Result of FASTA (ccds) for pFN21AE0498
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0498, 1054 aa
  1>>>pF1KE0498 1054 - 1054 aa - 1054 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2473+/-0.00105; mu= 18.4412+/- 0.063
 mean_var=107.0717+/-21.019, 0's: 0 Z-trim(106.9): 66  B-trim: 7 in 1/49
 Lambda= 0.123947
 statistics sampled from 9164 (9227) to 9164 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.283), width:  16
 Scan time:  4.380

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1054) 6969 1257.8       0
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1070) 6927 1250.3       0
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1058) 3600 655.4 1.8e-187
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4         (1052) 2887 527.9 4.4e-149
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2302) 1166 220.4 3.5e-56
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2581) 1166 220.5 3.8e-56
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2881) 1155 218.5 1.6e-55
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2897) 1155 218.5 1.6e-55
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          (2997) 1146 216.9 5.1e-55
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20         (2715) 1143 216.4 6.9e-55
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1            ( 897) 1089 206.3 2.4e-52
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16        (3230)  916 175.8 1.3e-42
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 797)  867 166.6 1.9e-40
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1613)  758 147.3 2.4e-34
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1614)  758 147.3 2.4e-34
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1616)  758 147.3 2.4e-34
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1617)  758 147.3 2.4e-34
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1647)  758 147.4 2.5e-34
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (1966)  733 142.9 6.3e-33
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2000)  733 142.9 6.4e-33
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2059)  733 143.0 6.5e-33
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1572)  724 141.3 1.6e-32
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1590)  724 141.3 1.6e-32
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15          (1828)  714 139.5 6.3e-32
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1             (1954)  690 135.2 1.3e-30
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10          (1493)  686 134.4 1.7e-30
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12          (1905)  686 134.5 2.1e-30
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12           (1912)  686 134.5 2.1e-30
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5           (1710)  676 132.7 6.6e-30
CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12        (3123)  676 132.9 1.1e-29
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1514)  628 124.1 2.3e-27
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 700)  434 89.1 3.5e-17
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 714)  434 89.1 3.6e-17
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 740)  434 89.2 3.7e-17
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10          ( 838)  434 89.2 4.1e-17
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 884)  434 89.2 4.2e-17
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 616)  400 83.0 2.2e-15
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 693)  400 83.1 2.4e-15
CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1           ( 747)  385 80.4 1.6e-14
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15        (1556)  383 80.3 3.6e-14
CCDS33765.2 RAD54L2 gene_id:23132|Hs108|chr3       (1467)  328 70.4 3.2e-11
CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX        (1250)  326 70.0 3.6e-11
CCDS7419.1 BTAF1 gene_id:9044|Hs108|chr10          (1849)  325 70.0 5.5e-11
CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8        ( 726)  316 68.0 8.2e-11
CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8         ( 910)  316 68.1 9.7e-11


>>CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX             (1054 aa)
 initn: 6969 init1: 6969 opt: 6969  Z-score: 6734.9  bits: 1257.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6969; 100.0% identity (100.0% similar) in 1054 aa overlap (1-1054:1-1054)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 REDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 REDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050    
pF1KE0 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS
             1030      1040      1050    

>>CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX             (1070 aa)
 initn: 6927 init1: 6927 opt: 6927  Z-score: 6694.2  bits: 1250.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6927; 100.0% identity (100.0% similar) in 1047 aa overlap (1-1047:1-1047)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
              250       260       270       280       290       300

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pF1KE0 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
              310       320       330       340       350       360

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pF1KE0 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
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pF1KE0 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
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pF1KE0 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
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pF1KE0 REDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 REDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
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pF1KE0 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
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pF1KE0 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
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pF1KE0 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
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pF1KE0 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
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pF1KE0 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
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             1030      1040      1050                    
pF1KE0 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS                
       :::::::::::::::::::::::::::                       
CCDS76 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMSQKRKAESATESSGKKDVKKVKS
             1030      1040      1050      1060      1070

