Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4136
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4136, 547 aa
  1>>>pF1KE4136 547 - 547 aa - 547 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4630+/-0.000878; mu= 13.3603+/- 0.053
 mean_var=92.1829+/-18.213, 0's: 0 Z-trim(108.3): 95  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.133582
 statistics sampled from 10041 (10137) to 10041 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.311), width:  16
 Scan time:  3.720

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14628.1 ARHGAP36 gene_id:158763|Hs108|chrX     ( 547) 3583 700.8 1.1e-201
CCDS65320.1 ARHGAP36 gene_id:158763|Hs108|chrX     ( 535) 3368 659.4 3.1e-189
CCDS83489.1 ARHGAP36 gene_id:158763|Hs108|chrX     ( 411) 2684 527.5 1.2e-149
CCDS14142.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs108|chrX         ( 765)  908 185.3 2.2e-46
CCDS14141.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs108|chrX         ( 771)  908 185.3 2.2e-46
CCDS14140.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs108|chrX         ( 974)  908 185.4 2.7e-46
CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2       ( 639)  296 67.4   6e-11
CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2       ( 646)  296 67.4 6.1e-11


>>CCDS14628.1 ARHGAP36 gene_id:158763|Hs108|chrX          (547 aa)
 initn: 3583 init1: 3583 opt: 3583  Z-score: 3734.6  bits: 700.8 E(32554): 1.1e-201
Smith-Waterman score: 3583; 100.0% identity (100.0% similar) in 547 aa overlap (1-547:1-547)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MGGCIPFLKAARALCPRIMPPLLLLSAFIFLVSVLGGAPGHNPDRRTKMVSIHSLSELER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGGCIPFLKAARALCPRIMPPLLLLSAFIFLVSVLGGAPGHNPDRRTKMVSIHSLSELER
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 LKLQETAYHELVARHFLSEFKPDRALPIDRPNTLDKWFLILRGQQRAVSHKTFGISLEEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKLQETAYHELVARHFLSEFKPDRALPIDRPNTLDKWFLILRGQQRAVSHKTFGISLEEV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 LVNEFTRRKHLELTATMQVEEATGQAAGRRRGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNEPTLPREFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVNEFTRRKHLELTATMQVEEATGQAAGRRRGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNEPTLPREFT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 RRGRRGAVSVDSLAELEDGALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKMSLNPIAKQIPQVVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RRGRRGAVSVDSLAELEDGALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKMSLNPIAKQIPQVVE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ACCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ACCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 MKDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLERLLKALHKITENCED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MKDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLERLLKALHKITENCED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 SIGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRESRKTKLGIDHYVASVNVVRAMID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SIGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRESRKTKLGIDHYVASVNVVRAMID
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 NWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 EARAAVLAQSKPSDEGSSEEPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLLRVPREKEAKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EARAAVLAQSKPSDEGSSEEPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLLRVPREKEAKT
              490       500       510       520       530       540

              
pF1KE4 GVSYFFP
       :::::::
CCDS14 GVSYFFP
              

>>CCDS65320.1 ARHGAP36 gene_id:158763|Hs108|chrX          (535 aa)
 initn: 3368 init1: 3368 opt: 3368  Z-score: 3510.8  bits: 659.4 E(32554): 3.1e-189
Smith-Waterman score: 3368; 100.0% identity (100.0% similar) in 516 aa overlap (32-547:20-535)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KE4 GGCIPFLKAARALCPRIMPPLLLLSAFIFLVSVLGGAPGHNPDRRTKMVSIHSLSELERL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65            MAWILDCLFASAFEPRPRRVSVLGGAPGHNPDRRTKMVSIHSLSELERL
                          10        20        30        40         

              70        80        90       100       110       120 
pF1KE4 KLQETAYHELVARHFLSEFKPDRALPIDRPNTLDKWFLILRGQQRAVSHKTFGISLEEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KLQETAYHELVARHFLSEFKPDRALPIDRPNTLDKWFLILRGQQRAVSHKTFGISLEEVL
      50        60        70        80        90       100         

             130       140       150       160       170       180 
pF1KE4 VNEFTRRKHLELTATMQVEEATGQAAGRRRGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNEPTLPREFTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VNEFTRRKHLELTATMQVEEATGQAAGRRRGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNEPTLPREFTR
     110       120       130       140       150       160         

