FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2041, 653 aa 1>>>pF1KE2041 653 - 653 aa - 653 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5824+/-0.000536; mu= 18.4076+/- 0.033 mean_var=82.3746+/-15.799, 0's: 0 Z-trim(108.1): 124 B-trim: 497 in 3/52 Lambda= 0.141312 statistics sampled from 16029 (16182) to 16029 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 9.740 The best scores are: opt bits E(85289) XP_005274610 (OMIM: 300109) PREDICTED: serine/thre ( 653) 4401 908.0 0 NP_006231 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 653) 4401 908.0 0 XP_016885101 (OMIM: 300109) PREDICTED: serine/thre ( 563) 3819 789.3 0 NP_689412 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 591) 2407 501.5 3.6e-141 NP_689410 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein ( 625) 2193 457.9 5.1e-128 NP_006230 (OMIM: 602256) serine/threonine-protein ( 753) 1106 236.3 3e-61 XP_011530341 (OMIM: 602256) PREDICTED: serine/thre ( 753) 1106 236.3 3e-61 NP_006238 (OMIM: 600658) serine/threonine-protein ( 499) 549 122.6 3.3e-27 XP_016882424 (OMIM: 600658) PREDICTED: serine/thre ( 551) 549 122.7 3.6e-27 NP_001191213 (OMIM: 600658) serine/threonine-prote ( 477) 438 100.0 2.1e-20 NP_001290432 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 307) 338 79.5 2e-14 NP_002711 (OMIM: 602035) serine/threonine-protein ( 307) 338 79.5 2e-14 NP_001009552 (OMIM: 176916) serine/threonine-prote ( 309) 338 79.5 2e-14 NP_001124164 (OMIM: 114105) serine/threonine-prote ( 469) 316 75.1 6.3e-13 XP_016863854 (OMIM: 114105) PREDICTED: serine/thre ( 509) 316 75.2 6.8e-13 NP_001124163 (OMIM: 114105) serine/threonine-prote ( 511) 316 75.2 6.8e-13 NP_000935 (OMIM: 114105) serine/threonine-protein ( 521) 316 75.2 6.9e-13 XP_016871868 (OMIM: 114106) PREDICTED: serine/thre ( 426) 312 74.3 1e-12 XP_005270001 (OMIM: 114106) PREDICTED: serine/thre ( 514) 312 74.3 1.2e-12 NP_001135826 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 515) 312 74.3 1.2e-12 NP_066955 (OMIM: 114106) serine/threonine-protein ( 524) 312 74.3 1.2e-12 NP_001135825 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 525) 312 74.3 1.2e-12 NP_001276898 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 410) 299 71.6 6.3e-12 XP_016869100 (OMIM: 114107) PREDICTED: serine/thre ( 418) 296 71.0 9.8e-12 XP_011517149 (OMIM: 612725) PREDICTED: serine/thre ( 293) 294 70.5 9.8e-12 NP_002712 (OMIM: 612725) serine/threonine-protein ( 305) 294 70.5 1e-11 NP_001116827 (OMIM: 612725) serine/threonine-prote ( 342) 294 70.5 1.1e-11 NP_001230904 (OMIM: 114107) serine/threonine-prote ( 502) 296 71.1 1.1e-11 NP_005596 (OMIM: 114107) serine/threonine-protein ( 512) 296 71.1 1.1e-11 NP_001230903 (OMIM: 114107) serine/threonine-prote ( 521) 296 71.1 1.2e-11 XP_016869099 (OMIM: 114107) PREDICTED: serine/thre ( 439) 277 67.2 1.5e-10 NP_002706 (OMIM: 176915) serine/threonine-protein ( 309) 225 56.4 1.8e-07 XP_016878893 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 228) 220 55.3 2.8e-07 NP_001290436 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 228) 220 55.3 2.8e-07 NP_001290435 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 228) 220 55.3 2.8e-07 XP_016878892 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 228) 220 55.3 2.8e-07 NP_002700 (OMIM: 600590) serine/threonine-protein ( 327) 195 50.3 1.3e-05 NP_996759 (OMIM: 600590) serine/threonine-protein ( 327) 195 50.3 1.3e-05 NP_996756 (OMIM: 176875) serine/threonine-protein ( 286) 187 48.7 3.5e-05 NP_002699 (OMIM: 176875) serine/threonine-protein ( 330) 187 48.7 4e-05 NP_001008709 (OMIM: 176875) serine/threonine-prote ( 341) 187 48.7 4.1e-05 XP_011536806 (OMIM: 176914) PREDICTED: serine/thre ( 362) 186 48.5 4.9e-05 NP_002701 (OMIM: 176914) serine/threonine-protein ( 323) 185 48.3 5.2e-05 XP_011536807 (OMIM: 176914) PREDICTED: serine/thre ( 330) 185 48.3 5.3e-05 NP_001231903 (OMIM: 176914) serine/threonine-prote ( 337) 185 48.3 5.4e-05 NP_001116841 (OMIM: 612725) serine/threonine-prote ( 283) 176 46.4 0.00017 NP_001290433 (OMIM: 602035) serine/threonine-prote ( 273) 168 44.8 0.0005 XP_006721124 (OMIM: 602035) PREDICTED: serine/thre ( 273) 168 44.8 0.0005 NP_001276897 (OMIM: 114106) serine/threonine-prote ( 514) 159 43.1 0.0029 >>XP_005274610 (OMIM: 300109) PREDICTED: serine/threonin (653 aa) initn: 4401 init1: 4401 opt: 4401 Z-score: 4851.8 bits: 908.