Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4178
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4178, 642 aa
1>>>pF1KE4178 642 - 642 aa - 642 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8629+/-0.000423; mu= 1.8187+/- 0.027
mean_var=321.0351+/-66.922, 0's: 0 Z-trim(122.0): 256 B-trim: 1344 in 1/59
Lambda= 0.071581
statistics sampled from 39102 (39386) to 39102 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.462), width: 16
Scan time: 12.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 1795 199.2 3.6e-50
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 1785 198.1 7.4e-50
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 1774 197.0 1.5e-49
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 1753 194.8 7.2e-49
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 1746 194.1 1.1e-48
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 1746 194.1 1.3e-48
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 1611 180.1 1.8e-44
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 1611 180.2 2.1e-44
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 1611 180.3 2.2e-44
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1611 180.3 2.3e-44
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 1611 180.3 2.3e-44
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1601 179.2 4.7e-44
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1601 179.2 4.7e-44
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1601 179.2 4.7e-44
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1601 179.3 4.8e-44
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1601 179.3 4.8e-44
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1601 179.3 4.8e-44
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 1583 177.2 1.3e-43
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 1583 177.2 1.3e-43
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 1571 176.0 3e-43
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 1547 173.6 2.1e-42
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 1527 171.5 7.6e-42
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 1527 171.6 9.1e-42
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 1524 171.3 1.1e-41
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 1520 170.8 1.5e-41
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 1486 167.2 1.3e-40
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 1486 167.2 1.3e-40
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 1473 165.9 3.6e-40
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 1473 165.9 3.8e-40
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 1473 165.9 3.8e-40
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 1354 153.6 1.9e-36
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 1354 153.6 1.9e-36
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 1327 150.7 9.9e-36
NP_001317952 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 427) 1287 146.6 1.8e-34
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1279 145.9 4.1e-34
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1279 145.9 4.1e-34
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1279 145.9 4.1e-34
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1279 145.9 4.1e-34
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1279 145.9 4.1e-34
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 1269 144.7 6.9e-34
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 1269 144.8 7.4e-34
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 1214 139.1 3.5e-32
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 1214 139.1 3.8e-32
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 1191 136.8 2.2e-31
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 1191 136.8 2.2e-31
NP_001278935 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 544) 1086 125.9 3.7e-28
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 1053 122.5 4.2e-27
NP_001316525 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 520) 1038 120.9 1.1e-26
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 1036 120.8 1.4e-26
NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 994 116.4 2.7e-25
>>NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isoform (593 aa)
initn: 2434 init1: 1364 opt: 1795 Z-score: 1021.7 bits: 199.2 E(85289): 3.6e-50
Smith-Waterman score: 1797; 47.7% identity (74.9% similar) in 597 aa overlap (31-623:4-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLL
:: ::: :. . .: .
NP_009 METPPLPPAC----TKQGHQKPLDSKDD-----
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAM
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NP_009 NTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAM
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDA
::.:::::: .: ....: .: .:....::::: : : :::.:::::.::::. :. .
NP_009 FTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKT
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 CCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLE
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NP_009 CCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESL
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NP_009 LISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEAL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE4 VRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDC
:.. ::: ::::.:.:::: ::: .. . ::: : . .. .::: . ::..
NP_009 VKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRS-V
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 EAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPE
: :: . .::: :: . .:: :.:.. ... ..::::..:. . ::.::::: . :
NP_009 ECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSV
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVA
..: ::: ::.:.:.::::..::.::.. :.:.: :. .. : :: :.::: : :.
NP_009 ANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVG
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 TLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGG
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NP_009 VVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGG
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 NDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKY
.:: .::: :.: ..::..:: ::. : . . :..: ::.:::.::: .: :.: :
NP_009 HDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYY
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640
pF1KE4 NPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
:: :.:: :..::: : :: .::.:..