>>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX             (1058 aa)
 initn: 3600 init1: 3600 opt: 3600  Z-score: 3479.0  bits: 655.4 E(32554): 1.8e-187
Smith-Waterman score: 6814; 98.9% identity (98.9% similar) in 1047 aa overlap (1-1047:1-1035)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
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pF1KE0 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE0 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
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pF1KE0 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
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pF1KE0 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
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pF1KE0 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
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pF1KE0 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
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       ::            ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RE------------EAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
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pF1KE0 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
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pF1KE0 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
      710       720       730       740       750       760        

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
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              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
      830       840       850       860       870       880        

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pF1KE0 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
      890       900       910       920       930       940        

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
      950       960       970       980       990      1000        

             1030      1040      1050                    
pF1KE0 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS                
       :::::::::::::::::::::::::::                       
CCDS76 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMSQKRKAESATESSGKKDVKKVKS
     1010      1020      1030      1040      1050        

>>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4              (1052 aa)
 initn: 5697 init1: 2873 opt: 2887  Z-score: 2790.0  bits: 527.9 E(32554): 4.4e-149
Smith-Waterman score: 5713; 81.8% identity (92.3% similar) in 1031 aa overlap (29-1044:11-1029)

               10        20        30        40        50          
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKG--EKKKE
                                   : : ..  . ::. :. .. ...::  :    
CCDS37                   MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAA
                                 10        20        30        40  

       60        70                     80        90       100     
pF1KE0 KNVSSFQLKLAAKA----------PKSEKEM---DPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELF
       . :.:      : :          : ..::.   :: :::::..:::.:::.::::::::
CCDS37 QAVASAASAGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELF
             50        60        70        80        90       100  

         110       120       130       140       150       160     
pF1KE0 AHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTS
       ::::::.:::.:::::.:: :::::::::::.:.:.:::::::::::::::::.:: :..
CCDS37 AHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKAT
            110       120       130       140       150       160  

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE0 NVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYL
       ::: ::: :::::: : :::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.
CCDS37 NVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYM
            170       180       190       200       210       220  

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE0 KHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDV
       :::::::::::::::::::::::.:::::::.:: .:..:::. ::::.:: ..::::::
CCDS37 KHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDV
            230       240       250       260       270       280  

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pF1KE0 CVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQN
       :::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS37 CVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQN
            290       300       310       320       330       340  

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE0 NLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEK
       ::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::.::::::::.::::
CCDS37 NLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEK
            350       360       370       380       390       400  

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE0 SLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYL
       :::::::.:::.:::::::::::.:::::::.:::.::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYL
            410       420       430       440       450       460  

         470       480       490       500       510       520     
pF1KE0 FDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWR
       ::::::::::::: :.:.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS37 FDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWR
            470       480       490       500       510       520  

         530       540       550       560       570       580     
pF1KE0 GYEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLAS
       .::::::::::::.::.:            .:.:.: :::.::.:::::::::::::::.
CCDS37 NYEYCRLDGQTPHDERQD------------SINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLAT
            530       540                   550       560       570

         590       600       610       620       630       640     
pF1KE0 ADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSI
       :::::::::::::::::::::::::::: : :::::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS37 ADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSI
              580       590       600       610       620       630

         650       660       670       680       690       700     
pF1KE0 VIQQGRLIDQQSNKLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNE
       :::::::.::. ::..:.::::::::::::::::::::.:::::  ::::: ::::::::
CCDS37 VIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNE
              640       650       660       670       680       690

         710       720       730       740       750       760     
pF1KE0 RLQKMGESSLRNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE
       .:.:::::::::: :: :.:.:.:::::::::::....::::::::::::::::::::::
CCDS37 KLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE
              700       710       720       730       740       750

         770       780       790       800       810       820     
pF1KE0 ALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPA
       :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:: :
CCDS37 ALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAA
              760       770       780       790       800       810

         830       840       850       860       870       880     
pF1KE0 LAQREEQKKIDGAEPLTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAR
        ::.::: ::: :: :. :: ::::::::::::::.:::::::::::::.:::::.::::
CCDS37 QAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAR
              820       830       840       850       860       870

         890       900       910       920       930       940     
pF1KE0 EVEGKSPEEVMEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKA
       :::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::
CCDS37 EVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKA
              880       890       900       910       920       930