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE4 RGRRGAVSVDSLAELEDGALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKMSLNPIAKQIPQVVEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RGRRGAVSVDSLAELEDGALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKMSLNPIAKQIPQVVEA
     170       180       190       200       210       220         

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE4 CCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 CCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRDM
     230       240       250       260       270       280         

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE4 KDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLERLLKALHKITENCEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLERLLKALHKITENCEDS
     290       300       310       320       330       340         

             370       380       390       400       410       420 
pF1KE4 IGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRESRKTKLGIDHYVASVNVVRAMIDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 IGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRESRKTKLGIDHYVASVNVVRAMIDN
     350       360       370       380       390       400         

             430       440       450       460       470       480 
pF1KE4 WDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 WDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSAE
     410       420       430       440       450       460         

             490       500       510       520       530       540 
pF1KE4 ARAAVLAQSKPSDEGSSEEPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLLRVPREKEAKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ARAAVLAQSKPSDEGSSEEPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLLRVPREKEAKTG
     470       480       490       500       510       520         

             
pF1KE4 VSYFFP
       ::::::
CCDS65 VSYFFP
     530     

>>CCDS83489.1 ARHGAP36 gene_id:158763|Hs108|chrX          (411 aa)
 initn: 2684 init1: 2684 opt: 2684  Z-score: 2800.2  bits: 527.5 E(32554): 1.2e-149
Smith-Waterman score: 2684; 100.0% identity (100.0% similar) in 411 aa overlap (137-547:1-411)

        110       120       130       140       150       160      
pF1KE4 AVSHKTFGISLEEVLVNEFTRRKHLELTATMQVEEATGQAAGRRRGNVVRRVFGRIRRFF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83                               MQVEEATGQAAGRRRGNVVRRVFGRIRRFF
                                             10        20        30

        170       180       190       200       210       220      
pF1KE4 SRRRNEPTLPREFTRRGRRGAVSVDSLAELEDGALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SRRRNEPTLPREFTRRGRRGAVSVDSLAELEDGALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKM
               40        50        60        70        80        90

        230       240       250       260       270       280      
pF1KE4 SLNPIAKQIPQVVEACCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLNPIAKQIPQVVEACCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQN
              100       110       120       130       140       150

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE4 VHDVAALLKEFFRDMKDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VHDVAALLKEFFRDMKDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLER
              160       170       180       190       200       210

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE4 LLKALHKITENCEDSIGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRESRKTKLGID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LLKALHKITENCEDSIGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRESRKTKLGID
              220       230       240       250       260       270

        410       420       430       440       450       460      
pF1KE4 HYVASVNVVRAMIDNWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HYVASVNVVRAMIDNWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKM
              280       290       300       310       320       330

        470       480       490       500       510       520      
pF1KE4 EEDALLSDPVETSAEARAAVLAQSKPSDEGSSEEPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EEDALLSDPVETSAEARAAVLAQSKPSDEGSSEEPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQD
              340       350       360       370       380       390

        530       540       
pF1KE4 RPLLRVPREKEAKTGVSYFFP
       :::::::::::::::::::::
CCDS83 RPLLRVPREKEAKTGVSYFFP
              400       410 

>>CCDS14142.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs108|chrX              (765 aa)
 initn: 934 init1: 691 opt: 908  Z-score: 946.2  bits: 185.3 E(32554): 2.2e-46
Smith-Waterman score: 974; 37.8% identity (66.9% similar) in 489 aa overlap (46-509:210-695)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KE4 PRIMPPLLLLSAFIFLVSVLGGAPGHNPDRRTKMVSIHSLSELERLKLQETAYHELVARH
                                     : . : :.::::::: .:::.:...:    
CCDS14 QSPPDSRGHPYVVWKSEGDFTWNSMSGRSVRLRSVPIQSLSELERARLQEVAFYQLQQDC
     180       190       200       210       220       230         

          80           90       100          110       120         
pF1KE4 FLSEFKPDRALPID---RPNTLDKWFLIL---RGQQRAVSHKTFGISLEEVLVNEFTRRK
        ::    . ..: :   : ..: : .  :   .....    ..::. : .:..:. . . 
CCDS14 DLSC---QITIPKDGQKRKKSLRKKLDSLGKEKNKDKEFIPQAFGMPLSQVIANDRAYKL
     240          250       260       270       280       290      

