Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4179
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4179, 644 aa
1>>>pF1KE4179 644 - 644 aa - 644 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0693+/-0.000907; mu= 11.3253+/- 0.054
mean_var=123.5494+/-24.888, 0's: 0 Z-trim(109.6): 159 B-trim: 148 in 1/51
Lambda= 0.115386
statistics sampled from 10822 (10987) to 10822 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16
Scan time: 3.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX ( 644) 4331 732.5 4.1e-211
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 677 124.3 5.1e-28
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 633 116.9 8.1e-26
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 633 116.9 8.4e-26
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 633 116.9 8.6e-26
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 633 116.9 8.6e-26
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 559 104.6 4.2e-22
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 543 101.9 2.6e-21
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 535 100.6 6.3e-21
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 535 100.6 6.4e-21
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 518 97.8 4.6e-20
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 508 96.1 1.5e-19
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 502 95.1 2.9e-19
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 491 93.3 9.8e-19
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 488 92.8 1.5e-18
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 488 92.8 1.5e-18
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 486 92.5 1.9e-18
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 476 90.8 5.5e-18
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 476 90.8 6e-18
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 470 89.8 1.2e-17
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 470 89.8 1.2e-17
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 464 88.8 2.3e-17
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 464 88.8 2.5e-17
CCDS35217.1 KLHL15 gene_id:80311|Hs108|chrX ( 604) 457 87.6 5.3e-17
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 450 86.5 1.3e-16
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 442 85.1 2.9e-16
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 421 81.6 3.5e-15
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 410 79.8 1.2e-14
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 407 79.3 1.7e-14
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 406 79.1 1.8e-14
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 406 79.1 1.9e-14
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 406 79.2 2.2e-14
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 406 79.2 2.2e-14
CCDS69155.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 551) 404 78.8 2.2e-14
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 404 78.8 2.3e-14
CCDS69154.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 584) 404 78.8 2.3e-14
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 400 78.1 3.6e-14
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 400 78.2 4.3e-14
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 400 78.2 4.6e-14
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 396 77.4 5.3e-14
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 396 77.5 5.8e-14
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 394 77.2 9.1e-14
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 380 74.8 3.7e-13
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 368 72.8 1.3e-12
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 365 72.3 2e-12
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 365 72.4 2.9e-12
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 362 71.8 3e-12
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 354 70.5 8.6e-12
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 352 70.2 1.1e-11
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 348 69.4 1.3e-11
>>CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX (644 aa)
initn: 4331 init1: 4331 opt: 4331 Z-score: 3903.6 bits: 732.5 E(32554): 4.1e-211
Smith-Waterman score: 4331; 100.0% identity (100.0% similar) in 644 aa overlap (1-644:1-644)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTLETEGSEFPAHRSLLACSSDYFRALFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTLETEGSEFPAHRSLLACSSDYFRALFKS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HTQESRARVIHLHVPSAAGLQRLLDFIYTAWLSLSMDTVEDTLEAASYLQVTEALGLCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HTQESRARVIHLHVPSAAGLQRLLDFIYTAWLSLSMDTVEDTLEAASYLQVTEALGLCGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YLERQLAPENCCFAANVAARFGLAHTLDAAERCIVSHLQELLARGAGPAGLLELNPTSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YLERQLAPENCCFAANVAARFGLAHTLDAAERCIVSHLQELLARGAGPAGLLELNPTSLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLRQEPTTERLAHCTELLERVRFGLVPADVLRRVYSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLRQEPTTERLAHCTELLERVRFGLVPADVLRRVYSGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GLVLPARVKGLIIQALNYHTTPSRQPLMQGEQTSIRSPQTRILLVGGRRAREVVIEEVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLVLPARVKGLIIQALNYHTTPSRQPLMQGEQTSIRSPQTRILLVGGRRAREVVIEEVAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PQRAARGQVAAPEPEEEEEELEEEEEEEEWELTQNVVAFDVYNHRWRSLTQLPTPLLGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQRAARGQVAAPEPEEEEEELEEEEEEEEWELTQNVVAFDVYNHRWRSLTQLPTPLLGHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VCTAGNFLFVLGGESPSGSASSPLADDSRVVTAQVHRYDPRFHAWTEVPAMREARAHFWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VCTAGNFLFVLGGESPSGSASSPLADDSRVVTAQVHRYDPRFHAWTEVPAMREARAHFWC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GAVGERLLAVGGLGAGGEVLASVEMYDLRRDRWTAAGALPRALHGHAGAVGDRGVVYISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GAVGERLLAVGGLGAGGEVLASVEMYDLRRDRWTAAGALPRALHGHAGAVGDRGVVYISG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGTARFGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGTARFGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 IERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLAVVEETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLAVVEETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE4 RWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQLAEGGDDEREGEVGEALDLVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQLAEGGDDEREGEVGEALDLVLG
610 620 630 640
>>CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 (617 aa)
initn: 821 init1: 313 opt: 677 Z-score: 616.5 bits: 124.3 E(32554): 5.1e-28
Smith-Waterman score: 964; 30.7% identity (58.1% similar) in 652 aa overlap (3-640:26-615)
10 20 30
pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTL-ETE
.: : ..:....: :.. :: ::.:::::: .
