Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2033
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2033, 624 aa
  1>>>pF1KE2033 624 - 624 aa - 624 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2964+/-0.00102; mu= 4.7395+/- 0.062
 mean_var=319.7868+/-65.207, 0's: 0 Z-trim(114.2): 34  B-trim: 33 in 1/53
 Lambda= 0.071721
 statistics sampled from 14726 (14754) to 14726 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.453), width:  16
 Scan time:  3.820

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14374.1 UBQLN2 gene_id:29978|Hs108|chrX        ( 624) 4079 435.9 7.5e-122
CCDS6663.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9         ( 589) 2617 284.6 2.5e-76
CCDS6664.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9         ( 561) 2174 238.8 1.5e-62
CCDS1127.1 UBQLN4 gene_id:56893|Hs108|chr1         ( 601) 1614 180.8 4.4e-45
CCDS7758.1 UBQLN3 gene_id:50613|Hs108|chr11        ( 655) 1146 132.5 1.8e-30
CCDS31385.1 UBQLNL gene_id:143630|Hs108|chr11      ( 475)  651 81.1 3.7e-15


>>CCDS14374.1 UBQLN2 gene_id:29978|Hs108|chrX             (624 aa)
 initn: 4079 init1: 4079 opt: 4079  Z-score: 2301.1  bits: 435.9 E(32554): 7.5e-122
Smith-Waterman score: 4079; 100.0% identity (100.0% similar) in 624 aa overlap (1-624:1-624)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MAENGESSGPPRPSRGPAAAQGSAAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQFKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAENGESSGPPRPSRGPAAAQGSAAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQFKEA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 ISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQNRPQGQSTQPSNAAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQNRPQGQSTQPSNAAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 TNTTSASTPRSNSTPISTNSNPFGLGSLGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLMASPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TNTTSASTPRSNSTPISTNSNPFGLGSLGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLMASPE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 MMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHLLNNPDIMRQTLEIARN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHLLNNPDIMRQTLEIARN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PAMMQEMMRNQDLALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLNAAQEQFGGNPFASVGSSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PAMMQEMMRNQDLALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLNAAQEQFGGNPFASVGSSSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SGEGTQPSRTENRDPLPNPWAPPPATQSSATTSTTTSTGSGSGNSSSNATGNTVAAANYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGEGTQPSRTENRDPLPNPWAPPPATQSSATTSTTTSTGSGSGNSSSNATGNTVAAANYV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 ASIFSTPGMQSLLQQITENPQLIQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNSPLFTANP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASIFSTPGMQSLLQQITENPQLIQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNSPLFTANP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 QLQEQMRPQLPAFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALMQIQQGLQTLATEAPGLIPSFTPGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QLQEQMRPQLPAFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALMQIQQGLQTLATEAPGLIPSFTPGV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 GVGVLGTAIGPVGPVTPIGPIGPIVPFTPIGPIGPIGPTGPAAPPGSTGSGGPTGPTVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GVGVLGTAIGPVGPVTPIGPIGPIVPFTPIGPIGPIGPTGPAAPPGSTGSGGPTGPTVSS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 AAPSETTSPTSESGPNQQFIQQMVQALAGANAPQLPNPEVRFQQQLEQLNAMGFLNREAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAPSETTSPTSESGPNQQFIQQMVQALAGANAPQLPNPEVRFQQQLEQLNAMGFLNREAN
              550       560       570       580       590       600

              610       620    
pF1KE2 LQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
              610       620    

>>CCDS6663.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9              (589 aa)
 initn: 3022 init1: 1826 opt: 2617  Z-score: 1483.8  bits: 284.6 E(32554): 2.5e-76
Smith-Waterman score: 2976; 74.8% identity (87.2% similar) in 635 aa overlap (1-624:1-589)

               10        20            30        40        50      
pF1KE2 MAENGESSGPPRPSRGPAAAQGS----AAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
       :::.:::.:::  . . :.:.:.    ::: :::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE2 FKEAISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQNRPQGQSTQPS
       ::: :::::::.::::::::::::::::::: :::::::::::::::.::::: .:.: .
CCDS66 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE2 NAAGTNTTSASTPRSNSTPISTNSNPFGLGSLGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLM
       :.::.:.:..::: ::::  :..:::::::.::::::::::::..:::::::::::.::.
CCDS66 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE2 ASPEMMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHLLNNPDIMRQTLE
       ..::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS66 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE2 IARNPAMMQEMMRNQDLALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLNAAQEQFGGNPFASVG
       .::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::. 
CCDS66 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE2 SSSSSGEGTQPSRTENRDPLPNPWAPPPATQSSATTSTTTSTGSGSGNSSSNATGNTVAA
       :..:::::.:::::::::::::::::  . .:::...:....:. .:...:...:....:
CCDS66 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
              310       320       330       340       350       360

