Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2237
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2237, 693 aa
1>>>pF1KE2237 693 - 693 aa - 693 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7409+/-0.000989; mu= -19.5033+/- 0.058
mean_var=440.7943+/-93.698, 0's: 0 Z-trim(116.2): 43 B-trim: 192 in 1/52
Lambda= 0.061088
statistics sampled from 16975 (17014) to 16975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.509), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS30875.1 CRTC2 gene_id:200186|Hs109|chr1 ( 693) 4733 431.6 1.9e-120
CCDS45348.1 CRTC3 gene_id:64784|Hs109|chr15 ( 618) 949 98.1 4.2e-20
CCDS32331.1 CRTC3 gene_id:64784|Hs109|chr15 ( 619) 946 97.8 5.1e-20
CCDS42525.1 CRTC1 gene_id:23373|Hs109|chr19 ( 650) 775 82.8 1.8e-15
>>CCDS30875.1 CRTC2 gene_id:200186|Hs109|chr1 (693 aa)
initn: 4733 init1: 4733 opt: 4733 Z-score: 2276.1 bits: 431.6 E(33420): 1.9e-120
Smith-Waterman score: 4733; 100.0% identity (100.0% similar) in 693 aa overlap (1-693:1-693)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YTRHIDSSPYSPAYLSPPPESSWRRTMAWGNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSALHTSVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YTRHIDSSPYSPAYLSPPPESSWRRTMAWGNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSALHTSVM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEMDPKVPAIEENLLDDKHLLKPWDAKKLSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEMDPKVPAIEENLLDDKHLLKPWDAKKLSSSSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPPAMNTGGSLPDLTNLHFPPPLPTPLDPEETAYPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPPAMNTGGSLPDLTNLHFPPPLPTPLDPEETAYPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSSPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSSPQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PQLQGSHSHPSLPASSLARHVLPTTSLGHPSLSAPALSSSSSSSSTSSPVLGAPSYPAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PQLQGSHSHPSLPASSLARHVLPTTSLGHPSLSAPALSSSSSSSSTSSPVLGAPSYPAST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PGASPHHRRVPLSPLSLLAGPADARRSQQQLPKQFSPTMSPTLSSITQGVPLDTSKLSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PGASPHHRRVPLSPLSLLAGPADARRSQQQLPKQFSPTMSPTLSSITQGVPLDTSKLSTD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QRLPPYPYSSPSLVLPTQPHTPKSLQQPGLPSQSCSVQSSGGQPPGRQSHYGTPYPPGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QRLPPYPYSSPSLVLPTQPHTPKSLQQPGLPSQSCSVQSSGGQPPGRQSHYGTPYPPGPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQFSMESPSASLVLDPPGFSEGPGFLGGEGPMGGPQDPHTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQFSMESPSASLVLDPPGFSEGPGFLGGEGPMGGPQDPHTF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NHQNLTHCSRHGSGPNIILTGDSSPGFSKEIAAALAGVPGFEVSAAGLELGLGLEDELRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NHQNLTHCSRHGSGPNIILTGDSSPGFSKEIAAALAGVPGFEVSAAGLELGLGLEDELRM
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 EPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEESFRSDRLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEESFRSDRLQ
670 680 690
>>CCDS45348.1 CRTC3 gene_id:64784|Hs109|chr15 (618 aa)
initn: 948 init1: 351 opt: 949 Z-score: 474.5 bits: 98.1 E(33420): 4.2e-20
Smith-Waterman score: 1208; 38.8% identity (59.8% similar) in 707 aa overlap (6-692:2-618)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLA
: .:::..: :::::::::::. ::::::: :::..: :. .:.: :::.
CCDS45 MAASPGSGSA---NPRKFSEKIALHTQRQAEETRAFEQLMTDLTLSRVQFQKLQQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR
. : :::::::.:. :. .::: .:. :. :.::::::::: .:. :. ::.:
CCDS45 RLTQYH-GGSLPNVSQLRSSASEFQPSFHQA-DNVRGTRHHGLVERPSRN--RF-HPLHR
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE2 YT-----RHIDSSPYSPAYLSPPPESSW-RRTMAWGNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSA
. :..:.: .. : : : . :: :. : . :: ::: ::::::.::::
CCDS45 RSGDKPGRQFDGSAFGANYSSQPLDESWPRQQPPWKD---EKHPGFRLTSALNRTNSDSA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE2 LHTSVMNPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEMDPKV-------PAIEENLLD-DKHL
::::... .::: : : : :. :. ::: . . : :::::. : :
CCDS45 LHTSALSTKPQDPYGGGGQ-SAWPAPYMGFCDGENNGHGEVASFPGPLKEENLLNVPKPL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LKP-WDAKKLSSSSSRPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPPAMNTGGSLPDLTNLHFPP
: :..:...: :.:::::.: : : :: : .. . ..:::::::::::::.
