FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5777, 632 aa 1>>>pF1KE5777 632 - 632 aa - 632 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6015+/-0.000924; mu= 12.9741+/- 0.055 mean_var=87.9177+/-17.867, 0's: 0 Z-trim(107.5): 68 B-trim: 242 in 1/51 Lambda= 0.136784 statistics sampled from 9548 (9617) to 9548 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16 Scan time: 2.420 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 4276 854.1 0 CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 1227 252.3 1.1e-66 CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 1227 252.3 1.1e-66 CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 1225 251.9 1.4e-66 CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 1218 250.6 3.7e-66 CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 1217 250.4 4.2e-66 CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 1052 217.8 2.3e-56 CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 1024 212.2 1e-54 CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 936 194.9 2e-49 CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 902 188.2 2.1e-47 CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 901 188.0 2.4e-47 CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 901 188.0 2.4e-47 CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 884 184.6 2.5e-46 CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 884 184.6 2.6e-46 CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 876 183.0 6.4e-46 CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 875 182.9 8.3e-46 CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 872 182.3 1.2e-45 CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 868 181.5 2.2e-45 CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 866 181.1 2.9e-45 CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 863 180.5 4.4e-45 CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 861 180.1 5.8e-45 CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 836 175.2 1.7e-43 CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 823 172.6 1.1e-42 CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 814 170.8 3.6e-42 CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 811 170.2 5.5e-42 CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 790 166.1 9.4e-41 CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 786 165.3 1.3e-40 CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 781 164.3 3.3e-40 CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 778 163.7 4.9e-40 CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 776 163.3 6.9e-40 CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 772 162.5 1.1e-39 CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 771 162.4 1.5e-39 CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 766 161.4 2.5e-39 CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 765 161.2 3.2e-39 CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 764 161.0 3.7e-39 CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 752 158.6 1.8e-38 CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 690 146.3 5.4e-35 CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 645 137.4 2.7e-32 CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 503 109.4 6.2e-24 CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 427 94.5 3.9e-19 CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3 ( 447) 322 73.7 5.9e-13 CCDS3251.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 471) 315 72.4 1.6e-12 CCDS58868.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 456) 314 72.2 1.8e-12 CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 302 69.8 9.3e-12 CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 302 69.8 9.7e-12 CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 301 69.6 1.1e-11 CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 441) 290 67.4 4.6e-11 CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 456) 290 67.4 4.8e-11 CCDS7745.1 CHRNA10 gene_id:57053|Hs108|chr11 ( 450) 287 66.8 7.1e-11 >>CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX (632 aa) initn: 4276 init1: 4276 opt: 4276 Z-score: 4560.6 bits: 854.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4276; 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CCDS43 YVKAIDMYLMGCFVFVFMALLEYALVNYIFFGRGPQRQKKAAEKAASANNEKMRLDVNKM 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 NVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAP CCDS43 DPHENILLSTLEIKNEMATSEAVMGLGDPRSTMLAYDASSIQYRKAGLPRHSFGRNALER 370 380 390 400 410 420 >>CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 (512 aa) initn: 1313 init1: 1211 opt: 1227 Z-score: 1310.3 bits: 252.3 E(32554): 1.1e-66 Smith-Waterman score: 1227; 52.3% identity (84.8% similar) in 310 aa overlap (54-363:31-340) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 NYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPV .: ..:.. .::.:. ::.::::.::: :: CCDS43 MWRVRKRGYFGIWSFPLIIAAVCAQSVNDPSNMSLVKETVDRLLKGYDIRLRPDFGGPPV 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 PVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDC : ..: ..::...::.:::::.::.:.:.:.:.::.: :::::: :. ..::::: CCDS43 AVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNVIPLNLTLDNRVADQLWVPDT 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 YFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVES ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: :.: .:: CCDS43 YFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIES 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 YGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQR ::::..:: ..: . ::. . ....:::... . .:.: : :::: :: :.:...: CCDS43 YGYTTDDIEFYWRGDDNAVTGVTKIELPQFSIVDYKLITKKVVFSTGSYPRLSLSFKLKR 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 EVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNIS ... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. ::.: CCDS43 NIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIP 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 CIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVG .::::.:.. :. :::..::::. .::.:..:::.:: . CCDS43 YVKAIDMYLMGCFVFVFMALLEYALVNYIFFGRGPQRQKKAAEKAASANNEKMRLDVNKI 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 NVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAP CCDS43 FYKDIKQNGTQYRSLWDPTGNLSPTRRTTNYDFSLYTMDPHENILLSTLEIKNEMATSEA 370 380 390 400 410 420 >>CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 (474 aa) initn: 1318 init1: 1196 opt: 1225 Z-score: 1308.8 bits: 251.9 E(32554): 1.4e-66 Smith-Waterman score: 1225; 45.0% identity (78.4% similar) in 398 aa overlap (43-431:17-413) 20 30 40 50 60 pF1KE5 LLLIRTWLAEGNYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANE----AVVQKILDRVLS :.... : . .:: . :.. .::.:. CCDS34 MWTVQNRESLGLLSFPVMITMVCCAHSTNEPSNMSYVKETVDRLLK 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RYDVRLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNL ::.::::.::: :: : . : :.::...::.:::::.::.:.:.:::.::.: ::: CCDS34 GYDIRLRPDFGGPPVDVGMRIDVASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQSWKDKRLSYSGIPLNL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 TLDYRMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLH ::: :. ..::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::. CCDS34 TLDNRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLR 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KFPMDKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFY ..:.:.: :.: .::::::..:: ..:. . .:. ......:::... ..::.: : CCDS34 RYPLDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWNGGEGAVTGVNKIELPQFSIVDYKMVSKKVEFT 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TGSYIRLILKFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLIL ::.: :: :.:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: . CCDS34 TGAYPRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSTLITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTM 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 TTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQ-PRRHRR :::..:::. ::.: .::::::.. :. ::::.::::...::.:...::... .. . CCDS34 TTISTHLRETLPKIPYVKAIDIYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGKGPQKKGASKQDQ 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 PRRVIARYRYQQVVV---GNVQDGLINVEDGVS-SLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQ . ....: : ::. . ..... .: : .: .. : :. : : .: . . CCDS34 SANEKNKLEMNKVQVDAHGNILLSTLEIRNETSGSEVLTSVSDPKATMYSYDS-ASIQYR 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 AQLATSESLSPLTSLSGQAPLATGESLSDLPSTSEQARHSYGVRFNGFQADDSIIPTEIR :.. :. CCDS34 KPLSSREAYGRALDRHGVPSKGRIRRRASQLKVKIPDLTDVNSIDKWSRMFFPITFSLFN 410 420 430 440 450 460 >>CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (473 aa) initn: 1329 init1: 1190 opt: 1218 Z-score: 1301.3 bits: 250.6 E(32554): 3.7e-66 Smith-Waterman score: 1218; 50.5% identity (83.7% similar) in 325 aa overlap (43-363:17-341) 20 30 40 50 60 pF1KE5 LLLIRTWLAEGNYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANE----AVVQKILDRVLS :.. . : . .:. . :.. .:..:. CCDS10 MWGLAGGRLFGIFSAPVLVAVVCCAQSVNDPGNMSFVKETVDKLLK 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 RYDVRLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNL ::.::::.::: :: : ..: ..::...::.:::::.::.:.: :.:.:::: ::: CCDS10 GYDIRLRPDFGGPPVCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 TLDYRMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLH ::: :. ..::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::. CCDS10 TLDNRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLR 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KFPMDKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFY ..:.:.: :.: .::::::..:: ..: . .:. .:....:::... . ..:..: : CCDS10 RYPLDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFA 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TGSYIRLILKFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLIL ::.: :: :.:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: . CCDS10 TGAYPRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTM 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 TTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRP :::..:::. ::.: .::::.:.. :. ::::.::::...::.:..:::.:: . CCDS10 TTINTHLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKT 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 RRVIARYRYQQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLAT CCDS10 AKAKNDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQS 350 360 370 380 390 400 >>CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (473 aa) initn: 1329 init1: 1190 opt: 1217 Z-score: 1300.2 bits: 250.4 E(32554): 4.2e-66 Smith-Waterman score: 1217; 52.4% identity (85.4% similar) in 309 aa overlap (55-363:33-341) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 YPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPVP : . :.. .:..:. ::.::::.::: :: CCDS10 SGLLELLLPIWLSWTLGTRGSEPRSVNDPGNMSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPPVC 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 VRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDCY : ..: ..::...::.:::::.::.:.: :.:.:::: :::::: :. ..::::: : CCDS10 VGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQLWVPDTY 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 FLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVESY :::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: :.: .::: CCDS10 FLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIESY 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 GYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQRE :::..:: ..: . .:. .:....:::... . ..:..: : ::.: :: :.:...:. CCDS10 GYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLKRN 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 VNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNISC .. ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. ::.: CCDS10 IGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIPY 250 260 270 280 290 300 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 IKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVGN .::::.:.. :. ::::.::::...::.:..:::.:: . CCDS10 VKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSKSESNRVD 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 VQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAPL CCDS10 AHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRFLGDRSLP 370 380 390 400 410 420 >>CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (402 aa) initn: 1191 init1: 1052 opt: 1052 Z-score: 1125.4 bits: 217.8 E(32554): 2.3e-56 Smith-Waterman score: 1052; 53.3% identity (85.8% similar) in 261 aa overlap (103-363:10-270) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 RLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDY :::.::.:.: :.:.:::: :::::: CCDS53 MWATYQTEEDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDN 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 RMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPM :. ..::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:. CCDS53 RVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPL 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 DKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSY :.: :.: .::::::..:: ..: . .:. .:....:::... . ..:..: : ::.: CCDS53 DEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAY 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 IRLILKFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTID :: :.:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::. CCDS53 PRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTIN 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 SHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVI .:::. ::.: .::::.:.. :. ::::.::::...::.:..:::.:: . CCDS53 THLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAK 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 ARYRYQQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESL CCDS53 NDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPRE 280 290 300 310 320 330 >>CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (388 aa) initn: 1112 init1: 973 opt: 1024 Z-score: 1095.8 bits: 212.2 E(32554): 1e-54 Smith-Waterman score: 1024; 52.7% identity (85.5% similar) in 256 aa overlap (108-363:1-256) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 FGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEK :.:.: :.:.:::: :::::: :. .. CCDS53 MYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQ 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 LWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQAC ::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: : CCDS53 LWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNC 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 NLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLIL .: .::::::..:: ..: . .:. .:....:::... . ..:..: : ::.: :: : CCDS53 TLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSL 100 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRD .:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. CCDS53 SFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRE 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 KLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRY ::.: .::::.:.. :. ::::.::::...::.:..:::.:: . CCDS53 TLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSK 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 QQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTS CCDS53 SESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRF 280 290 300 310 320 330 >>CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 (452 aa) initn: 1001 init1: 632 opt: 936 Z-score: 1000.9 bits: 194.9 E(32554): 2e-49 Smith-Waterman score: 936; 42.9% identity (76.3% similar) in 308 aa overlap (63-369:44-351) 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 HFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPVPVRISIYVT :: ... : .::..:: :: : ... :. CCDS36 LCAQQLRGTRAMNDIGDYVGSNLEISWLPNLDGLIAGYARNFRPGIGGPPVNVALALEVA 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 SIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDCYFLNSKDAF ::..::: ::.::.:.:.::.:.::::.: .:. .: :: :. .:::.:: ...:.:.:. CCDS36 SIDHISEANMEYTMTVFLHQSWRDSRLSYNHTNETLGLDSRFVDKLWLPDTFIVNAKSAW 80 90 100 110 120 130 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 VHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVESYGYTVEDII :::::::....:.:::.. :.::.:.:.::..:: :.:::.: : : .:::::. :::. CCDS36 FHDVTVENKLIRLQPDGVILYSIRITSTVACDMDLAKYPMDEQECMLDLESYGYSSEDIV 140 150 160 170 180 190 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 LFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYT-GSYIRLILKFQVQREVNSYLVQ .:... . :: ..:.. :::. . .:.. . : . :.. :: :.:...:. . :..: CCDS36 YYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAGQFPRLSLHFHLRRNRGVYIIQ 200 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 VYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIY : :.:: . ::.:::.. . :::..:.:..: .::. :..:: : :::.:.: CCDS36 SYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTTLMVSARSSLPRASAIKALDVY 260 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 ILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVGNVQDGLIN . .: ::: .:.::.. .. : .. . ::: CCDS36 FWICYVFVFAALVEYAFAHFNADYRKKQKAKVKVSRPRAEMDVRNAIVLFSLSAAGVTQE 320 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 VEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAPLATGESLS CCDS36 LAISRRQRRVPGNLMGSYRSVGVETGETKKEGAARSGGQGGIRARLRPIDADTIDIYARA 380 390 400 410 420 430 >>CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 (449 aa) initn: 883 init1: 616 opt: 902 Z-score: 964.7 bits: 188.2 E(32554): 2.1e-47 Smith-Waterman score: 902; 38.3% identity (71.5% similar) in 368 aa overlap (63-417:42-407) 40 50 60 70 80 pF1KE5 HFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSR---YDVRLRPNFGGAPVPVRISI ::....: ::.:.:::: : :: : .: CCDS43 WETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDARIRPNFKGPPVNVSCNI 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 YVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLN-LTLDYRMHEKLWVPDCYFLNS ...:. .:.: .::: ...:..: :.: :::: : . : :: : ...: :: .: : CCDS43 FINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANE 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 KDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVESYGYTV : : :..:..:..... .:.: :.::.: : :: .::..:::: :.: . .::.:::. CCDS43 KGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPMDVQTCIMQLESFGYTM 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 EDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLG-RTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQREVNS .:.:. :...: :..... : .::: . . . .. ::.. . .:...:... CCDS43 NDLIFEWQEQG-AVQVADGLTLPQFILKEEKDLRYCTKHYNTGKFTCIEARFHLERQMGY 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 YLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNISCIKA ::.:.: :..: .: ::::::.:.:.. ::: .:.:..: .:: .: : .::..: .:: CCDS43 YLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKA 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 IDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGP----RRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVG :::.. :::.::: .::::. .:.. .. ::. :.:.. . .:. .. .: CCDS43 IDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKEDEAGEGRFNFSAYGMG 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 pF1KE5 ----NVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLS ...:: :.:. . .: .: :: ::: . .: CCDS43 PACLQAKDG-ISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMAFLI 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 GQAPLATGESLSDLPSTSEQARHSYGVRFNGFQADDSIIPTEIRNRVEAHGHGVTHDHED CCDS43 FNMFYWIIYKIVRREDVHNQ 430 440 632 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 06:33:18 2016 done: Tue Nov 8 06:33:19 2016 Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]