     130       140           150       160       170          180  
pF1KE4 HLELTATMQVEEATGQAA----GRRRGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNE---PTLPREFTRR
       . .:    : . .   :.    : .: :      .      :.  ::   :. :.   : 
CCDS14 KQDLQRDEQKDASDFVASLLPFGNKRQNKELSSSNSSLSSTSETPNESTSPNTPEPAPRA
        300       310       320       330       340       350      

            190        200       210       220       230       240 
pF1KE4 GRRGAVSVDSLAELEDG-ALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKMSLNPIAKQIPQVVEA
        ::::.::::...:.:. . ::..::::  .   ...  .  .:.::::: .:.:..:..
CCDS14 RRRGAMSVDSITDLDDNQSRLLEALQLSLPAEAQSKKEKARDKKLSLNPIYRQVPRLVDS
        360       370       380       390       400       410      

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE4 CCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRDM
       ::: .:::::..:::: .  : .::::::::::.:.:: :.....:::::::::::.:::
CCDS14 CCQHLEKHGLQTVGIFRVGSSKKRVRQLREEFDRGIDVSLEEEHSVHDVAALLKEFLRDM
        420       430       440       450       460       470      

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE4 KDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLERLLKALHKITENCEDS
        : ::  .:: .:. :  :.:..::..::::.::.:::. :::.:::. :  .... .:.
CCDS14 PDPLLTRELYTAFINTLLLEPEEQLGTLQLLIYLLPPCNCDTLHRLLQFLSIVARHADDN
        480       490       500       510       520       530      

             370       380       390        400       410       420
pF1KE4 IGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRE-SRKTKLGIDHYVASVNVVRAMID
       :. ::: : ::.::: ::: .::  ::.: : . .: : ...   .. .: . ::. ::.
CCDS14 ISKDGQEVTGNKMTSLNLATIFGPNLLHKQKSSDKEFSVQSSARAEESTAIIAVVQKMIE
        540       550       560       570       580       590      

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 NWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSA
       :...::.::: .: .:   . ...:...:.. ::.  . .:  . . : ..     ..:.
CCDS14 NYEALFMVPPDLQNEVLISLLETDPDVVDYLLRRKASQSSSPDMLQSEVSFSVGGRHSST
        600       610       620       630       640       650      

              490                 500       510       520       530
pF1KE4 EARAAVLAQSKPSDEGS---SE-------EPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLL
       ..  :  .. .: :..:   ::       : :.:.:. .                     
CCDS14 DSNKASSGDISPYDNNSPVLSERSLLAMQEDAAPGGSEKLYRVPGQFMLVGHLSSSKSRE
        660       670       680       690       700       710      

              540                                       
pF1KE4 RVPREKEAKTGVSYFFP                                
                                                        
CCDS14 SSPGPRLGKGNWSLASRRWPKQATLLLLHVAWCGALRTFSSSLPYLMFL
        720       730       740       750       760     

>>CCDS14141.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs108|chrX              (771 aa)
 initn: 934 init1: 691 opt: 908  Z-score: 946.1  bits: 185.3 E(32554): 2.2e-46
Smith-Waterman score: 974; 37.8% identity (66.9% similar) in 489 aa overlap (46-509:7-492)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KE4 PRIMPPLLLLSAFIFLVSVLGGAPGHNPDRRTKMVSIHSLSELERLKLQETAYHELVARH
                                     : . : :.::::::: .:::.:...:    
CCDS14                         MSGRSVRLRSVPIQSLSELERARLQEVAFYQLQQDC
                                       10        20        30      

          80           90       100          110       120         
pF1KE4 FLSEFKPDRALPID---RPNTLDKWFLIL---RGQQRAVSHKTFGISLEEVLVNEFTRRK
        ::    . ..: :   : ..: : .  :   .....    ..::. : .:..:. . . 
CCDS14 DLSC---QITIPKDGQKRKKSLRKKLDSLGKEKNKDKEFIPQAFGMPLSQVIANDRAYKL
         40           50        60        70        80        90   

