FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0488, 1032 aa 1>>>pF1KB0488 1032 - 1032 aa - 1032 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1396+/-0.000954; mu= 4.5011+/- 0.057 mean_var=239.9669+/-48.889, 0's: 0 Z-trim(113.3): 56 B-trim: 88 in 1/51 Lambda= 0.082794 statistics sampled from 13863 (13905) to 13863 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.751), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16 Scan time: 3.700 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22 (1032) 6929 841.6 0 CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7 (1154) 855 116.1 4.2e-25 CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 536) 678 94.7 5.5e-19 CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 492) 675 94.3 6.6e-19 CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 ( 740) 468 69.8 2.5e-11 CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004) 468 69.9 3.1e-11 >>CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22 (1032 aa) initn: 6929 init1: 6929 opt: 6929 Z-score: 4485.7 bits: 841.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6929; 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CCDS53 ATKLLTEKQEELDPESELGKNLSLIPYSLVRAFYCERRRPVLFTPTVLAKTLVQRLLN-S 940 950 960 970 980 990 870 880 890 900 910 920 pF1KB0 SSRLDFQVCPAESLSGEE-LCPSSAPGAPKAQPATPGLGSRIR-AIQESVG--KKHCLLE .. ..: .: .. .. .: : ... .. .:. : : :.:. .:::::: CCDS53 GGAMEFTICKSDIVTRDEFLRRQKTETIIYSREKNPNAFECIAPANIEAVAAKNKHCLLE 1000 1010 1020 1030 1040 1050 930 940 950 960 970 980 pF1KB0 LGARGVRELVQNEIYPIVIHVEVTEKNVREVRGLLGRPGWRDSELLRQCRGSEQVLWGLP : CCDS53 AGIGCTRDLIKSNIYPIVLFIRVCEKNIKRFRKLLPRPETEEEFLRVCRLKEKELEALPC 1060 1070 1080 1090 1100 1110 >>CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (536 aa) initn: 684 init1: 401 opt: 678 Z-score: 454.3 bits: 94.7 E(32554): 5.5e-19 Smith-Waterman score: 949; 35.0% identity (63.4% similar) in 543 aa overlap (24-565:7-518) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ .: : .:: : :. ...:...:::::::.:.. . 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CCDS69 LMKAEDDCKVERK--------HTLKLRHAMEQRPSQ-ELLWELQQEKALLQARVQELEAS 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 LQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQEM .:. ..: ...::.:::.: ..:: . . ... .:. .: : . ..: CCDS69 VQEGKLDRSSP-----YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEK 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 EDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQYR : ..:. .:.:: .:: :. ..: :.::. :::::: .:.... :....: ::: : CCDS69 EMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALR 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 KQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQRAQGGTCLKACASSHSLCSNLSSTWSLS :::: : . ::: . . :. .: .:.: : :.. . : .: .. . CCDS69 KQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQ----LETLVLSSDLEDGSPRRSQEL 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 pF1KB0 EFPSPLGGPEATGEAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEINRLSILPFPPSAGSILRRQREEDP .:. : . . .. . :: :.. : .:. .: : .:: . :.. CCDS69 SLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQ------VLRNPHDAGLSSGEPPEKER 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 pF1KB0 APPKRSFSSMSDITGSVTL-KPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARGCGLDFLNRSLA :.:: .. . . : : : CCDS69 RRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS 500 510 520 530 >>CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (492 aa) initn: 670 init1: 401 opt: 675 Z-score: 452.9 bits: 94.3 E(32554): 6.6e-19 Smith-Waterman score: 947; 36.2% identity (65.0% similar) in 506 aa overlap (24-529:7-481) 10 20 30 40 50 60 pF1KB0 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ .: : .:: : :. ...:...:::::::.:.. . CCDS48 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB0 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC :::.::: . : ..: :.:::. :..:: ::::.::.:::. . .::.:::. 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CCDS48 LMKAEDDCKVERK--------HTLKLRHAMEQRPSQ-ELLWELQQEKALLQARVQELEAS 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KB0 LQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQEM .:. ..: ...::.:::.: ..:: . . ... .:. .: : . ..: CCDS48 VQEGKLDRSSP-----YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEK 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KB0 EDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQYR : ..:. .:.:: .:: :. ..: :.::. :::::: .:.... :....: ::: : CCDS48 EMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALR 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB0 KQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQRAQGGTCLKACASSHSLCSNLSSTWSLS :::: : . ::: . . :. .: .:.: : :.. . : .: .. . 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