Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3178
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3178, 415 aa
1>>>pF1KE3178 415 - 415 aa - 415 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2757+/-0.000399; mu= 17.4431+/- 0.025
mean_var=67.3046+/-13.495, 0's: 0 Z-trim(111.5): 35 B-trim: 13 in 1/54
Lambda= 0.156333
statistics sampled from 20036 (20064) to 20036 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 6.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001135858 (OMIM: 300906) pyruvate dehydrogenase ( 415) 2778 635.8 6.1e-182
NP_005382 (OMIM: 300906) pyruvate dehydrogenase ki ( 406) 2721 622.9 4.4e-178
NP_002601 (OMIM: 602524) [Pyruvate dehydrogenase ( ( 436) 1912 440.5 4e-123
NP_002602 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase ki ( 407) 1876 432.3 1e-120
NP_002603 (OMIM: 602527) pyruvate dehydrogenase ki ( 411) 1759 405.9 9.2e-113
XP_011509647 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 360) 1727 398.7 1.2e-110
NP_001186827 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase ( 343) 1615 373.4 4.8e-103
NP_001186828 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase ( 343) 1615 373.4 4.8e-103
XP_011509649 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 380) 1458 338.0 2.4e-92
XP_011509645 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 380) 1458 338.0 2.4e-92
XP_011509646 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 380) 1458 338.0 2.4e-92
NP_001265478 (OMIM: 602524) [Pyruvate dehydrogenas ( 456) 1458 338.1 2.7e-92
XP_006712658 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 244) 1141 266.4 5.5e-71
NP_001186829 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase ( 199) 757 179.8 5.4e-45
XP_006712657 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 281) 455 111.7 2.3e-24
NP_001116429 (OMIM: 614901,614923) [3-methyl-2-oxo ( 365) 245 64.4 5.2e-10
XP_016878348 (OMIM: 614901,614923) PREDICTED: 3-me ( 410) 245 64.5 5.7e-10
NP_005872 (OMIM: 614901,614923) [3-methyl-2-oxobut ( 412) 245 64.5 5.7e-10
>>NP_001135858 (OMIM: 300906) pyruvate dehydrogenase kin (415 aa)
initn: 2778 init1: 2778 opt: 2778 Z-score: 3387.4 bits: 635.8 E(85289): 6.1e-182
Smith-Waterman score: 2778; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 MREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLIKVRNRHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLIKVRNRHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDTNPVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDTNPVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVPLRKIDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVPLRKIDRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 FNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 LSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTF
370 380 390 400 410
>>NP_005382 (OMIM: 300906) pyruvate dehydrogenase kinase (406 aa)
initn: 2721 init1: 2721 opt: 2721 Z-score: 3318.1 bits: 622.9 E(85289): 4.4e-178
Smith-Waterman score: 2721; 100.0% identity (100.0% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 MREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLIKVRNRHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLIKVRNRHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDTNPVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDTNPVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVPLRKIDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVPLRKIDRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 FNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 LSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQ
370 380 390 400
>>NP_002601 (OMIM: 602524) [Pyruvate dehydrogenase (acet (436 aa)
initn: 1516 init1: 810 opt: 1912 Z-score: 2331.5 bits: 440.5 E(85289): 4e-123
Smith-Waterman score: 1912; 68.6% identity (88.4% similar) in 395 aa overlap (12-404:42-435)
10 20 30 40
pF1KE3 MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNAC
:: :.. :.::::::::.::::::: :::
NP_002 LAGPGPGLRAAGFSRSFSSDSGSSPASERGVPGQVDFYARFSPSPLSMKQFLDFGSVNAC
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 EKTSYMFLRKELPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPED
::::.::::.:::::::: :.:..::::::: ::: ::::::.::. :::....:: ::
NP_002 EKTSFMFLRQELPVRLANIMKEISLLPDNLLRTPSVQLVQSWYIQSLQELLDFKDKSAED
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 PQVLDNFLQVLIKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISF
... .: ...:..:::::::.::::::::::::.:: :: : :.:::::::: .:::.
