FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6766, 590 aa 1>>>pF1KE6766 590 - 590 aa - 590 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9691+/-0.000348; mu= 21.5171+/- 0.022 mean_var=81.2568+/-16.598, 0's: 0 Z-trim(114.8): 102 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.142280 statistics sampled from 24762 (24868) to 24762 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16 Scan time: 7.930 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001188467 (OMIM: 300003) arylsulfatase F precur ( 590) 4127 857.2 0 NP_001188468 (OMIM: 300003) arylsulfatase F precur ( 590) 4127 857.2 0 NP_004033 (OMIM: 300003) arylsulfatase F precursor ( 590) 4127 857.2 0 XP_011543824 (OMIM: 300003) PREDICTED: arylsulfata ( 607) 4127 857.2 0 NP_001660 (OMIM: 300002) arylsulfatase D isoform a ( 593) 2464 515.9 1.5e-145 NP_001011719 (OMIM: 300586) arylsulfatase H [Homo ( 562) 2415 505.8 1.6e-142 NP_000038 (OMIM: 300180,302950) arylsulfatase E is ( 589) 2363 495.1 2.6e-139 XP_005274576 (OMIM: 300180,302950) PREDICTED: aryl ( 589) 2363 495.1 2.6e-139 XP_005274575 (OMIM: 300180,302950) PREDICTED: aryl ( 598) 2363 495.1 2.7e-139 NP_001269557 (OMIM: 300180,302950) arylsulfatase E ( 614) 2363 495.2 2.7e-139 XP_016885014 (OMIM: 300180,302950) PREDICTED: aryl ( 614) 2363 495.2 2.7e-139 XP_005274578 (OMIM: 300180,302950) PREDICTED: aryl ( 535) 2205 462.7 1.4e-129 NP_001269560 (OMIM: 300180,302950) arylsulfatase E ( 544) 2205 462.7 1.4e-129 XP_016885016 (OMIM: 300003) PREDICTED: arylsulfata ( 561) 2019 424.5 4.6e-118 XP_011543825 (OMIM: 300003) PREDICTED: arylsulfata ( 578) 2019 424.5 4.7e-118 XP_005274572 (OMIM: 300002) PREDICTED: arylsulfata ( 475) 1986 417.7 4.5e-116 NP_000342 (OMIM: 300747,308100) steryl-sulfatase i ( 583) 1939 408.1 4.1e-113 NP_001307682 (OMIM: 300747,308100) steryl-sulfatas ( 578) 1934 407.1 8.4e-113 NP_001307683 (OMIM: 300747,308100) steryl-sulfatas ( 578) 1934 407.1 8.4e-113 NP_001307680 (OMIM: 300747,308100) steryl-sulfatas ( 590) 1934 407.1 8.5e-113 NP_001307679 (OMIM: 300747,308100) steryl-sulfatas ( 590) 1934 407.1 8.5e-113 NP_001307681 (OMIM: 300747,308100) steryl-sulfatas ( 590) 1934 407.1 8.5e-113 XP_016885017 (OMIM: 300003) PREDICTED: arylsulfata ( 297) 1918 403.5 5.1e-112 XP_011543826 (OMIM: 300003) PREDICTED: arylsulfata ( 462) 1917 403.5 8e-112 XP_005274571 (OMIM: 300002) PREDICTED: arylsulfata ( 548) 1230 262.5 2.6e-69 XP_011543823 (OMIM: 300180,302950) PREDICTED: aryl ( 402) 1226 261.6 3.6e-69 XP_016885015 (OMIM: 300180,302950) PREDICTED: aryl ( 427) 1226 261.6 3.8e-69 NP_033667 (OMIM: 300002) arylsulfatase D isoform b ( 382) 1222 260.7 6.2e-69 NP_001310472 (OMIM: 253000,612222) N-acetylgalacto ( 337) 474 107.2 9.4e-23 XP_016878602 (OMIM: 253000,612222) PREDICTED: N-ac ( 390) 467 105.8 2.8e-22 NP_000503 (OMIM: 253000,612222) N-acetylgalactosam ( 522) 400 92.2 4.8e-18 XP_005256358 (OMIM: 253000,612222) PREDICTED: N-ac ( 575) 400 92.2 5.1e-18 XP_006721842 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 329) 394 90.7 8.1e-18 XP_005257229 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 344) 394 90.7 8.4e-18 XP_011522847 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 413) 394 90.8 9.5e-18 XP_016879857 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 413) 394 90.8 9.5e-18 XP_011522846 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 427) 394 90.8 9.7e-18 XP_011522845 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 427) 394 90.8 9.7e-18 XP_016879856 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 461) 394 90.9 1e-17 XP_016879855 