FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5847, 2253 aa 1>>>pF1KE5847 2253 - 2253 aa - 2253 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5709+/-0.00119; mu= 20.2298+/- 0.072 mean_var=106.8839+/-21.270, 0's: 0 Z-trim(104.7): 31 B-trim: 52 in 1/49 Lambda= 0.124056 statistics sampled from 7994 (8019) to 7994 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16 Scan time: 5.660 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14073.1 PKDREJ gene_id:10343|Hs108|chr22 (2253) 15081 2711.6 0 CCDS73912.1 PKD1L3 gene_id:342372|Hs108|chr16 (1732) 636 126.2 1.3e-27 CCDS34633.1 PKD1L1 gene_id:168507|Hs108|chr7 (2849) 566 113.8 1.2e-23 CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 ( 805) 407 85.0 1.5e-15 CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 ( 968) 390 82.0 1.5e-14 CCDS43367.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 613) 353 75.3 9.9e-13 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SSEKMCLPAEKFVQNSIRREIHCHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKP 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE5 QGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 QGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTT 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE5 FNPDINLFCSISVIFEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLAYVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 FNPDINLFCSISVIFEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLAYVV 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KE5 DEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 DEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPF 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KE5 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E(32554): 1.3e-27 Smith-Waterman score: 936; 23.0% identity (53.2% similar) in 1220 aa overlap (1077-2216:608-1715) 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE5 ACTVKKARVVCLPVSLLQLIAQHSHSPHCTVSIVLQAPRFVMKLNDKLVRISIFSVQCLD .. ::. . . . .:: . .:: CCDS73 LPKDKVWQKDEEYTWVLNPEHLQHGIGTYYITAVLSERQEGAQQTPSLVSVITAVTQCYY 580 590 600 610 620 630 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE5 MYGIQSEWREGYCILGEKTSWYEVHCICKNVVRARRQLGTIGLTGIHLHTHYVMAKVIVI .. : . : .: ... ...:.:.... . .:. ... . CCDS73 WEIHNQTWSSAGCQVGPQSTILRTQCLCNHLT-------------FFASDFFVVPRTVNV 640 650 660 670 680 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE5 PNPVDLRLNIIKSLHQNPVTLFTVLFIILLYVGLAFWALYRDEMDQHLRGHVIVLPDNDP . . : : . . ::: . . .. .:: . :: .:. :.. . .: :: :::: CCDS73 EDTIKLFLRVTN----NPVGVSLLASLLGFYVITVVWARKKDQADMQ-KVKVTVLADNDP 690 700 710 720 730 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE5 YDNLCYLVTIFTGSRWGSGTRANVFVQLRGTVSTSDVHCLSHPHFTTLYRGSINTFLLTT .. ::. ..:: : ...: :.: . : :. . :. : : :. :.. ::....::::: CCDS73 SAQFHYLIQVYTGYRRSAATTAKVVITLYGSEGRSEPHHLCDPQKTVFERGGLDVFLLTT 740 750 760 770 780 790 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE5 KSDLGDIHSIRVWHNNEGRSPSWYLSRIKVENLFSRHIWLFICQKWLSVDT---TLDRTF ..::..::.:.::.: : :::::.:.. : .. .. : :.:. ::.:: :::.: CCDS73 WTSLGNLHSLRLWHDNSGVSPSWYVSQVIVCDMAVKRKWHFLCNCWLAVDLGDCELDRVF 800 810 820 830 840 850 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE5 HVTHPDERLTRKDFFFIDVSSNLRKNHMWFSIFASVVAKTFNRLQRLSCCLAMLLSSLLC . : .. . .: . .. ....:.:: . . :.:.::::::...:: ... CCDS73 IPVSKRELFSFRHLFSSMIVEKFTQDYLWLSIATRHPWNQFTRVQRLSCCMTLLLCNMVI 860 870 880 890 900 910 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE5 NIMFFNLNRQEQTESRERKYMRS-------MMIGIESVLITIPVQLLITFLFTCSQRKPQ :.::...: .: ... . :: ....:....: .:..:.: :: . :: CCDS73 NVMFWKIN---STTAKRDEQMRPFAVAWSELLVSIHTAVILFPINLVIGRLFPLIE--PQ 920 930 940 950 960 970 1460 1470 1480 1490 pF1KE5 ADLKEVSPQKHPLMSEAS----------EHWEEYLR----------------KWHAYETA : : . .:.:: :. .: .: : ... . CCDS73 ETLPLFPPIQASCLSDASVEPLSATMVVEELKETVRFLLRRNTYLLSKCEQPPWSSWDIT 980 990 1000 1010 1020 1030 1500 1510 1520 1530 pF1KE5 KVHPREVAKPAS---------KGKPRLPKASPKATSKPK-HRHRKAQ-IKTPE-TLGPNT :. . .: .:. . .. :. . . :: : .:. ::: . CCDS73 KLVKLLSSLVSSHLEGQGCHQQGERHWARVVPENHHHFCCYLHRVLQRLKSHLGTLGLTQ 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1540 1550 1560 1570 pF1KE5 --------NSNNNIEDDQDV---H---SEQHPSQK-------DLQQLKKKPRIVLPWWCV .. .... :.. : .::.::.. . .. :: : : . CCDS73 GHQSCDFLDAASQLQKLQELLETHILPTEQEPSREVTSFAILSSEEGKKPISNGLSKWLT 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KE5 YVAWFLVFATSSISSFFIVFYGLTYGYDKSIEWLFASFCSFCQSVLLVQPSKII----LL : :.:. :: :.:: ..:.: . :.. :... . : :.... :: :.. : CCDS73 SVCWLLLGFTSLASAFFTALYSLELSKDQATSWMISIILSVLQNIFISQPVKVVFFTFLY 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KE5 SGFRTNKPKYCKNLSWSTKYKYTEIRLDGMRMHPEEMQRIHDQIVRIRGTRMYQPLTEDE : . . :. :. .:: . . : .: ... : . . . .: . : CCDS73 SLMMSRMPRLNKENEQQTK-RILALLAKCSSSVP--GSRDKNNPVYV-APAINSPTKHPE 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1700 1710 1720 1730 1740 1750 pF1KE5 IRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYNQFIRDRFSMDLAT : .:.:: .: . . ::....::.::. : .... :: .: : :: ... CCDS73 -RTLKKKKLFK-----LTGDILVQILFLTLLMTAIYSAKNSNRFYLHQAIWKTFSHQFSE 1280 1290 1300 1310 1320 1760 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KE5 VTKLEDIYRWLNSVLLPLLHNDLNPTFLPESSSKILGLPLMRQVRAKSSEKMCLPAEKFV . :.:.: : : .::: :..: :.: CCDS73 IKLLQDFYPWANHILLPSLYGDY---------------------RGK------------- 1330 1340 1350 1820 1830 1840 1850 1860 1870 pF1KE5 QNSIRREIHCHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTY-KPQGTQWLYYSYGL :.. . :: : :.. . ...::. . :: : .:.. :. . : CCDS73 -NAVLEPSHC--KCGVQLIFQIPRTKTYEKVDEGQLAFCDNGHTCGRPKS---LFPGLHL 1360 1370 1380 1390 1400 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KE5 LH-TYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTTFNPDINLFCSI . .: . . ..: . ::.: .::. : . .. CCDS73 RRFSYICSPRPMVLIPTD----------ELHE-------------RLTSKNEN-----GF 1410 1420 1430 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE5 SVIFEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLA---YVVDEGCIIMQ : :.. :. ::. :.::. ....:. .. .. .:..: :. .:: . : CCDS73 SYIMR----GAFFTSLRLESFTSLQMSKKGC--VWSIISQVIYYLLVCYYAFIQGCQLKQ 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KE5 ERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPFHAVSQVDH .. . . :.:. .. : .:. : ... : . : .. . :: :. . .:. CCDS73 QKWRFFTGKRNILDTSIILISFILLGLDMKSISLHKKNMARYRDDQDRFISFYEAVKVNS 1500 1510 1520 1530 1540 1550 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KE5 IMRIILGFLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYFFVY-MAFG ..:: ..:. .. : .:. .:... : . . ... . . : .::. CCDS73 AATHLVGFPVLLATVQLWNLLRHSPRLRVISRTLSRAWDEVVGFLLIILILLTGYAIAFN 1560 1570 1580 1590 1600 1610 2110 2120 2130 2140 2150 2160 pF1KE5 YLVFGQHEWNYSNLIHSTQTVFSYCVS-AFQNTEFSNNRILGVLFLSSFMLVMICVLINL :.:: .: ... :. :: . .. . :. :. . .::.... . ...:. :.::: CCDS73 -LLFGCSISDYRTFFSSAVTVVGLLMGISHQEEVFALDPVLGTFLILTSVILMVLVVINL 1620 1630 1640 1650 1660 2170 2180 2190 2200 2210 2220 pF1KE5 FQAVILSAYEEMKQPVYEEPSDEVEAMTYLCRKLRTMFSFLTSQSKAKDEPEFFIDMLYG : ..:: :. . .. . .: . . : .:: ..... :. .... CCDS73 FVSAILMAFGKERKSLKKEAA----LIDTLLQKLSNLLGISWPQKTSSEQAATTAVGSDT 1670 1680 1690 1700 1710 1720 2230 2240 2250 pF1KE5 QPEKNSHRYLGLKTRNINGKKMVYLVV CCDS73 EVLDELP 1730 >>CCDS34633.1 PKD1L1 gene_id:168507|Hs108|chr7 (2849 aa) initn: 301 init1: 223 opt: 566 Z-score: 538.3 bits: 113.8 E(32554): 1.2e-23 Smith-Waterman score: 696; 21.4% identity (49.3% similar) in 2044 aa overlap (156-2089:797-2650) 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LTWSVRLPRSPGRLAWAFRLRLLGPGAARPASPAARVSPRSAAPGPRPQQGFVARTECPT .:: . . .: : : . . :: : CCDS34 SNYCVGLEVRAQAPVSVISEGTHLFFSRTTSSPIVLRGTQSFDPDD-PGATLRYHWECAT 770 780 790 800 810 820 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 DG-PARVMLQAVNSSSHRAVESSVSCQINACVIQRVRINTDQKGAPVRLSMQAEATINAS : ::. ... :..:. .. . ...: : . . :: . .:.: .. . .. CCDS34 AGSPAHPCFDS--STAHQLDAAAPTVSFEA---QWLSDSYDQFLVMLRVSSGGRNSSETR 830 840 850 860 870 880 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VQLD-CP--AARAIAQYWQVFSVPAVGQAPDWTQPLDLPQLEIRNSPLFIHIPNNSLQWG : :. : : : . : :. : .:.. :.: . : .::: : .: CCDS34 VFLSPYPDSAFRFVHISWVSFKDTFV----NWNDELSLQAMCEDCS----EIPNLSYSWD 890 900 910 920 930 310 320 330 340 350 pF1KE5 VYVFNFTVSITTGNPKMPEVKDSDAVYVWIVRSSLQAVML----GDAN---ITANFTEQ- ... : : . : : .. . . : : .: : :. :. :... CCDS34 LFLVNATEKNRIEVPFCRVVGLLGSLGLGAISESSQLNLLPTEPGTADPDATTTPFSREP 940 950 960 970 980 990 360 370 380 390 400 pF1KE5 --LILDGSTSSDPDADS--PLQGLQFFWYCTTDPRNYGGDRIILGSKEVCHPEQANLKW- . : ..: : . :. :. .: : .:: .:: ::...: CCDS34 SPVTLGQPATSAPRGTPTEPMTGV--YW---IPP---AGDSAVLGEA----PEEGSLDLE 1000 1010 1020 1030 1040 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 --PWASGPVLTLLPETLKGDHVYFFRMVIRKDSRTAFSDKRVHVLQGPKAIAHITCIENC : ..: ..: : . : .. .: .. .:: . . .: . :. : CCDS34 PGPQSKGSLMTGRSERSQPTHSPDPHL---SDFEAYYSDIQEAIPSGGRQPAKDT----- 1050 1060 1070 1080 1090 470 480 490 500 510 pF1KE5 