Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2746
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2746, 587 aa
1>>>pF1KE2746 587 - 587 aa - 587 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
65638526 residues in 92875 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2661+/-0.000354; mu= 19.1573+/- 0.022
mean_var=71.5820+/-14.393, 0's: 0 Z-trim(113.9): 42 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.151591
statistics sampled from 24389 (24431) to 24389 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 4.690
The best scores are: opt bits E(92875)
NP_000023 (OMIM: 300751,300752,301300) 5-aminolevu ( 587) 3968 877.4 0
NP_001033056 (OMIM: 300751,300752,301300) 5-aminol ( 550) 3042 674.9 2.1e-193
NP_001033057 (OMIM: 300751,300752,301300) 5-aminol ( 574) 3042 674.9 2.1e-193
NP_001291372 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synt ( 640) 2334 520.1 9.5e-147
NP_954635 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synthas ( 640) 2334 520.1 9.5e-147
NP_000679 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synthas ( 640) 2334 520.1 9.5e-147
NP_001291373 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synt ( 657) 2334 520.1 9.7e-147
XP_011531779 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synt ( 611) 2139 477.4 6.3e-134
XP_024309161 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synt ( 585) 1046 238.4 5.5e-62
XP_016861362 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synt ( 585) 1046 238.4 5.5e-62
XP_011531780 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synt ( 602) 1046 238.4 5.7e-62
NP_055106 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate co ( 419) 767 177.3 9.9e-44
XP_016884166 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 419) 767 177.3 9.9e-44
XP_005261467 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 445) 767 177.3 1e-43
NP_001165161 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 445) 767 177.3 1e-43
XP_005261468 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 433) 640 149.5 2.3e-35
XP_005261466 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 459) 640 149.5 2.4e-35
XP_016884164 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 507) 555 131.0 1e-29
XP_024307951 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 239) 463 110.6 6.5e-24
NP_001336874 (OMIM: 611120) serine palmitoyltransf ( 552) 437 105.2 6.6e-22
NP_060797 (OMIM: 611120) serine palmitoyltransfera ( 552) 437 105.2 6.6e-22
XP_016884165 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 495) 428 103.2 2.4e-21
XP_016884163 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 521) 428 103.2 2.5e-21
XP_011527582 (OMIM: 611120) serine palmitoyltransf ( 361) 390 94.8 5.8e-19
NP_004854 (OMIM: 605713,613640) serine palmitoyltr ( 562) 360 88.3 7.8e-17
XP_011528325 (OMIM: 607422) 2-amino-3-ketobutyrate ( 253) 336 82.9 1.6e-15
XP_011535686 (OMIM: 605713,613640) serine palmitoy ( 470) 311 77.6 1.1e-13
XP_024303147 (OMIM: 162400,605712) serine palmitoy ( 318) 255 65.2 4.1e-10
XP_024303146 (OMIM: 162400,605712) serine palmitoy ( 318) 255 65.2 4.1e-10
NP_001355202 (OMIM: 162400,605712) serine palmitoy ( 318) 255 65.2 4.1e-10
NP_001355201 (OMIM: 162400,605712) serine palmitoy ( 351) 255 65.2 4.4e-10
XP_016869690 (OMIM: 162400,605712) serine palmitoy ( 351) 255 65.2 4.4e-10
XP_011527581 (OMIM: 611120) serine palmitoyltransf ( 523) 256 65.6 5.2e-10
NP_006406 (OMIM: 162400,605712) serine palmitoyltr ( 473) 255 65.3 5.6e-10
NP_001268232 (OMIM: 162400,605712) serine palmitoy ( 513) 255 65.4 5.9e-10
XP_011516440 (OMIM: 162400,605712) serine palmitoy ( 365) 252 64.6 7.1e-10
>>NP_000023 (OMIM: 300751,300752,301300) 5-aminolevulina (587 aa)
initn: 3968 init1: 3968 opt: 3968 Z-score: 4688.1 bits: 877.4 E(92875): 0
Smith-Waterman score: 3968; 100.0% identity (100.0% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQFLFGIGRCPILATQGPNCSQIHLKATKAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQFLFGIGRCPILATQGPNCSQIHLKATKAGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DSPSWAKGHCPFMLSELQDGKSKIVQKAAPEVQEDVKAFKTDLPSSLVSVSLRKPFSGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DSPSWAKGHCPFMLSELQDGKSKIVQKAAPEVQEDVKAFKTDLPSSLVSVSLRKPFSGPQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EQEQISGKVTHLIQNNMPGNYVFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EQEQISGKVTHLIQNNMPGNYVFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FSEASVASKDVSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FSEASVASKDVSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VFRHNDPDHLKKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VFRHNDPDHLKKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GNAALNSKLCDLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GNAALNSKLCDLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KE2 TAVGLPLQDVSVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAVGLPLQDVSVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA
550 560 570 580
>>NP_001033056 (OMIM: 300751,300752,301300) 5-aminolevul (550 aa)