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 461) 394 90.9 1e-17 XP_011522843 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 488) 394 90.9 1.1e-17 XP_011522844 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 488) 394 90.9 1.1e-17 NP_001254656 (OMIM: 610008) arylsulfatase G [Homo ( 525) 394 90.9 1.1e-17 XP_016879850 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 525) 394 90.9 1.1e-17 NP_055775 (OMIM: 610008) arylsulfatase G [Homo sap ( 525) 394 90.9 1.1e-17 XP_016879854 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 525) 394 90.9 1.1e-17 XP_016879852 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 525) 394 90.9 1.1e-17 XP_016879853 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 525) 394 90.9 1.1e-17 XP_005257227 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 525) 394 90.9 1.1e-17 XP_016879851 (OMIM: 610008) PREDICTED: arylsulfata ( 525) 394 90.9 1.1e-17 >>NP_001188467 (OMIM: 300003) arylsulfatase F precursor (590 aa) initn: 4127 init1: 4127 opt: 4127 Z-score: 4578.9 bits: 857.2 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4127; 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99.8% identity (100.0% similar) in 590 aa overlap (1-590:18-607) 10 20 30 40 pF1KE6 MRPRRPLVFMSLVCALLNTCQAHRVHDDKPNIVLIMVDDLGIG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MDSKPILVQQEGIPSCTMRPRRPLVFMSLVCALLNTCQAHRVHDDKPNIVLIMVDDLGIG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 DLGCYGNDTMRTPHIDRLAREGVRLTQHISAASLCSPSRSAFLTGRYPIRSGMVSSGNRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DLGCYGNDTMRTPHIDRLAREGVRLTQHISAASLCSPSRSAFLTGRYPIRSGMVSSGNRR 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 VIQNLAVPAGLPLNETTLAALLKKQGYSTGLIGKWHQGLNCDSRSDQCHHPYNYGFDYYY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VIQNLAVPAGLPLNETTLAALLKKQGYSTGLIGKWHQGLNCDSRSDQCHHPYNYGFDYYY 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 GMPFTLVDSCWPDPSRNTELAFESQLWLCVQLVAIAILTLTFGKLSGWVSVPWLLIFSMI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GMPFTLVDSCWPDPSRNTELAFESQLWLCVQLVAIAILTLTFGKLSGWVSVPWLLIFSMI 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 LFIFLLGYAWFSSHTSPLYWDCLLMRGHEITEQPMKAERAGSIMVKEAISFLERHSKETF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LFIFLLGYAWFSSHTSPLYWDCLLMRGHEITEQPMKAERAGSIMVKEAISFLERHSKETF 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 LLFFSFLHVHTPLPTTDDFTGTSKHGLYGDNVEEMDSMVGKILDAIDDFGLRNNTLVYFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LLFFSFLHVHTPLPTTDDFTGTSKHGLYGDNVEEMDSMVGKILDAIDDFGLRNNTLVYFT 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 SDHGGHLEARRGHAQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIVRWPGKVPAGRLIKEPTSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SDHGGHLEARRGHAQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIVRWPGKVPAGRLIKEPTSL 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 MDILPTVASVSGGSLPQDRVIDGRDLMPLLQGNVRHSEHEFLFHYCGSYLHAVRWIPKDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MDILPTVASVSGGSLPQDRVIDGRDLMPLLQGNVRHSEHEFLFHYCGSYLHAVRWIPKDD 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 SGSVWKAHYVTPVFQPPASGGCYVTSLCRCFGEQVTYHNPPLLFDLSRDPSESTPLTPAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SGSVWKAHYVTPVFQPPASGGCYVTSLCRCFGEQVTYHNPPLLFDLSRDPSESTPLTPAT 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 EPLYDFVIKKVANALKEHQETIVPVTYQLSELNQGRTWLKPCCGVFPFCLCDKEEEVSQP :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EPLHDFVIKKVANALKEHQETIVPVTYQLSELNQGRTWLKPCCGVFPFCLCDKEEEVSQP 550 560 570 580 590 600 590 pF1KE6 RGPNEKR ::::::: XP_011 