FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4058, 323 aa 1>>>pF1KE4058 323 - 323 aa - 323 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1955+/-0.00114; mu= 11.0336+/- 0.067 mean_var=114.0050+/-22.955, 0's: 0 Z-trim(106.1): 202 B-trim: 22 in 1/47 Lambda= 0.120119 statistics sampled from 8544 (8783) to 8544 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16 Scan time: 2.390 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 323) 2159 385.4 3.2e-107 CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 302) 1771 318.2 5.3e-87 CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 306) 1492 269.8 1.9e-72 CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 ( 329) 1183 216.3 2.7e-56 CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 294) 978 180.7 1.2e-45 CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 262) 823 153.8 1.4e-37 CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 ( 278) 674 128.0 8.4e-30 CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 252) 455 90.0 2.1e-18 CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 356 73.6 1.4e-12 CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 356 73.6 1.4e-12 CCDS75319.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 581) 333 69.2 9e-12 CCDS43372.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 616) 333 69.2 9.4e-12 CCDS43371.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 627) 333 69.2 9.5e-12 CCDS34003.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2352) 339 70.8 1.2e-11 CCDS68721.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2490) 339 70.8 1.3e-11 CCDS34004.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2603) 339 70.8 1.3e-11 CCDS74908.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 ( 899) 332 69.2 1.4e-11 CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 332 69.2 1.6e-11 CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 321 67.6 9.1e-11 >>CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (323 aa) initn: 2159 init1: 2159 opt: 2159 Z-score: 2038.4 bits: 385.4 E(32554): 3.2e-107 Smith-Waterman score: 2159; 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CCDS38 CIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR 300 310 320 >>CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (294 aa) initn: 1191 init1: 966 opt: 978 Z-score: 932.9 bits: 180.7 E(32554): 1.2e-45 Smith-Waterman score: 978; 55.3% identity (79.2% similar) in 264 aa overlap (59-322:30-293) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 KVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQG ..: .: ::.:::: .:. :.:..::.:: CCDS35 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQG 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 VNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN ::..: ..:: :::::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: ::: ::: CCDS35 WAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVN 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR .::. ::..: : ::::::::..::: ::.. :.: . ::::.. .::::::.:: :. 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CCDS35 PPESPLAQLFLEREGPPSLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL 240 250 260 270 280 290 >>CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (262 aa) initn: 823 init1: 823 opt: 823 Z-score: 788.4 bits: 153.8 E(32554): 1.4e-37 Smith-Waterman score: 823; 54.7% identity (79.6% similar) in 225 aa overlap (59-283:30-254) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 KVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQG ..: .: ::.:::: .:. :.:..::.:: CCDS14 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQG 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 VNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN ::..: ..:: :::::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: ::: ::: CCDS14 WAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVN 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR .::. ::..: : ::::::::..::: ::.. :.: . ::::.. .::::::.:: :. CCDS14 LLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACENQQ 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 VDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSALDLA ::::::: ::.:..:. :.::::.:: .. :. :: :.::. . .::.:: ..:. CCDS14 RACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVELV 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 APKSSVEQALLLREGPPALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ :.: . : .: ::: CCDS14 PPESPLAQLFLEREGASLPKPKP 240 250 260 >>CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 (278 aa) initn: 785 init1: 548 opt: 674 Z-score: 648.5 bits: 128.0 E(32554): 8.4e-30 Smith-Waterman score: 674; 39.4% identity (69.0% similar) in 274 aa overlap (50-322:4-277) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 TFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLL : :. . : :..:.:.:::: .:. : CCDS70 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESL 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 ALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNAC :. :: .:. :: ::.. .. :: : : :.. :.. :: ::.:.. .. :.::: .:: CCDS70 QLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDAC 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 CSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTP ::: ::..:: .:::.. .. :::.::: : ::...:. ..:.. . ..::: CCDS70 ASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTP 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 LYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNA :.:::. ...:::: ::. ::.:. .. .: :: ::. .::..:..: ..:.:. :. CCDS70 LHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDN 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 QGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPP-ALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLER .::. : . .:. . . : : .::::::. .:: : . : ::..: : CCDS70 RGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLID 220 230 240 250 260 270 320 pF1KE4 FLLYQ .: : CCDS70 YLSYN >>CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (252 aa) initn: 894 init1: 443 opt: 455 Z-score: 443.9 bits: 90.0 E(32554): 2.1e-18 Smith-Waterman score: 754; 52.4% identity (76.0% similar) in 225 aa overlap (59-283:30-244) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 KVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLLALKTLIAQG ..: .: ::.:::: .:. :.:..::.:: CCDS55 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDWSPMHEAAIHGHQLSLRNLISQG 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 VNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAACVN ::..: ..:: :::::::::..:.: ::..::.:::::. ::::::: ::: ::: CCDS55 WAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDCVN 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 VLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACTYQR .::. ::..: : ::::::::..: : . ::::.. .::::::.:: :. 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