FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5737, 760 aa 1>>>pF1KE5737 760 - 760 aa - 760 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0134+/-0.000424; mu= 21.5651+/- 0.026 mean_var=62.0108+/-12.838, 0's: 0 Z-trim(110.8): 41 B-trim: 1040 in 1/50 Lambda= 0.162870 statistics sampled from 19199 (19237) to 19199 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 10.100 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001821 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exchang ( 760) 5105 1208.8 0 NP_001243873 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exch ( 666) 4466 1058.6 0 NP_001230303 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791) 4220 1000.8 0 NP_001820 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 818) 4220 1000.8 0 XP_011529888 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-) ( 831) 4118 976.9 0 XP_005262783 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-) ( 839) 4118 976.9 0 NP_776297 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange trans ( 866) 4118 976.9 0 NP_001269092 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 766) 4103 973.3 0 NP_001121370 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816) 4103 973.3 0 NP_001121371 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 816) 4103 973.3 0 XP_016884747 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820) 4103 973.3 0 XP_016884746 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31 ( 820) 4103 973.3 0 NP_000075 (OMIM: 300008,300009,300554,308990,31046 ( 746) 4080 967.9 0 NP_001230301 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange tr ( 791) 2679 638.7 2.7e-182 NP_000074 (OMIM: 118425,160800,255700) chloride ch ( 988) 702 174.3 2.2e-42 XP_011510703 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 835) 669 166.5 4.2e-40 XP_006713552 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 863) 669 166.5 4.3e-40 NP_001164560 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 869) 669 166.5 4.3e-40 NP_004357 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ch ( 898) 669 166.5 4.5e-40 NP_001164559 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 854) 667 166.0 5.9e-40 NP_000076 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ch ( 687) 561 141.0 1.6e-32 NP_001036169 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 686) 549 138.2 1.1e-31 NP_004061 (OMIM: 602024,613090) chloride channel p ( 687) 549 138.2 1.1e-31 NP_001244068 (OMIM: 602024,613090) chloride channe ( 644) 530 133.7 2.3e-30 NP_001164558 (OMIM: 600570,607628,615651) chloride ( 881) 516 130.5 2.9e-29 XP_011520656 (OMIM: 166600,602727,611490) PREDICTE ( 747) 452 115.4 8.6e-25 NP_001107803 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl( ( 781) 452 115.5 8.9e-25 NP_001278 (OMIM: 166600,602727,611490) H(+)/Cl(-) ( 805) 452 115.5 9.1e-25 XP_016867229 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 838) 433 111.0 2.1e-23 XP_016867228 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 846) 341 89.4 6.7e-17 NP_001159417 (OMIM: 602023,607364,613090) chloride ( 517) 335 87.9 1.2e-16 XP_011514084 (OMIM: 118425,160800,255700) PREDICTE ( 570) 313 82.7 4.7e-15 XP_006713553 (OMIM: 600570,607628,615651) PREDICTE ( 512) 274 73.5 2.5e-12 NP_001243888 (OMIM: 602726) chloride transport pro ( 847) 200 56.3 6.4e-07 NP_001277 (OMIM: 602726) chloride transport protei ( 869) 200 56.3 6.5e-07 >>NP_001821 (OMIM: 300114,302910) H(+)/Cl(-) exchange tr (760 aa) initn: 5105 init1: 5105 opt: 5105 Z-score: 6474.8 bits: 1208.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5105; 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NP_001 IYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRNDPPLAVLTQDNMTVDDIENMINETS 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 pF1KE5 YNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHP ::::::..:..:.::.::: ::.: .::..::..:::::..: . :... : :::.::.: NP_001 YNGFPVIMSKESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRP 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 pF1KE5 LKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMA :::: ::..:::::::::::: ::::::::::::::::..:::::::::::.:::::: : NP_001 LKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTA 730 740 750 760 770 780 760 pF1KE5 NQDPESIMFN :::: ::::: NP_001 NQDPASIMFN 790 >>NP_001820 (OMIM: 600580) H(+)/Cl(-) exchange transport (818 aa) initn: 4220 init1: 4220 opt: 4220 Z-score: 5350.5 bits: 1000.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4220; 78.2% identity (94.9% similar) in 760 aa overlap (1-760:59-818) 10 20 30 pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDF :.:.:....: .:.:.::::.: ::::.:: NP_001 LDGAGVIMDFQTSEDDNLLDGDTAVGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDF 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 HTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDL :::::.::: .: .:::.:.::.::: ::. ::: ::::::.:. : :: .:.:::.::. 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XP_011 IKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGIGVYSAIWQLCLALIFKIIMTV 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 FTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVTPGLYA ::::.:.::::::::::.::::::.:::.::::::.::::.::..::. ::::.:::::: XP_011 FTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFIFKEWCEVGADCITPGLYA 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 MVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIYEAHIH :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::..:::::.::::.::::::::. XP_011 MVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIR 550 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 LNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVV ::::::::.:.:::: :::.:::::::..:::.:::::.:::.:.:..:.::.::::::. XP_011 LNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRNDPPLAVLTQDNMTVDDIENMINETSYNGFPVI 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 pF1KE5 VSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRIL .:..:.::.::: ::.: .::..::..:::::..: . :... : :::.::.::::: :: XP_011 MSKESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSIL 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 pF1KE5 NLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESI ..:::::::::::: ::::::::::::::::..: .:::::::..:.:. :. XP_011 DMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQLKQHVEPLA 730 740 750 760 770 780 760 pF1KE5 MFN XP_011 PPWHYNKKRYPPAYGPDGKPRPRFNNVQLNLTDEEREETEEEVYLLNSTTL 790 800 810 820 830 >>XP_005262783 (OMIM: 600580) PREDICTED: H(+)/Cl(-) exch (839 aa) initn: 4071 init1: 4071 opt: 4118 Z-score: 5220.8 bits: 976.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4118; 77.2% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (1-749:32-780) 10 20 30 pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDF :.:.:....: .:.:.::::.: ::::.:: XP_005 DASSDPYLPYDGGGDSIPLRELHKRGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDF 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 HTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDL :::::.::: .: .:::.:.::.::: ::. ::: ::::::.:. : :: .:.:::.::. XP_005 HTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDI 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 AVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYI :.:::::::::.::::.::.:::::: :::::::.::::: :. :.::...:.:: ..:: XP_005 AADWMTDLKEGICLSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYI 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 LNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVT .::.:::.::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: XP_005 MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTIT 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 LVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGA :::.:.::::::::::::::::::::.:: :: ::: ::.:.:::::::.:::::::::: XP_005 LVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGA 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMA :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::. 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XP_005 IYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRNDPPLAVLTQDNMTVDDIENMINETS 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 pF1KE5 YNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHP ::::::..:..:.::.::: ::.: .::..::..:::::..: . :... : :::.::.: XP_005 YNGFPVIMSKESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRP 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 pF1KE5 LKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMA :::: ::..:::::::::::: ::::::::::::::::..: .:::::::..:.:. :. 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NP_776 HTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDI 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 AVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYI :.:::::::::.::::.::.:::::: :::::::.::::: :. :.::...:.:: ..:: NP_776 AADWMTDLKEGICLSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYI 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 LNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVT .::.:::.::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: NP_776 MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTIT 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 LVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGA :::.:.::::::::::::::::::::.:: :: ::: ::.:.:::::::.:::::::::: NP_776 LVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGA 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMA :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::. 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