FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3323, 917 aa 1>>>pF1KE3323 917 - 917 aa - 917 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1774+/-0.000422; mu= 6.7031+/- 0.027 mean_var=267.3867+/-54.878, 0's: 0 Z-trim(120.8): 12 B-trim: 968 in 1/54 Lambda= 0.078434 statistics sampled from 36411 (36423) to 36411 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16 Scan time: 15.700 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001188263 (OMIM: 189901) GC-rich sequence DNA-b ( 612) 1170 146.1 4.9e-34 XP_011531376 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich seq ( 706) 1170 146.2 5.4e-34 NP_003194 (OMIM: 189901) GC-rich sequence DNA-bind ( 781) 1170 146.2 5.8e-34 XP_005264577 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich seq ( 789) 1170 146.2 5.9e-34 XP_016860277 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich seq ( 416) 300 47.5 0.00016 XP_016860276 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich seq ( 424) 300 47.5 0.00016 XP_011531377 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich seq ( 424) 300 47.5 0.00016 >>NP_001188263 (OMIM: 189901) GC-rich sequence DNA-bindi (612 aa) initn: 1328 init1: 550 opt: 1170 Z-score: 732.0 bits: 146.1 E(85289): 4.9e-34 Smith-Waterman score: 1338; 34.7% identity (68.6% similar) in 663 aa overlap (255-915:3-610) 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 IHAARKKRQMARELGDFTPHDNEPGKGRLVREDENDASDDEDDDEKRRIVFSVKEKSQRQ ::.:.: ..: ::...:: :... .. :: NP_001 MKRESEDDP-ESEPDDHEKRIPFTLRPQTLRQ 10 20 30 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 KIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQEQIRKGINIPQVQASQPAEVNMYYQNTYQT ..::: .: . .... ...::. . :::.:.::...: . . .... : NP_001 RMAEE-SI-SRNEETSEESQEDEKQDTWEQQQMRKAVKIIEER-----DIDLSCGN---- 40 50 60 70 80 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 MPYGSSYGIPYSYTAYGSSDAKSQKTDNTVPFKTPSNEMTPVTIDLVKKQLKDRLDSMKE ::: : .: :... : : ::.....::::. :: ..: NP_001 ---GSS---------------KVKKFDTSISF--P-----PVNLEIIKKQLNTRLTLLQE 90 100 110 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 LHKTNRQQHEKHLQSRVDSTRAIERLEGSSGGIGERYKFLQEMRGYVQDLLECFSEKVPL :... ...::..:. .: .:. ::.::. . :: . :. ::..:..:..::. NP_001 THRSHLREYEKYVQDVKSSKSTIQNLESSSNQ-ALNCKFYKSMKIYVENLIDCLNEKIIN 120 130 140 150 160 170 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 INELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDESSEFSSHSNKALMAPNLDSFGRDRALYQEH :.:.::..: : ..: ...::::..: ::. ... : : . . .:. : :. NP_001 IQEIESSMHALLLKQAMTFMKRRQDELKHESTYLQQLSRKDETSTS-GNFSVD-----EK 180 190 200 210 220 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 AKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLEGLSSDDEETSTDITNFNLEKDRISKESGKV .. . : :.:::.::::: .:. .: :: ::::: :... .:. . : ... :: NP_001 TQWILEEIESRRTKRRQARVLSGN-CNHQEGTSSDDELPSAEMIDFQKSQGDILQKQKKV 230 240 250 260 270 280 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 FEDVLESFYSIDCIKSQFEAWRSKYYTSYKDAYIGLCLPKLFNPLIRLQLLTWTPLEAKC ::.: ..: .:. : .:. :: :. :: .:.:.::.:::.:::::.::. :.::. . NP_001 