Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6451
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6451, 504 aa
1>>>pF1KE6451 504 - 504 aa - 504 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6998+/-0.000702; mu= 18.7207+/- 0.043
mean_var=103.8629+/-20.419, 0's: 0 Z-trim(113.0): 29 B-trim: 3 in 1/52
Lambda= 0.125847
statistics sampled from 13613 (13642) to 13613 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.419), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 ( 504) 3337 616.1 2.9e-176
CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs108|chr12 ( 478) 1364 257.8 1.9e-68
CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs108|chr17 ( 465) 1022 195.7 9.2e-50
CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 ( 516) 856 165.6 1.2e-40
CCDS858.1 SLC16A1 gene_id:6566|Hs108|chr1 ( 500) 809 157.1 4.2e-38
CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs108|chr17 ( 505) 658 129.7 7.6e-30
CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 ( 471) 632 124.9 1.9e-28
CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs108|chr17 ( 426) 591 117.4 3.1e-26
CCDS11675.1 SLC16A6 gene_id:9120|Hs108|chr17 ( 523) 491 99.4 1.1e-20
CCDS2473.1 SLC16A14 gene_id:151473|Hs108|chr2 ( 510) 472 95.9 1.1e-19
CCDS7256.1 SLC16A9 gene_id:220963|Hs108|chr10 ( 509) 464 94.5 3.1e-19
CCDS5089.1 SLC16A10 gene_id:117247|Hs108|chr6 ( 515) 406 83.9 4.6e-16
CCDS14426.2 SLC16A2 gene_id:6567|Hs108|chrX ( 539) 395 81.9 1.9e-15
CCDS823.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 487) 366 76.6 6.8e-14
CCDS55623.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 439) 333 70.6 4e-12
CCDS55624.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 319) 328 69.6 6e-12
>>CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 (504 aa)
initn: 3337 init1: 3337 opt: 3337 Z-score: 3278.0 bits: 616.1 E(32554): 2.9e-176
Smith-Waterman score: 3337; 100.0% identity (100.0% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDTAWV
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CCDS13 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDTAWV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGVLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGVLTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGFLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGFLLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GGLLLHCCACGAVMRPPPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREASPRVRPRR
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CCDS13 GGLLLHCCACGAVMRPPPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREASPRVRPRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 RLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAFLLSIVGFVDI
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CCDS13 RLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAFLLSIVGFVDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGMV
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CCDS13 VARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGMV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEALE
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE6 VLSARGEPTEPEIEARPRLAAESV
::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLSARGEPTEPEIEARPRLAAESV
490 500
>>CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs108|chr12 (478 aa)
initn: 1356 init1: 833 opt: 1364 Z-score: 1342.3 bits: 257.8 E(32554): 1.9e-68
Smith-Waterman score: 1364; 46.8% identity (76.2% similar) in 425 aa overlap (12-436:13-430)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDTAW
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CCDS89 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGVLT
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CCDS89 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGFLL
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CCDS89 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LGGLLLHCCACGAVMRPPPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREASPRVRPR
::.:::. :. :..::: :: ... ... . :..: :.. ... . .
