Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5847
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5847, 2253 aa
1>>>pF1KE5847 2253 - 2253 aa - 2253 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1769+/-0.000508; mu= 22.7018+/- 0.032
mean_var=112.7434+/-22.907, 0's: 0 Z-trim(111.5): 83 B-trim: 195 in 1/51
Lambda= 0.120789
statistics sampled from 20064 (20147) to 20064 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 18.220
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006062 (OMIM: 604670) polycystic kidney disease (2253) 15081 2641.0 0
NP_001265354 (OMIM: 607894) polycystic kidney dise (1774) 688 132.7 3.8e-29
NP_443124 (OMIM: 607894) polycystic kidney disease (2459) 688 132.8 4.8e-29
XP_016878692 (OMIM: 607895) PREDICTED: polycystic (1022) 636 123.5 1.3e-26
XP_016878691 (OMIM: 607895) PREDICTED: polycystic (1224) 636 123.5 1.5e-26
XP_016878690 (OMIM: 607895) PREDICTED: polycystic (1352) 636 123.6 1.6e-26
NP_853514 (OMIM: 607895) polycystic kidney disease (1732) 636 123.7 2e-26
XP_016878693 (OMIM: 607895) PREDICTED: polycystic ( 945) 584 114.4 6.7e-24
NP_612152 (OMIM: 609721) polycystic kidney disease (2849) 566 111.6 1.4e-22
XP_016867287 (OMIM: 609721) PREDICTED: polycystic (2920) 566 111.7 1.4e-22
NP_057196 (OMIM: 604532) polycystic kidney disease ( 805) 407 83.5 1.2e-14
NP_001240766 (OMIM: 604532) polycystic kidney dise ( 758) 406 83.3 1.2e-14
XP_011538627 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic ( 687) 401 82.4 2.1e-14
XP_011538625 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic ( 710) 401 82.4 2.2e-14
XP_016872364 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic ( 710) 401 82.4 2.2e-14
NP_000288 (OMIM: 173910,613095) polycystin-2 [Homo ( 968) 390 80.6 1e-13
XP_011530332 (OMIM: 173910,613095) PREDICTED: poly ( 688) 364 75.9 1.8e-12
XP_011530331 (OMIM: 173910,613095) PREDICTED: poly ( 728) 364 75.9 1.9e-12
XP_016864832 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 604) 353 74.0 6.3e-12
NP_055201 (OMIM: 604669) polycystic kidney disease ( 613) 353 74.0 6.4e-12
NP_001287850 (OMIM: 604669) polycystic kidney dise ( 624) 353 74.0 6.5e-12
XP_011541623 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 564) 331 70.1 8.6e-11
XP_016864833 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 564) 331 70.1 8.6e-11
XP_011541620 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 590) 331 70.1 8.9e-11
XP_005255427 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (3288) 320 68.8 1.2e-09
XP_016878774 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (3327) 320 68.8 1.2e-09
XP_011520839 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (3329) 320 68.8 1.2e-09
XP_011520837 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (3603) 320 68.9 1.3e-09
XP_011520836 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4241) 320 68.9 1.5e-09
XP_011520834 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4287) 320 68.9 1.5e-09
NP_000287 (OMIM: 173900,601313) polycystin-1 isofo (4302) 320 68.9 1.5e-09
NP_001009944 (OMIM: 173900,601313) polycystin-1 is (4303) 320 68.9 1.5e-09
XP_011520832 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4311) 320 68.9 1.5e-09
XP_011520831 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4320) 320 68.9 1.5e-09
XP_011520830 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4321) 320 68.9 1.5e-09
XP_016872365 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic ( 649) 252 56.4 1.3e-06
XP_016864834 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 550) 223 51.3 3.9e-05
NP_001243083 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 617) 216 50.1 9.9e-05