NP_002 AKAIYDFTDTVIRIRNRHNDVIPTMAQGVIEYKESFGVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISI
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KE3 RMLINQHTLLFGGDT--NPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELE
:::.:::.::::: .: : ::::::.:.::: .:.::.::.:. ::. ::. .::::
NP_002 RMLLNQHSLLFGGKGKGSPSHRKHIGSINPNCNVLEVIKDGYENARRLCDLYYINSPELE
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 VEEFNAKAPDKPIQVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKE
.::.:::.: .:::::::::::.::.::::::.::::.: . .: :: ... ::::.:
NP_002 LEELNAKSPGQPIQVVYVPSHLYHMVFELFKNAMRATMEHHANRGV-YPPIQVHVTLGNE
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 DLSIKISDLGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQ
::..:.:: ::::::::::::::::::::::: .: .::.::::::::::::::::.:::
NP_002 DLTVKMSDRGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPRVETSRAVPLAGFGYGLPISRLYAQYFQ
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 GDLKLYSMEGVGTDAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDA
:::::::.:: :::::::.::::..:.:::::.::.::.::.:. ::::: :: ::.:
NP_002 GDLKLYSLEGYGTDAVIYIKALSTDSIERLPVYNKAAWKHYNTNHEADDWCVPSREPKDM
380 390 400 410 420 430
400 410
pF1KE3 SKYKAKQDKIKTNRTF
. ...
NP_002 TTFRSA
>>NP_002602 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase kinase (407 aa)
initn: 1852 init1: 1217 opt: 1876 Z-score: 2288.1 bits: 432.3 E(85289): 1e-120
Smith-Waterman score: 1876; 67.1% identity (87.5% similar) in 407 aa overlap (5-403:2-405)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MRLFRW---LLKQP----VPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKEL
:: :::. .:: ::..:.:::::::.::::::: .:::::::. :::.::
NP_002 MRWVWALLKNASLAGAPKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 PVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLI
:::::: :.:.::::: .:. ::: ::::::.::.:...:. .:.::: ..:..: ..:.
NP_002 PVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHRTLSQFTDALV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFG
.:::::::::::::::.:::. .: :: . :::::::::: .:::.:::::::::.:
NP_002 TIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIFD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GDTNPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQ
:.:::.::::::::::.:::..::::::. ::.::..::...:.::..:.:: .::.
NP_002 GSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINAANSKQPIH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVP
.:::::::.:::::::::.:::::: .:. . : .:..:.::.::::::.:: :::::
NP_002 MVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHES-SLILPPIKVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEP-TRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGT
::::.:::.::::::: : .: : ..::::::::::::::::.::::::.:.:::: ::
NP_002 LRKIERLFSYMYSTAPTP--QPGTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 DAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTN
::::::::::..: :::::.::::::::.: :: :: ::.::...: :.
