FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1903, 433 aa 1>>>pF1KE1903 433 - 433 aa - 433 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8544+/-0.00041; mu= 14.9981+/- 0.025 mean_var=93.5953+/-19.640, 0's: 0 Z-trim(113.4): 151 B-trim: 1206 in 1/51 Lambda= 0.132571 statistics sampled from 22585 (22775) to 22585 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16 Scan time: 8.770 The best scores are: opt bits E(85289) NP_064582 (OMIM: 610663) N-lysine methyltransferas ( 433) 2954 575.6 8.7e-164 NP_001317293 (OMIM: 606846) histone-lysine N-methy ( 477) 847 172.6 1.9e-42 NP_001161212 (OMIM: 608783) histone-lysine N-methy ( 428) 673 139.3 1.8e-32 XP_011542555 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 391) 537 113.3 1.2e-24 NP_073580 (OMIM: 608783) histone-lysine N-methyltr ( 369) 536 113.1 1.3e-24 NP_938015 (OMIM: 606846) histone-lysine N-methyltr ( 490) 468 100.1 1.3e-20 XP_011542559 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 258) 316 70.9 4.5e-12 XP_011542556 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 286) 315 70.7 5.5e-12 XP_011542561 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09 XP_011542560 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09 XP_011542562 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09 XP_011542563 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09 XP_016857583 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09 XP_016857584 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 236) 250 58.2 2.6e-08 NP_001019764 (OMIM: 614773) putative protein MSS51 ( 460) 168 42.7 0.0023 XP_005273224 (OMIM: 606425,609070,609820) PREDICTE ( 345) 159 40.9 0.0061 XP_005273223 (OMIM: 606425,609070,609820) PREDICTE ( 383) 159 41.0 0.0066 NP_071334 (OMIM: 606425,609070,609820) egl nine ho ( 426) 159 41.0 0.0072 >>NP_064582 (OMIM: 610663) N-lysine methyltransferase SM (433 aa) initn: 2954 init1: 2954 opt: 2954 Z-score: 3061.5 bits: 575.6 E(85289): 8.7e-164 Smith-Waterman score: 2954; 99.8% identity (99.8% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_064 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_064 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLEFPDNDSLVVLFAQVN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: NP_064 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLGFPDNDSLVVLFAQVN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 CNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEVFTSY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_064 CNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEVFTSY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 IDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVRYARN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_064 IDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVRYARN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 VIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_064 VIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGAL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 QYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_064 QYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDH 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 PYISEIKQEIESH ::::::::::::: NP_064 PYISEIKQEIESH 430 >>NP_001317293 (OMIM: 606846) histone-lysine N-methyltra (477 aa) initn: 701 init1: 272 opt: 847 Z-score: 883.0 bits: 172.6 E(85289): 1.9e-42 Smith-Waterman score: 847; 31.8% identity (66.0% similar) in 424 aa overlap (9-427:9-425) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE .: : . ::::::.: . : ..:..:. ::. :. . . :. :: :.: NP_001 MTIGRMENVEVFTAEGKGRGLKATKEFWAADIIFAERAYSAVVFDSLVNFVCHTCFKRQE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP : .::.:: : ::. :::. : :: ::: . .:. :.:..::.:::. . . . 