CCDS45 PKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAFPHNGQNLGLSPFLGTLNTGGSLPDLTNLHYST
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 PLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQS
:::. :: . . :.: :::..:. .:::::: .. ::.: :.::.:.
CCDS45 PLPASLDTTDHHFGSMSVGNSVNNIPAAMTHLGIR---------SSSGLQSSRSNPSIQA
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SLSNPNLQASLSSPQPQLQGSHSHPSLPASSLARHVLPTTSLGHPSLSAPALSSSSSSSS
.:.. :..::.. ::. .:..: :::: .::. : :..
CCDS45 TLNKTVLSSSLNN----------HPQTS--------VPNASALHPSLRLFSLSNPSLSTT
340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 TSSPVLGAPSYPASTPGASPHHRRVPLSPLSLLAGPADARRSQQQLPKQFSPTMSPTLSS
. :..:: ..:. :.:::.: :: ...: . .:.: : ::
CCDS45 N----LSGPS----------RRRQPPVSPLTLSPGP----EAHQGFSRQLSST-SPL---
380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ITQGVPLDTSKLSTDQR--LPPYPYSSPSLVLPTQPH-TPKSLQQPGLPSQSCSVQSSGG
.: ::.. ...: : : . . : : :. .:. : :: :
CCDS45 ----APYPTSQMVSSDRSQLSFLPTEAQAQVSPPPPYPAPQELTQPLLQ-----------
420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 QPPGRQSHYGTPYPPGPSGHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQFSMESPSASLVLDPPGFSEGP
:: . : .:. . : . :.:::.: . :. . .. .: .. ::
CCDS45 QPRA---------PEAPAQQPQAASSLPQSDFQLLPAQGSSLTNFFPDVGFDQQSMRPGP
470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 GFLGGEGPM--GGPQDPHTFNHQNLTHCSRHGSGPNIILTGDSSPGFSKEIAAALAGVPG
.: . :. : .. . : . : :: :: :: ::: .. :.. .::::.:
CCDS45 AF-PQQVPLVQQGSRELQDSFHLRPSPYSNCGSLPNTILP-DSSTSLFKDLNSALAGLP-
520 530 540 550 560
650 660 670 680 690
pF1KE2 FEVSAAGLELGLGLEDELRMEPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEESFRSDRLQ
::: ... . ::.::..:::.:.::::::: : ::.:::.::.:::
CCDS45 -EVSL-NVDTPFPLEEELQIEPLSLDGLNMLSDSSMGLLDPSVEETFRADRL
570 580 590 600 610
>>CCDS32331.1 CRTC3 gene_id:64784|Hs109|chr15 (619 aa)
initn: 1025 init1: 351 opt: 946 Z-score: 473.1 bits: 97.8 E(33420): 5.1e-20
Smith-Waterman score: 1217; 38.8% identity (59.8% similar) in 707 aa overlap (6-692:2-619)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTRLQAQKLRLA
: .:::..: :::::::::::. ::::::: :::..: :. .:.: :::.
CCDS32 MAASPGSGSA---NPRKFSEKIALHTQRQAEETRAFEQLMTDLTLSRVQFQKLQQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAEFQSPLHSPLDSSRSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR
. : :::::::.:. :. .::: .:. :. :.::::::::: .:. :. ::.:
CCDS32 RLTQYH-GGSLPNVSQLRSSASEFQPSFHQA-DNVRGTRHHGLVERPSRN--RF-HPLHR
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE2 YT-----RHIDSSPYSPAYLSPPPESSW-RRTMAWGNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSA
. :..:.: .. : : : . :: :. : . :: ::: ::::::.::::
CCDS32 RSGDKPGRQFDGSAFGANYSSQPLDESWPRQQPPWKD---EKHPGFRLTSALNRTNSDSA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE2 LHTSVMNPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEMDPKV-------PAIEENLLD-DKHL
::::... .::: : : : :. :. ::: . . : :::::. : :
CCDS32 LHTSALSTKPQDPYGGGGQ-SAWPAPYMGFCDGENNGHGEVASFPGPLKEENLLNVPKPL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LKP-WDAKKLSSSSSRPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPPAMNTGGSLPDLTNLHFPP
: :..:...: :.:::::.: : : :: : .. . ..:::::::::::::.