initn: 3712 init1: 3034 opt: 3042 Z-score: 3594.0 bits: 674.9 E(92875): 2.1e-193
Smith-Waterman score: 3642; 93.7% identity (93.7% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQFLFGIGRCPILATQGPNCSQIHLKATKAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQFLFGIGRCPILATQGPNCSQIHLKATKAGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DSPSWAKGHCPFMLSELQDGKSKIVQKAAPEVQEDVKAFKTDLPSSLVSVSLRKPFSGPQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSPSWAKGHCPFMLSELQDGKSKIVQKAAPEVQEDVKAFKT-------------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EQEQISGKVTHLIQNNMPGNYVFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ------------------GNYVFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQH
110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FSEASVASKDVSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSEASVASKDVSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELE
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKF
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VFRHNDPDHLKKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFRHNDPDHLKKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVH
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFT
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRV
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GNAALNSKLCDLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNAALNSKLCDLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAW
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580
pF1KE2 TAVGLPLQDVSVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAVGLPLQDVSVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA
510 520 530 540 550
>>NP_001033057 (OMIM: 300751,300752,301300) 5-aminolevul (574 aa)
initn: 3712 init1: 3034 opt: 3042 Z-score: 3593.7 bits: 674.9 E(92875): 2.1e-193
Smith-Waterman score: 3642; 93.7% identity (93.7% similar) in 587 aa overlap (1-587:25-574)
10 20 30
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQFLFGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRGGEVALGWNKKKRLFCEDFRFKMVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQFLFGIG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 RCPILATQGPNCSQIHLKATKAGGDSPSWAKGHCPFMLSELQDGKSKIVQKAAPEVQEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCPILATQGPNCSQIHLKATKAGGDSPSWAKGHCPFMLSELQDGKSKIVQKAAPEVQEDV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 KAFKTDLPSSLVSVSLRKPFSGPQEQEQISGKVTHLIQNNMPGNYVFSYDQFFRDKIMEK
::::: ::::::::::::::::::
NP_001 KAFKT-------------------------------------GNYVFSYDQFFRDKIMEK
130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 KQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQHFSEASVASKDVSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQHFSEASVASKDVSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETL
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 QRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKDSALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGC
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 EIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHLKKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGA
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 ICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGAGIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCV
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 GGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSGALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKH
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 MRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGNAALNSKLCDLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGNAALNSKLCDLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELL
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 RLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAWTAVGLPLQDVSVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAWTAVGLPLQDVSVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFG
510 520 530 540 550 560
580
pF1KE2 NMGPQYVTTYA
:::::::::::
NP_001 NMGPQYVTTYA
570
>>NP_001291372 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synthase (640 aa)
initn: 2338 init1: 2271 opt: 2334 Z-score: 2756.2 bits: 520.1 E(92875): 9.5e-147
Smith-Waterman score: 2394; 60.9% identity (82.3% similar) in 598 aa overlap (1-578:48-632)
10 20 30
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQ
. :::. : . :.: :..:..
NP_001 FLQKAGKSLLFYAQNCPKMMEVGAKPAPRALSTAAVHYQ--QIKETPPASEKDKTAKAK-
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KE2 FLFGIGRCPILATQGPNCSQIHLKATKAGGDSPSWAKG---HCPFMLSELQDGKSKIVQK
. . : . :.:. .:. .: :. ..: .:::. ..... :.. :
NP_001 ----VQQTPDGSQQSPDGTQL-----PSGHPLPATSQGTASKCPFLAAQMNQRGSSVFCK
80 90 100 110 120
90 100 110 120 130
pF1KE2 AAPEVQEDVKAF--------KTDLPSSLVSVS--------LRKPFSGPQEQEQISGKVTH
:. :.::::. . .:. :.:::. : : :. . :.: .:.:
NP_001 ASLELQEDVQEMNAVRKEVAETSAGPSVVSVKTDGGDPSGLLKNFQDIM-QKQRPERVSH
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 LIQNNMPGNY-VFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQHFSEASVASKD
:.:.:.: . .:.::.::. :: :::.:::::::::::: : .:.:. .:.. ...:.
