FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2041, 653 aa 1>>>pF1KE2041 653 - 653 aa - 653 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8852+/-0.00134; mu= 16.4512+/- 0.081 mean_var=85.8864+/-16.632, 0's: 0 Z-trim(101.4): 75 B-trim: 3 in 1/49 Lambda= 0.138392 statistics sampled from 6424 (6487) to 6424 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16 Scan time: 2.530 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 653) 4401 889.7 0 CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 591) 2407 491.5 1.4e-138 CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs108|chr4 ( 753) 1106 231.8 2.6e-60 CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19 ( 499) 549 120.5 5.6e-27 CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 ( 307) 338 78.2 1.8e-14 CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8 ( 309) 338 78.2 1.8e-14 CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 469) 316 74.0 5.4e-13 CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 511) 316 74.0 5.8e-13 CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 521) 316 74.0 5.9e-13 CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 515) 312 73.2 1e-12 CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 524) 312 73.2 1e-12 CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 525) 312 73.2 1e-12 CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 305) 294 69.5 8e-12 CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 342) 294 69.5 8.8e-12 CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 502) 296 70.0 9.1e-12 CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 512) 296 70.0 9.3e-12 CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 521) 296 70.0 9.4e-12 >>CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX (653 aa) initn: 4401 init1: 4401 opt: 4401 Z-score: 4752.5 bits: 889.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4401; 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CCDS34 MGSGTSTQHHFAFQNAERAFKAAALIQRWYRRYVARLEMRRRCTWSIFQSIEYAGQQDQV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QLSTFFSFMLENY---THIHKEELE--LRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRL .: :::...... .: .. : . .. . ....:. :: .::.:::::.:::: CCDS34 KLHDFFSYLMDHFIPSSHNDRDFLTRIFTEDRFAQDSEMKKCSDY-ESIEVPDSYTGPRL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 QFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGD .::: :.:::. .: :::.:::..:.:::: : :.::.....: :.:.:.::: CCDS34 SFPLLPDHATALVEAFRLKQQLHARYVLNLLYETKKHLVQLPNINRVSTCYSEEITVCGD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRG :::.::::..::::::::: . ::::::::::::.:.:::::: . .::::...::::: CCDS34 LHGQLDDLIFIFYKNGLPSPERSYVFNGDFVDRGKDSVEILMILFAFMLVYPKEFHLNRG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 NHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETT :::: :.:::::::::...:::.:::.::. :.. . :::..:..:...:..:::.:. : CCDS34 NHEDHMVNLRYGFTKEVMNKYKVHGKEILRTLQDVFCWLPLATLIDEKVLILHGGVSDIT 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 DLNLLHRVERNKMKSVL---------------------------IP---------PTETN ::.:: ..::.:. :.. :: :. CCDS34 DLELLDKIERSKIVSTMRCKTRQKSEKQMEEKRRANQKSSAQGPIPWFLPESRSLPSSPL 300 310 320 330 340 350 320 330 340 pF1KE2 R----DHDTDSKHNKVGVTFNAHGR-----IKTN------------G--------SPTEH : . :. ... . . :: .... : :.. CCDS34 RLGSYKAQKTSRSSSIPCSGSLDGRELSRQVRSSVELELERCRQQAGLLVTGEKEEPSRS 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 pF1KE2 LTE-------------HEWEQIIDILWSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVTSKILNKY .: .::.:..::::::: ...:: :: ::::::::::::...:.:: CCDS34 ASEADSEAGELRKPTQEEWRQVVDILWSDPMAQEGCKANTIRGGGCYFGPDVTQQLLQKY 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 QLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVTIFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVT ....:::::::::::::.::. ::.:::::::::: :::::::.:: . ::.. :::.. CCDS34 NMQFLIRSHECKPEGYEFCHNRKVLTIFSASNYYEVGSNRGAYVKLGPALTPHIVQYQAN 480 490 500 510 520 530 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 KATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMEN :.: .:::.. .:.::.. :::......::: :. .: : : ...:.:: .:. CCDS34 KVTHTLTMRQRISRVEESALRALREKLFAHSSDLLSEFKKHDADKVGLITLSDWAAAVES 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 ILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEYMSSFQNIRIEKPVQEA-HSTLVETLYRYRSDLEI .: :.:::: : .::: . .. .:: : ..:. :. .: .:.:.::::: ::.:: CCDS34 VLHLGLPWRMLRPQLVNSSADNMLEYKSWLKNLAKEQLSRENIQSSLLETLYRNRSNLET 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 IFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSSHYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLK :: ::.::::.::..::: :::::::.:. : CCDS34 IFRIIDSDHSGFISLDEFRQTWKLFSSHMNIDITDDCICDLARSIDFNKDGHIDINEFLE 