CCDS89 LGSLLLNACVAGSLMRP---LGP----NQTTSKSKNKTGKTEDDSSPKKIKTKKSTWEKV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RRLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAFLLSIVGFVD
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CCDS89 NKYLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAFVD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 IVARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGM
. :::. : .:. .::.. :.::.:.. ::. : :..: .:: . : :::..:
CCDS89 MFARPSVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGFGS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSE
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CCDS89 VSSVLFETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYMSCGAI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEAL
:. :.:.. ... :
CCDS89 VVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVTSE
420 430 440 450 460 470
>>CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs108|chr17 (465 aa)
initn: 1786 init1: 985 opt: 1022 Z-score: 1006.9 bits: 195.7 E(32554): 9.2e-50
Smith-Waterman score: 1729; 57.6% identity (77.3% similar) in 462 aa overlap (4-455:2-427)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGAGGPRRGEGP-----PDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYS
:: ::: :::::::.:: .:::.:::.:.:::::::::. :...: :::
CCDS11 MGGAVVDEGPTGVKAPDGGWGWAVLFGCFVITGFSYAFPKAVSVFFKELIQEFGIGYS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 DTAWVSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTA
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CCDS11 DTAWISSILLAMLYGTGPLCSVCVNRFGCRPVMLVGGLFASLGMVAASFCRSIIQVYLTT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GVLTGLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRG
::.::::::::::::::::. :: .:::.::::::::::::: ::::::: : .:.::::
CCDS11 GVITGLGLALNFQPSLIMLNRYFSKRRPMANGLAAAGSPVFLCALSPLGQLLQDRYGWRG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GFLLLGGLLLHCCACGAVMRP-----PPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLR
:::.::::::.::.:.:.::: :: :: ::
CCDS11 GFLILGGLLLNCCVCAALMRPLVVTAQPGSGP-PR-------------------------
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EASPRVRPRRRLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAF
: ::::::.: ::.:..:::. .:.:::::: ...:.:::: ::::: :::
CCDS11 -------PSRRLLDLSVFRDRGFVLYAVAASVMVLGLFVPPVFVVSYAKDLGVPDTKAAF
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LLSIVGFVDIVARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFC
::.:.::.:: :::: : .:::...::. ::::.... :::.::... : .::.::.::
CCDS11 LLTILGFIDIFARPAAGFVAGLGKVRPYSVYLFSFSMFFNGLADLAGSTAGDYGGLVVFC
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VAFGLSYGMVGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYE
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CCDS11 IFFGISYGMVGALQFEVLMAIVGTHKFSSAIGLVLLMEAVAVLVGPPSGGKLLDATHVYM
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 IIFYLAGSEVALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVA
.: :::.:: ..... ... :.: :. : : .:.. :
CCDS11 YVFILAGAEVLTSSLILLLGNFFCIR---KKPKEPQPEVAAAEEEKLHKPPADSGVDLRE
390 400 410 420 430 440
480 490 500
pF1KE6 EEPGNLEALEVLSARGEPTEPEIEARPRLAAESV
CCDS11 VEHFLKAEPEKNGEVVHTPETSV
450 460
>>CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 (516 aa)
initn: 864 init1: 836 opt: 856 Z-score: 843.4 bits: 165.6 E(32554): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 865; 36.1% identity (63.4% similar) in 435 aa overlap (8-430:38-460)
10 20 30
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPK
:. .::::::::.....::.:: . . .
CCDS74 TANSSKIITWLLEQPGKEEKRKTMAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 AVSVFFRALMRDFDAGYSDTAWVSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASA
.:.:: .. : :..:::. ::. . . .:..:.. ....:. .. ::::::.
CCDS74 CISIFFVEFQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLAST
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 GMILASFATRLLELYLTAGVLTGLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFL
:.::.:::: : .:::: :::::::.:: ..:.. :.: :: ::. :: :.: .:: .
CCDS74 GLILSSFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SALSPLGQQLLERFGWRGGFLLLGGLLLHCCACGAVMRPPPGPGPRPRRDSAGDRAGDAP
:.:. : :.:.:.:::..:.:::..:. :.:::.::: ..: . . . .
CCDS74 FILAPVVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITL-----KEDHTTPEQNHVC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KE6 GEAEADGAGLQLREASPRVRPRRRLLD--LAVCTDRA--------FAVYAVTKFLMALGL
. : ....:: .. . : : .. :.: ::. ..:: :
CCDS74 RTQKED-----IKRVSPYSSLTKEWAQTCLCCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGC
250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 FVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAFLLSIVGFVDIVARPACGALAGLARLR--PHVPYLFSL
. :: :: ..:: .::::.::.: .::.. . : :. :. .: :::..