NP_001 LLQDNLPKSVSTFQYDRFFEKKIDEKKNDHTYRVFKTVNRRAHIFPMADDYSDSLITKKQ
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 VSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKD
::::::::::::::::.: :...::..:::::::::::::::::::.::.:::.:: ::
NP_001 VSVWCSNDYLGMSRHPRVCGAVMDTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLERELADLHGKD
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 SALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHL
.::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::: . :..::::: .::
NP_001 AALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDSGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHL
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 KKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGA
..::..:.:..:::::::::::::::.:::::::::.:..::.:::::::::::::.::.
NP_001 RELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGG
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 GIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSG
:::.:::.: :.::::::::::::::::::::: .:.: :::::::::::::::::.:.:
NP_001 GIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLIDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAG
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pF1KE2 ALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGNAALNSKLC
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NP_001 DELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLVTWKQVGLELKPH
550 560 570 580 590 600
560 570 580
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: : :::::::.:::.::: :.:::...
NP_001 SSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGLSKLVSAQA
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>>NP_954635 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synthase, n (640 aa)
initn: 2338 init1: 2271 opt: 2334 Z-score: 2756.2 bits: 520.1 E(92875): 9.5e-147
Smith-Waterman score: 2394; 60.9% identity (82.3% similar) in 598 aa overlap (1-578:48-632)
10 20 30
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQ
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40 50 60 70 80
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pF1KE2 AAPEVQEDVKAF--------KTDLPSSLVSVS--------LRKPFSGPQEQEQISGKVTH
:. :.::::. . .:. :.:::. : : :. . :.: .:.:
NP_954 ASLELQEDVQEMNAVRKEVAETSAGPSVVSVKTDGGDPSGLLKNFQDIM-QKQRPERVSH
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140 150 160 170 180 190
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:.:.:.: . .:.::.::. :: :::.:::::::::::: : .:.:. .:.. ...:.
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::::::::::::::::.: :...::..:::::::::::::::::::.::.:::.:: ::
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260 270 280 290 300 310
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NP_954 GIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLIDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAG
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pF1KE2 ALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGNAALNSKLC
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10 20 30
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40 50 60 70 80
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. . : . :.:. .:. .: :. ..: .:::. ..... :.. :
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pF1KE2 LIQNNMPGNY-VFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQHFSEASVASKD
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:::.:::.: :.::::::::::::::::::::: .:.: :::::::::::::::::.:.:
NP_000 GIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLIDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAG
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pF1KE2 ALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGNAALNSKLC
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NP_000 ALESVRILKSAEGRVLRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVC
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500 510 520 530 540 550
pF1KE2 DLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAWTAVGLPLQDV
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NP_000 DELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLVTWKQVGLELKPH
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560 570 580
pF1KE2 SVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA
: : :::::::.:::.::: :.:::...
NP_000 SSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGLSKLVSAQA
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>>NP_001291373 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synthase (657 aa)
initn: 2338 init1: 2271 opt: 2334 Z-score: 2756.1 bits: 520.1 E(92875): 9.7e-147
Smith-Waterman score: 2394; 60.9% identity (82.3% similar) in 598 aa overlap (1-578:65-649)
10 20 30
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQ
. :::. : . :.: :..:..
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40 50 60 70 80
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. . : . :.:. .:. .: :. ..: .:::. ..... :.. :
NP_001 ----VQQTPDGSQQSPDGTQL-----PSGHPLPATSQGTASKCPFLAAQMNQRGSSVFCK
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:. :.::::. . .:. :.:::. : : :. . :.: .:.:
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NP_001 LLQDNLPKSVSTFQYDRFFEKKIDEKKNDHTYRVFKTVNRRAHIFPMADDYSDSLITKKQ
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pF1KE2 VSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKD
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NP_001 VSVWCSNDYLGMSRHPRVCGAVMDTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLERELADLHGKD
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.::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::: . :..::::: .::
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pF1KE2 KKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGA
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NP_001 RELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGG
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:::.:::.: :.::::::::::::::::::::: .:.: :::::::::::::::::.:.:
NP_001 GIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLIDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAG
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440 450 460 470 480 490
pF1KE2 ALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGNAALNSKLC
::::::.::. ::..::: :::::: :::.::: ::::. :::::::.::..:: :...:
NP_001 ALESVRILKSAEGRVLRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVC
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 DLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAWTAVGLPLQDV
: :.:.:.:::::::::::::::::::.::.:::.::::. :.:.::..: ::: :.