NP_001243082 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 642) 216 50.1 0.0001
NP_001307790 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 645) 216 50.1 0.0001
NP_000689 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5-lip ( 674) 216 50.1 0.00011
NP_001245378 (OMIM: 604669) polycystic kidney dise ( 523) 206 48.3 0.00029
NP_001166600 (OMIM: 613072,613079) lipoxygenase ho ( 457) 202 47.5 0.00043
NP_001138945 (OMIM: 613072,613079) lipoxygenase ho ( 512) 202 47.6 0.00047
XP_011524113 (OMIM: 613072,613079) PREDICTED: lipo ( 512) 202 47.6 0.00047
XP_011524112 (OMIM: 613072,613079) PREDICTED: lipo ( 529) 202 47.6 0.00048
NP_001294942 (OMIM: 613072,613079) lipoxygenase ho (1011) 202 47.8 0.00078
XP_011524109 (OMIM: 613072,613079) PREDICTED: lipo (1066) 202 47.9 0.00081
NP_001138944 (OMIM: 613072,613079) lipoxygenase ho (1114) 202 47.9 0.00083
XP_006722453 (OMIM: 613072,613079) PREDICTED: lipo (1162) 202 47.9 0.00086
>>NP_006062 (OMIM: 604670) polycystic kidney disease and (2253 aa)
initn: 15081 init1: 15081 opt: 15081 Z-score: 14198.1 bits: 2641.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 15081; 100.0% identity (100.0% similar) in 2253 aa overlap (1-2253:1-2253)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRPGPALLLLGVGLSLSVGRLPLPPVPRGAQAAVSGAPGGLLRGAPGLGVRGGRALLSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MRPGPALLLLGVGLSLSVGRLPLPPVPRGAQAAVSGAPGGLLRGAPGLGVRGGRALLSLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PSAVRAGGAVLSGRGSLCFPHGGTGRRWYCLDLRVLLSAQRLPWPAAPALALVDLQLSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PSAVRAGGAVLSGRGSLCFPHGGTGRRWYCLDLRVLLSAQRLPWPAAPALALVDLQLSAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GGRLSLTWSVRLPRSPGRLAWAFRLRLLGPGAARPASPAARVSPRSAAPGPRPQQGFVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GGRLSLTWSVRLPRSPGRLAWAFRLRLLGPGAARPASPAARVSPRSAAPGPRPQQGFVAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TECPTDGPARVMLQAVNSSSHRAVESSVSCQINACVIQRVRINTDQKGAPVRLSMQAEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TECPTDGPARVMLQAVNSSSHRAVESSVSCQINACVIQRVRINTDQKGAPVRLSMQAEAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 INASVQLDCPAARAIAQYWQVFSVPAVGQAPDWTQPLDLPQLEIRNSPLFIHIPNNSLQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 INASVQLDCPAARAIAQYWQVFSVPAVGQAPDWTQPLDLPQLEIRNSPLFIHIPNNSLQW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GVYVFNFTVSITTGNPKMPEVKDSDAVYVWIVRSSLQAVMLGDANITANFTEQLILDGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GVYVFNFTVSITTGNPKMPEVKDSDAVYVWIVRSSLQAVMLGDANITANFTEQLILDGST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 SSDPDADSPLQGLQFFWYCTTDPRNYGGDRIILGSKEVCHPEQANLKWPWASGPVLTLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SSDPDADSPLQGLQFFWYCTTDPRNYGGDRIILGSKEVCHPEQANLKWPWASGPVLTLLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 ETLKGDHVYFFRMVIRKDSRTAFSDKRVHVLQGPKAIAHITCIENCERNFIVSDRFSLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ETLKGDHVYFFRMVIRKDSRTAFSDKRVHVLQGPKAIAHITCIENCERNFIVSDRFSLFL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 NCTNCASRDFYKWSILSSSGGEMLFDWMGETVTGRNGAYLSIKAFAFRHFLEAEFSISLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NCTNCASRDFYKWSILSSSGGEMLFDWMGETVTGRNGAYLSIKAFAFRHFLEAEFSISLY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LACWSGVTSVFRHSFIINHGPQIGECKINPAKGIALITKFVVQCSNFRDKHVPLTYKIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LACWSGVTSVFRHSFIINHGPQIGECKINPAKGIALITKFVVQCSNFRDKHVPLTYKIIV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 SDLHSVGEISSVKENTLGTILYLGPQSTVPPSFLPVGMLASQYGLKIYAQVYDSLGAFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SDLHSVGEISSVKENTLGTILYLGPQSTVPPSFLPVGMLASQYGLKIYAQVYDSLGAFSQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 