CCDS74 SPLFVYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAV
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 ALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGMVGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVL
.. .:: : .: :: : .:: : .: : ::. . ::::.:
CCDS74 GM--DGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVY
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 LVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSEVALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGP
...:. :..:: ::::::. .: : : : . ...:... :
CCDS74 FLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAFLLCGFSMIFSSVLLGFARLIKRMRKTQLQFIA
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 GTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEALEVLSARGEPTEPEIEARPRLAAESV
CCDS74 KESDPKLQLWTNGSVAYSVARELDQKHGEPVATAVPGYSLT
480 490 500 510
>>CCDS858.1 SLC16A1 gene_id:6566|Hs108|chr1 (500 aa)
initn: 1194 init1: 777 opt: 809 Z-score: 797.5 bits: 157.1 E(32554): 4.2e-38
Smith-Waterman score: 1250; 41.4% identity (68.5% similar) in 485 aa overlap (4-473:6-484)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGW-VVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDT
::: : :::::::: ::.:: :. ::.:.:::...:::. . : : :..
CCDS85 MPPAVGGPV-GYTPPDGGWGWAVVIGA-FISIGFSYAFPKSITVFFKEIEGIFHATTSEV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 AWVSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGV
.:.::::::..:: ::.:::::...: : ::..:: :.. :.: ::: . . .::. ::
CCDS85 SWISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVCIGV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LTGLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGF
. :::::.:..:.: :.: :: .::::::::: ::::::: .:.::.: .. :::::.:
CCDS85 IGGLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWRGSF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LLLGGLLLHCCACGAVMRPPPGPGP----RPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREAS
:.::::::.::. ::.::: :: : . . .. ..:: . . . :. .:
CCDS85 LILGGLLLNCCVAGALMRPI-GPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE6 PRVRPRR------RLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTD
:. . : ..:::.. : :.: .: . .: .:::.: ..: .:.:. .
CCDS85 PKQEKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 AAFLLSIVGFVDIVARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALV
.::::::..:::.::::. : .:. .::.. :.:. ...:::. . . . .: :
CCDS85 SAFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTY---V
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 AFCVA---FGLSYGMVGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVD
.::: ::...: .... ::.:: :: :: ::.::: .:: ::.::: ::: :
CCDS85 GFCVYAGFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLND
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 VLKNYEIIFYLAGSEVALAGVFMAVATNCCLRC-AKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDS
. .:. .. : . ..:... .. . : :: .. . . . . .. :
CCDS85 MYGDYKYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KE6 EPLPVVAEEPGNLEALEVLSARGEPTEPEIEARPRLAAESV
. . .:: :
CCDS85 NEVTKAAESPDQKDTDGGPKEEESPV
480 490 500
>>CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs108|chr17 (505 aa)
initn: 1075 init1: 656 opt: 658 Z-score: 649.2 bits: 129.7 E(32554): 7.6e-30
Smith-Waterman score: 1056; 41.7% identity (68.7% similar) in 415 aa overlap (14-427:9-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDTAWV
::.:.:::: : .:. :.. ::: ...:: :. .:.:. :.:.:
CCDS11 MPQALERADGSWAWVVLLATMVTQGLTLGFPTCIGIFFTELQWEFQASNSETSWF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGVLTG
::. :.:. .::. :::: ::::: ... ::.::: ::. .::. : .::.::: .::
CCDS11 PSILTAVLHMAGPLCSILVGRFGCRVTVMLGGVLASLGMVASSFSHNLSQLYFTAGFITG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGFLLL
::. ..:: :. .::.:: ::: :::.::. : . .. :.. ::: .:::: ::..