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KE0 PFHQLRIQYGTSKGKNYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIK
       :::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::.::::.:::::.::.::::::::.:
CCDS37 PFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLK
              940       950       960       970       980       990

        1010      1020      1030      1040      1050               
pF1KE0 SRTAMEFQRRCNTLISLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS           
       ::::::.::::::::.:::.::::.::.:.::::::. :                     
CCDS37 SRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKL
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

CCDS37 KL
         

>>CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14              (2302 aa)
 initn: 1006 init1: 405 opt: 1166  Z-score: 1122.1  bits: 220.4 E(32554): 3.5e-56
Smith-Waterman score: 1354; 36.3% identity (64.5% similar) in 722 aa overlap (13-695:363-1057)

                                 10        20         30           
pF1KE0                   MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQP-GPSTSQEE----
                                     : .: . .. ... : : :  :  ::    
CCDS45 PILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVK
            340       350       360       370       380       390  

          40         50        60        70        80        90    
pF1KE0 --GAAAAATE-ATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR
         . .    : :: .  . .:. ..... :. :.:      ... .:   . ...::   
CCDS45 YKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDR---
            400       410       420       430       440            

          100       110       120       130        140       150   
pF1KE0 FEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQSLISAGDYRHRRTEQEE
          .: ..    : :. .  .     :    . :   .  : .  .. :  :. .  : .
CCDS45 ---ILDES----HSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSR
        450           460       470       480       490       500  

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE0 DEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLG
         ::   .:  ...  ..:.:  : . . ::.::..:.:::.  . :  : :::::::::
CCDS45 HPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLG
            510       520       530       540       550       560  

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE0 KTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAF
       ::.:.::.:  . .  .: :: .:..: ::. ::  ::. :.  . .: . :.  .:  .
CCDS45 KTIQSIAFLQEVYNV-GIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTE-MNTIVYHGSLASRQMI
            570        580       590       600        610       620

                    280         290       300       310       320  
pF1KE0 IRDEM---------MPG--EWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSK
        . ::         .::  ..:. .:..::....   .....:: ..::::::.::.. :
CCDS45 QQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCK
              630       640       650       660       670       680

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE0 LSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQK
       : . ....   ...:::::::::...::..::.:: :. : : ..: . :     :  ..
CCDS45 LLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGD---LKTEE
              690       700       710       720       730          

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE0 LVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNS-S
        :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.:  : . :...:...:  :: :... :.. .
CCDS45 QVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGA
       740       750       760       770       780       790       

             450       460       470         480                   
pF1KE0 GKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPG--PPYTTDEHI----------VSNSGKMV
       :. .   ::: .:.::::::::::..:::      .    ::          : ..::.:
CCDS45 GHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLV
       800       810       820       830       840       850       

     490       500       510       520       530       540         
pF1KE0 VLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVE
       ..:::: :::  : .:::::::.: ::::::: . : : : :.::..  . :.       
CCDS45 LIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQ-------
       860       870       880       890       900       910       

     550       560       570       580       590       600         
pF1KE0 FLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAH
             ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..::::::: ::::. : :
CCDS45 -----AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCH
                   920       930       940       950       960     

     610       620       630       640         650        660      
pF1KE0 RIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ--GRLIDQQS-NKLAKEEML
       ::::.: :.:.:::: :. :... ..: .:: ::. :.:.  ::  .  . ....:.:. 
CCDS45 RIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIE
         970       980       990      1000      1010      1020     

        670       680          690       700       710       720   
pF1KE0 QMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRMDIE
       ...:.::  ..  ...:   . .:::  :: :                            
CCDS45 DLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRT
        1030      1040      1050      1060      1070      1080     

           730       740       750       760       770       780   
pF1KE0 QSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRPPKQ
                                                                   
CCDS45 DISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLES
        1090      1100      1110      1120      1130      1140     

>>CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14              (2581 aa)
 initn: 1006 init1: 405 opt: 1166  Z-score: 1121.4  bits: 220.5 E(32554): 3.8e-56
Smith-Waterman score: 1354; 36.3% identity (64.5% similar) in 722 aa overlap (13-695:642-1336)