NP_002 DAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS
360 370 380 390 400
pF1KE3 RTF
>>NP_002603 (OMIM: 602527) pyruvate dehydrogenase kinase (411 aa)
initn: 1738 init1: 727 opt: 1759 Z-score: 2145.4 bits: 405.9 E(85289): 9.2e-113
Smith-Waterman score: 1759; 63.8% identity (87.2% similar) in 390 aa overlap (12-401:20-407)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKE
::...:..::.::::::.::.:::: .::::.::. :::.:
NP_002 MKAARFVLRSAGSLNGAGLVPREVEHFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVL
::::::: ..:...:: .:.: :: ::.:::.::...:.:...:::.: ..:..:...:
NP_002 LPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLF
:::::::..::::::::.::::. :: . :.:::::::: :::: :::.::: :.:
NP_002 IKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GGDTNPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPI
. :.. .:.:::::::.:.:. ::.::.: ..:::.:::: .:::.. . :.: ::.::
NP_002 S-DSQTGNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPI
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 QVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGV
..::::::: :::::::::.:::::: :.. : ....:.::::::.::::: ::::
NP_002 HIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTP-IEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 PLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGT
::: :::::.: ::::: : .. .: :::::::::::::::::.::::::.:::. : ::
NP_002 PLRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 DAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTN
::.::::::::::.:.::::::::..::. . ::::: :: ::.. .:
NP_002 DAIIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 RTF
>>XP_011509647 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate dehydr (360 aa)
initn: 1331 init1: 720 opt: 1727 Z-score: 2107.3 bits: 398.7 E(85289): 1.2e-110
Smith-Waterman score: 1727; 68.1% identity (88.3% similar) in 360 aa overlap (47-404:1-359)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 ERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPS
::::.:::::::: :.:..::::::: ::
XP_011 MFLRQELPVRLANIMKEISLLPDNLLRTPS
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 VGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLIKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEK
: ::::::.::. :::....:: :: ... .: ...:..:::::::.::::::::::::.
XP_011 VQLVQSWYIQSLQELLDFKDKSAEDAKAIYDFTDTVIRIRNRHNDVIPTMAQGVIEYKES
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 FGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDT--NPVHPKHIGSIDPTCNVA
:: :: : :.:::::::: .:::.:::.:::.::::: .: : ::::::.:.:::
XP_011 FGVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKGKGSPSHRKHIGSINPNCNVL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 DVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSHLFHMLFELFKNSMR
.:.::.::.:. ::. ::. .::::.::.:::.: .:::::::::::.::.::::::.::
XP_011 EVIKDGYENARRLCDLYYINSPELELEELNAKSPGQPIQVVYVPSHLYHMVFELFKNAMR
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 ATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLE
::.: . .: :: ... ::::.:::..:.:: ::::::::::::::::::::::: .:
XP_011 ATMEHHANRGV-YPPIQVHVTLGNEDLTVKMSDRGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPRVE
220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 PTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKALSSESFERLPVFNK
.::.::::::::::::::::.::::::::::.:: :::::::.::::..:.:::::.::
XP_011 TSRAVPLAGFGYGLPISRLYAQYFQGDLKLYSLEGYGTDAVIYIKALSTDSIERLPVYNK
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410
pF1KE3 SAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTF
.::.::.:. ::::: :: ::.: . ...
XP_011 AAWKHYNTNHEADDWCVPSREPKDMTTFRSA
330 340 350 360
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40 50 60 70 80 90
pF1KE3 QFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLE
:.:.::::: .:. ::: ::::::.::.:.
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100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLIKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYF
..:. .:.::: ..:..: ..:. .:::::::::::::::.:::. .: :: . :::::
NP_001 IMEFLDKDPEDHRTLSQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYF
40 50 60 70 80 90
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pF1KE3 LDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDTNPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQ
::::: .:::.:::::::::.: :.:::.::::::::::.:::..::::::. ::.::..
NP_001 LDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDK
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pF1KE3 YYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAV
::...:.::..:.:: .::..:::::::.:::::::::.:::::: .:. . : .
NP_001 YYMASPDLEIQEINAANSKQPIHMVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHES-SLILPPI
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:..:.::.::::::.:: :::::::::.:::.::::::: : .: : ..::::::::::
NP_001 KVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTP--QPGTGGTPLAGFGYGLP
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pF1KE3 ISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDW
::::::.::::::.:.:::: ::::::::::::..: :::::.::::::::.: :: ::
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pF1KE3 SNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTF
::.::...: :.
NP_001 CVPSTEPKNTSTYRVS
330 340
>>NP_001186828 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase kin (343 aa)
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Smith-Waterman score: 1615; 67.2% identity (88.7% similar) in 344 aa overlap (61-403:1-341)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 QFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLE
:.:.::::: .:. ::: ::::::.::.:.
