FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3187, 428 aa 1>>>pF1KE3187 428 - 428 aa - 428 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4895+/-0.000828; mu= 17.0023+/- 0.050 mean_var=92.1917+/-18.049, 0's: 0 Z-trim(109.8): 88 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.133576 statistics sampled from 11040 (11138) to 11040 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16 Scan time: 2.770 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 428) 2913 571.5 5.3e-163 CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 402) 1910 378.2 7.8e-105 CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 ( 376) 991 201.1 1.5e-51 CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 ( 400) 874 178.6 9.7e-45 CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 ( 438) 867 177.3 2.7e-44 CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 384) 837 171.4 1.3e-42 CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 419) 837 171.5 1.4e-42 CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 ( 305) 830 170.0 2.8e-42 CCDS11607.1 RNF43 gene_id:54894|Hs108|chr17 ( 783) 329 73.8 6.6e-13 CCDS82172.1 RNF43 gene_id:54894|Hs108|chr17 ( 656) 298 67.8 3.6e-11 >>CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (428 aa) initn: 2913 init1: 2913 opt: 2913 Z-score: 3039.9 bits: 571.5 E(32554): 5.3e-163 Smith-Waterman score: 2913; 100.0% identity (100.0% similar) in 428 aa overlap (1-428:1-428) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 QRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 QRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKIL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 QSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 QSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 SRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 KTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQE 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 TAVREIKS :::::::: CCDS14 TAVREIKS >>CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (402 aa) initn: 1903 init1: 1866 opt: 1910 Z-score: 1995.6 bits: 378.2 E(32554): 7.8e-105 Smith-Waterman score: 1966; 80.5% identity (89.6% similar) in 385 aa overlap (44-428:29-402) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 GCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNRTVWELSEEGVYGQ .::..:.. . : :. : : :::: CCDS14 MNQENRSSFFWLLVIFTFLLKITASFSMSAYVTVTYY--NETSNYTAIETCECGVYGL 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 DSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGCTFADKIH ::. . ::. : . . .::. .:.: :... :.:::.::. :::..::. CCDS14 ASPVANAMGVVGIPKN-NNYQACDHNTEF-------SNTKKPWIALIERGN-CTFSEKIQ 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 LAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVI : .:.:...::.: : : :..: :.. :::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TAGRRNADAVVIYNAPETGNQTIQMANFGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVI 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 EVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 EVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKK 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 AIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 AIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRT 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 CPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGTD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 CPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGTD 290 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 pF1KE3 EPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 EPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS 350 360 370 380 390 400 >>CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 (376 aa) initn: 1204 init1: 628 opt: 991 Z-score: 1038.9 bits: 201.1 E(32554): 1.5e-51 Smith-Waterman score: 1170; 50.1% identity (76.8% similar) in 367 aa overlap (39-404:34-374) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 VSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNRTVWELSEE : .:: ::.:.:. :.: :... ::.: CCDS57 LKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISF---HVG-NHVLSELGET 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGCTF ::.:..: :. ::::.:::.: :::::.: :. : . .:::::.::: ::: CCDS57 GVFGRSSTLKRVAGVIVPPEGK-IQNACNPNTIFSR-----SKYSETWLALIERGG-CTF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 ADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQ ..::..: :.::::..:.: ::: :.:.:: : . :.:..::::::::.:.. :..:. CCDS57 TQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 VTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLK .: :.:::.:: :.::: ::: :.:.::..::::: .:: :: :.:. ..: CCDS57 ITAVVEVGRKHIIWMNHYL-----VSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQRLT 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 ADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWL .: ....:.::::..:.::.::.:.::::..:.: :::::.::::::.:.:::.:.:::. CCDS57 TDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWI 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYAS : : :::.:::::::.:::.: ::.:. ::: .:::. .. : ::.. .:.. .: .. CCDS57 LPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSD 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 -VQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIK : ..: : : :...: .::. :: : CCDS57 KVIHVEENP-----TSQNNDIQ-----PHSVVEDVHPSP 350 360 370 pF1KE3 S >>CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 (400 aa) initn: 561 init1: 561 opt: 874 Z-score: 916.7 bits: 178.6 E(32554): 9.7e-45 Smith-Waterman score: 874; 41.3% identity (68.8% similar) in 356 aa overlap (26-375:20-369) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVW-TAYLNVSWRVPHTGVN ::::. .::.:: : .: .:. . :.: : CCDS20 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQT--N 