                                 10        20         30           
pF1KE0                   MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQP-GPSTSQEE----
                                     : .: . .. ... : : :  :  ::    
CCDS53 PILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVK
             620       630       640       650       660       670 

          40         50        60        70        80        90    
pF1KE0 --GAAAAATE-ATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR
         . .    : :: .  . .:. ..... :. :.:      ... .:   . ...::   
CCDS53 YKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDR---
             680       690       700       710       720           

          100       110       120       130        140       150   
pF1KE0 FEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQSLISAGDYRHRRTEQEE
          .: ..    : :. .  .     :    . :   .  : .  .. :  :. .  : .
CCDS53 ---ILDES----HSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSR
         730           740       750       760       770       780 

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE0 DEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLG
         ::   .:  ...  ..:.:  : . . ::.::..:.:::.  . :  : :::::::::
CCDS53 HPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLG
             790       800       810       820       830       840 

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE0 KTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAF
       ::.:.::.:  . .  .: :: .:..: ::. ::  ::. :.  . .: . :.  .:  .
CCDS53 KTIQSIAFLQEVYNV-GIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTE-MNTIVYHGSLASRQMI
             850        860       870       880        890         

                    280         290       300       310       320  
pF1KE0 IRDEM---------MPG--EWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSK
        . ::         .::  ..:. .:..::....   .....:: ..::::::.::.. :
CCDS53 QQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCK
     900       910       920       930       940       950         

            330       340       350       360       370       380  
pF1KE0 LSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQK
       : . ....   ...:::::::::...::..::.:: :. : : ..: . :     :  ..
CCDS53 LLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGD---LKTEE
     960       970       980       990      1000      1010         

            390       400       410       420       430       440  
pF1KE0 LVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNS-S
        :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.:  : . :...:...:  :: :... :.. .
CCDS53 QVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGA
       1020      1030      1040      1050      1060      1070      

             450       460       470         480                   
pF1KE0 GKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPG--PPYTTDEHI----------VSNSGKMV
       :. .   ::: .:.::::::::::..:::      .    ::          : ..::.:
CCDS53 GHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLV
       1080      1090      1100      1110      1120      1130      

     490       500       510       520       530       540         
pF1KE0 VLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVE
       ..:::: :::  : .:::::::.: ::::::: . : : : :.::..  . :.       
CCDS53 LIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQ-------
       1140      1150      1160      1170      1180                

     550       560       570       580       590       600         
pF1KE0 FLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAH
             ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..::::::: ::::. : :
CCDS53 -----AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCH
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

     610       620       630       640         650        660      
pF1KE0 RIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ--GRLIDQQS-NKLAKEEML
       ::::.: :.:.:::: :. :... ..: .:: ::. :.:.  ::  .  . ....:.:. 
CCDS53 RIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIE
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

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pF1KE0 QMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRMDIE
       ...:.::  ..  ...:   . .:::  :: :                            
CCDS53 DLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRT
         1310      1320      1330      1340      1350      1360    

           730       740       750       760       770       780   
pF1KE0 QSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRPPKQ
                                                                   
CCDS53 DISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLES
         1370      1380      1390      1400      1410      1420    

>>CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16              (2881 aa)
 initn: 1060 init1: 411 opt: 1155  Z-score: 1110.1  bits: 218.5 E(32554): 1.6e-55
Smith-Waterman score: 1361; 36.2% identity (64.1% similar) in 767 aa overlap (54-780:739-1456)

            30        40        50        60        70         80  
pF1KE0 IEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPK-SEKEMDPE
                                     .:. ..... :.:. : .:   .. : .: 
CCDS45 VMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFFADMEEEPF
      710       720       730       740       750       760        

             90        100         110       120       130         
pF1KE0 YEEKMKADRAKRFEFLL-KQT--ELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLI
         . ...::. .  :   :.:   .. ....  .     :  ..:      : .: ..: 
CCDS45 NPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQL-
      770       780       790       800       810       820        