        360           370       380       390       400       410  
pF1KE2 ANYV----ASIFSTPGMQSLLQQITENPQLIQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
        : :    ::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
              370       380       390       400       410       420

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE2 SPLFTANPQLQEQMRPQLPAFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALMQIQQGLQTLATEAPGL
       .:::..::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS66 NPLFAGNPQLQEQMRQQLPTFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
              430       440       450       460       470       480

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE2 IPSFTPGVGVGVLGTAIGPVGPVTPIGPIGPIVPFTPIGPIGPIGPTGPAAPPGSTGSGG
       ::.::::.:      :.: .:                                ::.:..:
CCDS66 IPGFTPGLG------ALGSTG--------------------------------GSSGTNG
                    490                                       500  

            540       550          560       570       580         
pF1KE2 PTGPTVSSAAPSETTSPT---SESGPNQQFIQQMVQALAGANAPQLPNPEVRFQQQLEQL
             :.:.:::.::::   .: : .:::::::.:::::.: ::: :::::::::::::
CCDS66 ------SNATPSENTSPTAGTTEPG-HQQFIQQMLQALAGVN-PQLQNPEVRFQQQLEQL
                  510       520        530        540       550    

     590       600       610       620    
pF1KE2 NAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
       .::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
          560       570       580         

>>CCDS6664.1 UBQLN1 gene_id:29979|Hs108|chr9              (561 aa)
 initn: 2556 init1: 1826 opt: 2174  Z-score: 1236.3  bits: 238.8 E(32554): 1.5e-62
Smith-Waterman score: 2749; 71.2% identity (83.0% similar) in 635 aa overlap (1-624:1-561)

               10        20            30        40        50      
pF1KE2 MAENGESSGPPRPSRGPAAAQGS----AAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
       :::.:::.:::  . . :.:.:.    ::: :::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPKIMKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQ
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE2 FKEAISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQNRPQGQSTQPS
       ::: :::::::.::::::::::::::::::: :::::::::::::::.::::: .:.: .
CCDS66 FKEEISKRFKSHTDQLVLIFAGKILKDQDTLSQHGIHDGLTVHLVIKTQNRPQDHSAQQT
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE2 NAAGTNTTSASTPRSNSTPISTNSNPFGLGSLGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLM
       :.::.:.:..::: ::::  :..:::::::.::::::::::::..:::::::::::.::.
CCDS66 NTAGSNVTTSSTPNSNSTSGSATSNPFGLGGLGGLAGLSSLGLNTTNFSELQSQMQRQLL
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE2 ASPEMMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHLLNNPDIMRQTLE
       ..::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS66 SNPEMMVQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHMLNNPDIMRQTLE
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE2 IARNPAMMQEMMRNQDLALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLNAAQEQFGGNPFASVG
       .::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::. 
CCDS66 LARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLSAAQEQFGGNPFASLV
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE2 SSSSSGEGTQPSRTENRDPLPNPWAPPPATQSSATTSTTTSTGSGSGNSSSNATGNTVAA
       :..:::::.:::::::::::::::::  . .:::...:....:. .:...:...:....:
CCDS66 SNTSSGEGSQPSRTENRDPLPNPWAPQTSQSSSASSGTASTVGGTTGSTASGTSGQSTTA
              310       320       330       340       350       360

        360           370       380       390       400       410  
pF1KE2 ANYV----ASIFSTPGMQSLLQQITENPQLIQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLN
        : :    ::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::   
CCDS66 PNLVPGVGASMFNTPGMQSLLQQITENPQLMQNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQM---
              370       380       390       400       410          

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE2 SPLFTANPQLQEQMRPQLPAFLQQMQNPDTLSAMSNPRAMQALMQIQQGLQTLATEAPGL
                                ::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS66 -------------------------QNPDTLSAMSNPRAMQALLQIQQGLQTLATEAPGL
                                420       430       440       450  