RGPNEKR >>NP_001660 (OMIM: 300002) arylsulfatase D isoform alpha (593 aa) initn: 2366 init1: 1982 opt: 2464 Z-score: 2734.0 bits: 515.9 E(85289): 1.5e-145 Smith-Waterman score: 2464; 60.1% identity (82.1% similar) in 577 aa overlap (4-577:15-588) 10 20 30 40 pF1KE6 MRPRRPLVFMSLVCALLNTCQAHRVHDDKPNIVLIMVDDLGIGDLGCYG : : . ..: ::.::. . .. ::::.:::.:::: ::::::: NP_001 MRSAARRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 NDTMRTPHIDRLAREGVRLTQHISAASLCSPSRSAFLTGRYPIRSGMVSSGNRRVIQNLA :.:.:::.::.::.::::::::..:: ::.:::.::::::. .:::: .:.. :..: : NP_001 NNTLRTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMDASNGYRALQWNA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 VPAGLPLNETTLAALLKKQGYSTGLIGKWHQGLNCDSRSDQCHHPYNYGFDYYYGMPFTL .::: ::::.: .:...::.::::::::::.:: ::.:.:::: :.::::.::::::: NP_001 GSGGLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 VDSCWPDPSRNTEL--AFESQLWLCVQLVAIAILTLTFGKLSGWVSVPWLLIFSMILFIF ...: ::.: :. :...::: .:..:..::::. :. :. :: . .: NP_001 TNDC--DPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFSVSARAVTGMAGVGC 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 LLGYAWFSSHTSPLYWDCLLMRGHEITEQPMKAERAGSIMVKEAISFLERHSKETFLLFF :. .:.:: :.:.:::.:..::::: :...:.:.:::.:..:::.. ::::. NP_001 LFFISWYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIERHKHGPFLLFL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 SFLHVHTPLPTTDDFTGTSKHGLYGDNVEEMDSMVGKILDAIDDFGLRNNTLVYFTSDHG :.:::: :: ::. : : :.:::::::::::: ..::.:.::.: ::.:.:..::::::: NP_001 SLLHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 GHLEARRGHAQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIVRWPGKVPAGRLIKEPTSLMDIL :::::: ::.::::::::::::::::::::::::::: .::: .::::.: :::::::.. NP_001 GHLEARDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVF 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 PTVASVSGGSLPQDRVIDGRDLMPLLQGNVRHSEHEFLFHYCGSYLHAVRWIPKDDSGSV :::... :: .::::::::..:.::::: .: :::::::::..:::.:: :: :::: NP_001 PTVVQLVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKD-SGSV 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 WKAHYVTPVFQPPASGGCYVTSLCRCFGEQVTYHNPPLLFDLSRDPSESTPLTPATEPLY ::.::.:: :.: ..:.:: ..: : :: ::.: :::::::::::::. :::: .:::: NP_001 WKVHYTTPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPLLFDLSRDPSEARPLTPDSEPLY 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 DFVIKKVANALKEHQETIVPVTYQLSELN-QGRTWLKPCCGVFPFCLCDKEEEVSQPRGP :: .:. :..::..:. :: :.: : . ::.:::: :::: : .. NP_001 HAVIARVGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPFCSCHEDGDGTP 540 550 560 570 580 590 590 pF1KE6 NEKR >>NP_001011719 (OMIM: 300586) arylsulfatase H [Homo sapi (562 aa) initn: 2144 init1: 1519 opt: 2415 Z-score: 2679.9 bits: 505.8 E(85289): 1.6e-142 Smith-Waterman score: 2415; 60.2% identity (82.1% similar) in 560 aa overlap (29-586:6-562) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MRPRRPLVFMSLVCALLNTCQAHRVHDDKPNIVLIMVDDLGIGDLGCYGNDTMRTPHIDR .:::::.:.::::.::: ::::... ::.::: NP_001 MTRNARPNIVLLMADDLGVGDLCCYGNNSVSTPNIDR 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KE6 LAREGVRLTQHISAASLCSPSRSAFLTGRYPIRSGMVSSGN-RRVIQNLAVPAGLPLNET :: ::::::::..:::.:.:::.:::::::::::::::. : :.. :. .::: ::: NP_001 LASEGVRLTQHLAAASMCTPSRAAFLTGRYPIRSGMVSAYNLNRAFTWLGGSGGLPTNET 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 TLAALLKKQGYSTGLIGKWHQGLNCDSRSDQCHHPYNYGFDYYYGMPFTLVDSCWPDPSR :.: ::...:: :::::::: ::.: ::.:.:.:: :.:: :.::.:: :...: . . NP_001 TFAKLLQHRGYRTGLIGKWHLGLSCASRNDHCYHPLNHGFHYFYGVPFGLLSDCQASKTP 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 