FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0498, 1054 aa 1>>>pF1KE0498 1054 - 1054 aa - 1054 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2473+/-0.00105; mu= 18.4412+/- 0.063 mean_var=107.0717+/-21.019, 0's: 0 Z-trim(106.9): 66 B-trim: 7 in 1/49 Lambda= 0.123947 statistics sampled from 9164 (9227) to 9164 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16 Scan time: 4.380 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 6969 1257.8 0 CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 6927 1250.3 0 CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 3600 655.4 1.8e-187 CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 2887 527.9 4.4e-149 CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 1166 220.4 3.5e-56 CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 1166 220.5 3.8e-56 CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 1155 218.5 1.6e-55 CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 1155 218.5 1.6e-55 CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 1146 216.9 5.1e-55 CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 1143 216.4 6.9e-55 CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 1089 206.3 2.4e-52 CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 916 175.8 1.3e-42 CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 867 166.6 1.9e-40 CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 758 147.3 2.4e-34 CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 758 147.3 2.4e-34 CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 758 147.3 2.4e-34 CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 758 147.3 2.4e-34 CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 758 147.4 2.5e-34 CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 733 142.9 6.3e-33 CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 733 142.9 6.4e-33 CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 733 143.0 6.5e-33 CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 724 141.3 1.6e-32 CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 724 141.3 1.6e-32 CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 714 139.5 6.3e-32 CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 690 135.2 1.3e-30 CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 686 134.4 1.7e-30 CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 686 134.5 2.1e-30 CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 686 134.5 2.1e-30 CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 676 132.7 6.6e-30 CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12 (3123) 676 132.9 1.1e-29 CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 628 124.1 2.3e-27 CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 434 89.1 3.5e-17 CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 434 89.1 3.6e-17 CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 434 89.2 3.7e-17 CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 434 89.2 4.1e-17 CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 434 89.2 4.2e-17 CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 400 83.0 2.2e-15 CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 400 83.1 2.4e-15 CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1 ( 747) 385 80.4 1.6e-14 CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 383 80.3 3.6e-14 CCDS33765.2 RAD54L2 gene_id:23132|Hs108|chr3 (1467) 328 70.4 3.2e-11 CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX (1250) 326 70.0 3.6e-11 CCDS7419.1 BTAF1 gene_id:9044|Hs108|chr10 (1849) 325 70.0 5.5e-11 CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 726) 316 68.0 8.2e-11 CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 910) 316 68.1 9.7e-11 >>CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054 aa) initn: 6969 init1: 6969 opt: 6969 Z-score: 6734.9 bits: 1257.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6969; 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CCDS37 NYEYCRLDGQTPHDERQD------------SINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLAT 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 640 pF1KE0 ADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSI :::::::::::::::::::::::::::: : :::::.:::::::::::::::.::::::: CCDS37 ADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSI 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 700 pF1KE0 VIQQGRLIDQQSNKLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNE :::::::.::. ::..:.::::::::::::::::::::.::::: ::::: :::::::: CCDS37 VIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNE 640 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KE0 RLQKMGESSLRNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE .:.:::::::::: :: :.:.:.:::::::::::....:::::::::::::::::::::: CCDS37 KLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE 700 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 820 pF1KE0 ALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPA :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:: : CCDS37 ALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAA 760 770 780 790 800 810 830 840 850 860 870 880 pF1KE0 LAQREEQKKIDGAEPLTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAR ::.::: ::: :: :. :: ::::::::::::::.:::::::::::::.:::::.:::: CCDS37 QAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAR 820 830 840 850 860 870 890 900 910 920 930 940 pF1KE0 EVEGKSPEEVMEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKA :::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::: CCDS37 EVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKA 880 890 900 910 920 930 950 960 970 980 990 1000 pF1KE0 PFHQLRIQYGTSKGKNYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIK :::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::.::::.:::::.::.::::::::.: CCDS37 PFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLK 940 950 960 970 980 990 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE0 SRTAMEFQRRCNTLISLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS ::::::.::::::::.:::.::::.::.:.::::::. : CCDS37 SRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 CCDS37 KL >>CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302 aa) initn: 1006 init1: 405 opt: 1166 Z-score: 1122.1 bits: 220.4 E(32554): 3.5e-56 Smith-Waterman score: 1354; 36.3% identity (64.5% similar) in 722 aa overlap (13-695:363-1057) 10 20 30 pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQP-GPSTSQEE---- : .: . .. ... : : : : :: CCDS45 PILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVK 340 350 360 370 380 390 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 --GAAAAATE-ATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR . . : :: . . .:. ..... :. :.: ... .: . ...:: CCDS45 YKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDR--- 400 410 420 430 440 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 FEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQSLISAGDYRHRRTEQEE .: .. : :. . . : . : . : . .. : :. . : . CCDS45 ---ILDES----HSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSR 450 460 470 480 490 500 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 DEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLG :: .: ... ..:.: : . . ::.::..:.:::. . : : ::::::::: CCDS45 HPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLG 510 520 530 540 550 560 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 KTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAF ::.:.::.: . . .: :: .:..: ::. :: ::. :. . .: . :. .: . CCDS45 KTIQSIAFLQEVYNV-GIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTE-MNTIVYHGSLASRQMI 570 580 590 600 610 620 280 290 300 310 320 pF1KE0 IRDEM---------MPG--EWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSK . :: .:: ..:. .:..::.... .....:: ..::::::.::.. : CCDS45 QQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCK 630 640 650 660 670 680 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 LSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQK : . .... ...:::::::::...::..::.:: :. : : ..: . : : .. 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CCDS45 LIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQ------- 860 870 880 890 900 910 550 560 570 580 590 600 pF1KE0 FLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAH ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..::::::: ::::. : : CCDS45 -----AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCH 920 930 940 950 960 610 620 630 640 650 660 pF1KE0 RIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ--GRLIDQQS-NKLAKEEML ::::.: :.:.:::: :. :... ..: .:: ::. :.:. :: . . ....:.:. CCDS45 RIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIE 970 980 990 1000 1010 1020 670 680 690 700 710 720 pF1KE0 QMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRMDIE ...:.:: .. ...: . .::: :: : CCDS45 DLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRT 1030 1040 1050 1060 1070 1080 730 740 750 760 770 780 pF1KE0 QSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRPPKQ CCDS45 DISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLES 1090 1100 1110 1120 1130 1140 >>CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581 aa) initn: 1006 init1: 405 opt: 1166 Z-score: 1121.4 bits: 220.5 E(32554): 3.8e-56 Smith-Waterman score: 1354; 36.3% identity (64.5% similar) in 722 aa overlap (13-695:642-1336) 10 20 30 pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQP-GPSTSQEE---- : .: . .. ... : : : : :: CCDS53 PILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVK 620 630 640 650 660 670 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 --GAAAAATE-ATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR . . : :: . . .:. ..... :. :.: ... .: . ...:: CCDS53 YKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDR--- 680 690 700 710 720 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 FEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQSLISAGDYRHRRTEQEE .: .. : :. . . : . : . : . .. : :. . : . CCDS53 ---ILDES----HSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSR 730 740 750 760 770 780 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 DEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLG :: .: ... ..:.: : . . ::.::..:.:::. . : : ::::::::: CCDS53 HPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLG 790 800 810 820 830 840 