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE2 IPSFTPGVGVGVLGTAIGPVGPVTPIGPIGPIVPFTPIGPIGPIGPTGPAAPPGSTGSGG
       ::.::::.:      :.: .:                                ::.:..:
CCDS66 IPGFTPGLG------ALGSTG--------------------------------GSSGTNG
            460                                             470    

            540       550          560       570       580         
pF1KE2 PTGPTVSSAAPSETTSPT---SESGPNQQFIQQMVQALAGANAPQLPNPEVRFQQQLEQL
             :.:.:::.::::   .: : .:::::::.:::::.: ::: :::::::::::::
CCDS66 ------SNATPSENTSPTAGTTEPG-HQQFIQQMLQALAGVN-PQLQNPEVRFQQQLEQL
                480       490        500        510       520      

     590       600       610       620    
pF1KE2 NAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
       .::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
        530       540       550       560 

>>CCDS1127.1 UBQLN4 gene_id:56893|Hs108|chr1              (601 aa)
 initn: 2174 init1: 1434 opt: 1614  Z-score: 922.8  bits: 180.8 E(32554): 4.4e-45
Smith-Waterman score: 2249; 58.7% identity (78.2% similar) in 642 aa overlap (20-624:2-601)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MAENGESSGPPRPSRGPAAAQGSAAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQFKEA
                          :. :.:    :  :.:::::::.:::... . .::..::: 
CCDS11                   MAEPSGAETRPP--IRVTVKTPKDKEEIVICDRASVKEFKEE
                                 10          20        30        40

               70        80        90       100       110          
pF1KE2 ISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQNRPQG---------Q
       ::.:::.: :::::::::::::: ::: ::::.::::::::::. .. :          .
CCDS11 ISRRFKAQQDQLVLIFAGKILKDGDTLNQHGIKDGLTVHLVIKTPQKAQDPAAATASSPS
               50        60        70        80        90       100

             120       130       140                               
pF1KE2 STQPSNAAGTNTTSASTPRSNSTPISTNSN------------PF---GLGS---------
       . .:..: .:. .: .:: . ::  :..:.            :    : ::         
CCDS11 TPDPASAPSTTPASPATPAQPSTSGSASSDAGSGSRRSSGGGPSPGAGEGSPSATASILS
              110       120       130       140       150       160

        150       160       170       180       190       200      
pF1KE2 -LGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLMASPEMMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIM
        .::. ::.::::.:.:: :::.:::.:::..:::. ::::::.::.:.:::::::..::
CCDS11 GFGGILGLGSLGLGSANFMELQQQMQRQLMSNPEMLSQIMENPLVQDMMSNPDLMRHMIM
              170       180       190       200       210       220

        210       220       230       240       250       260      
pF1KE2 ANPQMQQLIQRNPEISHLLNNPDIMRQTLEIARNPAMMQEMMRNQDLALSNLESIPGGYN
       ::::::::..:::::::.::::..::::.:.::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS11 ANPQMQQLMERNPEISHMLNNPELMRQTMELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYN
              230       240       250       260       270       280

        270       280       290       300       310       320      
pF1KE2 ALRRMYTDIQEPMLNAAQEQFGGNPFASVGSSSSSGEGTQPSRTENRDPLPNPWAPPPAT
       :::::::::::::..::.::::.:::.:....:.:. ..:: :::::.::::::.: : :
CCDS11 ALRRMYTDIQEPMFSAAREQFGNNPFSSLAGNSDSS-SSQPLRTENREPLPNPWSPSPPT
              290       300       310        320       330         

        330       340       350          360       370       380   
pF1KE2 QSSATTSTTTSTGSGSGNSSSNATGNT---VAAANYVASIFSTPGMQSLLQQITENPQLI
        :.:  :   .:: :::.:. . : ..   . ::.  ...:..: ::.:::::.:::::.
CCDS11 -SQAPGSGGEGTG-GSGTSQVHPTVSNPFGINAASLGSGMFNSPEMQALLQQISENPQLM
      340       350        360       370       380       390       

           390       400       410       420       430       440   
pF1KE2 QNMLSAPYMRSMMQSLSQNPDLAAQMMLNSPLFTANPQLQEQMRPQLPAFLQQMQNPDTL
       ::..::::::::::.:.::::.:::::.: :::..:::::::.: :::.::::::::..:
CCDS11 QNVISAPYMRSMMQTLAQNPDFAAQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQNPESL
       400       410       420       430       440       450       