FEEVQDDFCNIQNILLKFQQWREKFPDSYYEAFISLCIPKLLNPLIRVQLIDWNPLKLES 290 300 310 320 330 340 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 RDFENMLWFESLLFY--GCEEREQEKDDVDVALLPTIVEKVILPKLTVIAENMWDPFSTT ...: ::.:. . . : ..... : .: .:..:.:.:.:: ..: .:::.::. NP_001 TGLKEMPWFKSVEEFMDSSVEDSKKESSSDKKVLSAIINKTIIPRLTDFVEFLWDPLSTS 350 360 370 380 390 400 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 QTSRMVGITLKLINGYPSVVNAENKNTQVYLKALLLRMRRTLDDDVFMPLYPKNVLENKN ::. .. ... . . : .:. : ::... ::.....::::.:::::...:::. NP_001 QTTSLITHCRVILEEHSTCENEVSKSRQDLLKSIVSRMKKAVEDDVFIPLYPKSAVENKT 410 420 430 440 450 460 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 SGPYLFFQRQFWSSVKLLGNFLQWYGIFSNKTLQELSIDGLLNRYILMAFQNSEYGDDSI : : .:::::..::. :.: : :.... :::::.. :::::...:. :. : : . NP_001 SPHSKFQERQFWSGLKLFRNILLWNGLLTDDTLQELGLGKLLNRYLIIALLNATPGPDVV 470 480 490 500 510 520 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 KKAQNVINCFPKQWFMNLKGERTISQLENFCRYLVHLADTIYRNSIGCSDVEKRNARENI :: ..: :.:..:: : . .: ::::: ..:.. : . :. . :... NP_001 KKCNQVAACLPEKWFENSAMRTSIPQLENFIQFLLQSAHKLSRSEF----------RDEV 530 540 550 560 570 890 900 910 pF1KE3 KQIVKLLASVRALDHAMSVASDHNVKEFKSLIEGK ..:. .:....::..: : ..:.. ..::::. NP_001 EEIILILVKIKALNQAESFIGEHHLDHLKSLIKED 580 590 600 610 >>XP_011531376 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich sequenc (706 aa) initn: 1309 init1: 550 opt: 1170 Z-score: 731.2 bits: 146.2 E(85289): 5.4e-34 Smith-Waterman score: 1277; 32.3% identity (64.3% similar) in 753 aa overlap (170-915:15-704) 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 KEDLEKSKIKTELNSSAESEQPLDKTGHVKDTNQEDGVIIS--EHGED-EMDMESEKEEE :... ::. : : : :. . . ::: XP_011 MAHRPKRTFRQRAADSSDSDGAEESPAEPGAPRELPVPGSAEEE 10 20 30 40 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 KPKTGGAFSNALSSLNVLRPGEIPDAAFIHAARKKRQMARELGDFTPHDNEPGKGRL--V :. :: . : : : . . :. .. : .:. .: ...: : XP_011 PPSGGGRAQVAGLPHRVRGPR---GRGRVWASSRRATKA------APRADEGSESRTLDV 50 60 70 80 90 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 REDENDASDDEDDDEKRRIVFSVKEKSQRQKIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQ ::.: .... . . : . .: .: : . . .... ...::. . ::: XP_011 STDEEDKIHHSSESKDDQGLSSDSSSSLGEK--ELSSTVSRNEETSEESQEDEKQDTWEQ 100 110 120 130 140 150 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 EQIRKGINIPQVQASQPAEVNMYYQNTYQTMPYGSSYGIPYSYTAYGSSDAKSQKTDNTV .:.::...: . . .... : ::: : .: :... XP_011 QQMRKAVKIIEER-----DIDLSCGN-------GSS---------------KVKKFDTSI 160 170 180 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 PFKTPSNEMTPVTIDLVKKQLKDRLDSMKELHKTNRQQHEKHLQSRVDSTRAIERLEGSS : : ::.....::::. :: ..: :... ...::..:. .: .:. ::.:: XP_011 SF--P-----PVNLEIIKKQLNTRLTLLQETHRSHLREYEKYVQDVKSSKSTIQNLESSS 190 200 210 220 230 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 GGIGERYKFLQEMRGYVQDLLECFSEKVPLINELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDE . . :: . :. ::..:..:..::. :.:.::..: : ..: ...::::..: : XP_011 NQ-ALNCKFYKSMKIYVENLIDCLNEKIINIQEIESSMHALLLKQAMTFMKRRQDELKHE 