CCDS11 LGMCFSFQSSITVLGFYFVRRRVLANALASMGVSLGITLWPLLSRYLLENLGWRGTFLVF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 GGLLLHCCACGAVMRP-PPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREASPRVRPR
::..:::: :::..:: . .:. .. : :. : : : :. :
CCDS11 GGIFLHCCICGAIIRPVATSVAPETKE------CPPPPPETPALGC----LAACGRTIQR
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RRLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAFLLSIVGFVD
. .:. . . .. :: . . .::. .: ..:: :: .: . .::.:.::.:: .
CCDS11 HLAFDI-LRHNTGYCVYILGVMWSVLGFPLPQVFLVPYAMWHSVDEQQAALLISIIGFSN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 IVARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGM
: :: : .:: . : :::::::: ::::.: : . .. .::..:.:...:..
CCDS11 IFLRPLAGLMAGRPAFASHRKYLFSLALLLNGLTNLVCAASGDFWVLVGYCLAYSVSMSG
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSE
.::: :.::: : .:: :::: .... : ::.:: :: :.:. .:. .::...
CCDS11 IGALIFQVLMDIVPMDQFPRALGLFTVLDGLAFLISPPLAGLLLDATNNFSYVFYMSSFF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 VALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEAL
. :..::
CCDS11 LISAALFMGGSFYALQKKEQGKQAVAADALERDLFLEAKDGPGKQRSPEIMCQSSRQPRP
410 420 430 440 450 460
>>CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 (471 aa)
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Smith-Waterman score: 882; 38.3% identity (61.5% similar) in 449 aa overlap (11-450:31-447)
10 20 30 40
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVS
::::::::::: .: :...:..::. ....
CCDS11 MPAPQRKHRRGGFSHRCFPTPQTAMTPQPAGPPDGGWGWVVAAAAFAINGLSYGLLRSLG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 VFFRALMRDFDAGYSDTAWVSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMI
. : : . :: . .::::.:.. ::. ...::.: : ::.: :::...::.::: :..
CCDS11 LAFPDLAEHFDRSAQDTAWISALALAVQQAASPVGSALSTRWGARPVVMVGGVLASLGFV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 LASFATRLLELYLTAGVLTGLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSAL
...::. ::.::: :.:.:.: :: : :.: :. :: ::: :: ::: .:. . :
CCDS11 FSAFASDLLHLYLGLGLLAGFGWALVFAPALGTLSRYFSRRRVLAVGLALTGNGASSLLL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 SPLGQQLLERFGWRGGFLLLGGLLLHCCACGAVMRPPPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEA
.: : ::. :::::..::::.. :: :::.. : :: : ::
CCDS11 APALQLLLDTFGWRGALLLLGAITLHLTPCGALLLPLVLPGDPP-----------AP---
190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE6 EADGAGLQLREASPRVRPRRRL--LDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYA
:: : : :.. : :::...:. :.. : ::: . :. .:
CCDS11 -----------------PRSPLAALGLSLFTRRAFSIFALGTALVGGGYFVPYVHLAPHA
230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 KDAGVPDTDAAFLLSIVGFVDIVARPACGALAG-----LARLRPHVPYLFSLALLANGLT
: :. ::........ : :: .:: :: : :: : .:.: . ::.
CCDS11 LDRGLGGYGAALVVAVAAMGDAGARLVCGWLADQGWVPLPRLLAVFGALTGLGLWVVGLV
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 DLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGMVGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVL
. ... : :.: ::.::: : . : : :: . ::. .: :::... . . :
CCDS11 PVVGGEESWGGPLLAAAVAYGLSAGSYAPLVFGVLPGLVGVGGVVQATGLVMMLMSLGGL
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 IGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSEVALAGVFMAVATNCCL-RCAKAAPSG-PGTEGGA
.::: .: : : .. : :.:: . :.: :. .. : :. :.: . : : :
CCDS11 LGPPLSGFLRDETGDFTASFLLSGSLI-LSGSFIYIGLPRALPSCGPASPPATPPPETGE
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500
pF1KE6 SDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEALEVLSARGEPTEPEIEARPRLAAESV
CCDS11 LLPAPQAVLLSPGGPGSTLDTTC
450 460 470
>>CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs108|chr17 (426 aa)
initn: 819 init1: 583 opt: 591 Z-score: 584.5 bits: 117.4 E(32554): 3.1e-26
Smith-Waterman score: 832; 36.7% identity (61.1% similar) in 450 aa overlap (7-455:3-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDTAWV
:: : ::::::::::. . : .....: .. .::: .. :. . ..:.