ERNFIVSDRFSLFLNCTNCASRDFYKWSILSSSGGE--MLFDW----MGETV-TGRNGAY .: : :: . . . .. : ::.. .: ...:: .:..: : ... CCDS34 --SFPGSGP-SLSAEESPGDGDNLVDPS-LSAGRAEPVLMIDWPKALLGRAVFQGYSSSG 1100 1110 1120 1130 1140 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 LSIKAFAFRHFLEAE---FSISLYLACWSGVTSVFRHSFIINHGPQIGECKINPAKGIAL .. .. ... . . . ... .: :. . . . .: .:. :...: .:. CCDS34 ITEQTVTIKPYSLSSGETYVLQVSVASKHGLLGKAQLYLTVNPAPRDMACQVQPHHGLEA 1150 1160 1170 1180 1190 1200 580 590 600 610 620 pF1KE5 ITKFVVQCSNFR-DKHVPLTYKIIVSDLHSV--------------GEISSVKENTLGTIL : : : : . . : : ..:.: .. :.. :: . . ..: . CCDS34 HTVFSVFCMSGKPDFHYEFSYQIGNTSKHTLYHGRDTQYYFVLPAGEHLDNYKVMVSTEI 1210 1220 1230 1240 1250 1260 630 640 650 660 670 pF1KE5 YLGPQSTVPPSFLPVGMLASQYGLKIYAQ-VYDS-LGAFSQVTLHATAQAPTDKNSSKTV : : : : . : .: .: .. .:.: : .: . : .. :. . :: CCDS34 TDGKGSKVQPCTVVVTVLPRYHGNDCLGEDLYNSSLKNLSTLQLMGSY---TEIRNYITV 1270 1280 1290 1300 1310 1320 680 690 700 710 720 730 pF1KE5 LNQLLSFTVGPSSLLSTLIQKKDFLPAGYLLYIVASVLNNMKTELPLRDDRVNLRKHLID ....:: .. . .. : . . : ...:: .. : . . :.. CCDS34 ITRILS-RLSKEDKTASCNQWSRIQDA-----LISSVCRLAFVDQEEMIGSVLMLRDLVS 1330 1340 1350 1360 1370 740 750 760 770 780 790 pF1KE5 QSFLLPVSTLVEIGQVVMTITKLTQKPSEFTWDAQKRATM-----RVWQANQALQEYQQK : : . : : . . .. : . :. : : . :::.... :: ..: CCDS34 FSNKLGFMSAVLILKYTRALLAQGQFSGPFVIDKGVRLELIGLISRVWEVSE--QE-NSK 1380 1390 1400 1410 1420 1430 800 810 820 830 840 pF1KE5 DKRFRSEQ-IEIVSTGILMSLSNILKMTSPHQVVKDPF--YVIESLSDTILANKV--PGN .. .: :. : ..: .: :: :. .: :. . : ..: ... . .: ::. CCDS34 EEVYRHEEGITVISDLLLGCLS--LNHVSTGQMEFRTLLHYNLQSSVQSLGSVQVHLPGD 1440 1450 1460 1470 1480 1490 850 860 870 880 890 900 pF1KE5 KTTSMRTPNFNMYVKKVEKWGINQLFRNEKHCRNCFYPTLNVSSVPG-LSANGPISTMFC . ..: .. :.::. .:. :: :..:: ... .. . : CCDS34 --LAGHSP---AGAETQSPCYISQLILFKKNP----YPG---SQAPGQIGGVVGLNLYTC 1500 1510 1520 1530 1540 910 920 930 940 950 960 pF1KE5 DFTNDL-FPWLNDQENTSVEVSGFRMTGVADNGSVLEITPDVAEVYLVRKNLTFAAFN-L . . :: .. . :: : :. :. . . :.: .... :. : CCDS34 SSRRPINRQWL--RKPVMVEF------GEEDG---LDNRRNKTTFVLLRDKVNLHQFTEL 1550 1560 1570 1580 1590 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE5 TVGPNSEVDGSLKKTTGGFSFQVDSTVLREVLVHIVTEVMVLFTVLVYTGSQITPTALVA . .:. :.:.. . : . . ..: :. . ::. CCDS34 SENPQE-------------SLQIEIEFSKPVTRAFPVMLLVRFS------EKPTPS---- 1600 1610 1620 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE5 TFLVPHDIPPFASQSALFDPACTVKKARVVCLPVSLLQLIAQHSHSPHCTVSIVLQAPRF ::: . : .. :: . : : : : :::. :.....: :. CCDS34 DFLVKQIYFWDESIVQIYIPAASQKDASVGYL--SLLD--ADYDRKP---------PNRY 1630 1640 1650 1660 1670 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE5 VMKLNDKLVRISIFSVQCLDMYGIQSEWREGYCILGEKTSWYEVHCICKNVVRARRQLGT . : . :... ..:: . . ::. :: .:.: . ..:.. CCDS34 LAKAVNYTVHFQW--IRCL--FWDKREWKSERFSPQPGTSPEKVNC-------SYHRLAA 1680 1690 1700 1710 1720 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE5 IGLTGIHLHTHYVMAKVIVIPNPVDLRLNIIKSLHQNPVTLFTVLFIILLYVGLAFWALY ..: .:.. . .. :..:...: .:. .::. . .: . CCDS34 