           450       460       470       480       490       500   
pF1KE2 SAMSNPRAMQALMQIQQGLQTLATEAPGLIPSFTPGVGVGVLGTAIGPVGPVTPIGPIGP
       : ..::::::::.::::::::: ::::::.::                      .: .: 
CCDS11 SILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPS----------------------LGSFG-
       460       470       480                             490     

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE2 IVPFTPIGPIGPIGPTGPAAPPGSTGSGGPTGPTVSSAAPSETTSPTSESGPNQQFIQQM
        .  ::          .:.:  ::.... : .:: : :.:. :.:::. :. .::..:::
CCDS11 -ISRTP----------APSA--GSNAGSTPEAPTSSPATPA-TSSPTGASSAQQQLMQQM
                     500         510       520        530       540

           570       580       590       600       610       620   
pF1KE2 VQALAGANAPQLPNPEVRFQQQLEQLNAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQP
       .: :::..  :. .:::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS11 IQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNSMGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQL
              550       560       570       580       590       600

        
pF1KE2 S
       :
CCDS11 S
        

>>CCDS7758.1 UBQLN3 gene_id:50613|Hs108|chr11             (655 aa)
 initn: 1206 init1: 750 opt: 1146  Z-score: 660.7  bits: 132.5 E(32554): 1.8e-30
Smith-Waterman score: 1348; 40.0% identity (60.7% similar) in 682 aa overlap (16-608:5-642)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MAENGESSGPPRPSRGPAAAQGSAAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQFKEA
                      : :  ::: :   .:..:::::::::.::.:.: .. ..::.:: 
CCDS77            MAKGGEALPQGSPAPVQDPHLIKVTVKTPKDKEDFSVTDTCTIQQLKEE
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 ISKRFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQNRPQGQSTQPSNAAG
       ::.:::.. :::::::::::::: :.: : :..:::::::::: :.: .:.    ...  
CCDS77 ISQRFKAHPDQLVLIFAGKILKDPDSLAQCGVRDGLTVHLVIKRQHRAMGNECPAASVPT
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 TNTTSASTPRSNSTPISTNSNPFGLGSLGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLMASPE
        . . .: :. .:  :   ..: .. ::: :.::: :::.  .: .  :....: .. ::
CCDS77 QGPSPGSLPQPSS--IYPADGPPAF-SLGLLTGLSRLGLAYRGFPDQPSSLMRQHVSVPE
     110       120         130        140       150       160      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 MMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHLLNNPDIMRQTLEIARN
       .. :....::. ..:::  :.:::.. ::.::::::.::::.:.::::.:::::::. ::
CCDS77 FVTQLIDDPFIPGLLSNTGLVRQLVLDNPHMQQLIQHNPEIGHILNNPEIMRQTLEFLRN
        170       180       190       200       210       220      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PAMMQEMMRNQDLALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLNAAQEQFGGNPFASVGSSSS
       :::::::.:.:: .::::::::::::.:  :::::..:::::.::::::::::.. ....
CCDS77 PAMMQEMIRSQDRVLSNLESIPGGYNVLCTMYTDIMDPMLNAVQEQFGGNPFATATTDNA
        230       240       250       260       270       280      

              310       320                                        
pF1KE2 SGEGTQPSRTENRDPLPNPW-------------------AP-------------------
       .   .:::: :: :::::::                   ::                   
CCDS77 TTTTSQPSRMENCDPLPNPWTSTHGGSGSRQGRQDGDQDAPDIRNRFPNFLGIIRLYDYL
        290       300       310       320       330       340      

                                      330       340           350  
pF1KE2 --------------------------PPATQSSATTSTTTSTGSGSGNS----SSNATGN
                                 :: . . .  :. .:   :::.     :    : 
CCDS77 QQLHENPQSLGTYLQGTASALSQSQEPPPSVNRVPPSSPSSQEPGSGQPLPEESVAIKGR
        350       360       370       380       390       400      

            360               370       380           390       400
pF1KE2 TVAAANYVASIFSTPGM--------QSLLQQITENPQLIQNMLSA----PYMRSMMQSLS
       .   :       .. :.        .:   . :. :.:.... ..    :.    ..  .
CCDS77 SSCPAFLRYPTENSTGQGGDQDGAGKSSTGHSTNLPDLVSGLGDSANRVPFAPLSFSPTA
        410       420       430       440       450       460      