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4401; 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90.5% identity (90.5% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-591) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGCSSSSTKTRRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQMQLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 MGCSSSSTKTRRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQMQLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TFFSFMLENYTHIHKEELELRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 TFFSFMLENYTHIHKEELELRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 IDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 IDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 FLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 FLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETTDLNLLHRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 LRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETTDLNLLHRV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 ERNKMKSVLIPPTETNRDHDTDSKHNKVGVTFNAHGRIKTNGSPTEHLTEHEWEQIIDIL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 ERNKMKSVLIPPTETNRDHDTDSKHNKVGVTFNAHGRIKTNGSPTEHLTEHEWEQ----- 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 WSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVTSKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVT ::: NP_689 ---------------------------------------------------------VVT 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 IFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 IFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRER 360 370 380 390 400 410 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 VISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMENILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 VISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMENILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEY 420 430 440 450 460 470 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 MSSFQNIRIEKPVQEAHSTLVETLYRYRSDLEIIFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 MSSFQNIRIEKPVQEAHSTLVETLYRYRSDLEIIFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSS 480 490 500 510 520 530 610 620 630 640 650 pF1KE2 HYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLKAFYVVHRYEDLMKPDVTNLG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 HYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLKAFYVVHRYEDLMKPDVTNLG 540 550 560 570 580 590 >>NP_689410 (OMIM: 300109) serine/threonine-protein phos (625 aa) initn: 2222 init1: 2193 opt: 2193 Z-score: 2419.3 bits: 457.9 E(85289): 5.1e-128 Smith-Waterman score: 4140; 95.7% identity (95.7% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-625) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGCSSSSTKTRRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQMQLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 MGCSSSSTKTRRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQMQLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TFFSFMLENYTHIHKEELELRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 TFFSFMLENYTHIHKEELELRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 IDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 IDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 FLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 FLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETTDLNLLHRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 LRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETTDLNLLHRV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 ERNKMKSVLIPPTETNRDHDTDSKHNKVGVTFNAHGRIKTNGSPTEHLTEHEWEQIIDIL ::::::::::::::::::::::::::: ::::: NP_689 ERNKMKSVLIPPTETNRDHDTDSKHNK----------------------------IIDIL 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 WSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVTSKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 WSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVTSKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVT 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 IFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 IFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRER 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 VISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMENILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 VISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMENILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEY 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 MSSFQNIRIEKPVQEAHSTLVETLYRYRSDLEIIFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 MSSFQNIRIEKPVQEAHSTLVETLYRYRSDLEIIFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSS 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 pF1KE2 HYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLKAFYVVHRYEDLMKPDVTNLG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_689 HYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLKAFYVVHRYEDLMKPDVTNLG 580 590 600 610 620 >>NP_006230 (OMIM: 602256) serine/threonine-protein phos (753 aa) initn: 2140 init1: 920 opt: 1106 Z-score: 1220.5 bits: 236.3 E(85289): 3e-61 Smith-Waterman score: 1928; 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NP_006 KVTHTLTMRQRISRVEESALRALREKLFAHSSDLLSEFKKHDADKVGLITLSDWAAAVES 