FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3292, 763 aa 1>>>pF1KE3292 763 - 763 aa - 763 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4924+/-0.00129; mu= -4.7028+/- 0.076 mean_var=328.3235+/-74.482, 0's: 0 Z-trim(109.1): 460 B-trim: 59 in 1/51 Lambda= 0.070782 statistics sampled from 10177 (10690) to 10177 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16 Scan time: 3.240 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS42925.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 763) 5180 543.9 3.5e-154 CCDS13653.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 754) 4664 491.2 2.5e-138 CCDS42926.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 584) 3779 400.8 3.3e-111 CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 529) 3478 370.0 5.5e-102 CCDS12543.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 629) 2538 274.1 4.9e-73 CCDS12544.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 601) 2058 225.0 2.7e-58 CCDS46075.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 589) 2010 220.1 8e-57 CCDS31000.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 568) 972 114.1 6.3e-25 CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 588) 972 114.1 6.5e-25 CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 528) 963 113.2 1.1e-24 CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 601) 963 113.2 1.2e-24 CCDS8530.1 DYRK4 gene_id:8798|Hs108|chr12 ( 520) 927 109.5 1.4e-23 CCDS75666.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1171) 771 93.9 1.6e-18 CCDS75667.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1198) 769 93.7 1.9e-18 CCDS868.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1075) 765 93.2 2.3e-18 CCDS867.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1210) 765 93.2 2.6e-18 CCDS41634.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1194) 746 91.3 9.7e-18 CCDS7884.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1215) 746 91.3 9.8e-18 CCDS12555.1 HIPK4 gene_id:147746|Hs108|chr19 ( 616) 645 80.7 7.6e-15 CCDS4488.1 PRPF4B gene_id:8899|Hs108|chr6 (1007) 616 78.0 8.5e-14 >>CCDS42925.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 (763 aa) initn: 5180 init1: 5180 opt: 5180 Z-score: 2881.6 bits: 543.9 E(32554): 3.5e-154 Smith-Waterman score: 5180; 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CCDS42 HFTAAVQAMDCETHSPQVSSHVVHLLVSPAILRWSSTGCQVPLE 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 PQQNALHHHHGNSSHHHHHHHHHHHHHGQQALGNRTRPRVYNSPTNSSSTQDSMEVGHSH >>CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 (529 aa) initn: 3477 init1: 3477 opt: 3478 Z-score: 1944.4 bits: 370.0 E(32554): 5.5e-102 Smith-Waterman score: 3478; 98.3% identity (99.2% similar) in 528 aa overlap (1-528:1-528) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MHTGGETSACKPSSVRLAPSFSFHAAGLQMAGQMPHSHQYSDRRQPNISDQQVSALSYSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 MHTGGETSACKPSSVRLAPSFSFHAAGLQMAGQMPHSHQYSDRRQPNISDQQVSALSYSD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QIQQPLTNQVMPDIVMLQRRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRHQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 QIQQPLTNQVMPDIVMLQRRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRHQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 QGQGDDSSHKKERKVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 QGQGDDSSHKKERKVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 EQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 EQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 LSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 LSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 SAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 FSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 FSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 RKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 RKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 KTADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDPTHQHRHSGG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. . .: .: CCDS13 KTADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGASAISCSSWLVRH 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 HFTAAVQAMDCETHSPQVRQQFPAPLGWSGTEAPTQVTVETHPVQETTFHVAPQQNALHH >>CCDS12543.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 (629 aa) initn: 2472 init1: 2446 opt: 2538 Z-score: 1424.6 bits: 274.1 E(32554): 4.9e-73 Smith-Waterman score: 2538; 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36.3% identity (66.7% similar) in 463 aa overlap (38-494:70-517) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 SACKPSSVRLAPSFSFHAAGLQMAGQMPHSHQYSDRRQPNISDQQVSALSYSDQIQQPLT .....:.. .: : ...: :.. . : . CCDS31 RRLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTI---QSDGISDSEKCS-PTV 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 NQVMPDIVMLQRRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRHQQGQGDDS .: . . . .. . : ..:: .. .: ::: .: . . . CCDS31 SQGKSSDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQA--LKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGP 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 SHKKERKVY----NDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQE . ::.. : : :::: . :: .. :::. ..:::::::::...::. .. CCDS31 NAKKRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQ 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 WVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSY .::.:...:.: : :: :.:.:: ..:.: .. ..:. . : ::::.:..::.:: CCDS31 YVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSI 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAI .::.:.....:.: :..:.:::::.. .: : . .::::::::::::: . ::. CCDS31 DLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSL--DALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSST 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSG :..:::::: :..: ::::::::.::..:: :. ::.::.::::.:. ::.::: : CCDS31 KVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPG 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 ANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEK--LPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTR .: ::. ..:.::.:: ..:.:. .:. :... .: .. ::. .: CCDS31 EDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYC-SVTTQADGRVVLVGGRSR 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKK . : . : ::.. : . . ::: : ... : : .::..:. : ::.: ...: CCDS31 R-----GKKRGPPGSKDWGTALKGCDDYL-FIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISK 460 470 480 490 500 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 TADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDPTHQHRHSGGH .. . .: ..:: CCDS31 SVPRPLTTIDKVSGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETNGSIPLCSVLP 510 520 530 540 550 560 >>CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 (588 aa) initn: 925 init1: 470 opt: 972 Z-score: 560.8 bits: 114.1 E(32554): 6.5e-25 Smith-Waterman score: 972; 36.3% identity (66.7% similar) in 463 aa overlap (38-494:90-537) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 SACKPSSVRLAPSFSFHAAGLQMAGQMPHSHQYSDRRQPNISDQQVSALSYSDQIQQPLT .....:.. .: : ...: :.. . : . CCDS30 RRLNMTTEQFTGDHTQHFLDGGEMKVEQLFQEFGNRKSNTI---QSDGISDSEKCS-PTV 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 NQVMPDIVMLQRRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRHQQGQGDDS .: . . . .. . : ..:: .. .: ::: .: . . . CCDS30 SQGKSSDCLNTVKSNSSSKAPKVVPLTPEQA--LKQYKHHLTAYEKLEIINYPEIYFVGP 120 130 140 150 160 170 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 SHKKERKVY----NDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQE . ::.. : : :::: . :: .. :::. ..:::::::::...::. .. CCDS30 NAKKRHGVIGGPNNGGYDDADGAYIHVPRDHLAYRYEVLKIIGKGSFGQVARVYDHKLRQ 180 190 200 210 220 230 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 WVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSY .::.:...:.: : :: :.:.:: ..:.: .. ..:. . : ::::.:..::.:: CCDS30 YVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLKKQDKTGSMNVIHMLESFTFRNHVCMAFELLSI 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAI .::.:.....:.: :..:.:::::.. .: : . .::::::::::::: . ::. CCDS30 DLYELIKKNKFQGFSVQLVRKFAQSILQSL--DALHKNKIIHCDLKPENILLKHHGRSST 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 KIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSG :..:::::: :..: ::::::::.::..:: :. ::.::.::::.:. ::.::: : CCDS30 KVIDFGSSCFEYQKLYTYIQSRFYRAPEIILGSRYSTPIDIWSFGCILAELLTGQPLFPG 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 ANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEK--LPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTR .: ::. ..:.::.:: ..:.:. .:. :... .: .. ::. .: CCDS30 EDEGDQLACMMELLGMPPPKLLEQSKRAKYFINSKGIPRYC-SVTTQADGRVVLVGGRSR 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKK . : . : ::.. : . . ::: : ... : : .::..:. : ::.: ...: CCDS30 R-----GKKRGPPGSKDWGTALKGCDDYL-FIEFLKRCLHWDPSARLTPAQALRHPWISK 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 TADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDPTHQHRHSGGH .. . .: ..:: CCDS30 SVPRPLTTIDKVSGKRVVNPASAFQGLGSKLPPVVGIANKLKANLMSETNGSIPLCSVLP 530 540 550 560 570 580 >>CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 (528 aa) initn: 892 init1: 480 opt: 963 Z-score: 556.4 bits: 113.2 E(32554): 1.1e-24 Smith-Waterman score: 969; 39.9% identity (67.1% similar) in 416 aa overlap (109-522:107-501) 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 RRMPQTFRDPATAPLRKLSVDLIKTYKHINEVYYAKKKRRHQQGQGDDSSHKKERKVYND :.:. . ...::. . : CCDS89 KATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPEIYFLGLNAKKRQGMTGGPN--------NG 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 GYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLN :::::. .:. .. :::. ..::::::::::::::. .. ::.:...:.: : CCDS89 GYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKGSFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHR 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 QAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVS :: :.:.:: . :.: . . ..:. ..: ::::.:..::.::.:::.:.....:.: : CCDS89 QAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENFTFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFS 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 LNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRI : :.::::... : : . ::::::::::::: . ::.::..:::::: ::. CCDS89 LPLVRKFAHSILQCLD--ALHKNRIIHCDLKPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRV 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 YQYIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLG : ::::::::.:::.:: : . ::::::::::.:. :: ::. : .: ::. ..:.:: CCDS89 YTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLGCILAELLTGYPLLPGEDEGDQLACMIELLG 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 IPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKT-KDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGR .: ..:: . .:..: . . : .::. . .:. : : : .: CCDS89 MPSQKLLDASKRAKNFVSSKGYPRYCTVTTLSDGSVVLNGGRSRR-----GKLRGPPESR 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 RAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKKTADEG-TNTSNSVSTS . :.. . : : : :.. . :..:: .:. : ::.: .... . :. ..::. CCDS89 EWGNALKGCDDPL-FLDFLKQCLEWDPAVRMTPGQALRHPWLRRRLPKPPTGEKTSVK-- 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 PAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGRARSDPTHQHRHSGGHFTAAVQAMDCETHSP . ..:.:. .: :. ::..: CCDS89 ---RITESTGAITSISKLPPPSSSASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS 480 490 500 510 520 763 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 02:09:45 2016 done: Tue Nov 8 02:09:46 2016 Total Scan time: 3.240 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]