VTLHATAQAPTDKNSSKTVLNQLLSFTVGPSSLLSTLIQKKDFLPAGYLLYIVASVLNNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VTLHATAQAPTDKNSSKTVLNQLLSFTVGPSSLLSTLIQKKDFLPAGYLLYIVASVLNNM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 KTELPLRDDRVNLRKHLIDQSFLLPVSTLVEIGQVVMTITKLTQKPSEFTWDAQKRATMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KTELPLRDDRVNLRKHLIDQSFLLPVSTLVEIGQVVMTITKLTQKPSEFTWDAQKRATMR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 VWQANQALQEYQQKDKRFRSEQIEIVSTGILMSLSNILKMTSPHQVVKDPFYVIESLSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VWQANQALQEYQQKDKRFRSEQIEIVSTGILMSLSNILKMTSPHQVVKDPFYVIESLSDT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 ILANKVPGNKTTSMRTPNFNMYVKKVEKWGINQLFRNEKHCRNCFYPTLNVSSVPGLSAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ILANKVPGNKTTSMRTPNFNMYVKKVEKWGINQLFRNEKHCRNCFYPTLNVSSVPGLSAN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 GPISTMFCDFTNDLFPWLNDQENTSVEVSGFRMTGVADNGSVLEITPDVAEVYLVRKNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GPISTMFCDFTNDLFPWLNDQENTSVEVSGFRMTGVADNGSVLEITPDVAEVYLVRKNLT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE5 FAAFNLTVGPNSEVDGSLKKTTGGFSFQVDSTVLREVLVHIVTEVMVLFTVLVYTGSQIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FAAFNLTVGPNSEVDGSLKKTTGGFSFQVDSTVLREVLVHIVTEVMVLFTVLVYTGSQIT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE5 PTALVATFLVPHDIPPFASQSALFDPACTVKKARVVCLPVSLLQLIAQHSHSPHCTVSIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PTALVATFLVPHDIPPFASQSALFDPACTVKKARVVCLPVSLLQLIAQHSHSPHCTVSIV
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE5 LQAPRFVMKLNDKLVRISIFSVQCLDMYGIQSEWREGYCILGEKTSWYEVHCICKNVVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LQAPRFVMKLNDKLVRISIFSVQCLDMYGIQSEWREGYCILGEKTSWYEVHCICKNVVRA
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE5 RRQLGTIGLTGIHLHTHYVMAKVIVIPNPVDLRLNIIKSLHQNPVTLFTVLFIILLYVGL
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NP_006 RRQLGTIGLTGIHLHTHYVMAKVIVIPNPVDLRLNIIKSLHQNPVTLFTVLFIILLYVGL
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE5 AFWALYRDEMDQHLRGHVIVLPDNDPYDNLCYLVTIFTGSRWGSGTRANVFVQLRGTVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AFWALYRDEMDQHLRGHVIVLPDNDPYDNLCYLVTIFTGSRWGSGTRANVFVQLRGTVST
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE5 SDVHCLSHPHFTTLYRGSINTFLLTTKSDLGDIHSIRVWHNNEGRSPSWYLSRIKVENLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SDVHCLSHPHFTTLYRGSINTFLLTTKSDLGDIHSIRVWHNNEGRSPSWYLSRIKVENLF
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pF1KE5 SRHIWLFICQKWLSVDTTLDRTFHVTHPDERLTRKDFFFIDVSSNLRKNHMWFSIFASVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SRHIWLFICQKWLSVDTTLDRTFHVTHPDERLTRKDFFFIDVSSNLRKNHMWFSIFASVV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AKTFNRLQRLSCCLAMLLSSLLCNIMFFNLNRQEQTESRERKYMRSMMIGIESVLITIPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QLLITFLFTCSQRKPQADLKEVSPQKHPLMSEASEHWEEYLRKWHAYETAKVHPREVAKP
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1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE5 ASKGKPRLPKASPKATSKPKHRHRKAQIKTPETLGPNTNSNNNIEDDQDVHSEQHPSQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ASKGKPRLPKASPKATSKPKHRHRKAQIKTPETLGPNTNSNNNIEDDQDVHSEQHPSQKD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE5 LQQLKKKPRIVLPWWCVYVAWFLVFATSSISSFFIVFYGLTYGYDKSIEWLFASFCSFCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LQQLKKKPRIVLPWWCVYVAWFLVFATSSISSFFIVFYGLTYGYDKSIEWLFASFCSFCQ