     130       140           150       160       170          180  
pF1KE4 HLELTATMQVEEATGQAA----GRRRGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNE---PTLPREFTRR
       . .:    : . .   :.    : .: :      .      :.  ::   :. :.   : 
CCDS14 KQDLQRDEQKDASDFVASLLPFGNKRQNKELSSSNSSLSSTSETPNESTSPNTPEPAPRA
           100       110       120       130       140       150   

            190        200       210       220       230       240 
pF1KE4 GRRGAVSVDSLAELEDG-ALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKMSLNPIAKQIPQVVEA
        ::::.::::...:.:. . ::..::::  .   ...  .  .:.::::: .:.:..:..
CCDS14 RRRGAMSVDSITDLDDNQSRLLEALQLSLPAEAQSKKEKARDKKLSLNPIYRQVPRLVDS
           160       170       180       190       200       210   

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE4 CCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRDM
       ::: .:::::..:::: .  : .::::::::::.:.:: :.....:::::::::::.:::
CCDS14 CCQHLEKHGLQTVGIFRVGSSKKRVRQLREEFDRGIDVSLEEEHSVHDVAALLKEFLRDM
           220       230       240       250       260       270   

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE4 KDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLERLLKALHKITENCEDS
        : ::  .:: .:. :  :.:..::..::::.::.:::. :::.:::. :  .... .:.
CCDS14 PDPLLTRELYTAFINTLLLEPEEQLGTLQLLIYLLPPCNCDTLHRLLQFLSIVARHADDN
           280       290       300       310       320       330   

             370       380       390        400       410       420
pF1KE4 IGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRE-SRKTKLGIDHYVASVNVVRAMID
       :. ::: : ::.::: ::: .::  ::.: : . .: : ...   .. .: . ::. ::.
CCDS14 ISKDGQEVTGNKMTSLNLATIFGPNLLHKQKSSDKEFSVQSSARAEESTAIIAVVQKMIE
           340       350       360       370       380       390   

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 NWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSA
       :...::.::: .: .:   . ...:...:.. ::.  . .:  . . : ..     ..:.
CCDS14 NYEALFMVPPDLQNEVLISLLETDPDVVDYLLRRKASQSSSPDMLQSEVSFSVGGRHSST
           400       410       420       430       440       450   

              490                 500       510       520       530
pF1KE4 EARAAVLAQSKPSDEGS---SE-------EPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLL
       ..  :  .. .: :..:   ::       : :.:.:. .                     
CCDS14 DSNKASSGDISPYDNNSPVLSERSLLAMQEDAAPGGSEKLYRVPGQFMLVGHLSSSKSRE
           460       470       480       490       500       510   

              540                                                  
pF1KE4 RVPREKEAKTGVSYFFP                                           
                                                                   
CCDS14 SSPGPRLGKDLSEEPFDIWGTWHSTLKSGSKDPGMTGSSGDIFESSSLRAGPCSLSQGNL
           520       530       540       550       560       570   

>>CCDS14140.1 ARHGAP6 gene_id:395|Hs108|chrX              (974 aa)
 initn: 934 init1: 691 opt: 908  Z-score: 944.6  bits: 185.4 E(32554): 2.7e-46
Smith-Waterman score: 974; 37.8% identity (66.9% similar) in 489 aa overlap (46-509:210-695)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KE4 PRIMPPLLLLSAFIFLVSVLGGAPGHNPDRRTKMVSIHSLSELERLKLQETAYHELVARH
                                     : . : :.::::::: .:::.:...:    
CCDS14 QSPPDSRGHPYVVWKSEGDFTWNSMSGRSVRLRSVPIQSLSELERARLQEVAFYQLQQDC
     180       190       200       210       220       230         

          80           90       100          110       120         
pF1KE4 FLSEFKPDRALPID---RPNTLDKWFLIL---RGQQRAVSHKTFGISLEEVLVNEFTRRK
        ::    . ..: :   : ..: : .  :   .....    ..::. : .:..:. . . 
CCDS14 DLSC---QITIPKDGQKRKKSLRKKLDSLGKEKNKDKEFIPQAFGMPLSQVIANDRAYKL
     240          250       260       270       280       290      