240 250 260 270 280 290 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 SSEFSSHSNKALMAPNLDSFGRDRALYQEHAKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLE :. ... : : . . .:. : :... . : :.:::.::::: .:. .: : XP_011 STYLQQLSRKDETSTS-GNFSVD-----EKTQWILEEIESRRTKRRQARVLSGN-CNHQE 300 310 320 330 340 350 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 GLSSDDEETSTDITNFNLEKDRISKESGKVFEDVLESFYSIDCIKSQFEAWRSKYYTSYK : ::::: :... .:. . : ... ::::.: ..: .:. : .:. :: :. :: XP_011 GTSSDDELPSAEMIDFQKSQGDILQKQKKVFEEVQDDFCNIQNILLKFQQWREKFPDSYY 360 370 380 390 400 410 620 630 640 650 660 670 pF1KE3 DAYIGLCLPKLFNPLIRLQLLTWTPLEAKCRDFENMLWFESLLFY--GCEEREQEKDDVD .:.:.::.:::.:::::.::. :.::. . ...: ::.:. . . : ..... : XP_011 EAFISLCIPKLLNPLIRVQLIDWNPLKLESTGLKEMPWFKSVEEFMDSSVEDSKKESSSD 420 430 440 450 460 470 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 VALLPTIVEKVILPKLTVIAENMWDPFSTTQTSRMVGITLKLINGYPSVVNAENKNTQVY .: .:..:.:.:.:: ..: .:::.::.::. .. ... . . : .:. : XP_011 KKVLSAIINKTIIPRLTDFVEFLWDPLSTSQTTSLITHCRVILEEHSTCENEVSKSRQDL 480 490 500 510 520 530 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 LKALLLRMRRTLDDDVFMPLYPKNVLENKNSGPYLFFQRQFWSSVKLLGNFLQWYGIFSN ::... ::.....::::.:::::...:::.: : .:::::..::. :.: : :.... XP_011 LKSIVSRMKKAVEDDVFIPLYPKSAVENKTSPHSKFQERQFWSGLKLFRNILLWNGLLTD 540 550 560 570 580 590 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 KTLQELSIDGLLNRYILMAFQNSEYGDDSIKKAQNVINCFPKQWFMNLKGERTISQLENF :::::.. :::::...:. :. : : .:: ..: :.:..:: : . .: ::::: XP_011 DTLQELGLGKLLNRYLIIALLNATPGPDVVKKCNQVAACLPEKWFENSAMRTSIPQLENF 600 610 620 630 640 650 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 CRYLVHLADTIYRNSIGCSDVEKRNARENIKQIVKLLASVRALDHAMSVASDHNVKEFKS ..:.. : . :. . :.....:. .:....::..: : ..:.. ..:: XP_011 IQFLLQSAHKLSRSEF----------RDEVEEIILILVKIKALNQAESFIGEHHLDHLKS 660 670 680 690 700 pF1KE3 LIEGK ::. XP_011 LIKED >>NP_003194 (OMIM: 189901) GC-rich sequence DNA-binding (781 aa) initn: 1483 init1: 550 opt: 1170 Z-score: 730.7 bits: 146.2 E(85289): 5.8e-34 Smith-Waterman score: 1447; 33.9% identity (68.0% similar) in 741 aa overlap (179-915:95-779) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 KTELNSSAESEQPLDKTGHVKDTNQEDGVIISEHGEDEMDMESEKEEEKPKTGGAFSNAL .: ::.. ::..... .. . :..: NP_003 RGRGRVWASSRRATKAAPRADEGSESRTLDVSTDEEDKIHHSSESKDDQGLSSDS-SSSL 70 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 SSLNVLRPGEIPDAAFIHAARKKRQMARELGDFTPHD--NEPGKGRLVREDENDASDDED . .. .:::::::.:::.::..:: :. : . . . . ::.:.: .. : NP_003 GEKELSSTVKIPDAAFIQAARRKRELARAQDDYISLDVQHTSSISGMKRESEDDPESEPD 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 DDEKRRIVFSVKEKSQRQKIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQEQIRKGINIPQV : ::: : :... .. ::..::: .: . .... ...::. . :::.:.::...: . NP_003 DHEKR-IPFTLRPQTLRQRMAEE-SI-SRNEETSEESQEDEKQDTWEQQQMRKAVKIIEE 190 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 QASQPAEVNMYYQNTYQTMPYGSSYGIPYSYTAYGSSDAKSQKTDNTVPFKTPSNEMTPV . .... . :....: .: :... : : :: NP_003 R-----DIDL----------------------SCGNGSSKVKKFDTSISF--P-----PV 