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 ILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEYMSSFQNIRIEKPVQEA-HSTLVETLYRYRSDLEI .: :.:::: : .::: . .. .:: : ..:. :. .: .:.:.::::: ::.:: NP_006 VLHLGLPWRMLRPQLVNSSADNMLEYKSWLKNLAKEQLSRENIQSSLLETLYRNRSNLET 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 IFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSSHYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLK :: ::.::::.::..::: :::::::.:. : NP_006 IFRIIDSDHSGFISLDEFRQTWKLFSSHMNIDITDDCICDLARSIDFNKDGHIDINEFLE 660 670 680 690 700 710 640 650 pF1KE2 AFYVVHRYEDLMKPDVTNLG NP_006 AFRLVEKSCPEGDASECPQATNAKDSGCSSPGAH 720 730 740 750 >>XP_011530341 (OMIM: 602256) PREDICTED: serine/threonin (753 aa) initn: 2140 init1: 920 opt: 1106 Z-score: 1220.5 bits: 236.3 E(85289): 3e-61 Smith-Waterman score: 1928; 45.0% identity (70.9% similar) in 693 aa overlap (1-606:1-692) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGCSSSSTKT---RRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQM :: ..:. . . .. ...:: .:: ::: : :::. :.. . .:::::::: .: :. 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XP_011 DLELLDKIERSKIVSTMRCKTRQKSEKQMEEKRRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPL 300 310 320 330 340 350 320 330 340 pF1KE2 R----DHDTDSKHNKVGVTFNAHGR-----IKTN------------G--------SPTEH : . :. ... . . :: .... : :.. XP_011 RLGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLDGRELSRQVRSSVELELERCRQQAGLLVTGEKEEPSRS 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 pF1KE2 LTE-------------HEWEQIIDILWSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVTSKILNKY .: .::.:..::::::: ...:: :: ::::::::::::...:.:: XP_011 ASEADSEAGELRKPTQEEWRQVVDILWSDPMAQEGCKANTIRGGGCYFGPDVTQQLLQKY 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 QLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVTIFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVT ....:::::::::::::.::. ::.:::::::::: :::::::.:: . ::.. :::.. XP_011 NMQFLIRSHECKPEGYEFCHNRKVLTIFSASNYYEVGSNRGAYVKLGPALTPHIVQYQAN 480 490 500 510 520 530 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 KATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMEN :.: .:::.. .:.::.. :::......::: :. .: : : ...:.:: .:. XP_011 KVTHTLTMRQRISRVEESALRALREKLFAHSSDLLSEFKKHDADKVGLITLSDWAAAVES 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 ILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEYMSSFQNIRIEKPVQEA-HSTLVETLYRYRSDLEI .: :.:::: : .::: . .. .:: : ..:. :. .: .:.:.::::: ::.:: XP_011 VLHLGLPWRMLRPQLVNSSADNMLEYKSWLKNLAKEQLSRENIQSSLLETLYRNRSNLET 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 IFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSSHYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLK :: ::.::::.::..::: :::::::.:. : XP_011 IFRIIDSDHSGFISLDEFRQTWKLFSSHMNIDITDDCICDLARSIDFNKDGHIDINEFLE 660 670 680 690 700 710 640 650 pF1KE2 AFYVVHRYEDLMKPDVTNLG XP_011 AFRLVEKSCPEGDASECPQATNAKDSGCSSPGAH 720 730 740 750 >>NP_006238 (OMIM: 600658) serine/threonine-protein phos (499 aa) initn: 749 init1: 407 opt: 549 Z-score: 609.4 bits: 122.6 E(85289): 3.3e-27 Smith-Waterman score: 772; 35.2% identity (63.0% similar) in 381 aa overlap (86-462:156-487) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QMQLSTFFSFMLENYTHIHKEELELRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQ-F : .... : : ..:. . : :.::.:. 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XP_016 ---MCDLLWSDPQPQNG-RSISKRGVSCQFGPDVTKAFLEENNLDYIIRSHEVKAEGYEV 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 pF1KE2 CHDGKVVTIFSASNYYEEGSNRGAYIKLC-SGTTPRFFQYQ--VTKATCFQPLRQRVDTM : :. ::.::: :: .. .:...::.: : :.: :. :.. . :: .: XP_016 AHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLQGSDLRPQFHQFTAVVSHPSGPLPLPSRPGDK 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 ENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMENILGLNLPWRSLSSNL XP_016 EAETLVRGRGRFCRWVLRGSVLTSVHPTCPGPTASSQRQAHGLCQHAAAARNDVR 500 510 520 530 540 550 >>NP_001191213 (OMIM: 600658) serine/threonine-protein p (477 aa) initn: 699 init1: 343 opt: 438 Z-score: 487.3 bits: 100.0 E(85289): 2.1e-20 Smith-Waterman score: 695; 34.6% identity (58.8% similar) in 381 aa overlap (86-462:156-465) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QMQLSTFFSFMLENYTHIHKEELELRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQ-F : .... : : ..:. . : :.::.:. 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NP_001 AHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLQGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYANTLLQL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 SAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMENILGLNLPWRSLSSNLVN NP_001 GMM 653 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 12:51:02 2016 done: Sun Nov 6 12:51:03 2016 Total Scan time: 9.740 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]