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 RTVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGA-LNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLA ::: .:: : .:..:: : . :.. : .::. :..: : : : :: : . . :.: CCDS20 LTVWSVSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGA-APWVA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 LIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTK :. ::: ::: ::. .: .:.::..:..: : ..:::: :. .::.:::. :: . CCDS20 LVARGG-CTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGRE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 ILQSIQRGIQVTMVIEVGKKH-GPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNA ::. .:.:: :::.: :: .: ... :. ::...:. . .....::: .:. . CCDS20 ILELVQKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 RAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNH .: .: . : ..::.::.: :.:.:.:.: : :...:::::: .: .:..::: :.: CCDS20 GSQIGSQSHRK-ETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKH 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 IFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGI---EVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHE :::. :.:::::.:::::::: :..:::: ::.. . . : . .: . . CCDS20 IFHRICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALP 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 EDNRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEED .:. :. .: :: . .:: CCDS20 DDDGSDDSSPPSAS-PAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS 350 360 370 380 390 400 >>CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 (438 aa) initn: 872 init1: 549 opt: 867 Z-score: 908.9 bits: 177.3 E(32554): 2.7e-44 Smith-Waterman score: 880; 41.6% identity (66.0% similar) in 394 aa overlap (20-389:18-402) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVW-TAYLNVSWRVPHT--- ::..::. : . .. : : ::..:... : CCDS34 MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEE--WYTAFVNITYAEPAPDPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 ------GVNRTVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGS : . : .: : ::. :: . . : .: .. ::.:.:.:..:: :. CCDS34 AGAAGGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTR-GK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 TVQVSWLALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIM .:.::: .:. ::. :::. :. ..::..:::: .. ::.: : : :. :::::: CCDS34 ----NWIALIPKGN-CTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 IGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKH-GPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFY : . :: .:.. ..:.: ::: : .: .. .:.. :. :::.::... ......:: CCDS34 IPEPKGKEIVSLLERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFY 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 SARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDL .:.: : :..:.::.: :::::..::.::.:.:::: : :.:::::: :::::. CCDS34 YIQRFRYANARDRNQRRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 VRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVE-------DGSVSLQVPV :::: : :.:::.:::::::.:::::::: .::::::: ... : :: : CCDS34 VRILPCRHLFHKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPP 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 pF1KE3 SNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASV------QGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEAN .:.:.. ::. .. : : . . .: : :: : : : :..: : CCDS34 TNQITG-ASDTTVNESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSD 360 370 380 390 400 400 410 420 pF1KE3 SVAVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS CCDS34 SDISLIMAMEVGLSDVELSTDQDCEEVKS 410 420 430 >>CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (384 aa) initn: 760 init1: 507 opt: 837 Z-score: 878.4 bits: 171.4 E(32554): 1.3e-42 Smith-Waterman score: 837; 44.0% identity (68.7% similar) in 323 aa overlap (9-327:1-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR .:: : : .:: : .: : .. ... .:: .::. . : :. CCDS64 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAG-VLVPPDGPGALN--ACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWL : ..: :: ::: : : ::.: :. . .:.:.: : :: ... .:. CCDS64 TF--RIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPP----NIK-QWI 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 ALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGT ::.:::. ::: .:: : ..: ..::.: ...: . :.:::. ::.:.:: .:.: CCDS64 ALLQRGN-CTFKEKISRAAFHNAVAVVIYN-NKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPW-VNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRN ::. ....:.: :.: :: . : .. :. :::.::... . ...::: ...: CCDS64 DILSYLEKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRY 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 ARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCN . :..:.::.: :::::..: ::.:.:::: :: : :::::: :: ::.:::: :. CCDS64 TNARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCK 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 HIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEED :.:::.:::::: :: :::::: .::::::: CCDS64 HVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSAL 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDET CCDS64 GDLAGDNSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTR 350 360 370 380 >>CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (419 aa) initn: 760 init1: 507 opt: 837 Z-score: 877.9 bits: 171.5 E(32554): 1.4e-42 Smith-Waterman score: 837; 44.0% identity (68.7% similar) in 323 aa overlap (9-327:1-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR .:: : : .:: : .: : .. ... .:: .::. . : :. CCDS44 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAG-VLVPPDGPGALN--ACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWL : ..: :: ::: : : ::.: :. . .:.:.: : :: ... .:. CCDS44 TF--RIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPP----NIK-QWI 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 ALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGT ::.:::. ::: .:: : ..: ..::.: ...: . :.:::. ::.:.:: .:.: CCDS44 ALLQRGN-CTFKEKISRAAFHNAVAVVIYN-NKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPW-VNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRN ::. ....:.: :.: :: . : .. :. :::.::... . ...::: ...: CCDS44 DILSYLEKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRY 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 ARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCN . :..:.::.: :::::..: ::.:.:::: :: : :::::: :: ::.:::: :. CCDS44 TNARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCK 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 HIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEED :.:::.:::::: :: :::::: .::::::: CCDS44 HVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSAL 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 NRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDET CCDS44 GDLAGDNSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYM 350 360 370 380 390 400 >>CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 (305 aa) initn: 1001 init1: 428 opt: 830 Z-score: 872.4 bits: 170.0 E(32554): 2.8e-42 Smith-Waterman score: 1003; 51.5% identity (76.7% similar) in 309 aa overlap (18-323:16-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR : :: ..: :: : : : .:.:::.::....: :. CCDS47 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLS--FPDSNG-KAIWTAHLNITFQVG----NE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQV-SWLAL . ::.: ::.:. :::: :.::.. :.: . :::.: :::. : :. ::::: CCDS47 ITSELGESGVFGNHSPLERVSGVVALPEGWNQ-NACHPLTNFSRPK------QADSWLAL 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 IQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKI :.::: :::. ::..: :.::.:..:.:. :: ..:.:::: :. .:::.::.:::: .: CCDS47 IERGG-CTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEI 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRL--RNA :.:::.:. ::..::::. : ::.:: ... : . :::..:: . . :: : CCDS47 LHSIQKGVYVTVIIEVGRMHMQWVSHYIMYL-----FTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVP 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 RAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNH . .:.. :.:.:.:::: .::::.::.::.:. . :.:.::.. :::.:.::::::.: CCDS47 NSFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKH 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 IFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDN .:::.:.::::: ::::::::::::: CCDS47 FFHKACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT 280 290 300 >>CCDS11607.1 RNF43 gene_id:54894|Hs108|chr17 (783 aa) initn: 249 init1: 211 opt: 329 Z-score: 345.2 bits: 73.8 E(32554): 6.6e-13 Smith-Waterman score: 329; 27.8% identity (57.9% similar) in 266 aa overlap (65-321:63-316) 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 GSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNRTVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALN :. :::.. . . :. : :. : : CCDS11 AAAVESERSAEQKAIIRVIPLKMDPTGKLNLTLEGVFAGVAEITPAEGKLMQSH-P--LY 40 50 60 70 80 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 ACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGC-TFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRN :: . .. . : :.. : : ..:.: ..: ::::: ::.:.. : CCDS11 LCNASDDDNLEPGFISIVKLESPRRAPR--PCLSLASKARMAGERGAS-AVLFDITEDRA 90 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 EVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSV . ...: .. ...: . . :... . .. .. . ::. :. : .. ....: CCDS11 AAEQLQQPLGLTWPVVLIWGNDAEKLMEFVYKNQKAHVRIEL-KEPPAWPDYDVWILMTV 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 --SFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIG ..:.: :.: . : :..: . .:: : .. : : : . .:. : CCDS11 VGTIFVIILASV----LRIRCRPRHSRPDPLQQRTAWAISQLATRRYQA-SCRQARGEWP 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 pF1KE3 PDGDSC------AVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKAL .:.:: :.:.: .. .. .:...: : ::..:::::: .:::::.: .: CCDS11 DSGSSCSSAPVCAICLEEFSEGQELRVISCLHEFHRNCVDPWLHQHRTCPLCMFNITEGD 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 GIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTN CCDS11 SFSQSLGPSRSYQEPGRRLHLIRQHPGHAHYHLPAAYLLGPSRSAVARPPRPGPFLPSQE 330 340 350 360 370 380 >>CCDS82172.1 RNF43 gene_id:54894|Hs108|chr17 (656 aa) initn: 211 init1: 211 opt: 298 Z-score: 313.9 bits: 67.8 E(32554): 3.6e-11 Smith-Waterman score: 298; 29.1% identity (61.2% similar) in 196 aa overlap (134-321:1-189) 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 VPTVWGSTVQVSWLALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGA .: ::::: ::.:.. : . ...: . CCDS82 MAGERGAS-AVLFDITEDRAAAEQLQQPLG 10 20 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 VDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSV--SFFIITAA . ...: . . :... . .. .. . ::. :. : .. ....: ..:.: : CCDS82 LTWPVVLIWGNDAEKLMEFVYKNQKAHVRIEL-KEPPAWPDYDVWILMTVVGTIFVIILA 30 40 50 60 70 80 230 240 250 260 270 pF1KE3 TVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSC---- .: . : :..: . .:: : .. : : : . .:. : .:.:: CCDS82 SV----LRIRCRPRHSRPDPLQQRTAWAISQLATRRYQA-SCRQARGEWPDSGSSCSSAP 90 100 110 120 130 140 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 --AVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGS :.:.: .. .. .:...: : ::..:::::: .:::::.: .: CCDS82 VCAICLEEFSEGQELRVISCLHEFHRNCVDPWLHQHRTCPLCMFNITEGDSFSQSLGPSR 150 160 170 180 190 200 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 VSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEA CCDS82 SYQEPGRRLHLIRQHPGHAHYHLPAAYLLGPSRSAVARPPRPGPFLPSQEPGMGPRHHRF 210 220 230 240 250 260 428 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:48:51 2016 done: Sun Nov 6 04:48:52 2016 Total Scan time: 2.770 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]