     130       140           150       160       170          180  
pF1KE4 HLELTATMQVEEATGQAA----GRRRGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNE---PTLPREFTRR
       . .:    : . .   :.    : .: :      .      :.  ::   :. :.   : 
CCDS14 KQDLQRDEQKDASDFVASLLPFGNKRQNKELSSSNSSLSSTSETPNESTSPNTPEPAPRA
        300       310       320       330       340       350      

            190        200       210       220       230       240 
pF1KE4 GRRGAVSVDSLAELEDG-ALLLQTLQLSKISFPIGQRLLGSKRKMSLNPIAKQIPQVVEA
        ::::.::::...:.:. . ::..::::  .   ...  .  .:.::::: .:.:..:..
CCDS14 RRRGAMSVDSITDLDDNQSRLLEALQLSLPAEAQSKKEKARDKKLSLNPIYRQVPRLVDS
        360       370       380       390       400       410      

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE4 CCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQLREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRDM
       ::: .:::::..:::: .  : .::::::::::.:.:: :.....:::::::::::.:::
CCDS14 CCQHLEKHGLQTVGIFRVGSSKKRVRQLREEFDRGIDVSLEEEHSVHDVAALLKEFLRDM
        420       430       440       450       460       470      

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE4 KDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSALQLLVYLMPPCHSDTLERLLKALHKITENCEDS
        : ::  .:: .:. :  :.:..::..::::.::.:::. :::.:::. :  .... .:.
CCDS14 PDPLLTRELYTAFINTLLLEPEEQLGTLQLLIYLLPPCNCDTLHRLLQFLSIVARHADDN
        480       490       500       510       520       530      

             370       380       390        400       410       420
pF1KE4 IGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGSALLKKGKFGKRE-SRKTKLGIDHYVASVNVVRAMID
       :. ::: : ::.::: ::: .::  ::.: : . .: : ...   .. .: . ::. ::.
CCDS14 ISKDGQEVTGNKMTSLNLATIFGPNLLHKQKSSDKEFSVQSSARAEESTAIIAVVQKMIE
        540       550       560       570       580       590      

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 NWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSPEALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSA
       :...::.::: .: .:   . ...:...:.. ::.  . .:  . . : ..     ..:.
CCDS14 NYEALFMVPPDLQNEVLISLLETDPDVVDYLLRRKASQSSSPDMLQSEVSFSVGGRHSST
        600       610       620       630       640       650      

              490                 500       510       520       530
pF1KE4 EARAAVLAQSKPSDEGS---SE-------EPAVPSGTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLL
       ..  :  .. .: :..:   ::       : :.:.:. .                     
CCDS14 DSNKASSGDISPYDNNSPVLSERSLLAMQEDAAPGGSEKLYRVPGQFMLVGHLSSSKSRE
        660       670       680       690       700       710      

              540                                                  
pF1KE4 RVPREKEAKTGVSYFFP                                           
                                                                   
CCDS14 SSPGPRLGKDLSEEPFDIWGTWHSTLKSGSKDPGMTGSSGDIFESSSLRAGPCSLSQGNL
        720       730       740       750       760       770      

>>CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2            (639 aa)
 initn: 260 init1: 234 opt: 296  Z-score: 310.0  bits: 67.4 E(32554): 6e-11
Smith-Waterman score: 303; 26.9% identity (51.5% similar) in 361 aa overlap (181-536:116-422)

              160       170       180       190        200         
pF1KE4 RGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNEPTLPREFTRRGRRGAVSV-DSLAELEDGALLLQTLQLS
                                     : :. . : . .: ::.:. . .:. .  .
CCDS54 PGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGT
          90       100       110       120       130       140     

     210       220        230       240       250       260        
pF1KE4 KISFPIGQRLLGS-KRKMSLNPIAKQIPQVVEACCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQ
         .  .::::  .   .....:  . .: .:: : .:: .:: .  ::: :  . . :.:
CCDS54 PCGAVFGQRLDETVAYEQKFGP--HLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQ
         150       160         170       180       190       200   

      270       280       290       300       310       320        
pF1KE4 LREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRDMKDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSA
       ::. :: :    .: . .:: ::.::: ..::. . ..: . : .::: . :   :. .:
CCDS54 LRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKA
           210       220       230       240       250       260   