CCDS11 MARRTE-PPDGGWGWVVVLSAFFQSALVFGVLRSFGVFFVEFVAAFEEQAARVSWI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGVLTG
.:: .:. .::.: : :.:: :::...::.::. ::.:::::: : .:::. :.:.:
CCDS11 ASIGIAVQQFGSPVGSALSTKFGPRPVVMTGGILAALGMLLASFATSLTHLYLSIGLLSG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGFLLL
: ::.: :.: :. :: ::: ::.::: .: . ...:. : :: ...:::..::.
CCDS11 SGWALTFAPTLACLSCYFSRRRSLATGLALTGVGLSSFTFAPFFQWLLSHYAWRGSLLLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GGLLLHCCACGAVMRPPPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREASPRVRPRR
..: :: ::::..::: . :: ..: ::
CCDS11 SALSLHLVACGALLRPP--------------------SLAEDPAVG----------GPRA
180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 RLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAFLLSIVGFVDI
.: .: : :.:. :. : :.: . :: . .: ::::::.:.. :.
CCDS11 QLTSLL--HHGPFLRYTVALTLINTGYFIPYLHLVAHLQDLDWDPLPAAFLLSVVAISDL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGMV
:.: . : : : : : : :. : .:.. :.. ::::. ::.:.. : .
CCDS11 VGRVVSGWL-GDAVPGP-VTRLLMLWTTLTGVSLALFPVAQAPTALVALAVAYGFTSGAL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSEV
. : : :: .:. :. .:::. ..:. . :.::: .: : :: :: : .::. .
CCDS11 APLAFSVLPELIGTRRIYCGLGLLQMIESIGGLLGPPLSGYLRDVTGNYTASFVVAGAFL
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KE6 -ALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEAL
. .:..... :. . ..:. :: : ::.
CCDS11 LSGSGILLTLPHFFCFSTTTSGPQDLVTE--ALDTKVPLPKEGLEED
390 400 410 420
480 490 500
pF1KE6 EVLSARGEPTEPEIEARPRLAAESV
>>CCDS11675.1 SLC16A6 gene_id:9120|Hs108|chr17 (523 aa)
initn: 716 init1: 491 opt: 491 Z-score: 485.2 bits: 99.4 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 725; 30.5% identity (60.1% similar) in 469 aa overlap (13-444:19-485)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGY
:::::::.: . : : :.::. :. .::: :: .:. .
CCDS11 MTQNKLKLCSKANVYTEVPDGGWGWAVAVSFFFVEVFTYGIIKTFGVFFNDLMDSFNESN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 SDTAWVSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLT
: .:. :: . .: ..:....: .::: : :.. ::::.:.::. :::. .. ..:..
CCDS11 SRISWIISICVFVLTFSAPLATVLSNRFGHRLVVMLGGLLVSTGMVAASFSQEVSHMYVA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AGVLTGLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWR
:...::: ..: :.. .:. :: .:: .....:..: . :..: . : ::.:::
CCDS11 IGIISGLGYCFSFLPTVTILSQYFGKRRSIVTAVASTGECFAVFAFAPAIMALKERIGWR
130 140 150 160 170 180
180 190 200
pF1KE6 GGFLLLGGLLLHCCACGAVMRP-----PPGPG------------------PRPRRDS--A
..:..: : :. ::..:: : .: : :: .
