FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4179, 644 aa 1>>>pF1KE4179 644 - 644 aa - 644 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8558+/-0.000378; mu= 12.4782+/- 0.023 mean_var=136.7976+/-28.264, 0's: 0 Z-trim(116.6): 324 B-trim: 1450 in 1/51 Lambda= 0.109657 statistics sampled from 27525 (27936) to 27525 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16 Scan time: 11.930 The best scores are: opt bits E(85289) NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 677 119.2 4.4e-26 NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 633 112.2 5.5e-24 XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 633 112.3 5.7e-24 NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 633 112.3 5.7e-24 NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 633 112.3 5.7e-24 NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 633 112.3 5.7e-24 XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 633 112.3 5.8e-24 NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 633 112.3 5.8e-24 NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 633 112.3 5.8e-24 XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 633 112.3 5.8e-24 XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 633 112.3 5.8e-24 NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 508 92.5 5.1e-18 XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 508 92.5 5.1e-18 XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 508 92.5 5.1e-18 NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 502 91.5 9.2e-18 NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 502 91.5 9.2e-18 NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 502 91.5 9.2e-18 XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 502 91.5 9.2e-18 XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 502 91.5 9.2e-18 NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 488 89.3 4.3e-17 NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 488 89.3 4.5e-17 NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 476 87.4 1.5e-16 XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 470 86.4 3e-16 NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 470 86.4 3.1e-16 NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 470 86.4 3.1e-16 NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 464 85.5 5.8e-16 NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 464 85.5 6.1e-16 XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 464 85.5 6.2e-16 XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 458 84.6 1.2e-15 XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 457 84.4 1.3e-15 NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 457 84.4 1.3e-15 NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 442 82.0 6.6e-15 XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 420 78.4 6.3e-14 XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 420 78.5 6.8e-14 NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 421 78.7 6.9e-14 NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 421 78.7 6.9e-14 NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 410 76.9 2e-13 NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 410 77.0 2.2e-13 NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 407 76.5 3.1e-13 NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 406 76.3 3.5e-13 NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 406 76.3 3.5e-13 NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 406 76.4 4e-13 NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 406 76.4 4e-13 NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 404 76.0 4.3e-13 NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 400 75.4 6.5e-13 NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 400 75.4 7.6e-13 NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 400 75.5 8e-13 XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 400 75.5 8.3e-13 XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 400 75.5 8.3e-13 XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 400 75.5 8.3e-13 >>NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Homo sa (617 aa) initn: 821 init1: 313 opt: 677 Z-score: 589.2 bits: 119.2 E(85289): 4.4e-26 Smith-Waterman score: 964; 30.7% identity (58.1% similar) in 652 aa overlap (3-640:26-615) 10 20 30 pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTL-ETE .: : ..:....: :.. :: ::.:::::: . 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NP_061 VFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGE-LATVECYNPRMNEWS 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 AAGALPRALHGHAGAVGDRGVVYISGGKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGT .. . . .::::.: :..::::: . . .:. . :. . : .:::: : NP_061 YVAKMSEPHYGHAGTVYG-GLMYISGGITHD-----TFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMTT 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 pF1KE4 AR-------FGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSEIERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLA .: : .. :. : : . :. : :.: :::: . . . :.: NP_061 VRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVA 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 VVEETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLDRWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQL---- : :. ..:: .: . .: : :: . :.:. . :: . .:.: .: . 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NP_001 LQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNF 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 QELLARGAGPAGLLELNPTSLRAVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLR-QEPTTERLAHCT ::. : .:.: : ::.. .. . : .:. . ::: .:: :. . NP_001 PALLSTGE----FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEP---RMDFAA 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 ELLERVRFGLV-PADVLRRVYSGSGLVLPARVKGLIIQALNYHTTPSRQPLMQGEQTSIR .:.. .:: :. : ... : . . . .:...: ::. : ::.::...:.:: NP_001 KLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 SPQTRILLVGGRRAREVVIEEVAAPQRAARGQVAAPEPEEEEEELEEEEEEEEWELTQNV : :... .:: ...:. .... 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NP_001 RFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGE-LPTVECYNPRTNEWTYV 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 GALPRALHGHAGAVGDRGVVYISGGKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGTAR . . . .::::.: ::.::::: . . ..:. . :. . : .:::: :.: NP_001 AKMSEPHYGHAGTVYG-GVMYISGGITHD-----TFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVR 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 pF1KE4 -------FGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSEIERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLAVV :... :. : : . :. : :.: :::: . . . :.:: NP_001 GLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVF 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 EETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLDRWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQLAEGGDD :. ..:: .: . .: : :: : :.:. . :: . .:.: .: NP_001 ENKIYVVGGYSWNNRCMVEI--VQKYDPDKDEWHKV-FDLPESLGGIRACTLTVFPPEET 550 560 570 580 590 600 630 640 pF1KE4 EREGEVGEALDLVLG NP_001 TPSPSRESPLSAP 610 >>XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like prot (639 aa) initn: 848 init1: 312 opt: 633 Z-score: 551.4 bits: 112.3 E(85289): 5.7e-24 Smith-Waterman score: 953; 30.7% identity (58.0% similar) in 622 aa overlap (11-621:58-618) 10 20 30 pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTLETEGSE- :....: :.. :: ::.:::::: .. 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XP_016 RFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGE-LPTVECYNPRTNEWTYV 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 GALPRALHGHAGAVGDRGVVYISGGKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGTAR . . . .::::.: ::.::::: . . ..:. . :. . : .:::: :.: XP_016 AKMSEPHYGHAGTVYG-GVMYISGGITHD-----TFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVR 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 pF1KE4 -------FGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSEIERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLAVV :... :. : : . :. : :.: :::: . . . :.:: XP_016 GLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVF 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 EETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLDRWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQLAEGGDD :. ..:: .: . .: : :: : :.:. . :: . .:.: .: XP_016 ENKIYVVGGYSWNNRCMVEI--VQKYDPDKDEWHKV-FDLPESLGGIRACTLTVFPPEET 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE4 EREGEVGEALDLVLG XP_016 TPSPSRESPLSAP 630 >>NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (639 aa) initn: 848 init1: 312 opt: 633 Z-score: 551.4 bits: 112.3 E(85289): 5.7e-24 Smith-Waterman score: 953; 30.7% identity (58.0% similar) in 622 aa overlap (11-621:58-618) 10 20 30 pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTLETEGSE- :....: :.. :: ::.:::::: .. 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