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NP_001 ESLKKIEELK--AHWKWE-QVLAMCQAIISSNSERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLL 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 EGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAH : :: :: . ..:: .: . . .:.:.: . . : :. :. ::.:.: NP_001 EEALFYGTRTMEPYRIFFPGSHPVRGVQVMKVGKLQLHQGMFPQAMKNLRLAFDIMRVTH 350 360 370 380 390 400 420 430 pF1KE1 GKDHPYISEIKQEIESH :..: : .. NP_001 GREHSLIEDLILLLEECDANIRAS 410 420 >>XP_011542555 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lysine (391 aa) initn: 675 init1: 269 opt: 537 Z-score: 563.7 bits: 113.3 E(85289): 1.2e-24 Smith-Waterman score: 626; 29.4% identity (56.4% similar) in 422 aa overlap (9-426:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE .:.: . .: ::::. :.. :.::: ::.. . :: :. :. :: XP_011 MEPLKVEKFATAKRGNGLRAVTPLRPGELLFRSDPLAYTVCKGSRGVVCDRCLLGKE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP : .:..:. : ::...:::. :: :: ::. . . : ..::: .:.. : . XP_011 KLMRCSQCRVAKYCSAKCQKKAWPDHKRECKCLKSCKPRY-PPDSVRLLGRVVFKL-MDG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE1 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLE----FPDNDSLVVLF . :::: . ..::...:: ..::. ... . ...::. .... .: .: : XP_011 APSESEKLYSFYDLESNINKLTEDKKEGLRQLVMTFQHFMREEIQDASQLPPAFDLFEAF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 AQVNCNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEV :.: ::.::: . :....: ...:...:.:::: :: ....: .:::..:. ::: XP_011 AKVICNSFTICNAEMQEVGVGLYPSISLLNHSCDPNCSIVFNGPHLLLRAVRDIEVGEE- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVR :.: :. : :: : XP_011 ---DADMLTGDEQ----------VWKEVQESLKK-------------------------- 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 YARNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDW :::.. :.: ..: .:. . : . : :.:.:... :: .:. . XP_011 -----IEELK--AHWKWE-QVLAMCQAIISSNSERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLL 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 EGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAH : :: :: . ..:: .: . . .:.:.: . . : :. :. ::.:.: XP_011 EEALFYGTRTMEPYRIFFPGSHPVRGVQVMKVGKLQLHQGMFPQAMKNLRLAFDIMRVTH 310 320 330 340 350 360 420 430 pF1KE1 GKDHPYISEIKQEIESH :..: : .. XP_011 GREHSLIEDLILLLEECDANIRAS 370 380 390 >>NP_073580 (OMIM: 608783) histone-lysine N-methyltransf (369 aa) initn: 674 init1: 329 opt: 536 Z-score: 563.1 bits: 113.1 E(85289): 1.3e-24 Smith-Waterman score: 687; 31.6% identity (63.2% similar) in 367 aa overlap (64-426:2-355) 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 FSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKEGLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPM .:..:. : ::...:::. :: :: ::. . NP_073 MRCSQCRVAKYCSAKCQKKAWPDHKRECKCL 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 VVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHPERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDI . : ..::: .:.. : . . :::: . ..::...:: ..::. ... . NP_073 KSCKPRY-PPDSVRLLGRVVFKL-MDGAPSESEKLYSFYDLESNINKLTEDKKEGLRQLV 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 pF1KE1 AALHHFYSKHLE----FPDNDSLVVLFAQVNCNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSC ...::. .... .: .: ::.: ::.::: . :....: ...:...:.:::: NP_073 MTFQHFMREEIQDASQLPPAFDLFEAFAKVICNSFTICNAEMQEVGVGLYPSISLLNHSC 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 CPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEVFTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTT :: ....: .:::..:. :::. :.:.:. .:.: .:::.: : :.: .: : NP_073 DPNCSIVFNGPHLLLRAVRDIEVGEELTICYLDMLMTSEERRKQLRDQYCFECDCFRCQT 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 KDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVRYARNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMS .::: . .: : . :. . . :::.. :.: ..: .:. . : NP_073 QDKDADMLT----GD----EQVWKEVQESLKKIEELK--AHWKWE-QVLAMCQAIISSNS 210 220 230 240 250 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 SVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLG . : :.:.:... :: .:. . : :: :: . ..:: .: . . .:.: NP_073 ERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLLEEALFYGTRTMEPYRIFFPGSHPVRGVQVMKVG 260 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 pF1KE1 RLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDHPYISEIKQEIESH .: . . : :. :. ::.:.::..: : .. NP_073 KLQLHQGMFPQAMKNLRLAFDIMRVTHGREHSLIEDLILLLEECDANIRAS 320 330 340 350 360 >>NP_938015 (OMIM: 606846) histone-lysine N-methyltransf (490 aa) initn: 665 init1: 254 opt: 468 Z-score: 491.1 bits: 100.1 E(85289): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 812; 31.1% identity (64.3% similar) in 437 aa overlap (9-427:9-438) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE .: : . ::::::.: . : ..:..:. ::. :. . . :. :: :.: NP_938 MTIGRMENVEVFTAEGKGRGLKATKEFWAADIIFAERAYSAVVFDSLVNFVCHTCFKRQE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP : .::.:: : ::. :::. : :: ::: . .:. :.:..::.:::. . . . NP_938 KLHRCGQCKFAHYCDRTCQKDAWLNHKNECSAIKRYGKV--PNENIRLAARIMWRVEREG 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLEFPDNDSLVVLFAQVN :..: ....:.... .:.. .. :. .. ... . . . . . .:. .: NP_938 TGLTEGCLVSVDDLQNHVEHFGEEEQKDLRVDVDTFLQYWPPQSQQFSMQYISHIFGVIN 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 pF1KE1 CNGFTIEDEE-LSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTY--------KGTL-----AEVRA :::::. :.. :. .: .:::...:.::.: :: : . :. . :.:: NP_938 CNGFTLSDQRGLQAVGVGIFPNLGLVNHDCWPNCTVIFNNGNHEAVKSMFHTQMRIELRA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 VQEIKPGEEVFTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDP- . .:. :::. .::::.: .:.:. .:. .:.: : :..: : :: . .. ..: NP_938 LGKISEGEELTVSYIDFLNVSEERKRQLKKQYYFDCTCEHCQKKLKDDLFLGVK--DNPK 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 PKAEAIRDMVRYARNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQ :. :....:........:.. .:. :....:. ::. :: :.:.:::.:. NP_938 PSQEVVKEMIQFSKDTLEKIDKARSEGLYHEVVKLCRECLEKQEPVFADTNIYMLRMLSI 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 AMGVCLYMQDWEGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKA---AGE . : :.: .: : :..... : : :: : :.. . . : . : . .:. NP_938 VSEVLSYLQAFEEASFYARRMVDGYMK---LYHPNNAQLGMAVMRAGLTNWHAGNIEVGH 360 370 380 390 400 410 410 420 430 pF1KE1 KALKKAIAIMEVAHGKDHPYISEIKQEIESH . :: ::. :.:: .:: .... NP_938 GMICKAYAILLVTHGPSHPITKDLEAMRVQTEMELRMFRQNEFMYYKMREAALNNQPMQV 420 430 440 450 460 470 >>XP_011542559 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lysine (258 aa) initn: 470 init1: 316 opt: 316 Z-score: 337.8 bits: 70.9 E(85289): 4.5e-12 Smith-Waterman score: 467; 32.1% identity (62.2% similar) in 249 aa overlap (178-426:7-244) 150 160 170 180 190 200 pF1KE1 LIQSDIAALHHFYSKHLEFPDNDSLVVLFAQVNCNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNH .: ::.::: . :....: ...:...:.:: XP_011 MEEEEEKVICNSFTICNAEMQEVGVGLYPSISLLNH 10 20 30 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 SCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEVFTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQEC :: :: ....: .:::..:. :::. :.:.:. .:.: .:::.: : :.: .: XP_011 SCDPNCSIVFNGPHLLLRAVRDIEVGEELTICYLDMLMTSEERRKQLRDQYCFECDCFRC 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 TTKDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVRYARNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEK :.::: . .: : . :. . . :::.. :.: ..: .:. . 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XP_011 CQTQDKDADMLT----GD----EQVWKEVQESLKKIEELK--AHWKWE-QVLAMCQAIIS 130 140 150 160 170 330 340 350 360 370 380 pF1KE1 KMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWL . : . : :.:.:... :: .:. . : :: :: . ..:: .: . . . XP_011 SNSERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLLEEALFYGTRTMEPYRIFFPGSHPVRGVQVM 180 190 200 210 220 230 390 400 410 420 430 pF1KE1 KLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDHPYISEIKQEIESH :.:.: . . : :. :. ::.:.::..: : .. 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