FALLRRKLKASFEVSD--------------ISKLQSHPENLLPSIFIMGSVILYGFLVAK 1730 1740 1750 1760 1770 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE5 RDEMDQHLR---GHVIVLPDNDPYDNLCYLVTIFTGSRWGSGTRANVFVQLRGTVSTSDV ..:.: . :.... . : .: : :.: :: : . ..:.. : : . :.. CCDS34 SRQVDHHEKKKAGYIFLQEASLPGHQL-YAVVIDTGFRAPARLTSKVYIVLCGDNGLSET 1780 1790 1800 1810 1820 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE5 HCLSHPHFTTLYRGSINTFLLTTKSDLGDIHSIRVWHNNEGRSPSWYLSRIKVENLFSRH . :: :. . :.: .::.:.. ..:: ...::.::...: ::.:..:.. :..: . . CCDS34 KELSCPEKPLFERNSRHTFILSAPAQLGLLRKIRLWHDSRGPSPGWFISHVMVKELHTGQ 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE5 IWLFICQKWLSV---DTTLDRTFHVTHPDERLTRKDFFFIDVSSNLRKNHMWFSIFASVV :.: : :::. : ..: . . : . .:. . :. :.:.:... CCDS34 GWFFPAQCWLSAGRHDGRVERELTCLQGG--LGFRKLFYCKFTEYLEDFHVWLSVYSRPS 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE5 AKTFNRLQRLSCCLAMLLSSLLCNIMFFNLNRQEQTESRERKYMRSMMIGIESVLITIPV .. . . ::. .. :: : . . ::: . . :. .:. .:.. : CCDS34 SSRYLHTPRLTVSFS-LLCVYACLTALVAAGGQEQPHLDVSPTLGSFRVGLLCTLLASPG 1950 1960 1970 1980 1990 2000 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KE5 QLLITFLFTCSQRKPQADLKEVSPQKHPLMSEASEHWEEYLRKWHAYETAKVHPREVAKP :...:: :.. : . .: :.. :: . :. . . .: :. .::. .: CCDS34 AQLLSLLFRLSKEAPGS--ARVEPHS-PLRGGAQTEAPHGPNSWGRIPDAQ-EPRK--QP 2010 2020 2030 2040 2050 2060 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE5 AS-----KGKPRLPKASPKATSKPKHRHRKAQIKTPETLGPNTNSNNNIEDDQDVHSEQH :: .:. . :: ..:. : : :.. . . .... :. : CCDS34 ASAILSGSGRAQRKAASDNGTACPAP---KLQVHGADHSRTSLMGKSHCCPP---HT-QA 2070 2080 2090 2100 2110 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KE5 PSQKDLQQLKKKPRIVLPWWCVYVAWFLVFATSSISSFFIVFYGLTYGYDKSIEWL-FAS ::. . . : . ::: : : . ..: :. : . .: .. ..:: . : CCDS34 PSSGLEGLMPQWSRALQPWWSSAV-WAICGTASLACSLGTGFLAYRFGQEQCVQWLHLLS 2120 2130 2140 2150 2160 2170 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KE5 FCSFCQSVLLVQPSKIILLS-GF----RTNKPKYCKNLSWSTK--------YKYTEIRLD . : ....:: . :.. :: :... . ..: .:. ..:.. .. CCDS34 LSVVC-CIFITQPLMVCLMALGFAWKRRADNHFFTESLCEATRDLDSELAERSWTRLPFS 2180 2190 2200 2210 2220 2230 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE5 GMRMHPE---EMQRIHDQIVRIRGTRMYQPLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHF . :. :.... . : : .: .. ..: ... : . :. : : . CCDS34 SSCSIPDCAGEVEKVLAARQQARHLRWAHPPSKAQLRGTRQRMRRESRTRAALRDISMDI 2240 2250 2260 2270 2280 2290 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KE5 IFLALLLILIVLLRHTDCFYYNQFIRDRFSMD----LATVTKLEDIYRWLNSVLLPLLHN ..: ::: .: : . :: :: .:. . :. . .. : . : ..:: :. CCDS34 LMLLLLLCVIYGRFSQDEYSLNQAIRKEFTRNARNCLGGLRNIADWWDWSLTTLLDGLYP 2300 2310 2320 2330 2340 2350 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE5 DLNPTF-LPESSSKILG-------LPLMRQVRAKSSEKMCLPAEKF---VQNSIRREIHC .:. .: .. :: ..::... ...: : . : ...:: : CCDS34 GGTPSARVPGAQPGALGGKCYLIGSSVIRQLKV-FPRHLCKPPRPFSALIEDSIPT---C 2360 2370 2380 2390 2400 1830 1840 1850 1860 1870 1880 pF1KE5 HPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKPQGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYAL :. : ::. : .: . . . :: : : . . : CCDS34 SPEVG-GPENP--YL-----IDPENQNVTLNG----PGGCG---TREDCVLSLG------ 2410 2420 2430 2440 1890 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE5 YFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTTFNPDINLFCSISVIFEVSQLGVV . : .. :..:. : :.:..: :: ...: .:: .:: :.:. :. : . CCDS34 -----RTRTEAHTALSRLRASMWIDRSTRAVSVHFTLYNPPTQLFTSVSLRVEILPTGSL 2450 2460 2470 2480 2490 2500 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KE5 NTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLAYVVDEGCII---MQERA--SYVRSVY : ..:::. : .. . .:.. :.: :: . . :. :.... :: :. CCDS34 VPSSLVESFSI--FRSDSALQYHLMLPQLVF-LALSLIHLCVQLYRMMDKGVLSYWRKPR 2510 2520 2530 2540 2550 2000 2010 2020 2030 2040 2050 pF1KE5 NLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHF--LATGII-RFYLSNPEDFIPFHAVSQVDHIMRIILG : :. :. . . : . :. :: . .:. . . :. . ... .. : . : CCDS34 NWLE--LSVVGVSLTYYAVSGHLVTLAGDVTNQFHRGLCRAFMDLTLMASWNQRARWLRG 2560 2570 2580 2590 2600 2610 2060 2070 2080 2090 2100 2110 pF1KE5 FLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYFFVYMAFGYLVFGQHE .:::: :: . . . . .. .::.: CCDS34 ILLFLFTLKCVYLPGIQNTMASCSSMMRHSLPSIFVAGLVGALMLAALSHLHRFLLSMWV 2620 2630 2640 2650 2660 2670 2120 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE5 WNYSNLIHSTQTVFSYCVSAFQNTEFSNNRILGVLFLSSFMLVMICVLINLFQAVILSAY CCDS34 LPPGTFTDAFPGLLFHFPRRSQKDCLLGLSKSDQRAMACYFGILLIVSATLCFGMLRGFL 2680 2690 2700 2710 2720 2730 >>CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 (805 aa) initn: 200 init1: 116 opt: 407 Z-score: 392.5 bits: 85.0 E(32554): 1.5e-15 Smith-Waterman score: 455; 22.6% identity (55.9% similar) in 558 aa overlap (1681-2215:75-604) 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE5 TKYKYTEIRLDGMRMHPEEMQRIHDQIVRIRGTRMYQPLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLF .: : : : .:. :: CCDS74 PLQPQPKKPEDEPQETAYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTT---- 50 60 70 80 90 100 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KE5 LSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYNQFIRDRF-------SMDLATVTKLEDIYRW : .:....::. . .: . .. .::.. . . : .... ..... :.. . CCDS74 LRELLVYIVFLVDICLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDF 110 120 130 140 150 160 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KE5 LNSVLLPLLHND--LNPTFLPESSSK-------ILGLPLMRQVRAKSSEKMCLPAEKFVQ .. :: :. : : ..: . .::.: .::...... :. : : . CCDS74 AQGPLLDSLYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDS--CVVHEDFRE 170 180 190 200 210 1820 1830 1840 1850 1860 1870 pF1KE5 NSIRREIHCHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKPQGTQWLYYSYGLLH . . :. :. : :. .. : . ...::. : . .: : CCDS74 DIL----SCYDVYSPDKEEQLPFGPF-----------NGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLT 220 230 240 250 260 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KE5 TYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTTFNPDINLFCSISVI .:..::: : . : .: .:. :. :::. :::. : .: ......: .::::: . .. CCDS74 SYSGGGYYLDL-P-GSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLV 270 280 290 300 310 320 1940 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KE5 FEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIY-LYVAILIFFLAYVVDEGCIIMQERASY : : . : .... .: . . . : : . .:.. :::.: . .: : CCDS74 VEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRY 330 340 350 360 370 380 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KE5 VRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPFHAV----SQVDHI . :..:.:.... . : . . . . . .. .. :..:. . :. . .: ... CCDS74 LSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNM 390 400 410 420 430 440 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KE5 MRIILGFLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYFFVYMAFGYL . : :. .. :.: . ... . .. . . :. : :.: ::.: .::: CCDS74 NAVNL-FFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILGFAVMFFIV---FFAYAQLGYL 450 460 470 480 490 2110 2120 2130 2140 2150 2160 pF1KE5 VFGQHEWNYSNLIHSTQTVFSYCVSAFQNTEFSN-NRILGVLFLSSFMLVMICVLINLFQ .:: . :.:..:. : : .. :. . ..: ::::: .. .... .. ::.:.: CCDS74 LFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFL 500 510 520 530 540 550 2170 2180 2190 2200 2210 2220 pF1KE5 AVILSAYEEMKQPVYEEPSDEVEAMTYLCRKL-RTMFSFLTSQSKAKDEPEFFIDMLYGQ :.: ..: :.:. . . .::.. : . .:.. . . ...: CCDS74 AIINDTYSEVKEELAGQ-KDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEI 560 570 580 590 600 610 2230 2240 2250 pF1KE5 PEKNSHRYLGLKTRNINGKKMVYLVV CCDS74 QFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEI 620 630 640 650 660 670 >>CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 (968 aa) initn: 162 init1: 119 opt: 390 Z-score: 374.9 bits: 82.0 E(32554): 1.5e-14 Smith-Waterman score: 464; 22.9% identity (57.4% similar) in 568 aa overlap (1661-2199:172-706) 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE5 ILLSGFRTNKPKYCKNLSWSTKYKYTEIRLDGMRMH-PEEMQ--RIHDQIVRIRGTRMYQ : .. : : : : :. .:: : CCDS36 GGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCPSPVGGGDPLHRHLPLEGQPPRVAWAERLVRGLRGLW 150 160 170 180 190 200 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE5 PLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYNQFIRDRF : .:.: .: : ..:...:: .: :: . .. .::.... . : CCDS36 GTRLMEESSTNREKYLKS----VLRELVTYLLFLIVLCILTYGMMSSNVYYYTRMMSQLF 210 220 230 240 250 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KE5 ---------SMDLATVTKLEDIYRWLNSVLLPLLHNDLNPTFLPESSSK--------ILG . .. :....::.... .. :: :. ..:. :.... .:: CCDS36 LDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTEADNRSFIFYENLLLG 260 270 280 290 300 310 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE5 LPLMRQVRAKSSEKMCLPAEKFVQNSIRREIH-CHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAI .: .::.:.... : . ...: ::. :. :... :: .. . . . 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