CCDS65 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTS--NTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGD
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 GSE-FPAHRSLLACSSDYFRALFKSHTQESRARVIHLHVPSAAGLQRLLDFIYTAWLSLS
:.: ::.::...: .::::.:.: . .:. :.:: . .::....:::::: :::.
CCDS65 GDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 MDTVEDTLEAASYLQVTEALGLCGRYLERQLAPENCCFAANVAARFGLAHTLDAAERCIV
::...:::::::.::. .: .: .: .. .:: .. .: ..: .. .. :.
CCDS65 MDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFIL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 SHLQELLARGAGPAGLLELNPTSLRAVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLRQEPTTERLAH
... ::. : .:.: : ::.. .. . : .:. : ::: : :. .
CCDS65 KNFPALLSTGE----FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDP--RMDY
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 CTELLERVRFGLV-PADVLRRVYSGSGLVLPARVKGLIIQALNYHTTPSRQPLMQGEQTS
..:.. .:: :. : :.. : . . . .:...: ::. : ::.::...:.
CCDS65 AAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 IRSPQTRILLVGGRRAREVVIEEVAAPQRAARGQVAAPEPEEEEEELEEEEEEEEWELTQ
::: .:... .:: ...:. . : .. .:. .:
CCDS65 IRSDSTHLVTLGGVLRQQLVVSK--------------------ELRMYDERAQE------
300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 NVVAFDVYNHRWRSLTQLPTPLLGHSVCTAGNFLFVLGGESPSGSASSPLADDSRVVTAQ
::::. . .: :.. . ::::.:.::.: . .. .:
CCDS65 -----------WRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDT-------
330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 VHRYDPRFHAWTEVPAMREARAHFWCGAVGERLLAVGGLGAGGEVLASVEMYDLRRDRWT
: :.:::.. : .: .. : :. : .:. .: :::: .:.:: ::.:: :. : ..:.
CCDS65 VFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGE-LATVECYNPRMNEWS
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 AAGALPRALHGHAGAVGDRGVVYISGGKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGT
.. . . .::::.: :..::::: . . .:. . :. . : .:::: :
CCDS65 YVAKMSEPHYGHAGTVYG-GLMYISGGITHD-----TFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMTT
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560
pF1KE4 AR-------FGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSEIERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLA
.: : .. :. : : . :. : :.: :::: . . . :.:
CCDS65 VRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVA
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 VVEETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLDRWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQL----
: :. ..:: .: . .: : :: . :.:. . :: . .:.: .: .
CCDS65 VFENKIYVVGGYSWNNRCMVEI--VQKYDPEKDEWHKV-FDLPESLGGIRACTLTVFPPE
550 560 570 580 590
630 640
pF1KE4 AEGGDDEREGEVGEALDLVLG
. :. ::. .. :
CCDS65 ENPGSPSRESPLSAPSDHS
600 610
>>CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (613 aa)
initn: 848 init1: 312 opt: 633 Z-score: 576.9 bits: 116.9 E(32554): 8.1e-26
Smith-Waterman score: 953; 30.7% identity (58.0% similar) in 622 aa overlap (11-621:32-592)
10 20 30
pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTLETEGSE-
:....: :.. :: ::.:::::: ..
CCDS55 KLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 -FPAHRSLLACSSDYFRALFKSHTQESRARVIHLHVPSAAGLQRLLDFIYTAWLSLSMDT
::.:: ..: .::::.:.: . .:. :.:: : .::....:::::: :::.::.
CCDS55 AFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 VEDTLEAASYLQVTEALGLCGRYLERQLAPENCCFAANVAARFGLAHTLDAAERCIVSHL
..:::::::.::. .: .: .: .. .:: .. .: ..:... .. .....
CCDS55 LQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 QELLARGAGPAGLLELNPTSLRAVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLR-QEPTTERLAHCT
::. : .:.: : ::.. .. . : .:. . ::: .:: :. .