NP_009 NPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
570 580 590
>>NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isofo (597 aa)
initn: 2434 init1: 1364 opt: 1785 Z-score: 1016.1 bits: 198.1 E(85289): 7.4e-50
Smith-Waterman score: 1785; 49.2% identity (77.0% similar) in 565 aa overlap (63-623:31-594)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 QPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLC
: : . . :.. :: .:...:...:::
NP_001 MVWLEARPQILFVCTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLC
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 DIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYT
:... . :: ::.::::.::::::::::.:::::: .: ....: .: .:....::
NP_001 DVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYT
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 AEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKA
::: : : :::.:::::.::::. :. .::.:: ::: : ::::::.::: :.:.:::.
NP_001 AEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNK
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 AHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQ
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NP_001 ANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQE
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 HVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSR
. :::. :::::: :..:. .:. :.::.. ::: ::::.:.:::: ::: .. . :
NP_001 FMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVR
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 TRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRL
:: : . .. .::: . ::.. : :: . .::: :: . .:: :.:.. ... .
NP_001 TRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRS-VECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLV
310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 YAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLN
.::::..:. . ::.::::: . : ..: ::: ::.:.:.::::..::.::.. :.
NP_001 FAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLS
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500
pF1KE4 SAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNV
:.: :. .. : :: :.::: : :... : ::::::::..:. :.::: :. .:
NP_001 SVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNE
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 WSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRST
:. .: : .:::.:::.::.. ::..::.:: .::: :.: ..::..:: ::. : .
NP_001 WTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRN
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 HDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFP
. :..: ::.:::.::: .: :.: ::: :.:: :..::: : :: .::.:..
NP_001 AGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
540 550 560 570 580 590
630 640
pF1KE4 PPSSPTLSVSSTSL
>>XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like prot (555 aa)
initn: 2010 init1: 1364 opt: 1774 Z-score: 1010.3 bits: 197.0 E(85289): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 1774; 50.0% identity (77.8% similar) in 550 aa overlap (78-623:4-552)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 RPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHK
:: .:...:...::::... . :: ::.
XP_016 MKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEISAHR
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLP
::::.::::::::::.:::::: .: ....: .: .:....::::: : : :::.:::
XP_016 VVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLP
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 AASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKT
::.::::. :. .::.:: ::: : ::::::.::: :.:.:::. :. :. :::.::. .
XP_016 AAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLS
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLS
:::. : ..:: :.:::.:.. :::.:..::..::.:: :.:.. . :::. ::::::
XP_016 EEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLP
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 RDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFA
:..:. .:. :.::.. ::: ::::.:.:::: ::: .. . ::: : . .. .
XP_016 REYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVV
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 VGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATV
::: . ::.. : :: . .::: :: . .:: :.:.. ... ..::::..:. . ::
XP_016 VGGQAPKAIRS-VECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTV
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 ESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSV
.::::: . : ..: ::: ::.:.:.::::..::.::.. :.:.: :. .. : :
XP_016 DSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHV
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 AAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAG
: :.::: : :... : ::::::::..:. :.::: :. .: :. .: : .:::.::
XP_016 APMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAG
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 VAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGG
:.::.. ::..::.:: .::: :.: ..::..:: ::. : . . :..: ::.:::
XP_016 VGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGG
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 NDGSSSLNSIEKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
.::: .: :.: ::: :.:: :..::: : :: .::.:..
XP_016 DDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
520 530 540 550
>>NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein 3 i (587 aa)
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Smith-Waterman score: 1753; 49.5% identity (76.7% similar) in 553 aa overlap (74-622:32-583)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEI
:. :: .:...:.. ::::... . ::
NP_059 EGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEI
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pF1KE4 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
.::.::::.::::: ::::..::::. .. ..:.: :.:..:... ::::: : : :::
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pF1KE4 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
.:::::::::: ::. :: :: ::: :.::::::.:::.:.:.:::. :. :. ::: .
NP_059 VLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPE
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
: :::. : : :: :.:::.:.: :::.:..::.::.... ..: .:. .::. :::
NP_059 VMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRL
190 200 210 220 230 240
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pF1KE4 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGP
::: ::.:. :. :.:.... :::.::::.:.:::: .:: .. . ::.:: .