NP_001 DELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLENLLVTWKQVGLELKPH
570 580 590 600 610 620
560 570 580
pF1KE2 SVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA
: : :::::::.:::.::: :.:::...
NP_001 SSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGLSKLVSAQA
630 640 650
>>XP_011531779 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synthase (611 aa)
initn: 2143 init1: 2076 opt: 2139 Z-score: 2526.0 bits: 477.4 E(92875): 6.3e-134
Smith-Waterman score: 2199; 60.9% identity (82.3% similar) in 553 aa overlap (1-533:65-604)
10 20 30
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQ
. :::. : . :.: :..:..
XP_011 FLQKAGKSLLFYAQNCPKMMEVGAKPAPRALSTAAVHYQ--QIKETPPASEKDKTAKAK-
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40 50 60 70 80
pF1KE2 FLFGIGRCPILATQGPNCSQIHLKATKAGGDSPSWAKG---HCPFMLSELQDGKSKIVQK
. . : . :.:. .:. .: :. ..: .:::. ..... :.. :
XP_011 ----VQQTPDGSQQSPDGTQL-----PSGHPLPATSQGTASKCPFLAAQMNQRGSSVFCK
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pF1KE2 AAPEVQEDVKAF--------KTDLPSSLVSVS--------LRKPFSGPQEQEQISGKVTH
:. :.::::. . .:. :.:::. : : :. . :.: .:.:
XP_011 ASLELQEDVQEMNAVRKEVAETSAGPSVVSVKTDGGDPSGLLKNFQDIM-QKQRPERVSH
150 160 170 180 190 200
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 LIQNNMPGNY-VFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQHFSEASVASKD
:.:.:.: . .:.::.::. :: :::.:::::::::::: : .:.:. .:.. ...:.
XP_011 LLQDNLPKSVSTFQYDRFFEKKIDEKKNDHTYRVFKTVNRRAHIFPMADDYSDSLITKKQ
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pF1KE2 VSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKD
::::::::::::::::.: :...::..:::::::::::::::::::.::.:::.:: ::
XP_011 VSVWCSNDYLGMSRHPRVCGAVMDTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLERELADLHGKD
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pF1KE2 SALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHL
.::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::: . :..::::: .::
XP_011 AALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDSGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHL
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pF1KE2 KKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGA
..::..:.:..:::::::::::::::.:::::::::.:..::.:::::::::::::.::.
XP_011 RELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDGAVCPLEELCDVAHEFGAITFVDEVHAVGLYGARGG
390 400 410 420 430 440
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pF1KE2 GIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSG
:::.:::.: :.::::::::::::::::::::: .:.: :::::::::::::::::.:.:
XP_011 GIGDRDGVMPKMDIISGTLGKAFGCVGGYIASTSSLIDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAG
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 ALESVRLLKGEEGQALRRAHQRNVKHMRQLLMDRGLPVIPCPSHIIPIRVGNAALNSKLC
::::::.::. ::..::: :::::: :::.::: ::::. :::::::.::..:: :...:
XP_011 ALESVRILKSAEGRVLRRQHQRNVKLMRQMLMDAGLPVVHCPSHIIPVRVADAAKNTEVC
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 DLLLSKHGIYVQAINYPTVPRGEELLRLAPSPHHSPQMMEDFVEKLLLAWTAVGLPLQDV
: :.:.:.:::::::::::::::::::.::.:::.::::. :.
XP_011 DELMSRHNIYVQAINYPTVPRGEELLRIAPTPHHTPQMMNYFLVSPQRIC
570 580 590 600 610
560 570 580
pF1KE2 SVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA
>>XP_024309161 (OMIM: 125290) 5-aminolevulinate synthase (585 aa)
initn: 2014 init1: 989 opt: 1046 Z-score: 1234.4 bits: 238.4 E(92875): 5.5e-62
Smith-Waterman score: 1948; 53.5% identity (73.2% similar) in 598 aa overlap (1-578:48-577)
10 20 30
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQ
. :::. : . :.: :..:..
XP_024 FLQKAGKSLLFYAQNCPKMMEVGAKPAPRALSTAAVHYQ--QIKETPPASEKDKTAKAK-
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KE2 FLFGIGRCPILATQGPNCSQIHLKATKAGGDSPSWAKG---HCPFMLSELQDGKSKIVQK
. . : . :.:. .:. .: :. ..: .:::. ..... :.. :
XP_024 ----VQQTPDGSQQSPDGTQL-----PSGHPLPATSQGTASKCPFLAAQMNQRGSSVFCK
80 90 100 110 120
90 100 110 120 130
pF1KE2 AAPEVQEDVKAF--------KTDLPSSLVSVS--------LRKPFSGPQEQEQISGKVTH
:. :.::::. . .:. :.:::. : : :. . :.: .:.:
XP_024 ASLELQEDVQEMNAVRKEVAETSAGPSVVSVKTDGGDPSGLLKNFQDIM-QKQRPERVSH
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 LIQNNMPGNY-VFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQHFSEASVASKD
:.:.:.: . .:.::.::. :: :::.:::::::::::: : .:.:. .:.. ...:.