      330          340       350       360       370       380     
pF1KE4 LQLLVY---LMPPCHSDTLERLLKALHKITENCEDSIGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGS
        : :.    ..:  . . :  . . ::.:  ::  ..         :.:.  ::: :.: 
CCDS54 QQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNC--AV---------NKMSVDNLATVIG-
           270       280       290                  300       310  

         390       400       410       420       430       440     
pF1KE4 ALLKKGKFGKRESRKTKLGIDHYVASVNVVRAMIDNWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSP
                                 ::..:. ...  :...  :.::: ..        
CCDS54 --------------------------VNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTM-------
                                       320       330               

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE4 EALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSAEARAAVLAQSKPSDEGSSEEPAVPS
           .:: ...   .:  : .   :  .:: . .  ::..: . .   :   :.  .  :
CCDS54 ----MIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQKNDP-KKAPVARSSV-GWDATEDLRISRTDSFSS
          340       350       360        370        380       390  

         510       520       530       540                         
pF1KE4 GTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLLRVPREKEAKTGVSYFFP                  
        :. : :    .:. :     .   .:::::                             
CCDS54 MTSDS-DTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGA
             400       410       420       430       440       450 

CCDS54 NSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEAS
             460       470       480       490       500       510 

>>CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2            (646 aa)
 initn: 260 init1: 234 opt: 296  Z-score: 309.9  bits: 67.4 E(32554): 6.1e-11
Smith-Waterman score: 303; 26.9% identity (51.5% similar) in 361 aa overlap (181-536:123-429)

              160       170       180       190        200         
pF1KE4 RGNVVRRVFGRIRRFFSRRRNEPTLPREFTRRGRRGAVSV-DSLAELEDGALLLQTLQLS
                                     : :. . : . .: ::.:. . .:. .  .
CCDS33 PGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGT
            100       110       120       130       140       150  

     210       220        230       240       250       260        
pF1KE4 KISFPIGQRLLGS-KRKMSLNPIAKQIPQVVEACCQFIEKHGLSAVGIFTLEYSVQRVRQ
         .  .::::  .   .....:  . .: .:: : .:: .:: .  ::: :  . . :.:
CCDS33 PCGAVFGQRLDETVAYEQKFGP--HLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQ
            160       170         180       190       200       210

      270       280       290       300       310       320        
pF1KE4 LREEFDQGLDVVLDDNQNVHDVAALLKEFFRDMKDSLLPDDLYMSFLLTATLKPQDQLSA
       ::. :: :    .: . .:: ::.::: ..::. . ..: . : .::: . :   :. .:
CCDS33 LRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKA
              220       230       240       250       260       270

      330          340       350       360       370       380     
pF1KE4 LQLLVY---LMPPCHSDTLERLLKALHKITENCEDSIGIDGQLVPGNRMTSTNLALVFGS
        : :.    ..:  . . :  . . ::.:  ::  ..         :.:.  ::: :.: 
CCDS33 QQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNC--AV---------NKMSVDNLATVIG-
              280       290       300                  310         

         390       400       410       420       430       440     
pF1KE4 ALLKKGKFGKRESRKTKLGIDHYVASVNVVRAMIDNWDVLFQVPPHIQRQVAKRVWKSSP
                                 ::..:. ...  :...  :.::: ..        
CCDS33 --------------------------VNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTM-------
                                320       330       340            

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE4 EALDFIRRRNLRKIQSARIKMEEDALLSDPVETSAEARAAVLAQSKPSDEGSSEEPAVPS
           .:: ...   .:  : .   :  .:: . .  ::..: . .   :   :.  .  :
CCDS33 ----MIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQKNDP-KKAPVARSSV-GWDATEDLRISRTDSFSS
             350       360       370        380        390         

         510       520       530       540                         
pF1KE4 GTARSHDDEEGAGNPPIPEQDRPLLRVPREKEAKTGVSYFFP                  
        :. : :    .:. :     .   .:::::                             
CCDS33 MTSDS-DTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGA
     400        410       420       430       440       450        

CCDS33 NSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMSQDLRQLSDSQRTSTYDNVPSLPGSPGEEAS
      460       470       480       490       500       510        




547 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 02:29:04 2016 done: Sun Nov  6 02:29:05 2016
 Total Scan time:  3.720 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com