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE5 SVLLVQPSKIILLSGFRTNKPKYCKNLSWSTKYKYTEIRLDGMRMHPEEMQRIHDQIVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SVLLVQPSKIILLSGFRTNKPKYCKNLSWSTKYKYTEIRLDGMRMHPEEMQRIHDQIVRI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE5 RGTRMYQPLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RGTRMYQPLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYN
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE5 QFIRDRFSMDLATVTKLEDIYRWLNSVLLPLLHNDLNPTFLPESSSKILGLPLMRQVRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QFIRDRFSMDLATVTKLEDIYRWLNSVLLPLLHNDLNPTFLPESSSKILGLPLMRQVRAK
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE5 SSEKMCLPAEKFVQNSIRREIHCHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SSEKMCLPAEKFVQNSIRREIHCHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKP
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1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE5 QGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE5 FNPDINLFCSISVIFEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLAYVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FNPDINLFCSISVIFEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLAYVV
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE5 DEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPF
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NP_006 DEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPF
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pF1KE5 HAVSQVDHIMRIILGFLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYF
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NP_006 HAVSQVDHIMRIILGFLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYF
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE5 FVYMAFGYLVFGQHEWNYSNLIHSTQTVFSYCVSAFQNTEFSNNRILGVLFLSSFMLVMI
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NP_006 FVYMAFGYLVFGQHEWNYSNLIHSTQTVFSYCVSAFQNTEFSNNRILGVLFLSSFMLVMI
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
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NP_006 CVLINLFQAVILSAYEEMKQPVYEEPSDEVEAMTYLCRKLRTMFSFLTSQSKAKDEPEFF
2170 2180 2190 2200 2210 2220
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NP_006 IDMLYGQPEKNSHRYLGLKTRNINGKKMVYLVV
2230 2240 2250
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.::.: ... : . .. . : .:. .: :.. . . : .: ..
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: . : .: . : : :.:.:: .. . : : : ..:.:.. . :
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:.: .: . ... .. ..: . .:.: .:: .:.. . .:..:: . : :
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.: .. . .. :.. . :::: . .: :. : . :.: .. :.: .:.:
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. .: .. :: .. ..: :.:.:.: . .:... . . :. : :.. .
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..::: :. . ..: : . .: .. . .. : :
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. . : ::: . : . ...: . : : : .. . . :
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:: : : :. : .:. .: : .. : .: .:: :..::.:....
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.:. : ::...: : . ..: . ....:::.. :: . ..::
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...:: .: .:: . .: :: ::::. . ::::..:: : :..: ..: : : : .
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. : :.:..:::. : .::..: :. ..: . .::. .:.... .:.:.:::
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. . ..:.:.::.:::...:: ..: .:::... . :.. .. . . .:::.:
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: .. .:..:::. .: .. . :.: :.:
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: :. .: . .. ::: .: .
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: . :. . .. ::. ...: : . : ... .. :. .. :..
