FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6086, 324 aa 1>>>pF1KE6086 324 - 324 aa - 324 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7402+/-0.000507; mu= 20.0038+/- 0.031 mean_var=93.8584+/-22.772, 0's: 0 Z-trim(108.2): 232 B-trim: 1084 in 1/50 Lambda= 0.132385 statistics sampled from 16009 (16296) to 16009 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16 Scan time: 5.440 The best scores are: opt bits E(85289) NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 793 162.3 1.2e-39 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 791 161.9 1.6e-39 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 772 158.3 2e-38 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 766 157.1 4.3e-38 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 745 153.1 7e-37 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 745 153.1 7e-37 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 745 153.1 7e-37 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 741 152.3 1.2e-36 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 732 150.6 3.9e-36 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 732 150.6 3.9e-36 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 732 150.6 4e-36 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 731 150.4 4.5e-36 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 719 148.2 2.2e-35 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 710 146.4 7.2e-35 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 699 144.3 3.1e-34 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 696 143.7 4.5e-34 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 690 142.6 9.9e-34 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 689 142.4 1.1e-33 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 681 140.9 3.3e-33 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 674 139.6 8.4e-33 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 572 120.1 6.2e-27 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 542 114.4 3.3e-25 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 209 50.8 4.6e-06 NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 183 46.1 0.00021 NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 174 44.2 0.00055 XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 174 44.2 0.00055 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 172 43.7 0.00064 NP_005288 (OMIM: 601751) melanin-concentrating hor ( 422) 173 44.0 0.00065 XP_016860005 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 171 43.6 0.00077 XP_005246154 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 171 43.6 0.00077 XP_005246155 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 171 43.6 0.00077 NP_064707 (OMIM: 610376) atypical chemokine recept ( 362) 171 43.6 0.00077 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 163 42.0 0.0021 NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 161 41.6 0.0028 NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 161 41.7 0.003 NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 161 41.7 0.0031 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 160 41.4 0.0031 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 161 41.7 0.0032 NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 157 41.0 0.0056 XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 157 41.0 0.0057 NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 154 40.3 0.0071 XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 154 40.3 0.0071 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 154 40.3 0.0075 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 154 40.3 0.0075 NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 154 40.4 0.0079 NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 154 40.4 0.0079 NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 154 40.4 0.0079 NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 154 40.4 0.0079 NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 154 40.4 0.0079 XP_005251839 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 152 39.9 0.0095 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 598 init1: 361 opt: 793 Z-score: 832.6 bits: 162.3 E(85289): 1.2e-39 Smith-Waterman score: 793; 43.2% identity (71.1% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-304) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MESPNRTTIQEFI---FSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHT : : : :.::: ::..: . ..:.. :. .: :: . :: .:: :. . ::. 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NP_001 NKEIKDALKRLQKRKCC 300 310 >>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa) initn: 770 init1: 351 opt: 772 Z-score: 810.8 bits: 158.3 E(85289): 2e-38 Smith-Waterman score: 772; 39.2% identity (71.2% similar) in 309 aa overlap (1-302:1-306) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MESPNRT-TIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPM :: :.. ..::.. .:: .:. :. ::. :..... : .:: ... .. :: :: NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YTFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSERS-----ISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLL : :.. .:::::::.:.::::::..... .. :::.::. :.::: . : : :: NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 TVMAFDHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLE .:::.:.:.::: ::::: :.. .::.:.. . . :: . .. :: : .:: : .. NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 HIFCDFLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIF-MSYDGIVAVILRIHSAG :.::: :.: :.::: . ...: : :. :. . . . :: .:......: ::. NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTD---MSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 GRRTAFSTCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSL :: :::::.::. : .:... ..: : .: .. . ... .::. :..::::: : NP_003 GRYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 RNKEIKEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF ::.:.:.:. NP_003 RNQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV 300 310 320 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 535 init1: 305 opt: 766 Z-score: 804.8 bits: 157.1 E(85289): 4.3e-38 Smith-Waterman score: 766; 37.6% identity (73.0% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-309) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY : : :.. ::.. .. . ... :. .: ::.. :.::: .: .......:::::: NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSER-SISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF :.. :::... .:. ::::..::::. .::: ::.:::::: : . : :. .::. NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD :.: ::: :: : ::. . ... . . :... . . . .:.: :: :: ..:.::: NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF :...:.:.:: :. .. ... .:.:. ....:. ::. .. :. .::. ::. :: NP_003 SPPLFKLSCSDT--ILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK :::.::. .. ::... ::: :..::: : . .. ..:. :..::.:::::.::.: NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF .:. . :.. . NP_003 KALANVISRKRTSSFL 300 310 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 680 init1: 241 opt: 745 Z-score: 783.1 bits: 153.1 E(85289): 7e-37 Smith-Waterman score: 745; 37.7% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY : . :.: ..:::. .. .: : :: .: .:. :.:: .:. ...:...:::::: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSE-RSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF :.. ::.... :.:...:..:. .:.: ..: :..: :..: . : : ::.:::. NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD :.:.:.:. :.: .:: ::..:... : :::. . : ::.: .. ..:: :. NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF .: :.::::.:: . . .:. : : ..: :...:: :...::.:.: ::. :: NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSI--VLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK ::.::. : .: .: . . :.. .. :.. . ... .:.:.:..::.::::::::.: NP_036 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF : .: NP_036 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT 300 310 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 680 init1: 241 opt: 745 Z-score: 783.1 bits: 153.1 E(85289): 7e-37 Smith-Waterman score: 745; 37.7% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY : . :.: ..:::. .. .: : :: .: .:. :.:: .:. ...:...:::::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSE-RSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF :.. ::.... :.:...:..:. .:.: ..: :..: :..: . : : ::.:::. XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD :.:.:.:. :.: .:: ::..:... : :::. . : ::.: .. ..:: :. 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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD ::..:.: :::: . :: .::. :. . : . .. : . .. : ::..: . :.::: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF :.:.:.:.::. .: . . :. .:: . :. :: :. ..:.. :. :: :: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSE--GALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK ::: ::. : ::.... .:. ...: : .. ..:..:..::.::::::. .: XP_011 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF :.:: .: .. ::: XP_011 GALKKVVG--RVVFSV 300 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 557 init1: 308 opt: 732 Z-score: 769.7 bits: 150.6 E(85289): 3.9e-36 Smith-Waterman score: 732; 38.0% identity (69.0% similar) in 316 aa overlap (1-315:1-312) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY : . :.....::.. .. . .. . :: .: .: :.:::.:: :.... :::::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSS-LLSERSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF :.: :::..: .. .:.::::.. .: ..::: ::: :::: . ::.:::. NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD ::..:.: :::: . :: .::. :. . : . .. : . .. : ::..: . :.::: NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF :.:.:.:.::. .: . . :. .:: . :. :: :. ..:.. :. :: :: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSE--GALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK ::: ::. : ::.... .:. ...: : .. ..:..:..::.::::::. .: NP_036 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF :.:: .: .. ::: NP_036 GALKKVVG--RVVFSV 300 310 324 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 09:22:43 2016 done: Tue Nov 8 09:22:44 2016 Total Scan time: 5.440 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]