250 260 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 TIDLVKKQLKDRLDSMKELHKTNRQQHEKHLQSRVDSTRAIERLEGSSGGIGERYKFLQE .....::::. :: ..: :... ...::..:. .: .:. ::.::. . :: . NP_003 NLEIIKKQLNTRLTLLQETHRSHLREYEKYVQDVKSSKSTIQNLESSSNQ-ALNCKFYKS 270 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 MRGYVQDLLECFSEKVPLINELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDESSEFSSHSNKAL :. ::..:..:..::. :.:.::..: : ..: ...::::..: ::. ... : : NP_003 MKIYVENLIDCLNEKIINIQEIESSMHALLLKQAMTFMKRRQDELKHESTYLQQLSRKDE 330 340 350 360 370 380 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 MAPNLDSFGRDRALYQEHAKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLEGLSSDDEETSTD . . .:. : :... . : :.:::.::::: .:. .: :: ::::: :.. NP_003 TSTS-GNFSVD-----EKTQWILEEIESRRTKRRQARVLSGN-CNHQEGTSSDDELPSAE 390 400 410 420 430 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 ITNFNLEKDRISKESGKVFEDVLESFYSIDCIKSQFEAWRSKYYTSYKDAYIGLCLPKLF . .:. . : ... ::::.: ..: .:. : .:. :: :. :: .:.:.::.:::. NP_003 MIDFQKSQGDILQKQKKVFEEVQDDFCNIQNILLKFQQWREKFPDSYYEAFISLCIPKLL 440 450 460 470 480 490 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 NPLIRLQLLTWTPLEAKCRDFENMLWFESLLFY--GCEEREQEKDDVDVALLPTIVEKVI :::::.::. :.::. . ...: ::.:. . . : ..... : .: .:..:.: NP_003 NPLIRVQLIDWNPLKLESTGLKEMPWFKSVEEFMDSSVEDSKKESSSDKKVLSAIINKTI 500 510 520 530 540 550 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 LPKLTVIAENMWDPFSTTQTSRMVGITLKLINGYPSVVNAENKNTQVYLKALLLRMRRTL .:.:: ..: .:::.::.::. .. ... . . : .:. : ::... ::.... NP_003 IPRLTDFVEFLWDPLSTSQTTSLITHCRVILEEHSTCENEVSKSRQDLLKSIVSRMKKAV 560 570 580 590 600 610 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 DDDVFMPLYPKNVLENKNSGPYLFFQRQFWSSVKLLGNFLQWYGIFSNKTLQELSIDGLL .::::.:::::...:::.: : .:::::..::. :.: : :.... :::::.. :: NP_003 EDDVFIPLYPKSAVENKTSPHSKFQERQFWSGLKLFRNILLWNGLLTDDTLQELGLGKLL 620 630 640 650 660 670 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 NRYILMAFQNSEYGDDSIKKAQNVINCFPKQWFMNLKGERTISQLENFCRYLVHLADTIY :::...:. :. : : .:: ..: :.:..:: : . .: ::::: ..:.. : . NP_003 NRYLIIALLNATPGPDVVKKCNQVAACLPEKWFENSAMRTSIPQLENFIQFLLQSAHKLS 680 690 700 710 720 730 870 880 890 900 910 pF1KE3 RNSIGCSDVEKRNARENIKQIVKLLASVRALDHAMSVASDHNVKEFKSLIEGK :. . :.....:. .:....::..: : ..:.. ..::::. NP_003 RSEF----------RDEVEEIILILVKIKALNQAESFIGEHHLDHLKSLIKED 740 750 760 770 780 >>XP_005264577 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich sequenc (789 aa) initn: 1483 init1: 550 opt: 1170 Z-score: 730.6 bits: 146.2 E(85289): 5.9e-34 Smith-Waterman score: 1445; 34.3% identity (67.9% similar) in 750 aa overlap (171-915:97-787) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 EDLEKSKIKTELNSSAESEQPLDKTGHVKDTNQEDGVIISEHGEDEMDMESEKEEEKPKT :..:: . : ...:.. . :.. . XP_005 RGRVWASSRRATKAAPRADEGSESRTLDVSTDEEDKIHHSSESKDDQGLSSDSSSSLGEK 70 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 pF1KE3 GGAFSNALSSLNVLRPG-EIPDAAFIHAARKKRQMARELGDFTPHD--NEPGKGRLVRED .:...:: : :. .:::::::.:::.::..:: :. : . . . . ::. XP_005 --ELSSTVSS--SLFPSVKIPDAAFIQAARRKRELARAQDDYISLDVQHTSSISGMKRES 130 140 150 160 170 180 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 ENDASDDEDDDEKRRIVFSVKEKSQRQKIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQEQI :.: ..: ::...:: :... .. ::..::: .: . .... ...::. . :::.:. XP_005 EDDP-ESEPDDHEKRIPFTLRPQTLRQRMAEE-SI-SRNEETSEESQEDEKQDTWEQQQM 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 RKGINIPQVQASQPAEVNMYYQNTYQTMPYGSSYGIPYSYTAYGSSDAKSQKTDNTVPFK ::...: . . .... : ::: : .: :... : XP_005 RKAVKIIEER-----DIDLSCGN-------GSS---------------KVKKFDTSISF- 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 TPSNEMTPVTIDLVKKQLKDRLDSMKELHKTNRQQHEKHLQSRVDSTRAIERLEGSSGGI : ::.....::::. :: ..: :... ...::..:. .: .:. ::.::. XP_005 -P-----PVNLEIIKKQLNTRLTLLQETHRSHLREYEKYVQDVKSSKSTIQNLESSSNQ- 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 GERYKFLQEMRGYVQDLLECFSEKVPLINELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDESSE . :: . :. ::..:..:..::. :.:.::..: : ..: ...::::..: ::. XP_005 ALNCKFYKSMKIYVENLIDCLNEKIINIQEIESSMHALLLKQAMTFMKRRQDELKHESTY 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 FSSHSNKALMAPNLDSFGRDRALYQEHAKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLEGLS ... : : . . .:. : :... . : :.:::.::::: .:. .: :: : XP_005 LQQLSRKDETSTS-GNFSVD-----EKTQWILEEIESRRTKRRQARVLSGN-CNHQEGTS 390 400 410 420 430 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 SDDEETSTDITNFNLEKDRISKESGKVFEDVLESFYSIDCIKSQFEAWRSKYYTSYKDAY :::: :... .:. . : ... ::::.: ..: .:. : .:. :: :. :: .:. XP_005 SDDELPSAEMIDFQKSQGDILQKQKKVFEEVQDDFCNIQNILLKFQQWREKFPDSYYEAF 440 450 460 470 480 490 620 630 640 650 660 670 pF1KE3 IGLCLPKLFNPLIRLQLLTWTPLEAKCRDFENMLWFESLLFY--GCEEREQEKDDVDVAL :.::.:::.:::::.::. :.::. . ...: ::.:. . . : ..... : . XP_005 ISLCIPKLLNPLIRVQLIDWNPLKLESTGLKEMPWFKSVEEFMDSSVEDSKKESSSDKKV 500 510 520 530 540 550 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 LPTIVEKVILPKLTVIAENMWDPFSTTQTSRMVGITLKLINGYPSVVNAENKNTQVYLKA : .:..:.:.:.:: ..: .:::.::.::. .. ... . . : .:. : ::. XP_005 LSAIINKTIIPRLTDFVEFLWDPLSTSQTTSLITHCRVILEEHSTCENEVSKSRQDLLKS 560 570 580 590 600 610 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 LLLRMRRTLDDDVFMPLYPKNVLENKNSGPYLFFQRQFWSSVKLLGNFLQWYGIFSNKTL .. ::.....::::.:::::...:::.: : .:::::..::. :.: : :.... :: XP_005 IVSRMKKAVEDDVFIPLYPKSAVENKTSPHSKFQERQFWSGLKLFRNILLWNGLLTDDTL 620 630 640 650 660 670 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 QELSIDGLLNRYILMAFQNSEYGDDSIKKAQNVINCFPKQWFMNLKGERTISQLENFCRY :::.. :::::...:. :. : : .:: ..: :.:..:: : . .: ::::: .. XP_005 QELGLGKLLNRYLIIALLNATPGPDVVKKCNQVAACLPEKWFENSAMRTSIPQLENFIQF 680 690 700 710 720 730 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 LVHLADTIYRNSIGCSDVEKRNARENIKQIVKLLASVRALDHAMSVASDHNVKEFKSLIE :.. : . :. . :.....:. .:....::..: : ..:.. ..::::. XP_005 LLQSAHKLSRSEF----------RDEVEEIILILVKIKALNQAESFIGEHHLDHLKSLIK 740 750 760 770 780 pF1KE3 GK XP_005 ED >>XP_016860277 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich sequenc (416 aa) initn: 586 init1: 173 opt: 300 