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pF1KE0 SAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYE
       .:.    :: .           :  ::.  ... : .: .:. ::.::..:::::.  . 
CCDS45 QASRPDTRRLD-----------RPPSNIWKKIDQSRDYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWY
       830                  840       850       860       870      

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE0 NGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLR
       :  : :::::::::::.:.:..: :     .: :: ....: ::. ::  ::. :. .. 
CCDS45 NRRNCILADEMGLGKTIQSITFL-YEILLTGIRGPFLIIAPLSTIANWEREFRTWT-DIN
        880       890        900       910       920       930     

     260       270                280         290       300        
pF1KE0 VICFVGDKDARAA------FIRD---EMMPGEW--DVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYL
       :. . :.  .:        ..::   ... : .  .. .:..::..   . .. ..:: .
CCDS45 VVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCV
          940       950       960       970       980       990    

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pF1KE0 VIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDF
       .::::::.::.. :: : .. ..  ...:::::::::...::..::.:: :  : : . :
CCDS45 IIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTF
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE0 DSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYT
        . :     :  .. :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.:  : . :...:...: 
CCDS45 MQEFGD---LKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYR
         1060         1070      1080      1090      1100      1110 

      430       440        450       460       470                 
pF1KE0 KILMKDIDVLNS-SGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEP---GP------PYTTD
        :: :... :.. .:. .   :.: .:.::::::::::. :::    :       : ..:
CCDS45 AILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASD
            1120      1130      1140      1150      1160      1170 

      480          490       500       510       520       530     
pF1KE0 EHI---VSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQ
        :.   ....::.:..:::: :.:  : .:::::::.: ::::::: . . : : :.::.
CCDS45 FHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGR
            1180      1190      1200      1210      1220      1230 

         540       550       560       570       580       590     
pF1KE0 TPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSD
       .  . :.             ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..:::
CCDS45 VRGNLRQ------------AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSD
                        1240      1250      1260      1270         

         600       610       620       630       640       650     
pF1KE0 WNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQ
       :::: ::::. : :::::.: :.:.::.: :. :... .:: .:: ::. :.:.  .  .
CCDS45 WNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQS--MSGR
    1280      1290      1300      1310      1320      1330         

              660       670       680          690        700      
pF1KE0 QSN-----KLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTILERGEKK-TAEMNER
       .::     .:.:.:. ...:.::  ..  .:.:   . .:::  :: :  :  : : . :
CCDS45 ESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGR
      1340      1350      1360      1370      1380      1390       

        710         720       730       740       750       760    
pF1KE0 LQKMGESSL--RNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYF-
        . ....:.   . : ::  ::     .:    ::     :       .::.  ..:   
CCDS45 GSTFAKASFVASGNRTDI--SL-----DDPNFWQK-----W------AKKAEIDIEAISG
      1400      1410             1420                 1430         

           770       780       790       800       810       820   
pF1KE0 REALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPN
       :..: .. :.: :  ::                                           
CCDS45 RNSLVIDTPRIRKQTRPFSATKDELAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVE
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

>>CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16              (2897 aa)
 initn: 1060 init1: 411 opt: 1155  Z-score: 1110.1  bits: 218.5 E(32554): 1.6e-55
Smith-Waterman score: 1361; 36.2% identity (64.1% similar) in 767 aa overlap (54-780:739-1456)

            30        40        50        60        70         80  
pF1KE0 IEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPK-SEKEMDPE
                                     .:. ..... :.:. : .:   .. : .: 
CCDS76 VMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFFADMEEEPF
      710       720       730       740       750       760        

             90        100         110       120       130         
pF1KE0 YEEKMKADRAKRFEFLL-KQT--ELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLI
         . ...::. .  :   :.:   .. ....  .     :  ..:      : .: ..: 
CCDS76 NPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQL-
      770       780       790       800       810       820        

     140       150       160       170       180       190         
pF1KE0 SAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYE
       .:.    :: .           :  ::.  ... : .: .:. ::.::..:::::.  . 
CCDS76 QASRPDTRRLD-----------RPPSNIWKKIDQSRDYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWY
       830                  840       850       860       870      