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250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 VLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSD
:...::: . ::.. : :: . ::: .: . .:: :.::. .....:::::..:.
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310 320 330 340 350 360
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pF1KE4 LATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGT
. ::. :: : . : .:: ::: ::.:.:. :::..::.::.. : :.: :. :.
NP_059 VRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNE
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 WTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRR
: :: :.::: : :....:.::::::::..:. :.:::.:.: .: : ::.: .::
NP_059 WFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRR
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 SSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLY
:.:::.:: : ::..::.:: .::: :.: ...:..:: ::. : . . :..: ::
NP_059 SGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLY
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pF1KE4 AVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSS
.:::.::: .: :.: ::: :.:: . . : : :: .::::.
NP_059 VVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
550 560 570 580
640
pF1KE4 TSL
>>NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein (555 aa)
initn: 1682 init1: 1323 opt: 1746 Z-score: 994.7 bits: 194.1 E(85289): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 1746; 49.7% identity (76.9% similar) in 549 aa overlap (78-622:4-551)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 RPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHK
:: .:...:.. ::::... . ::.::.
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pF1KE4 VVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLP
::::.::::: ::::..::::. .. ..:.: :.:..:... ::::: : : :::.:::
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pF1KE4 AASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKT
::::::: ::. :: :: ::: :.::::::.:::.:.:.:::. :. :. ::: .:
NP_001 AASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLG
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230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLS
:::. : : :: :.:::.:.: :::.:..::.::.... ..: .:. .::. ::::::
NP_001 EEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLP
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pF1KE4 RDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFA
::.:. :. :.:.... :::.::::.:.:::: .:: .. . ::.:: . :...
NP_001 RDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIV
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pF1KE4 VGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATV
::: . ::.. : :: . ::: .: . .:: :.::. .....:::::..:. . ::
NP_001 VGGQAPKAIRS-VECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTV
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 ESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSV
. :: : . : .:: ::: ::.:.:. :::..::.::.. : :.: :. :. : :
NP_001 DVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWFFV
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pF1KE4 AAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAG
: :.::: : :....:.::::::::..:. :.:::.:.: .: : ::.: .:::.::
NP_001 APMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAG
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pF1KE4 VAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGG
:.:: : ::..::.:: .::: :.: ...:..:: ::. : . . :..: ::.:::
NP_001 VGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGG
460 470 480 490 500 510
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pF1KE4 NDGSSSLNSIEKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
.::: .: :.: ::: :.:: . . : : :: .::::.
NP_001 DDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
520 530 540 550
>>XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like prot (633 aa)
initn: 1981 init1: 1335 opt: 1746 Z-score: 994.0 bits: 194.1 E(85289): 1.3e-48
Smith-Waterman score: 1746; 50.2% identity (77.6% similar) in 540 aa overlap (88-623:92-630)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 QLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYF
..::::... . :: ::.::::.:::::
XP_011 QWRDLSSLQPPTPGFKRLSHLSLPSSWDYSQNLLCDVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYF
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pF1KE4 HAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGV
:::::.:::::: .: ....: .: .:....::::: : : :::.:::::.::::. :
XP_011 HAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQ
. .::.:: ::: : ::::::.::: :.:.:::. :. :. :::.::. .:::. : ..:
XP_011 KKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDA
: :.:::.:.. :::.:..::..::.:: :.:.. . :::. :::::: :..:. .:.
XP_011 VCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 ESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIH
:.::.. ::: ::::.:.:::: ::: .. . ::: : . .. .::: . ::.
XP_011 EALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 GDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTW
. : :: . .::: :: . .:: :.:.. ... ..::::..:. . ::.::::: . :
XP_011 S-VECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQW
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 QPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYV
..: ::: ::.:.:.::::..::.::.. :.:.: :. .. : :: :.::: :
XP_011 TSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSV
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYV
:... : ::::::::..:. :.::: :. .: :. .: : .:::.:::.::.. ::.