CCDS11 YSLLFVGLLQLNIVIFGALLRPIFIRGPASPKIVIQENRKEAQYMLENEKTRTSIDSIDS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250
pF1KE6 GDRAGDAPGEAEADG-------AGLQ--LREASPRVRPRRR-LLDLAVCTDRAFAVYAVT
: . .: .. . : .: : ..::: .. :::... ...: ::.
CCDS11 GVELTTSPKNVPTHTNLELEPKADMQQVLVKTSPRPSEKKAPLLDFSILKEKSFICYALF
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 KFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAFLLSIVGFVDIVARPACGALAGLARLRPHV
.. .::.:.:.. .. . . :. . :::::: ...... .: . : . . .:
CCDS11 GLFATLGFFAPSLYIIPLGISLGIDQDRAAFLLSTMAIAEVFGRIGAGFVLNREPIRKIY
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 PYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVAFCVAFGLSYGMVGALQFEVLMA--AVGAPRF
:. . ::. .: .. : . .:.. . ::. : .:. .. .: .:: ..
CCDS11 IELICVILLTVSLFAFTFATE--FWGLMSCSIFFGFMVGTIGGTHIPLLAEDDVVGIEKM
370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 PSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIFYLAGSEVALAGVFMAVATNCCLRC
:: :. ..... : : ::: :: ::: : : :: .. .:::.: .:.. : .
CCDS11 SSAAGVYIFIQSIAGLAGPPLAGLLVDQSKIYSRAFYSCAAGMALAAVCLALVRPCKMGL
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 AKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEPGNLEALEVLSARGEPTEPEIEARP
. ::
CCDS11 CQHHHSGETKVVSHRGKTLQDIPEDFLEMDLAKNEHRVHVQMEPV
480 490 500 510 520
>>CCDS2473.1 SLC16A14 gene_id:151473|Hs108|chr2 (510 aa)
initn: 552 init1: 448 opt: 472 Z-score: 466.7 bits: 95.9 E(32554): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 584; 26.1% identity (57.3% similar) in 475 aa overlap (14-436:29-495)
10 20 30 40
pF1KE6 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRA
::::.:... . : : . .: :..:.
CCDS24 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 LMRDFDAGYSDTAWVSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFA
...: . . ::::::. ... .:: ..... ::: . . :::. : : .:...:
CCDS24 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 TRLLELYLTAGVLTGLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQ
. . :..: :: .::: .. . :...:.: ::..:: ::.::...:. .. : .
CCDS24 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE6 QLLERFGWRGGFLLLGGLLLHCCACGAVMRP-PPG-----PGPR-----PRRDSAGDRAG
: ..:::...:. :.. :. :.:::.::: :: :: . : ... . ..
CCDS24 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKST
190 200 210 220 230 240
220 230 240
pF1KE6 DAPGEAEADGAGL---------QLREASPRVRPRRRLLDLAVC-----------------
:..: .:: : .: .. :. . : .
CCDS24 GQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGFEDW
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290
pF1KE6 -----------TDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAF-LLSIVG
:.: :... .. .. .: : : . .. .. . . .: : ::..
CCDS24 YSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTSIIA
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FVDIVARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSS---ARARSYGALVAFCVAF
.: : .. :..: : : . .... :::: :: ..:..:...:. .
CCDS24 IVHIFGKVILGVIADL----PCIS-VWNVFLLANFTLVLSIFILPLMHTYAGLAVICALI
370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 GLSYGMVGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKNYEIIF
:.: :. .:. : :: .. .: :... ... ..:.::: :: . :. ..:.. :
CCDS24 GFSSGYF-SLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSF
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 YLAGSEVALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPVVAEEP
:. : .. .:. . :.:
CCDS24 YICGLLYMIGILFLLIQP--CIRIIEQSRRKYMDGAHV
480 490 500 510
504 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:26:17 2016 done: Tue Nov 8 13:26:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]