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 KTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAF ::.:.::.: . . .: :: .:..: ::. :: ::. :. . .: . :. .: . CCDS53 KTIQSIAFLQEVYNV-GIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTE-MNTIVYHGSLASRQMI 850 860 870 880 890 280 290 300 310 320 pF1KE0 IRDEM---------MPG--EWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSK . :: .:: ..:. .:..::.... .....:: ..::::::.::.. : CCDS53 QQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCK 900 910 920 930 940 950 330 340 350 360 370 380 pF1KE0 LSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQK : . .... ...:::::::::...::..::.:: :. : : ..: . : : .. CCDS53 LLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGD---LKTEE 960 970 980 990 1000 1010 390 400 410 420 430 440 pF1KE0 LVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNS-S :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.: : . :...:...: :: :... :.. . CCDS53 QVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGA 1020 1030 1040 1050 1060 1070 450 460 470 480 pF1KE0 GKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPG--PPYTTDEHI----------VSNSGKMV :. . ::: .:.::::::::::..::: . :: : ..::.: CCDS53 GHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLV 1080 1090 1100 1110 1120 1130 490 500 510 520 530 540 pF1KE0 VLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVE ..:::: ::: : .:::::::.: ::::::: . : : : :.::.. . :. CCDS53 LIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQ------- 1140 1150 1160 1170 1180 550 560 570 580 590 600 pF1KE0 FLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAH ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..::::::: ::::. : : CCDS53 -----AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCH 1190 1200 1210 1220 1230 1240 610 620 630 640 650 660 pF1KE0 RIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ--GRLIDQQS-NKLAKEEML ::::.: :.:.:::: :. :... ..: .:: ::. :.:. :: . . ....:.:. CCDS53 RIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIE 1250 1260 1270 1280 1290 1300 670 680 690 700 710 720 pF1KE0 QMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRMDIE ...:.:: .. ...: . .::: :: : CCDS53 DLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRT 1310 1320 1330 1340 1350 1360 730 740 750 760 770 780 pF1KE0 QSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRPPKQ CCDS53 DISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLES 1370 1380 1390 1400 1410 1420 >>CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881 aa) initn: 1060 init1: 411 opt: 1155 Z-score: 1110.1 bits: 218.5 E(32554): 1.6e-55 Smith-Waterman score: 1361; 36.2% identity (64.1% similar) in 767 aa overlap (54-780:739-1456) 30 40 50 60 70 80 pF1KE0 IEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPK-SEKEMDPE .:. ..... :.:. : .: .. : .: CCDS45 VMIDTEEFFVKYKNYSYLHCEWATEEQLLKDKRIQQKIKRFKLRQAQRAHFFADMEEEPF 710 720 730 740 750 760 90 100 110 120 130 pF1KE0 YEEKMKADRAKRFEFLL-KQT--ELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLI . ...::. . : :.: .. .... . : ..: : .: ..: CCDS45 NPDYVEVDRVLEVSFCEDKDTGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDLAKIEEFEQL- 770 780 790 800 810 820 140 150 160 170 180 190 pF1KE0 SAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYE .:. :: . : ::. ... : .: .:. ::.::..:::::. . CCDS45 QASRPDTRRLD-----------RPPSNIWKKIDQSRDYKNGNQLREYQLEGLNWLLFNWY 830 840 850 860 870 200 210 220 230 240 250 pF1KE0 NGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLR : : :::::::::::.:.:..: : .: :: ....: ::. :: ::. :. .. CCDS45 NRRNCILADEMGLGKTIQSITFL-YEILLTGIRGPFLIIAPLSTIANWEREFRTWT-DIN 880 890 900 910 920 930 260 270 280 290 300 pF1KE0 VICFVGDKDARAA------FIRD---EMMPGEW--DVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYL :. . :. .: ..:: ... : . .. .:..::.. . .. ..:: . CCDS45 VVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCV 940 950 960 970 980 990 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 VIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDF .::::::.::.. :: : .. .. ...:::::::::...::..::.:: : : : . : CCDS45 IIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTF 1000 1010 1020 1030 1040 1050 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 DSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYT . : : .. :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.: : . :...:...: CCDS45 MQEFGD---LKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYR 1060 1070 1080 1090 1100 1110 430 440 450 460 470 pF1KE0 KILMKDIDVLNS-SGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEP---GP------PYTTD :: :... :.. .:. . :.: .:.::::::::::. ::: : : ..: CCDS45 AILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASD 1120 1130 1140 1150 1160 1170 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 EHI---VSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQ :. ....::.:..:::: :.: : .:::::::.: ::::::: . . : : :.::. CCDS45 FHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 TPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSD . . :. ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..::: CCDS45 VRGNLRQ------------AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSD 1240 1250 1260 1270 600 610 620 630 640 650 pF1KE0 WNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQ :::: ::::. : :::::.: :.:.::.: :. :... .:: .:: ::. :.:. . . 