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... .... :. . :.. . :..: :. :::::. :.:.:: :::....
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:: ..::: :: .:..::.. :: .:....:: :.. ...: . :.
NP_001 FFTMLYGLHYGRASSLRWLISMAVSFVESMFVTQPLKVLGFAAF------FALVLKRVDD
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pF1KE5 YKYTEIRLDGMRMHPEEMQRIHDQIVRIRGTRMYQPLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLS
. : : : . :. . .. . : . .::: :. .: . ...:. ..
NP_001 EEDTVAPLPGHLLGPDPYALFRAR--RNSSRDVYQPPLTAAIEKMKTTHLKEQKAFALIR
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pF1KE5 YILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYNQFIRDRFSMDLATVTKLEDIYRWLNSVLLPLL
::... :: .::.. : . .. :. .. :. .. : ......: :..:. :
NP_001 EILAYLGFLWMLLLVAYGQRDPSAYHLNRHLQHSFTRGFSGVLGFREFFKWANTTLVSNL
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pF1KE5 HNDLNPTFLPESSSKILGLPLMRQVRAKSSEKMCLPAEKFVQNSIRREIHCHPKYGIDPE
.. : :. ...::..: .::::.. :. : : . : . :. :..: :
NP_001 YGH-PPGFITDGNSKLVGSAQIRQVRVQ--ESSC-PLAQQPQAYLN---GCRAPYSLDAE
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pF1KE5 DTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKPQGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRF
: .:. :: . . . . :. : . : .: : .: .:::.. . ..:
NP_001 DMADYGEGWNAT-------TLSEWQYQSQDQRQGYPIWGKLTVYRGGGYVVPLGTDRQST
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pF1KE5 NSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTTFNPDINLFCSISVIFEVSQLGVVNTSISLHSF
. :: : ...::: : :: .: :..: ..:::: ... .:.: ::. : .:.:.
NP_001 SRILRY--LFDNTWLDALTRAVFVESTVYNANVNLFCIVTLTLETSALGTFFTHAALQSL
1440 1450 1460 1470 1480
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pF1KE5 SLADF-DRKASAEIYLYVAILIFFLAYVVDEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTV
: : : . . ..:.: :.: .: . .: .: : .:::..:.
NP_001 RLYPFTDGWHPFVVAAELIYFLFLLYYMVVQGKRMSKETWGYFCSKWNLLELAIILASWS
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2020 2030 2040 2050 2060 2070
pF1KE5 LIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPFHAVSQVDHIMRIILGFLLFLTILKTLRYSRF
...:... :: .. .. :. : : .. .: . :..::..:. .: . :.
NP_001 ALAVFVKRAVLAERDLQRCRNHREEGISFSETAAADAALGYIIAFLVLLSTVKLWHLLRL
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pF1KE5 FYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYFFVYMAFGYLVFGQHEWNYSNLIHSTQTVFSY
. . :.. : : . .:. .....: . :.:: . .:..:. ...:. :
NP_001 NPKMNMITAALRRAWGDISGFMIVILTMLLAYSIASNLIFGWKLRSYKTLFDAAETMVSL
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pF1KE5 CVSAFQNTE-FSNNRILGVLFLSSFMLVMICVLINLFQAVILSAYEEMKQPVYEEPSDEV
.. :. : .. . .:: ....: .. : :..::: .::: :. : .. : . :.:
NP_001 QLGIFNYEEVLDYSPVLGSFLIGSCIVFMTFVVLNLFISVILVAFSEEQK--YYQLSEEG
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pF1KE5 EAMTYLCRKLRTMFSFLTSQSKAKDEPEFFIDMLYGQPEKNSHRYLGLKTRNINGKKMVY
: . : :. .::: .:: ..::
NP_001 EIVDLLLMKI---LSFLGIKSK-REEPGSSREQPGSLSQTRHSRPAQALPKD
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pF1KE5 AYLSIKAFAFRHFLEAEFSISLYLACWSGVTSVFRH-----SFIINHGP--QIGECKINP
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.::.: ... : . .. . : .:. .: :.. . . : .: ..