Z-score: 202.2 bits: 47.5 E(85289): 0.00016 Smith-Waterman score: 500; 30.0% identity (63.9% similar) in 360 aa overlap (179-536:95-409) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 KTELNSSAESEQPLDKTGHVKDTNQEDGVIISEHGEDEMDMESEKEEEKPKTGGAFSNAL .: ::.. ::..... .. . :..: XP_016 RGRGRVWASSRRATKAAPRADEGSESRTLDVSTDEEDKIHHSSESKDDQGLSSDS-SSSL 70 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 SSLNVLRPGEIPDAAFIHAARKKRQMARELGDFTPHD--NEPGKGRLVREDENDASDDED . .. .:::::::.:::.::..:: :. : . . . . ::.:.: ..: XP_016 GEKELSSTVKIPDAAFIQAARRKRELARAQDDYISLDVQHTSSISGMKRESEDDP-ESEP 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 DDEKRRIVFSVKEKSQRQKIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQEQIRKGINIPQV ::...:: :... .. ::..::: .: . .... ...::. . :::.:.::...: . XP_016 DDHEKRIPFTLRPQTLRQRMAEE-SI-SRNEETSEESQEDEKQDTWEQQQMRKAVKIIEE 190 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 QASQPAEVNMYYQNTYQTMPYGSSYGIPYSYTAYGSSDAKSQKTDNTVPFKTPSNEMTPV . .... : ::: : .: :... : : :: XP_016 R-----DIDLSCGN-------GSS---------------KVKKFDTSISF--P-----PV 250 260 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 TIDLVKKQLKDRLDSMKELHKTNRQQHEKHLQSRVDSTRAIERLEGSSGGIGERYKFLQE .....::::. :: ..: :... ...::..:. .: .:. ::.::. . :: . XP_016 NLEIIKKQLNTRLTLLQETHRSHLREYEKYVQDVKSSKSTIQNLESSSNQ-ALNCKFYKS 270 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 MRGYVQDLLECFSEKVPLINELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDESSEFSSHSNKAL :. ::..:..:..::. :.:.::..: : ..: ...::::..: ::. ... : : XP_016 MKIYVENLIDCLNEKIINIQEIESSMHALLLKQAMTFMKRRQDELKHESTYLQQLSRKDE 330 340 350 360 370 380 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 MAPNLDSFGRDRALYQEHAKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLEGLSSDDEETSTD . . .:. : :... . : :.:: XP_016 TSTS-GNFSVD-----EKTQWILEEIESRRYLYKVKI 390 400 410 >>XP_016860276 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich sequenc (424 aa) initn: 586 init1: 173 opt: 300 Z-score: 202.0 bits: 47.5 E(85289): 0.00016 Smith-Waterman score: 498; 30.4% identity (63.7% similar) in 369 aa overlap (171-536:97-417) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 EDLEKSKIKTELNSSAESEQPLDKTGHVKDTNQEDGVIISEHGEDEMDMESEKEEEKPKT :..:: . : ...:.. . :.. . XP_016 RGRVWASSRRATKAAPRADEGSESRTLDVSTDEEDKIHHSSESKDDQGLSSDSSSSLGEK 70 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 pF1KE3 GGAFSNALSSLNVLRPG-EIPDAAFIHAARKKRQMARELGDFTPHD--NEPGKGRLVRED .:...:: : :. .:::::::.:::.::..:: :. : . . . . ::. XP_016 --ELSSTVSS--SLFPSVKIPDAAFIQAARRKRELARAQDDYISLDVQHTSSISGMKRES 130 140 150 160 170 180 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 ENDASDDEDDDEKRRIVFSVKEKSQRQKIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQEQI :.: ..: ::...:: :... .. ::..::: .: . .... ...::. . :::.:. XP_016 EDDP-ESEPDDHEKRIPFTLRPQTLRQRMAEE-SI-SRNEETSEESQEDEKQDTWEQQQM 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 RKGINIPQVQASQPAEVNMYYQNTYQTMPYGSSYGIPYSYTAYGSSDAKSQKTDNTVPFK ::...: . . .... : ::: : .: :... : XP_016 RKAVKIIEER-----DIDLSCGN-------GSS---------------KVKKFDTSISF- 