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CCDS76 VVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCV 940 950 960 970 980 990 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 VIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDF .::::::.::.. :: : .. .. ...:::::::::...::..::.:: : : : . : CCDS76 IIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTF 1000 1010 1020 1030 1040 1050 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 DSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYT . : : .. :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.: : . :...:...: CCDS76 MQEFGD---LKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYR 1060 1070 1080 1090 1100 1110 430 440 450 460 470 pF1KE0 KILMKDIDVLNS-SGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEP---GP------PYTTD :: :... :.. .:. . :.: .:.::::::::::. ::: : : ..: CCDS76 AILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASD 1120 1130 1140 1150 1160 1170 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 EHI---VSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQ :. ....::.:..:::: :.: : .:::::::.: ::::::: . . : : :.::. CCDS76 FHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 TPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSD . . :. ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..::: CCDS76 VRGNLRQ------------AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSD 1240 1250 1260 1270 600 610 620 630 640 650 pF1KE0 WNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQ :::: ::::. : :::::.: :.:.::.: :. :... .:: .:: ::. :.:. . . CCDS76 WNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQS--MSGR 1280 1290 1300 1310 1320 1330 660 670 680 690 700 pF1KE0 QSN-----KLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTILERGEKK-TAEMNER .:: .:.:.:. ...:.:: .. .:.: . .::: :: : : : : . : CCDS76 ESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEGR 1340 1350 1360 1370 1380 1390 710 720 730 740 750 760 pF1KE0 LQKMGESSL--RNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYF- . ....:. . : :: :: .: :: : .::. ..: CCDS76 GSTFAKASFVASGNRTDI--SL-----DDPNFWQK-----W------AKKAEIDIEAISG 1400 1410 1420 1430 770 780 790 800 810 820 pF1KE0 REALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPN :..: .. :.: : :: CCDS76 RNSLVIDTPRIRKQTRPFSATKDELAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVE 1440 1450 1460 1470 1480 1490 >>CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997 aa) initn: 1218 init1: 425 opt: 1146 Z-score: 1101.2 bits: 216.9 E(32554): 5.1e-55 Smith-Waterman score: 1352; 36.4% identity (63.1% similar) in 773 aa overlap (48-779:841-1563) 20 30 40 50 60 70 pF1KE0 TATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKK--EKNVSSFQLKLAAKAPKS :. : :: : ..... :. : . . : CCDS47 VKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIEDLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFLS 820 830 840 850 860 870 80 90 100 110 120 130 pF1KE0 EKE---MDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQT-ELFAHF-IQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRI : : ..:.: : .:: : . : .:. .. . : . . . CCDS47 EIEDELFNPDYVE---VDRIMDFARSTDDRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQA 880 890 900 910 920 140 150 160 170 180 190 pF1KE0 KKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRG : .: ..:.: :. : :. :. ... : : : : : ... ::.::..: CCDS47 KIEEFEKLMS------REPETERVERPPADDWKKS------ESSREYKNNNKLREYQLEG 930 940 950 960 970 200 210 220 230 240 250 pF1KE0 LNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNE .:::. . : : :::::::::::.:.:..: : . ..: :: .:..: ::. :: : CCDS47 VNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFL-YEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWERE 980 990 1000 1010 1020 1030 260 270 280 290 pF1KE0 FKRWVPSLRVICFVGDKDARAA------FIRD---EMMPG--EWDVCVTSYEMVIKEKSV :. :. : :. . :.. .: . ...: ... : .. . .:..::.. . CCDS47 FRTWTE-LNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPE 1040 1050 1060 1070 1080 1090 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 FKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLP .... :: .:::::::.::.. :: : .. . ...:::::::::...::..::.:: : CCDS47 LRNIPWRCVVIDEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEP 1100 1110 1120 1130 1140 1150 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 DVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGL . : : : . : : .. :..