FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6060, 320 aa 1>>>pF1KE6060 320 - 320 aa - 320 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2518+/-0.000453; mu= 16.0397+/- 0.028 mean_var=105.0072+/-28.413, 0's: 0 Z-trim(108.4): 265 B-trim: 983 in 1/51 Lambda= 0.125160 statistics sampled from 16123 (16506) to 16123 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16 Scan time: 5.510 The best scores are: opt bits E(85289) NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 898 173.6 4.6e-43 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 892 172.5 9.9e-43 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 172.5 9.9e-43 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 172.5 9.9e-43 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 891 172.3 1.1e-42 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 878 170.0 5.5e-42 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 873 169.1 1.1e-41 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 854 165.7 1.1e-40 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 844 163.9 4e-40 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 838 162.8 8.4e-40 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 829 161.2 2.6e-39 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 822 159.9 6.3e-39 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 801 156.1 9e-38 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 797 155.4 1.4e-37 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 785 153.2 6.4e-37 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 777 151.8 1.8e-36 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 777 151.8 1.8e-36 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 777 151.8 1.8e-36 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 771 150.7 3.7e-36 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 728 142.9 8e-34 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 550 110.8 3.9e-24 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 498 101.4 2.6e-21 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 209 49.2 1.4e-05 NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 208 49.1 1.7e-05 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 199 47.5 5.2e-05 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 199 47.5 5.5e-05 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 197 47.0 5.8e-05 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 197 47.1 6.4e-05 NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 196 47.0 7.7e-05 NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 195 46.8 8.5e-05 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 183 44.5 0.00035 XP_005260196 (OMIM: 602779) PREDICTED: proteinase- ( 273) 182 44.3 0.00035 NP_001269833 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 291) 180 43.9 0.00047 XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 180 44.0 0.00051 XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 180 44.0 0.00051 NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 180 44.0 0.00053 XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 180 44.0 0.00055 XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 180 44.1 0.00057 NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 180 44.1 0.00057 XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 179 43.8 0.00057 NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 180 44.1 0.00057 NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 180 44.1 0.00058 NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 180 44.1 0.00058 XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 180 44.1 0.00058 NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 180 44.1 0.00059 NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 180 44.1 0.00059 NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 180 44.1 0.00059 NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 180 44.1 0.0006 NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 180 44.1 0.0006 NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 180 44.1 0.0006 >>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa) initn: 936 init1: 892 opt: 898 Z-score: 894.0 bits: 173.6 E(85289): 4.6e-43 Smith-Waterman score: 898; 43.7% identity (77.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMYFL : ...:: :.:::. .: ...::...:.. : .: .:.:.::: : .::.::::. 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NP_003 LRKVATRNFP 300 >>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa) initn: 916 init1: 872 opt: 878 Z-score: 874.7 bits: 170.0 E(85289): 5.5e-42 Smith-Waterman score: 878; 44.3% identity (77.4% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMYFL : ...:: :.:::. .: ...::...:.. : .: .:.:.::: : .::.::::. XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAYDR ::.::..:. .... ::.: .. .:.:: :.::::.. ::: ::.::..::.:: XP_011 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCEAP :.:::.::.: :.. .:: ... .:..: .....:. .:: .:.: ...: : ::.: XP_011 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFATCS .:.::.: ::: : . . :..:.::.:::: ::: : ::: . :...:.:::.::: XP_011 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 SHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEALK ::..:: :::.. : .:..::. . .. : . ::.. :: ::::::..::.: : XP_011 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRGS 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 LWLGTCVNLKHQQNEAHRSR >>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa) initn: 866 init1: 866 opt: 873 Z-score: 869.6 bits: 169.1 E(85289): 1.1e-41 Smith-Waterman score: 873; 43.2% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (5-304:7-307) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMY .: :::::. .. . ...::...: . : .: .:. .::. . : .:::::: NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAY :.:..::..:. ......:.. . .:.:: ::..:.:.. .::: ::.:::.::: NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE :: .:.:.::.: ..:. .:: .. .: :.:..: .. .:: .: :: ::.:::. : NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT :.:.:.::..: ..:..... : ..: :. .:: ::. :. ::: .::. .:.:::.: NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA :.::..::.:::: :. ::.: . : .. . ::.. :::::::::..:: ::: : NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 L-KLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR : .: :: NP_001 LGRLLLGKRELGKE 310 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 826 init1: 771 opt: 854 Z-score: 851.1 bits: 165.7 E(85289): 1.1e-40 Smith-Waterman score: 854; 42.0% identity (76.3% similar) in 295 aa overlap (10-304:15-309) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHT :::.:. : . . :.:...: : .:..: ..:.: . : .::: NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 PMYFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAA ::::.::.::..:. .....:.. .. .:.:: ::: .:..:. .:: :: ::.. NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 MAYDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHF :.::::::::.::.: .:: ..: ....::. : ... :.. :. : :: ...::: NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FCEAPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKA :::.:.:.::.:.:: : : ...: ...:.:. :::.::: :. :.: :.:: . .:. NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 FATCSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEV :.::..:. .:.::. .. :..: : : .. : .. :::. :: ::::::..::. : NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 KEALKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR . :.: .: NP_001 RGAVKRLMGWE 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 836 init1: 836 opt: 844 Z-score: 841.3 bits: 163.9 E(85289): 4e-40 Smith-Waterman score: 844; 43.2% identity (77.1% similar) in 292 aa overlap (9-299:11-302) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFN-HTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPM .:::... . :. ...::. .:. :..: .:.:.::. : ::.:: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMA ::.: .::.... . . :::: . :. . .:: ::..:..:. .: .::::::.:: NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFC ::::.:.: ::.::..:. . ... .::. : . .:.. .:::.::.....:::: NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EAPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFA ..: ...:.::::..:: . .:....: ::: :: : ::.: . :.....:::. NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKE :::::. ::.::: .. .::. :::. : . :..: ::. ::.:::.:::.::::::. NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 ALKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR :: NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP 310 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 838 init1: 838 opt: 838 Z-score: 835.5 bits: 162.8 E(85289): 8.4e-40 Smith-Waterman score: 838; 44.2% identity (75.7% similar) in 292 aa overlap (10-300:13-303) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPM :::::. . : .::: ..:. .::: : .:.::. : .::::: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMA ::.::.::..:: .:.::::: .. : ...:. .:: .: :.. ..: .: :..::: NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFC ::::::.:.:: : ..:: ::. :...... : . .:.: : :.. .::.. : :::: NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EAPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSL-ILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAF . : :. :.:.:: : ..: .... . .: :. ::: : ... . :...:.::: NP_001 DMPQLLILSCTDT-FFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 ATCSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVK ::.::...:.::: .:::.:. .: :.. :. .:.:::. :.:::::::.::.:.: NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 EALKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR .::: NP_001 DALKRLQKRKCC 300 310 320 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 09:08:52 2016 done: Tue Nov 8 09:08:53 2016 Total Scan time: 5.510 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]