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: . : .: . : : :.:.:: .. . : : : ..:.:.. . :
NP_443 SEKIPTALQGEGG-PEQLLQLAKAVSSMLNQEHESQGSGQSLSIDVRQKVREHVLGS--L
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. .: .. :: .. ..: :.:.:.: . .:... . . :. : :.. .
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pF1KE5 ---AFNLTVGPNSEVDGSLKKTTGGFSFQVDSTVLREVLVHIVTEVMVLFTVLVYTGSQI
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NP_443 QPTVLNLTSPEALWVNVTSGEATLG------------IQLHWRPDIALTLS-LGYGYHPN
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. . : ::: . : . ...: . : : : .. . . :
NP_443 KSSYDAQTHLVPM-VAPDELPTWILSP----QDLRF-GEGVYYLTVVPESDLEP------
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pF1KE5 VLQAPRFVMKLNDKLVRISIFSVQCLDMYGIQSEWREGYCILGEKTSWYEVHCICKNVVR
:: : : :. : .:. .: : .. : .: .:: :..::.:....
NP_443 ---APG-----RDLTVGITTFLSHCVFWDEVQETWDDSGCQVGPRTSPYQTHCLCNHLTF
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pF1KE5 ARRQLGTIGLTGIHLHTHYVMAKVIVIPNPVDLRLNIIKSLHQNPVTLFTVLFIILLYVG
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NP_443 ----FGS---------TFLVMSNAINIHQTAEL----FATFEDNPVVVTTVGCLCVVYVL
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pF1KE5 LAFWALYRDEMDQHLRGHVIVLPDNDPYDNLCYLVTIFTGSRWGSGTRANVFVQLRGTVS
...:: .: .:: . .: :: ::::. . ::::..:: : :..: ..: : : : .
NP_443 VVIWARRKDAQDQA-KVKVTVLEDNDPFAQYHYLVTVYTGHRRGAATSSKVTVTLYGLDG
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pF1KE5 TSDVHCLSHPHFTTLYRGSINTFLLTTKSDLGDIHSIRVWHNNEGRSPSWYLSRIKVENL
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NP_443 EREPHHLADPDTPVFERGAVDAFLLSTLFPLGELRSLRLWHDNSGDRPSWYVSRVLVYDL
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pF1KE5 FSRHIWLFICQKWLSV---DTTLDRTFHVTHPDERLTRKDFFFIDVSSNLRKNHMWFSIF
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NP_443 VMDRKWYFLCNSWLSINVGDCVLDKVFPVATEQDRKQFSHLFFMKTSAGFQDGHIWYSIF
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pF1KE5 ASVVAKTFNRLQRLSCCLAMLLSSLLCNIMFFNLNR----QEQTESRERKYMRSMMIGIE
. . ..:.:.::.:::...:: ..: .:::... . :.. .. . . .:::.:
NP_443 SRCARSSFTRVQRVSCCFSLLLCTMLTSIMFWGVPKDPAEQKMDLGKIEFTWQEVMIGLE
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pF1KE5 SVLITIPVQLLITFLFTCSQRK------------------------------PQADLKEV
: .. .:..:::. .: .. . :.: :.:
NP_443 SSILMFPINLLIVQIFQNTRPRVAKEQNTGKWDRGSPNLTPSPQPMEDGLLTPEAVTKDV
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pF1KE5 S------------PQK-----------------------HPLMSEASEHWEEYLRKWHAY
: :. .: . .. ::: .: .
NP_443 SRIVSSLFKALKVPSPALGWDSVNLMDINSLLALVEDVIYPQNTSGQVFWEEA-KKREDP
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: . :. . .. ::. ...: : . : ... .. :. .. :..
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... .... :. . :.. . :..: :. :::::. :.:.:: :::....