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.: : . : CCDS47 SRFPSETTFMQEFGD---LKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVEL 1160 1170 1180 1190 1200 1210 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 SKMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKM-RLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPG------ ...:...: :: :.. :...: . .. ::: .:.::::::::::..::: CCDS47 TNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFK 1220 1230 1240 1250 1260 1270 480 490 500 510 520 pF1KE0 ------PPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRG : . ... .::.:..:::: ::: : ::::::::.: ::::::: . : CCDS47 ETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRR 1280 1290 1300 1310 1320 1330 530 540 550 560 570 580 pF1KE0 YEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASA : : :.::.. . :. ::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..: CCDS47 YPYERIDGRVRGNLRQ------------AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAA 1340 1350 1360 1370 590 600 610 620 630 640 pF1KE0 DVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIV :. :..::::::: ::::. : :::::.: :...:::: :. :... ..: .:: ::. : CCDS47 DTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAV 1380 1390 1400 1410 1420 1430 650 660 670 680 690 pF1KE0 IQQGRLIDQQSN---KLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTIL-ERGEKK .:. .. .: .:.:.:. ...:.:: .. ..:.: . .::: :: .: . CCDS47 LQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTI 1440 1450 1460 1470 1480 1490 700 710 720 730 740 750 pF1KE0 TAEMNERLQKMGESSL--RNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANY : : . . . ....:. . : :: :: .: :: : .::. CCDS47 TIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDI--SL-----DDPNFWQK-----WA------KKAEL 1500 1510 1520 1530 1540 760 770 780 790 800 810 pF1KE0 AVDAYF-REALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVP .:: :. : .. :.. : : CCDS47 DIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQG 1550 1560 1570 1580 1590 1600 >>CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715 aa) initn: 1026 init1: 416 opt: 1143 Z-score: 1098.9 bits: 216.4 E(32554): 6.9e-55 Smith-Waterman score: 1348; 36.6% identity (64.7% similar) in 711 aa overlap (143-807:417-1107) 120 130 140 150 160 pF1KE0 AQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSE----SRKTSNVC : .... :. ..: : : .:. CCDS13 KDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVLPEIKHVERPASDSW 390 400 410 420 430 440 170 180 190 200 210 220 pF1KE0 IRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHY ..: : : ... ::.::..:.:::. . : : :::::::::::.:.:..:. . CCDS13 QKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEI-FL 450 460 470 480 490 500 230 240 250 260 270 pF1KE0 RNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEM---------M :.: :: ....: ::. :: ::. :. . .: . :.. .: . . :: . CCDS13 RGIHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWTE-MNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPL 510 520 530 540 550 560 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 PG--EWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLL : .. : .:..::.. . .::.:: ..::::::.::.. :: : .. . ...: CCDS13 SGVFKFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVL 570 580 590 600 610 620 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 LTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLR ::::::::...::..::::: :. : : : : : .. :..:...:::..:: CCDS13 LTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGD---LKTEEQVKKLQSILKPMMLR 630 640 650 660 670 680 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 RIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKM-RLLNILMQL :.: ::::.: ::.: : . :...:...: :: :... :...... .: :.: .:.: CCDS13 RLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMEL 690 700 710 720 730 740 460 470 480 490 500 pF1KE0 RKCCNHPYLFDGAE------------PGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSR :::::::::..::: : : . ... .::.:..:::: :: : . CCDS13 RKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHK 750 760 770 780 790 800 510 520 530 540 550 560 pF1KE0 VLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPN :::::::.: ::::::: . : : : :.::.. . :. ::. : :. CCDS13 VLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQ------------AAIDRFCKPD 810 820 830 840 570 580 590 600 610 620 pF1KE0 SSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLIT :..:.:.: ::::::::::..::. :..::::::: ::::. : :::::.: :.:.:::: CCDS13 SDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLIT 850 860 870 880 890 900 630 640 650 660 670 pF1KE0 DNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ-----GRLIDQQSNKLAKEEMLQMIRHGATHVFAS :. :... ..: .:: ::. :.:. : :: .:. :..:. .:: . CCDS13 RNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQDINRKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEED 910 920 930 940 950 960 680 690 700 710 720 pF1KE0 KESELTDEDITTILERGEKKTAEMNE-RLQKMGESSL--RNFRMDIE-------QSLYKF . :.. .::: ::.: . . ..: . . ....:. . : :: :. :. CCDS13 EGSKFCEEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKI 970 980 990 1000 1010 1020 730 740 750 760 770 780 pF1KE0 EGEDYREK-QKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQD : . : .: ..: :. :. ...... . : .. :: . :: .. ..: CCDS13 AELDTEAKNEKESLV--IDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLND 1030 1040 1050 1060 1070 1080 790 800 810 820 830 840 pF1KE0 --FQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEPLTPEET ... . :.. ::..: . CCDS13 KARRYLRAECFRV-EKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYK 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1054 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 20:41:20 2016 done: Mon Nov 7 20:41:21 2016 Total Scan time: 4.380 Total Display time: 0.370 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]