CCDS32 PKQLWETKEIQSLSGRPRSCDVGGGNAFPHNGQNLGLSPFLGTLNTGGSLPDLTNLHYST
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 PLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGPGYDAPGLHSPLSHPSLQS
:::. :: . . :.: :::..:. .:::::: .. ::.: :.::.:.
CCDS32 PLPASLDTTDHHFGSMSVGNSVNNIPAAMTHLGIR---------SSSGLQSSRSNPSIQA
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SLSNPNLQASLSSPQPQLQGSHSHPSLPASSLARHVLPTTSLGHPSLSAPALSSSSSSSS
.:.. :..::.. ::. .:..: :::: .::. : :..
CCDS32 TLNKTVLSSSLNN----------HPQTS--------VPNASALHPSLRLFSLSNPSLSTT
340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 TSSPVLGAPSYPASTPGASPHHRRVPLSPLSLLAGPADARRSQQQLPKQFSPTMSPTLSS
. :..:: ..:. :.:::.: :: ...: . .:.: : ::
CCDS32 N----LSGPS----------RRRQPPVSPLTLSPGP----EAHQGFSRQLSST-SPL---
380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ITQGVPLDTSKLSTDQR--LPPYPYSSPSLVLPTQPH-TPKSLQQPGLPSQSCSVQSSGG
.: ::.. ...: : : . . : : :. .:. : :: :
CCDS32 ----APYPTSQMVSSDRSQLSFLPTEAQAQVSPPPPYPAPQELTQPLLQ-----------
420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 QPPGRQSHYGTPYPPGPSGHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQFSMESPSASLVLDPPGFSEGP
:: . : .:. . : . :.:::.: . :. . .. .: .. ::
CCDS32 QPRA---------PEAPAQQPQAASSLPQSDFQLLPAQGSSLTNFFPDVGFDQQSMRPGP
470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 GFLGGEGPM--GGPQDPHTFNHQNLTHCSRHGSGPNIILTGDSSPGFSKEIAAALAGVPG
.: . :. : .. . : . : :: :: :: ::: .. :.. .::::.:
CCDS32 AF-PQQVPLVQQGSRELQDSFHLRPSPYSNCGSLPNTILPEDSSTSLFKDLNSALAGLP-
520 530 540 550 560
650 660 670 680 690
pF1KE2 FEVSAAGLELGLGLEDELRMEPLGLEGLNMLSDPCALLPDPAVEESFRSDRLQ
::: ... . ::.::..:::.:.::::::: : ::.:::.::.:::
CCDS32 -EVSL-NVDTPFPLEEELQIEPLSLDGLNMLSDSSMGLLDPSVEETFRADRL
570 580 590 600 610
>>CCDS42525.1 CRTC1 gene_id:23373|Hs109|chr19 (650 aa)
initn: 975 init1: 394 opt: 775 Z-score: 391.3 bits: 82.8 E(33420): 1.8e-15
Smith-Waterman score: 1233; 39.4% identity (61.3% similar) in 724 aa overlap (14-692:2-650)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MATSGANGPGSATASASNPRKFSEKIALQKQRQAEETAAFEEVMMDIGSTR---LQAQK-
:...:::::::::::..:.:::::::::::: :.. :: :: ::
CCDS42 MATSNNPRKFSEKIALHNQKQAEETAAFEEVMKDLSLTRAARLQLQKS
10 20 30 40
60 70 80 90
pF1KE2 --LRLAYTRSSHYGGSLPNVNQIGSGLAE--FQ----------------SPLHSP-LDSS
:.:. .:...:::::::::::::: . :: .:..: ::.:
CCDS42 QYLQLGPSRGQYYGGSLPNVNQIGSGTMDLPFQPSGFLGEALAAAPVSLTPFQSSGLDTS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140
pF1KE2 RSTRHHGLVERVQRDPRRMVSPLRR------YTRHIDSSPYSPAYLSPPPESSWRRTMAW