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 TPSNEMTPVTIDLVKKQLKDRLDSMKELHKTNRQQHEKHLQSRVDSTRAIERLEGSSGGI : ::.....::::. :: ..: :... ...::..:. .: .:. ::.::. XP_016 -P-----PVNLEIIKKQLNTRLTLLQETHRSHLREYEKYVQDVKSSKSTIQNLESSSNQ- 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 GERYKFLQEMRGYVQDLLECFSEKVPLINELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDESSE . :: . :. ::..:..:..::. :.:.::..: : ..: ...::::..: ::. XP_016 ALNCKFYKSMKIYVENLIDCLNEKIINIQEIESSMHALLLKQAMTFMKRRQDELKHESTY 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 FSSHSNKALMAPNLDSFGRDRALYQEHAKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLEGLS ... : : . . .:. : :... . : :.:: XP_016 LQQLSRKDETSTS-GNFSVD-----EKTQWILEEIESRRYLYKVKI 390 400 410 420 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 SDDEETSTDITNFNLEKDRISKESGKVFEDVLESFYSIDCIKSQFEAWRSKYYTSYKDAY >>XP_011531377 (OMIM: 189901) PREDICTED: GC-rich sequenc (424 aa) initn: 586 init1: 173 opt: 300 Z-score: 202.0 bits: 47.5 E(85289): 0.00016 Smith-Waterman score: 498; 30.4% identity (63.7% similar) in 369 aa overlap (171-536:97-417) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 EDLEKSKIKTELNSSAESEQPLDKTGHVKDTNQEDGVIISEHGEDEMDMESEKEEEKPKT :..:: . : ...:.. . :.. . XP_011 RGRVWASSRRATKAAPRADEGSESRTLDVSTDEEDKIHHSSESKDDQGLSSDSSSSLGEK 70 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 pF1KE3 GGAFSNALSSLNVLRPG-EIPDAAFIHAARKKRQMARELGDFTPHD--NEPGKGRLVRED .:...:: : :. .:::::::.:::.::..:: :. : . . . . ::. XP_011 --ELSSTVSS--SLFPSVKIPDAAFIQAARRKRELARAQDDYISLDVQHTSSISGMKRES 130 140 150 160 170 180 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 ENDASDDEDDDEKRRIVFSVKEKSQRQKIAEEIGIEGSDDDALVTGEQDEELSRWEQEQI :.: ..: ::...:: :... .. ::..::: .: . .... ...::. . :::.:. XP_011 EDDP-ESEPDDHEKRIPFTLRPQTLRQRMAEE-SI-SRNEETSEESQEDEKQDTWEQQQM 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 RKGINIPQVQASQPAEVNMYYQNTYQTMPYGSSYGIPYSYTAYGSSDAKSQKTDNTVPFK ::...: . . .... : ::: : .: :... : XP_011 RKAVKIIEER-----DIDLSCGN-------GSS---------------KVKKFDTSISF- 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 TPSNEMTPVTIDLVKKQLKDRLDSMKELHKTNRQQHEKHLQSRVDSTRAIERLEGSSGGI : ::.....::::. :: ..: :... ...::..:. .: .:. ::.::. XP_011 -P-----PVNLEIIKKQLNTRLTLLQETHRSHLREYEKYVQDVKSSKSTIQNLESSSNQ- 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 GERYKFLQEMRGYVQDLLECFSEKVPLINELESAIHQLYKQRASRLVQRRQDDIKDESSE . :: . :. ::..:..:..::. :.:.::..: : ..: ...::::..: ::. XP_011 ALNCKFYKSMKIYVENLIDCLNEKIINIQEIESSMHALLLKQAMTFMKRRQDELKHESTY 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 FSSHSNKALMAPNLDSFGRDRALYQEHAKRRIAEREARRTRRRQAREQTGKMADHLEGLS ... : : . . .:. : :... . : :.:: XP_011 LQQLSRKDETSTS-GNFSVD-----EKTQWILEEIESRRYLYKVKI 390 400 410 420 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 SDDEETSTDITNFNLEKDRISKESGKVFEDVLESFYSIDCIKSQFEAWRSKYYTSYKDAY 917 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 05:04:16 2016 done: Sun Nov 6 05:04:18 2016 Total Scan time: 15.700 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]