660 670 680 690 700 710 640 650 pF1KE2 AFYVVHRYEDLMKPDVTNLG CCDS34 AFRLVEKSCPEGDASECPQATNAKDSGCSSPGAH 720 730 740 750 >>CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19 (499 aa) initn: 749 init1: 407 opt: 549 Z-score: 597.8 bits: 120.5 E(32554): 5.6e-27 Smith-Waterman score: 772; 35.2% identity (63.0% similar) in 381 aa overlap (86-462:156-487) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QMQLSTFFSFMLENYTHIHKEELELRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQ-F : .... : : ..:. . : :.::.:. CCDS12 KPHDKDAKMKYQECNKIVKQKAFERAIAGDEHKRSVVDSLD-IESMTIEDEYSGPKLEDG 130 140 150 160 170 180 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 PLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLH .: . . :.. .:.:. :: . . ..: ..:.::... .... . ....:.::: : CCDS12 KVTISFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQVKEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTH 190 200 210 220 230 240 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNH :.. ::. :: :::::: :::.:::::::::. :.:... : :.::. .:: :::: CCDS12 GQFYDLLNIFELNGLPSETNPYIFNGDFVDRGSFSVEVILTLFGFKLLYPDHFHLLRGNH 250 260 270 280 290 300 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 EDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGI-SET-T : :: ::: :. :: .. ... : . :::.. .....:..:::. :: . CCDS12 ETDNMNQIYGFEGEVKAKYT---AQMYELFSEVFEWLPLAQCINGKVLIMHGGLFSEDGV 310 320 330 340 350 360 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 DLNLLHRVERNKMKSVLIPPTETNRDHDTDSKHNKVGVTFNAHGRIKTNGSPTEHLTEHE :. ....:::.. :: :: .: CCDS12 TLDDIRKIERNRQ-----PP---------DS-------------------GP-------- 370 380 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 WEQIIDILWSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVTSKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEI . :.:::::. .:: . :: .: ::::::. .:.. .: ..::::: : ::::. CCDS12 ---MCDLLWSDPQPQNG-RSISKRGVSCQFGPDVTKAFLEENNLDYIIRSHEVKAEGYEV 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 CHDGKVVTIFSASNYYEEGSNRGAYIKLC-SGTTPRFFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMEN : :. ::.::: :: .. .:...::.: : :.: :. .. .:. CCDS12 AHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLQGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYANTLLQL 440 450 460 470 480 490 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 SAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMENILGLNLPWRSLSSNLVN CCDS12 GMM >>CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 (307 aa) initn: 370 init1: 171 opt: 338 Z-score: 373.2 bits: 78.2 E(32554): 1.8e-14 Smith-Waterman score: 415; 28.5% identity (57.0% similar) in 323 aa overlap (119-440:5-275) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 QDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKK .:.: .: ... .... : . .... CCDS10 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKARE 10 20 30 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 VLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKN .: . : ... :: ::.:::.::.. :: .: .: : : :.: ::::::: CCDS10 ILVEESNVQRVD-SP---VTVCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETN-YLFMGDFVDRGFY 40 50 60 70 80 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 SIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFY :.: ...: . . ::. . : :::::. ... ::: : :.:: . . . :.. CCDS10 SVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQITQVYGFYDECLRKY--GSVTVWRYCTEIF 90 100 110 120 130 140 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 AWLPIGTIVDNEILVIHGGISETTD-LNLLHRVERNKMKSVLIPPTETNRDHDTDSKHNK .: ...:.:..:. .:::.: . . :. .. ..:.. .: :: CCDS10 DYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTIDRKQE----VP-------HD------- 150 160 170 180 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 VGVTFNAHGRIKTNGSPTEHLTEHEWEQIIDILWSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVT .: . :.:::::. .: . . ::.: :: ::. CCDS10 ---------------GP-----------MCDLLWSDPEDTTG-WGVSPRGAGYLFGSDVV 190 200 210 220 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 SKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVTIFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPR ... .. :. :.:. :::. . :.:..:: :: . .: .: ..: CCDS10 AQFNAANDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKD 230 240 250 260 270 280 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 FFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQ CCDS10 FIIFEAAPQETRGIPSKKPVADYFL 290 300 >>CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8 (309 aa) initn: 476 init1: 160 opt: 338 Z-score: 373.1 bits: 78.2 E(32554): 1.8e-14 Smith-Waterman score: 466; 30.2% identity (55.7% similar) in 334 aa overlap (120-451:9-289) 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 DMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKV ..: .: ..: . :. . : . ..:.. CCDS60 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEI 10 20 30 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 LKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNS : . : ... : ::.:::.::.. ::. .: .: . : :.: ::.:::: : CCDS60 LTKESNVQEVRC-P---VTVCGDVHGQFHDLMELFRIGGKSPDTN-YLFMGDYVDRGYYS 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 IEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYA .: . .: . . ::. . . :::::. ... ::: : :.:: . . . . ... CCDS60 VETVTLLVALKVRYPERITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKY--GNANVWKYFTDLFD 100 110 120 130 140 150 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 WLPIGTIVDNEILVIHGGISETTDLNLLHRVERNKMKSVLIPPTETNRDHDTDSKHNKVG .::. ..::..:. .:::.: . : .: : .... : : : CCDS60 YLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSID-TLDHIRALDRLQEV---PHE--------------- 160 170 180 190 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 VTFNAHGRIKTNGSPTEHLTEHEWEQIIDILWSDP--RGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVT .: . :.::::: :: : : ::.: :: :.. CCDS60 -------------GP-----------MCDLLWSDPDDRGGWGISP---RGAGYTFGQDIS 200 210 220 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 SKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVTIFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPR . . : .. :.:. :::. ::: .::::::: :: . .:..: ..: . CCDS60 ETFNHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYS 230 240 250 260 270 280 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 FFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQ :.:. 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CCDS47 ----AYG-------P-----------MCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFY 230 240 250 260 390 400 410 420 430 pF1KE2 GPDVTSKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEICHDGK------VVTIFSASNYYEEGSNRGA . .. ..:.. .: ..:.:: . ::.. . .. ..::::: :: . .:..: CCDS47 SYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAA 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 YIKLCSGTTPRFFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQD .: CCDS47 VLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSE 330 340 350 360 370 380 >>CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 (521 aa) initn: 388 init1: 141 opt: 316 Z-score: 346.1 bits: 74.0 E(32554): 5.9e-13 Smith-Waterman score: 370; 27.6% identity (55.6% similar) in 333 aa overlap (121-439:43-323) 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 MRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVL .:.: . .. :. .:... : ..: CCDS34 TTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALRIITEGASIL 20 30 40 50 60 70 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 KQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSI .: :. :. .: ::.:::.::.. ::. .: .: :.. :.: ::.:::: :: CCDS34 RQEKNLLDID-AP---VTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTR-YLFLGDYVDRGYFSI 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 EILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAW : .. : . ..::. : : ::::: .. . : .: ::. .:. . . . 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CCDS34 ----AYG-------P-----------MCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFY 230 240 250 260 390 400 410 420 430 pF1KE2 GPDVTSKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEICHDGK------VVTIFSASNYYEEGSNRGA . .. ..:.. .: ..:.:: . ::.. . .. ..::::: :: . .:..: CCDS34 SYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAA 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 YIKLCSGTTPRFFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQD .: CCDS34 VLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSE 330 340 350 360 370 380 >>CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 (515 aa) initn: 380 init1: 147 opt: 312 Z-score: 341.8 bits: 73.2 E(32554): 1e-12 Smith-Waterman score: 362; 27.0% identity (55.6% similar) in 333 aa overlap (121-439:52-332) 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 MRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVL .:.: . . .. . . .:... : .: CCDS44 GADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLVKEGRVDEEIALRIINEGAAIL 30 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 KQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSI .. .. ... .: .:.:::.::.. ::. .: .: :.. :.: ::.:::: :: CCDS44 RREKTMIEVE-AP---ITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTR-YLFLGDYVDRGYFSI 90 100 110 120 130 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 EILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAW : .. : : ..::. : : ::::: .. . : .: ::. .:. . : . 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