKSGD
.:::::::::
CCDS31 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
310 320 330 340
>>CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 1556 init1: 1537 opt: 1544 Z-score: 1129.8 bits: 217.2 E(32554): 1.3e-56
Smith-Waterman score: 1544; 73.8% identity (90.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
:.:::::::: :.::::::::::::::: :::.:::.:.: : ::::::.. :::::::
CCDS31 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
:::::::::::::::::.::: :.::::.::::.:::.::::::.::::.::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
:::.::::::.:: :: ::.: .::. :: ::: :::: .:..:::::.: :: :: ::
CCDS31 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
.:: :::..:: ::... :::.:::.:::..:: ::..:. :::::::::.:::::::
CCDS31 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::: :::.::::..:: ..:.:.:.: ::::::.::::.:::::::::::::::: ::
CCDS31 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LMKILGKGKSGD
:.:.: : :
CCDS31 LQKVLKKRKLI
310
>>CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1261 init1: 1234 opt: 1234 Z-score: 908.8 bits: 176.3 E(32554): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 1234; 56.6% identity (84.5% similar) in 304 aa overlap (4-307:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ...: :.:::.:::. .: ::..::.: ....:::.:.:::. : .::::::
CCDS31 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
::::::::::.::. ::::::: .::.:::.:: :::..:::: .: :.::::::.:.:
CCDS31 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGAQIFFLPTLGGGECFLLAAMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
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CCDS31 LKRWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
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CCDS58 ALRKGLDRCRIGSQH
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]