     200       210       220       230       240       250         
pF1KE0 NGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLR
       :  : :::::::::::.:.:..: :     .: :: ....: ::. ::  ::. :. .. 
CCDS76 NRRNCILADEMGLGKTIQSITFL-YEILLTGIRGPFLIIAPLSTIANWEREFRTWT-DIN
        880       890        900       910       920       930     

     260       270                280         290       300        
pF1KE0 VICFVGDKDARAA------FIRD---EMMPGEW--DVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYL
       :. . :.  .:        ..::   ... : .  .. .:..::..   . .. ..:: .
CCDS76 VVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCV
          940       950       960       970       980       990    

      310       320       330       340       350       360        
pF1KE0 VIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDF
       .::::::.::.. :: : .. ..  ...:::::::::...::..::.:: :  : : . :
CCDS76 IIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTF
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE0 DSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYT
        . :     :  .. :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.:  : . :...:...: 
CCDS76 MQEFGD---LKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYR
         1060         1070      1080      1090      1100      1110 

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pF1KE0 KILMKDIDVLNS-SGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEP---GP------PYTTD
        :: :... :.. .:. .   :.: .:.::::::::::. :::    :       : ..:
CCDS76 AILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASD
            1120      1130      1140      1150      1160      1170 

      480          490       500       510       520       530     
pF1KE0 EHI---VSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQ
        :.   ....::.:..:::: :.:  : .:::::::.: ::::::: . . : : :.::.
CCDS76 FHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGR
            1180      1190      1200      1210      1220      1230 

         540       550       560       570       580       590     
pF1KE0 TPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSD
       .  . :.             ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..:::
CCDS76 VRGNLRQ------------AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSD
                        1240      1250      1260      1270         

         600       610       620       630       640       650     
pF1KE0 WNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQ
       :::: ::::. : :::::.: :.:.::.: :. :... .:: .:: ::. :.:.  .  .
CCDS76 WNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQS--MSGR
    1280      1290      1300      1310      1320      1330         

              660       670       680          690        700      
pF1KE0 QSN-----KLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTILERGEKK-TAEMNER
       .::     .:.:.:. ...:.::  ..  .:.:   . .:::  :: :  :  : : . :
CCDS76 ESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGR
      1340      1350      1360      1370      1380      1390       

        710         720       730       740       750       760    
pF1KE0 LQKMGESSL--RNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYF-
        . ....:.   . : ::  ::     .:    ::     :       .::.  ..:   
CCDS76 GSTFAKASFVASGNRTDI--SL-----DDPNFWQK-----W------AKKAEIDIEAISG
      1400      1410             1420                 1430         

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pF1KE0 REALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPN
       :..: .. :.: :  ::                                           
CCDS76 RNSLVIDTPRIRKQTRPFSATKDELAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVE
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

>>CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8               (2997 aa)
 initn: 1218 init1: 425 opt: 1146  Z-score: 1101.2  bits: 216.9 E(32554): 5.1e-55
Smith-Waterman score: 1352; 36.4% identity (63.1% similar) in 773 aa overlap (48-779:841-1563)

        20        30        40        50          60        70     
pF1KE0 TATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKK--EKNVSSFQLKLAAKAPKS
                                     :. :  :: :  ..... :. : . .   :
CCDS47 VKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFLS
              820       830       840       850       860       870

             80        90       100         110       120       130
pF1KE0 EKE---MDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQT-ELFAHF-IQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRI
       : :   ..:.: :   .::   :     .  :  .:. ..  .     :  . .    . 
CCDS47 EIEDELFNPDYVE---VDRIMDFARSTDDRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQA
              880          890       900       910       920       

              140       150       160       170       180       190
pF1KE0 KKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRG
       : .: ..:.:      :. : :. :.  ... : :      : :  : ... ::.::..:
CCDS47 KIEEFEKLMS------REPETERVERPPADDWKKS------ESSREYKNNNKLREYQLEG
       930             940       950             960       970     

              200       210       220       230       240       250
pF1KE0 LNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNE
       .:::.  . :  : :::::::::::.:.:..: :  . ..: :: .:..: ::. ::  :
CCDS47 VNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFL-YEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWERE
         980       990      1000       1010      1020      1030    