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.. : :. ...::..: .::::.. :. : : . : . :. :..: :
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: .:. :: . . . . :. : . : .: : .: .:::.. . ..:
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: : : . . ..:.: :.: .: . .: .: : .:::..:.
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...:... :: .. .. :. : : .. .: . :..::..:. .: . :.
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. . :.. : : . .:. .....: . :.:: . .:..:. ...:. :
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NP_443 EIVDLLLMKI---LSFLGIKSK-REEPGSSREQPGSLSQTRHSRPAQALPKD
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1220
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XP_016 SVCWLLLGFTSLASAFFTALYSLELSKDQATSWMISIILSVLQNIFISQPVKVVFFTFLY
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XP_016 SLMMSRMPRLNKENEQQTK-RILALLAKCSSSVPG--SRDKNNPVYV-APAINSPTKHPE
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XP_016 -RTLKKKKLFK-----LTGDILVQILFLTLLMTAIYSAKNSNRFYLHQAIWKTFSHQFSE
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>>NP_853514 (OMIM: 607895) polycystic kidney disease pro (1732 aa)
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pF1KE5 ACTVKKARVVCLPVSLLQLIAQHSHSPHCTVSIVLQAPRFVMKLNDKLVRISIFSVQCLD
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NP_853 LPKDKVWQKDEEYTWVLNPEHLQHGIGTYYITAVLSERQEGAQQTPSLVSVITAVTQCYY
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NP_853 WEIHNQTWSSAGCQVGPQSTILRTQCLCNHLT-------------FFASDFFVVPRTVNV
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NP_853 EDTIKLFLRVTN----NPVGVSLLASLLGFYVITVVWARKKDQADMQ-KVKVTVLADNDP
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NP_853 IPVSKRELFSFRHLFSSMIVEKFTQDYLWLSIATRHPWNQFTRVQRLSCCMTLLLCNMVI
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: : . .:.:: :. .: .: : ... .
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.. .... :.. : .::.::.. . .. :: : : .
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: :.:. :: :.:: ..:.: . :.. :... . : :.... :: :.. :
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: . . :. :. .:: . . : .: ... : . . . .: . :
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: .:.:: .: . . ::....::.::. : .... :: .: : :: ...
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NP_853 IKLLQDFYPWANHILLPSLYGDY---------------------RGK-------------
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:.. . :: : :.. . ...::. . :: : .:.. :. . :
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. .: . . ..: . ::.: .::. : . ..
NP_853 RRFSYICSPRPMVLIPTD----------ELHE-------------RLTSKNEN-----GF
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.. . . :.:. .. : .:. : ... : . : .. . :: :. . .:.
NP_853 QKWRFFTGKRNILDTSIILISFILLGLDMKSISLHKKNMARYRDDQDRFISFYEAVKVNS
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NP_853 AATHLVGFPVLLATVQLWNLLRHSPRLRVISRTLSRAWDEVVGFLLIILILLTGYAIAFN
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NP_853 EVLDELP
1730
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NP_612 GWFFPAQCWLSAGRHDGRVERELTCLQGG--LGFRKLFYCKFTEYLEDFHVWLSVYSRPS
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NP_612 SSRYLHTPRLTVSFS-LLCVYACLTALVAAGGQEQPHLDVSPTLGSFRVGLLCTLLASPG
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NP_612 AQLLSLLFRLSKEAPGS--ARVEPHS-PLRGGAQTEAPHGPNSWGRIPDAQ-EPRK--QP
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NP_612 ASAILSGSGRAQRKAASDNGTACPAP---KLQVHGADHSRTSLMGKSHCCPP---HT-QA
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NP_612 PSSGLEGLMPQWSRALQPWWSSAV-WAICGTASLACSLGTGFLAYRFGQEQCVQWLHLLS
2120 2130 2140 2150 2160 2170
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pF1KE5 FCSFCQSVLLVQPSKIILLS-GF----RTNKPKYCKNLSWSTK--------YKYTEIRLD
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