XP_011 GVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYA
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540 550 560 570 580 590
pF1KE4 AGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSI
.::.:: .::: :.: ..::..:: ::. : . . :..: ::.:::.::: .: :.
XP_011 VGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640
pF1KE4 EKYNPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
: ::: :.:: :..::: : :: .::.:..
XP_011 EYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
610 620 630
>>NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isofo (568 aa)
initn: 2161 init1: 717 opt: 1611 Z-score: 919.2 bits: 180.1 E(85289): 1.8e-44
Smith-Waterman score: 1611; 44.5% identity (75.4% similar) in 557 aa overlap (74-624:15-568)
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pF1KE4 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEI
: ...: : . .. :::..: .. ..:
NP_001 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
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110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
::..::.: : :: :::::.. :.:: .. .. ..:..: .:.:.:::... . : :..
NP_001 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
50 60 70 80 90 100
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pF1KE4 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
:: .: ::::. : .::::::..:: ::::::::.::::..:.:: :.:: :...::..
NP_001 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
: ...::.::: ... .:..::..:.:.:: . :.:.::.::.. ::. . .:. .::
NP_001 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
170 180 190 200 210 220
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pF1KE4 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPV
:::. .:: . .. . : : .:. :..::.:.:::::.: .: . ::.::. .: .
NP_001 PLLAPQFL-ADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-T
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 LFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDL
:::::: . . : :: ::. : ::.:. :: . :::.. ..::.::: :: . :
NP_001 LFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTL
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 ATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTW
::: :.: :.::. :.:.: ::::.:.: .:..::.:: : ::..::.:: . :
NP_001 NTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQW
350 360 370 380 390 400
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pF1KE4 TSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSA
. ::.::: : : ::.:.:.:::::: :.:: : .:: ..:..: :. :.: .::...
NP_001 NFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGV
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pF1KE4 GVAVLEGALYVAGGNDG-TSCLNS-----VERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDG
::.. .: ::. ::.:. .: :.: ::::.::. : .:: :.: :.. . .
NP_001 GVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGD
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pF1KE4 WLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSV
:::::: ::.. ::..: :.:.::.:. .. . :... :....:
NP_001 KLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
530 540 550 560
640
pF1KE4 SSTSL
>>NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isofo (709 aa)
initn: 2001 init1: 717 opt: 1611 Z-score: 918.0 bits: 180.2 E(85289): 2.1e-44
Smith-Waterman score: 1611; 44.5% identity (75.4% similar) in 557 aa overlap (74-624:156-709)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEI
: ...: : . .. :::..: .. ..:
NP_001 SCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
::..::.: : :: :::::.. :.:: .. .. ..:..: .:.:.:::... . : :..
NP_001 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
:: .: ::::. : .::::::..:: ::::::::.::::..:.:: :.:: :...::..
NP_001 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
: ...::.::: ... .:..::..:.:.:: . :.:.::.::.. ::. . .:. .::
NP_001 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPV
:::. .:: . .. . : : .:. :..::.:.:::::.: .: . ::.::. .: .
NP_001 PLLAPQFL-ADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-T
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
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:::::: . . : :: ::. : ::.:. :: . :::.. ..::.::: :: . :
NP_001 LFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTL
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 ATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTW
::: :.: :.::. :.:.: ::::.:.: .:..::.:: : ::..::.:: . :
NP_001 NTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQW
490 500 510 520 530 540
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 TSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSA
. ::.::: : : ::.:.:.:::::: :.:: : .:: ..:..: :. :.: .::...
NP_001 NFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGV
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530 540 550 560 570
pF1KE4 GVAVLEGALYVAGGNDG-TSCLNS-----VERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDG
::.. .: ::. ::.:. .: :.: ::::.::. : .:: :.: :.. . .
NP_001 GVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGD
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:::::: ::.. ::..: :.:.::.:. .. . :... :....:
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pF1KE4 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
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XP_016 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
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pF1KE4 SSTSL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]