Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6041
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6041, 317 aa
1>>>pF1KE6041 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6879+/-0.0014; mu= 14.2217+/- 0.081
mean_var=177.7315+/-59.184, 0's: 0 Z-trim(101.9): 386 B-trim: 424 in 1/46
Lambda= 0.096204
statistics sampled from 6284 (6727) to 6284 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 2.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 2070 300.5 1.1e-81
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 1381 204.9 6.9e-53
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 1088 164.2 1.2e-40
CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 ( 324) 1072 162.0 5.7e-40
CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 ( 343) 1032 156.5 2.8e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1025 155.5 5.2e-38
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 998 151.7 7.1e-37
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 982 149.5 3.2e-36
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 981 149.4 3.7e-36
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 975 148.5 6.5e-36
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 966 147.3 1.5e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 965 147.2 1.7e-35
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 963 146.9 2e-35
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 960 146.4 2.7e-35
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 960 146.4 2.7e-35
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 959 146.3 3e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 950 145.0 7e-35
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 945 144.4 1.2e-34
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 944 144.2 1.3e-34
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 943 144.1 1.4e-34
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 937 143.2 2.4e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 937 143.3 2.5e-34
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 937 143.3 2.6e-34
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 936 143.1 2.7e-34
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 935 143.0 2.9e-34
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 935 143.0 3e-34
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 933 142.7 3.6e-34
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 931 142.4 4.5e-34
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 926 141.8 7.3e-34
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 923 141.3 9.4e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 922 141.2 1e-33
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 920 140.9 1.3e-33
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 918 140.6 1.5e-33
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 916 140.3 1.8e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 916 140.3 1.8e-33
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 914 140.1 2.2e-33
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 914 140.1 2.4e-33
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 914 140.1 2.4e-33
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 914 140.1 2.4e-33
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 913 139.9 2.5e-33
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 911 139.7 3e-33
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 909 139.4 3.7e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 908 139.2 4e-33
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 907 139.1 4.4e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 906 138.9 4.8e-33
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 906 138.9 4.8e-33
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 904 138.7 5.9e-33
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 903 138.5 6.5e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 902 138.4 7.1e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 902 138.4 7.1e-33
>>CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 2070 init1: 2070 opt: 2070 Z-score: 1579.8 bits: 300.5 E(32554): 1.1e-81
Smith-Waterman score: 2070; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWLFVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWLFVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEIIKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEIIKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IKRTIFQKGDKASLAHL
:::::::::::::::::
CCDS30 IKRTIFQKGDKASLAHL
310
>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1409 init1: 1379 opt: 1381 Z-score: 1063.0 bits: 204.9 E(32554): 6.9e-53
Smith-Waterman score: 1381; 66.3% identity (86.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWLFVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMY
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CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMAY
::::.::: :: :::.::::::.:.:::::::::.::::: ::::::::.::::::::::
CCDS30 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFCD
::::::::::::: .:: ::::..: .:: :. :. :. : :.::::. :.:::.:::
CCDS30 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKAFST
:::.::::: ::: :.::::.::. :: ::..:. ::..:: .::.: .:.:..::.::
CCDS30 FPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAIST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEIIKA
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CCDS30 CASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IKRTIFQKGDKASLAHL
..: . . :
CCDS30 VRRQLKRIGILA
310
>>CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1094 init1: 737 opt: 1088 Z-score: 843.2 bits: 164.2 E(32554): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 1088; 53.1% identity (80.3% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWLFVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMY
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CCDS30 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPMY
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pF1KE6 HFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMAY
.:.:..::::.:::..::::::::..::::.::..::.:: :::::: :: :::.::
CCDS30 NFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMAI
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pF1KE6 DRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFCD
:::.::: ::.: .::: :::...:. ::: . :... : ::::. :.:..::::
CCDS30 DRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKAFST
. :.::::: ::: ::.. .:.: :.:::..: .::.::. ..:.: .. ::.:::::
CCDS30 LVPVLSLACTDTSM-ILIEDVIHAVTIIITFLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAFST
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pF1KE6 CASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEIIKA
::.:: : :::::. .::.:.. .: .:: ..:....::.:. ::::::::::.. .:
CCDS30 CAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNNA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IKRTI-FQKGDKASLAHL
::. . .::
CCDS30 IKKLFCLQKVLNKPGG
300 310
>>CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 (324 aa)
initn: 819 init1: 472 opt: 1072 Z-score: 831.1 bits: 162.0 E(32554): 5.7e-40
Smith-Waterman score: 1072; 51.0% identity (79.7% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWL-FVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPM
:.. :.... ::.: .: ..:.. . :: ::. : : . ::..:..:..:.. :::::
CCDS30 MESPNRTTIQEFIFSAFP-YSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE6 YHFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMA
: :.:.:::::.:::..:::::::..:::. .::: ::::: ::::: : : :::.::
CCDS30 YTFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSER-SISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 YDRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFC
.:.::::: ::::: ::: ::.... .: .:::. :. :. : ::::. :...::::
CCDS30 FDHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DFPPLLSLACKDTSANILVDFA--INAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKA
:: :.: ::: :: : .... . :.: :. . ..:..:: :....:.:..:.::. :
CCDS30 DFLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FSTCASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEI
::::.::. : .::::. .::.:.. .::: : ..:....::.:. ::::::::::::
CCDS30 FSTCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEI
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 IKAIKRTIFQKGDKASLAHL
.:::. : :
CCDS30 KEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
300 310 320
>>CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 (343 aa)
initn: 1025 init1: 700 opt: 1032 Z-score: 800.8 bits: 156.5 E(32554): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1032; 51.8% identity (75.7% similar) in 313 aa overlap (5-315:33-341)
10 20 30
pF1KE6 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWL--FVLLL
:.. ..::.: : . :: : :. ::
CCDS30 QYSVGNQHSNYRSLLFPFLCSQMTQLTASGNQTMVTEFLFSMFPHAH--RGGLLFFIPLL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 LAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMYHFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTI
: : : . ::...: ::.. :::::.: :.:::::::. ::.:::::::: ..::.:.:
CCDS30 LIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQKSI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 SFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCG
: :::::: ::::::: .: .::::: :::.::: ::.:: :: :: ..... ::
CCDS30 SVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSCFCG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 FLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFCDFPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFF
:: . :. : ::::. :.:..::::: :.::::: :: ..:: ::.: :. .:.
CCDS30 FLLVLPEIAWISTLPFCGSNQIHQIFCDFTPVLSLACTDTFLVVIVD-AIHAAEIVASFL
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKAFSTCASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDR
: .:: ::: ..: ...: :..:::::::.:::: :.::::. ::.:.. .::. :
CCDS30 VIALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFWDT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KE6 TLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEIIKAIKRTIFQKGDKASLAHL
..:... .:.:. :::::::.::.. .:: : .:. .:. :
CCDS30 AIAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGR-LFHYQKRAGWAGK
300 310 320 330 340
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 1028 init1: 1004 opt: 1025 Z-score: 795.9 bits: 155.5 E(32554): 5.2e-38
Smith-Waterman score: 1025; 47.4% identity (82.5% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWLFVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMY
:.. :.....::..:::.... .. ::....:.:. :. ::.::. . : ::::::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
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310
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CCDS46 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
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