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pF1KE0 FKRWVPSLRVICFVGDKDARAA------FIRD---EMMPG--EWDVCVTSYEMVIKEKSV
       :. :.  : :. . :.. .: .      ...:   ... :  .. . .:..::.. .   
CCDS47 FRTWTE-LNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPE
         1040       1050      1060      1070      1080      1090   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE0 FKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLP
       .... :: .:::::::.::.. :: : .. .   ...:::::::::...::..::.:: :
CCDS47 LRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEP
          1100      1110      1120      1130      1140      1150   

     360       370       380       390       400       410         
pF1KE0 DVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGL
       . : :   : . :     :  .. :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.:  : . :
CCDS47 SRFPSETTFMQEFGD---LKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVEL
          1160         1170      1180      1190      1200      1210

     420       430       440        450       460       470        
pF1KE0 SKMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKM-RLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPG------
       ...:...:  :: :..  :...: . ..  ::: .:.::::::::::..:::        
CCDS47 TNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFK
             1220      1230      1240      1250      1260      1270

                  480       490       500       510       520      
pF1KE0 ------PPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRG
              :    . ... .::.:..:::: :::  : ::::::::.: ::::::: . : 
CCDS47 ETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRR
             1280      1290      1300      1310      1320      1330

        530       540       550       560       570       580      
pF1KE0 YEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASA
       : : :.::..  . :.             ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..:
CCDS47 YPYERIDGRVRGNLRQ------------AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAA
             1340                  1350      1360      1370        

        590       600       610       620       630       640      
pF1KE0 DVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIV
       :. :..::::::: ::::. : :::::.: :...:::: :. :... ..: .:: ::. :
CCDS47 DTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAV
     1380      1390      1400      1410      1420      1430        

        650          660       670       680          690          
pF1KE0 IQQGRLIDQQSN---KLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTIL-ERGEKK
       .:.    .. .:   .:.:.:. ...:.::  .. ..:.:   . .:::  :: .: .  
CCDS47 LQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTI
     1440      1450      1460      1470      1480      1490        

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pF1KE0 TAEMNERLQKMGESSL--RNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANY
       : : . . . ....:.   . : ::  ::     .:    ::     :       .::. 
CCDS47 TIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDI--SL-----DDPNFWQK-----WA------KKAEL
     1500      1510      1520             1530                 1540

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pF1KE0 AVDAYF-REALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVP
        .::   :. : .. :.. :  :                                     
CCDS47 DIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQG
             1550      1560      1570      1580      1590      1600

>>CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20              (2715 aa)
 initn: 1026 init1: 416 opt: 1143  Z-score: 1098.9  bits: 216.4 E(32554): 6.9e-55
Smith-Waterman score: 1348; 36.6% identity (64.7% similar) in 711 aa overlap (143-807:417-1107)

            120       130       140       150       160            
pF1KE0 AQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSE----SRKTSNVC
                                     :    .... :. ..: :     : .:.  
CCDS13 KDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVLPEIKHVERPASDSW
        390       400       410       420       430       440      

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE0 IRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHY
        ..: :  : ... ::.::..:.:::.  . :  : :::::::::::.:.:..:. .   
CCDS13 QKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEI-FL
        450       460       470       480       490       500      

      230       240       250       260       270                  
pF1KE0 RNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEM---------M
       :.: :: ....: ::. ::  ::. :.  . .: . :.. .:  . . ::         .
CCDS13 RGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTE-MNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPL
         510       520       530        540       550       560    

     280         290       300       310       320       330       
pF1KE0 PG--EWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLL
        :  .. : .:..::.. .   .::.::  ..::::::.::.. :: : .. .   ...:
CCDS13 SGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVL
          570       580       590       600       610       620    

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE0 LTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLR
       ::::::::...::..::::: :. : :   :   :     :  .. :..:...:::..::
CCDS13 LTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGD---LKTEEQVKKLQSILKPMMLR
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CCDS13 AELDTEAKNEKESLV--IDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLND
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