:.:::::::.:: :. :. :: :: . :. :: ::. ::::: ..:::::
CCDS42 RTTRHHGLVDRVYRERGRLGSPHRRPLSVDKHGRQADSCPYGTMYLSPPADTSWRRT---
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 GNFPAEKGQLFRLPSALNRTSSDSALHTSVMNPSPQDTYPGPTPPSILPSRRGGILDGEM
.:::::: :.:.:. ... . . . ..: .:
CCDS42 --------------------NSDSALHQSTMTPTQPESFSSGSQD--VHQKRVLLLT---
170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 DPKVPAIEENLLD-DKHLLKP-WDAKKLSSSSSRPRSCEVPGINIFPSPDQPANVPVLPP
::..::. . ::.: : ::.:: ..:::.:::::::::::: :: .. ..:
CCDS42 ---VPGMEETTSEADKNLSKQAWDTKK---TGSRPKSCEVPGINIFPSADQENTTALIPA
210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 AMNTGGSLPDLTNLHFPPPLPTPLDPEETAYPSLSGGNSTSNLTHTMTHLGISRGMGLGP
. :::::::::::.::: :::::::::: ..:.::...::.::. ..:::::. : :
CCDS42 THNTGGSLPDLTNIHFPSPLPTPLDPEEPTFPALSSSSSTGNLAANLTHLGIG---GAGQ
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 GYDAPGLHSPLSHPSLQSSLSNPNLQASLSSPQPQLQGSHSHPSL-PASSLARHV-LPTT
:...:: :: .:. : :: ::. . :.: :.: : : ... : . .
CCDS42 GMSTPG-SSPQHRPAGVSPLS-------LSTEARRQQAS---PTLSPLSPITQAVAMDAL
320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 SLGHPSLSAPALSSSSSSSSTSSPVLGAPSYPAST--PGASPHHRRVPLSPLSLLAGPAD
:: . .: .....:.. .: : ::: : : . : : : . : :.
CCDS42 SL-EQQLPYAFFTQAGSQQPPPQPQPPPPPPPASQQPPPPPPPQAPVRLPPGGPLLPSAS
370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 ARRSQQQLPKQFSPTMSPTLSSITQGVPLDTSKLSTDQRLPPYPYSSPSLV-LPTQPHTP
:. : : .. :. : ::. :. : . .. : . :.:.: :. .:
CCDS42 LTRGPQ--PPPLAVTV-P--SSLPQSPPENPGQPSMGIDIA----SAPALQQYRTSAGSP
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 KSLQQPGLPSQSCSVQSSGGQPPGRQSHYGTPYPPGPSGHGQQSYHRPMSDFNLGNLEQF
. :.: : .. . : :. : . : :. . : . . :: : . .. .::::
CCDS42 AN-QSPTSPVSNQGF--SPGSSPQHTSTLGSVF--GDAYYEQQMAARQANALS-HQLEQF
480 490 500 510 520
570 580 590 600 610
pF1KE2 SM-ESPSASLVLDPPG----FSEGPGFLGGEGPMGGPQDPHTFNHQNLTHCSRHGSGPNI
.: :. .: : :: .:.. ...: : :. : :.: . : :.. :::
CCDS42 NMMENAISSSSLYSPGSTLNYSQA-AMMGLTGSHGSLPD-----SQQLGYAS-HSGIPNI
530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 ILT--GDSSPGFSKEIAAALAGVPGFEVSAAGLELGLGLEDELRMEPLGLEGLNMLSDPC
::: :.: :..:::....:::: .. . .. : :::...:: :.::.::.::
CCDS42 ILTVTGESPPSLSKELTSSLAGVGDVSFDSDS-QFPL---DELKIDPLTLDGLHMLNDPD
580 590 600 610 620 630
680 690
pF1KE2 ALLPDPAVEESFRSDRLQ
.: :::.:..:: :::
CCDS42 MVLADPATEDTFRMDRL
640 650
693 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Aug 16 14:42:02 2021 done: Mon Aug 16 14:42:02 2021
Total Scan time: 2.240 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]