NP_001 MKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLD
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100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LLEYENKSPEDPQVLDNFLQVLIKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYF
..:. .:.::: ..:..: ..:. .:::::::::::::::.:::. .: :: . :::::
NP_001 IMEFLDKDPEDHRTLSQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYF
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pF1KE3 LDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDTNPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQ
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100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 YYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAV
::...:.::..:.:: .::..:::::::.:::::::::.:::::: .:. . : .
NP_001 YYMASPDLEIQEINAANSKQPIHMVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHES-SLILPPI
160 170 180 190 200
280 290 300 310 320
pF1KE3 KTLVTLGKEDLSIKISDLGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEP-TRAAPLAGFGYGLP
:..:.::.::::::.:: :::::::::.:::.::::::: : .: : ..::::::::::
NP_001 KVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTP--QPGTGGTPLAGFGYGLP
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 ISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDW
::::::.::::::.:.:::: ::::::::::::..: :::::.::::::::.: :: ::
NP_001 ISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDW
270 280 290 300 310 320
390 400 410
pF1KE3 SNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRTF
::.::...: :.
NP_001 CVPSTEPKNTSTYRVS
330 340
>>XP_011509649 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate dehydr (380 aa)
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pF1KE3 ERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPS
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10 20 30
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pF1KE3 VGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVL-----DNFLQV---------------LIKVR
: ::::::.::. :::....:: :: ... ..::: .:..:
XP_011 VQLVQSWYIQSLQELLDFKDKSAEDAKAIYERPRRTWLQVSSLCCMACKMIFTDTVIRIR
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pF1KE3 NRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLFGGDT
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XP_011 NRHNDVIPTMAQGVIEYKESFGVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKG
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pF1KE3 --NPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQV
.: : ::::::.:.::: .:.::.::.:. ::. ::. .::::.::.:::.: .::::
XP_011 KGSPSHRKHIGSINPNCNVLEVIKDGYENARRLCDLYYINSPELELEELNAKSPGQPIQV
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:::::::.::.::::::.::::.: . .: :: ... ::::.:::..:.:: ::::::
XP_011 VYVPSHLYHMVFELFKNAMRATMEHHANRGV-YPPIQVHVTLGNEDLTVKMSDRGGGVPL
220 230 240 250 260
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pF1KE3 RKIDRLFNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGTDA
::::::::::::::::: .: .::.::::::::::::::::.::::::::::.:: ::::
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:::.::::..:.:::::.::.::.::.:. ::::: :: ::.: . ...
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pF1KE3 F
>>XP_011509645 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate dehydr (380 aa)
initn: 1383 init1: 720 opt: 1458 Z-score: 1779.0 bits: 338.0 E(85289): 2.4e-92
Smith-Waterman score: 1677; 65.0% identity (83.9% similar) in 380 aa overlap (47-404:1-379)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 ERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKELPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPS
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XP_011 MFLRQELPVRLANIMKEISLLPDNLLRTPS
10 20 30
80 90 100 110
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XP_011 VQLVQSWYIQSLQELLDFKDKSAEDAKAIYERPRRTWLQVSSLCCMACKMIFTDTVIRIR
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XP_011 NRHNDVIPTMAQGVIEYKESFGVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKG
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pF1KE3 --NPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPIQV
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XP_011 KGSPSHRKHIGSINPNCNVLEVIKDGYENARRLCDLYYINSPELELEELNAKSPGQPIQV
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XP_011 VYVPSHLYHMVFELFKNAMRATMEHHANRGV-YPPIQVHVTLGNEDLTVKMSDRGGGVPL
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pF1KE3 VIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTNRT
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XP_011 VIYIKALSTDSIERLPVYNKAAWKHYNTNHEADDWCVPSREPKDMTTFRSA
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 F
415 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 12:50:25 2016 done: Sun Nov 6 12:50:26 2016
Total Scan time: 6.250 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]