              410                420       430       440       450 
pF1KE2 QNPDLAAQMMLNSPLFTAN---------PQLQEQMRPQLPAFLQQMQNPDTLSAMSNPRA
         : .     : :: .  .         ::::....:::: .:...:     .::.::::
CCDS77 AIPGIPEPPWLPSPAYPRSLRPDGMNPAPQLQDEIQPQLP-LLMHLQ-----AAMANPRA
        470       480       490       500        510            520

             460       470       480       490       500       510 
pF1KE2 MQALMQIQQGLQTLATEAPGLIPSFTPGVGVGVLGTAIGPVGPVTPIGPIGPIVPFTPIG
       .::: ::.::::.:::::: :.  : : .. :. :.. : .          :..   :. 
CCDS77 LQALRQIEQGLQVLATEAPRLLLWFMPCLA-GT-GSVAGGIESRED-----PLMSEDPL-
              530       540       550         560            570   

             520       530       540       550       560       570 
pF1KE2 PIGPIGPTGPAAPPGSTGSGGPTGPTVSSAAPSETTSPTSESGPNQQFIQQMVQALAGAN
                :  ::        . :...::  .  . :         :.. :.: :...:
CCDS77 ---------PNPPP-------EVFPALDSAELGFLSPP---------FLH-MLQDLVSTN
                            580       590                 600      

             580       590       600       610       620    
pF1KE2 APQLPNPEVRFQQQLEQLNAMGFLNREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQPS
        ::  .::..:: ::::: .:::::::::::::::::                
CCDS77 -PQQLQPEAHFQVQLEQLRSMGFLNREANLQALIATGGDVDAAVEKLRQS   
         610       620       630       640       650        

>>CCDS31385.1 UBQLNL gene_id:143630|Hs108|chr11           (475 aa)
 initn: 636 init1: 241 opt: 651  Z-score: 385.5  bits: 81.1 E(32554): 3.7e-15
Smith-Waterman score: 741; 36.3% identity (59.7% similar) in 466 aa overlap (34-445:32-475)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KE2 NGESSGPPRPSRGPAAAQGSAAAPAEPKIIKVTVKTPKEKEEFAVPENSSVQQFKEAISK
                                     .: :::  ....: : .. ::.:::: .  
CCDS31 WHAISRTSRMSQSGCPSGLLADKNISSSATRVIVKTAGNQKDFMVADDISVRQFKEMLLA
              10        20        30        40        50        60 

            70        80        90       100         110           
pF1KE2 RFKSQTDQLVLIFAGKILKDQDTLIQHGIHDGLTVHLVIKSQ--NRPQGQSTQ--PSNAA
       .:. : :::::.: : .:::.::: :.:: :: :..:::::.  .:  ..: .  :.:  
CCDS31 HFQCQMDQLVLVFMGCLLKDHDTLSQRGIMDGHTIYLVIKSKQGSRSLAHSFRDLPTNDP
              70        80        90       100       110       120 

     120         130       140       150       160       170       
pF1KE2 G--TNTTSASTPRSNSTPISTNSNPFGLGSLGGLAGLSSLGLSSTNFSELQSQMQQQLMA
            .:.... : .. : . :. :  :. . :           ..  ....:  .  ..
CCDS31 CHRDRNTKGNSSRVHQ-PTGMNQAPVELAHFVG-----------SDAPKVHTQNLE--VS
             130        140       150                  160         

       180       190       200       210       220        230      
pF1KE2 SPEMMIQIMENPFVQSMLSNPDLMRQLIMANPQMQQLIQRNPEISHLL-NNPDIMRQTLE
        ::   :..::: .: .::: ..: :.:  . . :::.:.:::.:.:: .: .:. ::::
CCDS31 HPECKAQMLENPSIQRLLSNMEFMWQFISEHLDTQQLMQQNPEVSRLLLDNSEILLQTLE
       170       180       190       200       210       220       

        240           250              260       270       280     
pF1KE2 IARNPAMMQEMMR----NQDLALS-------NLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMLNAAQE
       .::: ::.::.:.    .:.:          .::..::: ::: . :.::.. :::. :.
CCDS31 LARNLAMIQEIMQIQQPSQNLEYPLNPQPYLGLETMPGGNNALGQNYADINDQMLNSMQD
       230       240       250       260       270       280       

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