CCDS55 PALLSTGE----FLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEP---RMDFAA
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 ELLERVRFGLV-PADVLRRVYSGSGLVLPARVKGLIIQALNYHTTPSRQPLMQGEQTSIR
.:.. .:: :. : ... : . . . .:...: ::. : ::.::...:.::
CCDS55 KLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 SPQTRILLVGGRRAREVVIEEVAAPQRAARGQVAAPEPEEEEEELEEEEEEEEWELTQNV
: :... .:: ...:. ....
CCDS55 SDTTHLVTLGGVLRQQLVV-------------------------------------SKEL
300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 VAFDVYNHRWRSLTQLPTPLLGHSVCTAGNFLFVLGGESPSGSASSPLADDSRVVTAQVH
.: :.:.::. . .: :.. . ::::.:.::.: . .. .: :
CCDS55 RMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDT-------VF
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 RYDPRFHAWTEVPAMREARAHFWCGAVGERLLAVGGLGAGGEVLASVEMYDLRRDRWTAA
:.:::.. : .: .. : :. : .:. : :::: .:.:: : .:: :. : ..:: .
CCDS55 RFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGE-LPTVECYNPRTNEWTYV
380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 GALPRALHGHAGAVGDRGVVYISGGKAGRGEGGASSLRDLYVLGPEEQVWSKKAPMGTAR
. . . .::::.: ::.::::: . . ..:. . :. . : .:::: :.:
CCDS55 AKMSEPHYGHAGTVYG-GVMYISGGITHD-----TFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVR
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560
pF1KE4 -------FGHHMAVLRGAVFAFLGRYEPFSEIERYDPGADQWTRLRPLPYDRFCYGLAVV
:... :. : : . :. : :.: :::: . . . :.::
CCDS55 GLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVF
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 EETALLLGGLKWRDSRQVPTRNVVGYDLDLDRWEDIGCALPWAWSGLRCAVLQLAEGGDD
:. ..:: .: . .: : :: : :.:. . :: . .:.: .:
CCDS55 ENKIYVVGGYSWNNRCMVEI--VQKYDPDKDEWHKV-FDLPESLGGIRACTLTVFPPEET
550 560 570 580 590 600
630 640
pF1KE4 EREGEVGEALDLVLG
CCDS55 TPSPSRESPLSAP
610
>>CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (639 aa)
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10 20 30
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630
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650
>>CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (658 aa)
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CCDS55 TPSPSRESPLSAP
650
>>CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 (616 aa)
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:: . : .: .: . :. :. ... . :.:.:: . .: .:.::: :. . : :. ...:
CCDS10 PRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENG-ALSSVETYSPKTDSWSYVAGL
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CCDS10 PRFTYGHAGTIY-KDFVYISGGHDY--QIGPYR-KNLLCYDHRTDVWEERRPMTTARGWH
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.::: .:... . ...: :: . :.: : :: : .: : : .:..
CCDS10 RIYILGGYSWENT--AFSKTVQVYDREADKWSR-GVDLPKAIAGGSACVCALEPRPEDKK
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. :.
CCDS10 KKGKGKRHQDRGQ
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>>CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 (615 aa)
initn: 666 init1: 338 opt: 543 Z-score: 496.0 bits: 101.9 E(32554): 2.6e-21
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pF1KE4 MSYFLSYCKAHGGALLTGYQALRAEGFLCDVTLETEGSE
.:. .:: : .:::.: : ::.: .
CCDS12 GGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQGQLLDVVLTINREA
20 30 40 50 60 70
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CCDS12 FPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHIIDFAYSAEVTLDLDCV
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pF1KE4 EDTLEAASYLQVTEALGLCGRYLERQLAPENCCFAANVAARFGLAHTLDAAERCIVSHLQ
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CCDS12 QDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSLASLRESVDAFTFRHFL
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pF1KE4 ELLARGAGPAGLLELNPTSLRAVLGAPDVARVPEARLLGLALAWLRQEPTTERLAHCTEL
.. : .:.: : : . . : :. :. ::...:. : . ...
CCDS12 QI----AEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHDPA--RRPRASHV
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CCDS12 LCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEMQSPRTAVRSD
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CCDS12 VPSLVTFGGT--------PYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARH-------------------
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CCDS12 --------FRELTEMEVGCSHTCVAVLDNFVYVAGGQHLQYRSGEGAVD-------ACYR
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CCDS12 YDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYATGGRNRAGS-LASVERYCPRRNEWGYAC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]