NTELAFESQLWLCVQLVAIAILTLTFGKLSGWVSVPWLLIFSMILFIFLLGYAWFSSHTS . . .. .::. . .:.. . : . :.. : :::: .:: . :. ::. .:.::. NP_001 ELHRWLRIKLWISTVALALVPFLLLIPKFARWFSVPWKVIFVFALLAFLFFTSWYSSYGF 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 PLYWDCLLMRGHEITEQPMKAERAGSIMVKEAISFLERHSKETFLLFFSFLHVHTPLPTT :.:.:::.::: .:::: :...:.:.:::..:.::...: :::::::::::::: . NP_001 TRRWNCILMRNHEIIQQPMKEEKVASLMLKEALAFIERYKREPFLLFFSFLHVHTPLISK 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 DDFTGTSKHGLYGDNVEEMDSMVGKILDAIDDFGLRNNTLVYFTSDHGGHLEARRGHAQL :.: ::.: ::::::::: ::::::::.:. : :.::::::::.::::: : .:: NP_001 KKFVGRSKYGRYGDNVEEMDWMVGKILDALDQERLANHTLVYFTSDNGGHLEPLDGAVQL 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 GGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIVRWPGKVPAGRLIKEPTSLMDILPTVASVSGGSLP ::::::::::::::::::::::::: :::. . :::.:.:::::::: ::.. ..:: : NP_001 GGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFRWPSVLEAGRVINEPTSLMDIYPTLSYIGGGILS 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 QDRVIDGRDLMPLLQGNVRHSEHEFLFHYCGSYLHAVRWIPKDDSGSVWKAHYVTPVFQP :::::::..:::::.: . ::.::::::::: :::.::: :: ..::::::::: : : NP_001 QDRVIDGQNLMPLLEGRASHSDHEFLFHYCGVYLHTVRWHQKD-CATVWKAHYVTPKFYP 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 PASGGCYVTSLCRCFGEQVTYHNPPLLFDLSRDPSESTPLTPATEPLYDFVIKKVANALK ..:.:: ...: : :. ::::.::::::.::::::. ::.: .:::.: ::::. :.. NP_001 EGTGACYGSGICSCSGD-VTYHDPPLLFDISRDPSEALPLNPDNEPLFDSVIKKMEAAIR 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 EHQETIVPVTYQLSELNQ-GRTWLKPCCGVFPFCLCDKEEEVSQPRGPNEKR ::..:..:: :.: .: . ::.::::.:::: ::::... : .: NP_001 EHRRTLTPVPQQFSVFNTIWKPWLQPCCGTFPFCGCDKEDDI-LPMAP 520 530 540 550 560 >>NP_000038 (OMIM: 300180,302950) arylsulfatase E isofor (589 aa) initn: 2224 init1: 1856 opt: 2363 Z-score: 2622.0 bits: 495.1 E(85289): 2.6e-139 Smith-Waterman score: 2363; 59.2% identity (82.6% similar) in 559 aa overlap (25-579:33-587) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MRPRRPLVFMSLVCALLNTCQAHRVHDDKPNIVLIMVDDLGIGDLGCYGNDTMR . ..:::.:.:.:::::::.:::::.::: NP_000 HLHHSCLCFRSWLPAMLAVLLSLAPSASSDISASRPNILLLMADDLGIGDIGCYGNNTMR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 TPHIDRLAREGVRLTQHISAASLCSPSRSAFLTGRYPIRSGMVSSGNRRVIQNLAVPAGL ::.:::::..::.:::::::::::.:::.::::::::.::::::: . ::.: .. .:: NP_000 TPNIDRLAEDGVKLTQHISAASLCTPSRAAFLTGRYPVRSGMVSSIGYRVLQWTGASGGL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 PLNETTLAALLKKQGYSTGLIGKWHQGLNCDSRSDQCHHPYNYGFDYYYGMPFTLVDSC- : ::::.: .::..::.:::::::: ::::.: ::.:::: ..:::..:::::.:. .: NP_000 PTNETTFAKILKEKGYATGLIGKWHLGLNCESASDHCHHPLHHGFDHFYGMPFSLMGDCA 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 -WPDPSRNTELAFESQLWLCVQLVAIAILTLTFGKLSGWVSVPWL-LIFSMILFIFLLGY : . ..: :..: . :..:.. :::. :::. . : :. .:.: . ..::. NP_000 RWELSEKRVNL--EQKLNFLFQVLALVALTLVAGKLTHLIPVSWMPVIWSALSAVLLLAS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 AWFSSHTSPLYWDCLLMRGHEITEQPMKAERAGSIMVKEAISFLERHSKETFLLFFSFLH ..: . .. ::.:::.: :::::: .:. ....:. :::.:... :::: :::: NP_000 SYFVGALI-VHADCFLMRNHTITEQPMCFQRTTPLILQEVASFLKRNKHGPFLLFVSFLH 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 VHTPLPTTDDFTGTSKHGLYGDNVEEMDSMVGKILDAIDDFGLRNNTLVYFTSDHGGHLE :: :: : ..: : : :::::::::::: :::.:::..: :: :.::.:::::::: :: NP_000 VHIPLITMENFLGKSLHGLYGDNVEEMDWMVGRILDTLDVEGLSNSTLIYFTSDHGGSLE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 ARRGHAQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIVRWPGKVPAGRLIKEPTSLMDILPTVA . :..: ::::::::::::::::::::::::: :::: .::::.: :::::::..:::. 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