XP_024 LLQDNLPKSVSTFQYDRFFEKKIDEKKNDHTYRVFKTVNRRAHIFPMADDYSDSLITKKQ
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 VSVWCSNDYLGMSRHPQVLQATQETLQRHGAGAGGTRNISGTSKFHVELEQELAELHQKD
::::::::::::::::.: :...::..:::::::::::::::::::.::.:::.:: ::
XP_024 VSVWCSNDYLGMSRHPRVCGAVMDTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLERELADLHGKD
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 SALLFSSCFVANDSTLFTLAKILPGCEIYSDAGNHASMIQGIRNSGAAKFVFRHNDPDHL
.::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::: . :..::::: .::
XP_024 AALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDSGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHL
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320 330 340 350 360 370
pF1KE2 KKLLEKSNPKIPKIVAFETVHSMDGAICPLEELCDVSHQYGALTFVDEVHAVGLYGSRGA
..::..:.:..::::::::::::::
XP_024 RELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDG-----------------------------------
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XP_024 --------------------KAFGCVGGYIASTSSLIDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAG
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::::::.::. ::..::: :::::: :::.::: ::::. :::::::.::..:: :...:
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: :.:.:.:::::::::::::::::::.::.:::.::::. :.:.::..: ::: :.
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pF1KE2 SVAACNFCRRPVHFELMSEWERSYFGNMGPQYVTTYA
: : :::::::.:::.::: :.:::...
XP_024 SSAECNFCRRPLHFEVMSEREKSYFSGLSKLVSAQA
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10 20 30
pF1KE2 MVTAAMLLQCCPVLARGPTSLLGKVVKTHQ
. :::. : . :.: :..:..
XP_016 FLQKAGKSLLFYAQNCPKMMEVGAKPAPRALSTAAVHYQ--QIKETPPASEKDKTAKAK-
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40 50 60 70 80
pF1KE2 FLFGIGRCPILATQGPNCSQIHLKATKAGGDSPSWAKG---HCPFMLSELQDGKSKIVQK
. . : . :.:. .:. .: :. ..: .:::. ..... :.. :
XP_016 ----VQQTPDGSQQSPDGTQL-----PSGHPLPATSQGTASKCPFLAAQMNQRGSSVFCK
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90 100 110 120 130
pF1KE2 AAPEVQEDVKAF--------KTDLPSSLVSVS--------LRKPFSGPQEQEQISGKVTH
:. :.::::. . .:. :.:::. : : :. . :.: .:.:
XP_016 ASLELQEDVQEMNAVRKEVAETSAGPSVVSVKTDGGDPSGLLKNFQDIM-QKQRPERVSH
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140 150 160 170 180 190
pF1KE2 LIQNNMPGNY-VFSYDQFFRDKIMEKKQDHTYRVFKTVNRWADAYPFAQHFSEASVASKD
:.:.:.: . .:.::.::. :: :::.:::::::::::: : .:.:. .:.. ...:.
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::::::::::::::::.: :...::..:::::::::::::::::::.::.:::.:: ::
XP_016 VSVWCSNDYLGMSRHPRVCGAVMDTLKQHGAGAGGTRNISGTSKFHVDLERELADLHGKD
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260 270 280 290 300 310
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XP_016 AALLFSSCFVANDSTLFTLAKMMPGCEIYSDSGNHASMIQGIRNSRVPKYIFRHNDVSHL
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..::..:.:..::::::::::::::
XP_016 RELLQRSDPSVPKIVAFETVHSMDG-----------------------------------
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pF1KE2 GIGERDGIMHKIDIISGTLGKAFGCVGGYIASTRDLVDMVRSYAAGFIFTTSLPPMVLSG
::::::::::::: .:.: :::::::::::::::::.:.:
XP_016 --------------------KAFGCVGGYIASTSSLIDTVRSYAAGFIFTTSLPPMLLAG
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587 residues in 1 query sequences
65638526 residues in 92875 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Apr 23 11:12:52 2019 done: Tue Apr 23 11:12:53 2019
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]